More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xcel_2820 on replicon NC_013530
Organism: Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013530  Xcel_2820  major facilitator superfamily MFS_1  100 
 
 
421 aa  819    Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.549151  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1603  major facilitator superfamily MFS_1  66.43 
 
 
432 aa  486  1e-136  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0347546  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_05030  Major Facilitator Superfamily transporter  54.07 
 
 
414 aa  409  1e-113  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3278  major facilitator transporter  55.34 
 
 
415 aa  409  1e-113  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.471566  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0417  major facilitator transporter  48.93 
 
 
420 aa  374  1e-102  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00934872 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0234  major facilitator superfamily MFS_1  52.61 
 
 
442 aa  375  1e-102  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1093  major facilitator superfamily MFS_1  50.85 
 
 
408 aa  355  1e-96  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.400006 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0347  major facilitator transporter  49.39 
 
 
425 aa  347  2e-94  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4222  major facilitator transporter  42.36 
 
 
432 aa  298  9e-80  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.399211  hitchhiker  0.00102981 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2409  major facilitator transporter  40.99 
 
 
402 aa  245  9e-64  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0925995  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1968  major facilitator superfamily MFS_1  36.21 
 
 
405 aa  182  7e-45  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00000336752  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_01200  Major Facilitator Superfamily transporter  35.71 
 
 
411 aa  172  9e-42  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.780735  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0656  major facilitator transporter  36.04 
 
 
435 aa  163  4.0000000000000004e-39  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2261  major facilitator superfamily MFS_1  37.17 
 
 
411 aa  158  2e-37  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.484467 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2064  major facilitator transporter  35.81 
 
 
426 aa  157  4e-37  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.230072 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0236  major facilitator transporter  40.23 
 
 
402 aa  154  2.9999999999999998e-36  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00072705 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4215  major facilitator superfamily MFS_1  31.81 
 
 
467 aa  150  5e-35  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.251159  normal  0.128113 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0258  major facilitator superfamily MFS_1  29.7 
 
 
451 aa  144  3e-33  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.305305 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0419  major facilitator transporter  31.5 
 
 
416 aa  141  3e-32  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4165  major facilitator transporter  32.23 
 
 
416 aa  134  3e-30  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0148559  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8782  major facilitator superfamily MFS_1  30.67 
 
 
429 aa  134  3e-30  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.753165 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7391  major facilitator transporter  33.78 
 
 
434 aa  133  5e-30  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.671193  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0671  major facilitator transporter  29.97 
 
 
456 aa  130  5.0000000000000004e-29  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0719  hypothetical protein  30.14 
 
 
418 aa  125  1e-27  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.384757  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0208  hypothetical protein  39.31 
 
 
289 aa  125  1e-27  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1671  putative transporter  29.86 
 
 
418 aa  124  3e-27  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1705  putative transporter  29.86 
 
 
418 aa  124  3e-27  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.167293  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1912  putative transporter  29.86 
 
 
417 aa  124  3e-27  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0586  putative transporter  29.86 
 
 
417 aa  124  3e-27  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2325  major facilitator superfamily permease  29.86 
 
 
397 aa  124  4e-27  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0197346  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2244  major facilitator transporter  29.86 
 
 
397 aa  124  4e-27  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7428  antibiotic efflux protein  30.25 
 
 
406 aa  122  8e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0620213 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2962  major facilitator superfamily MFS_1  31.91 
 
 
461 aa  119  9.999999999999999e-26  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.470581  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2101  major facilitator superfamily MFS_1  27.73 
 
 
447 aa  114  4.0000000000000004e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0365  major facilitator transporter  27.75 
 
 
427 aa  112  9e-24  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0592694 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0516  major facilitator superfamily MFS_1  28.09 
 
 
420 aa  112  9e-24  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2910  major facilitator superfamily MFS_1  30.14 
 
 
439 aa  112  1.0000000000000001e-23  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.346093  normal  0.416861 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3773  major facilitator superfamily MFS_1  34.22 
 
 
420 aa  112  1.0000000000000001e-23  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.159588  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0074  major facilitator superfamily MFS_1  25 
 
 
410 aa  110  6e-23  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.147937  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2429  major facilitator superfamily MFS_1  30.22 
 
 
418 aa  108  2e-22  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.945021  normal  0.699098 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6746  hypothetical protein  29.33 
 
 
427 aa  103  8e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.869375  normal  0.283343 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1568  major facilitator transporter  20.84 
 
 
405 aa  101  3e-20  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1600  major facilitator transporter  20.84 
 
 
405 aa  101  3e-20  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6539  major facilitator superfamily MFS_1  29.23 
 
 
415 aa  100  4e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.6945  normal  0.0125799 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2668  protein of unknown function DUF894, DitE  26.15 
 
 
541 aa  99.8  8e-20  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4238  major facilitator transporter  28.46 
 
 
420 aa  99.8  9e-20  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.375023 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2475  major facilitator superfamily MFS_1  27.94 
 
 
494 aa  99.4  1e-19  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.495662  normal  0.811847 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0056  major facilitator superfamily MFS_1  28.65 
 
 
433 aa  94.7  3e-18  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5278  hypothetical protein  25.99 
 
 
408 aa  94  4e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.306023  normal  0.251543 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1221  major facilitator transporter  30.46 
 
 
451 aa  94.4  4e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0719879 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4481  major facilitator transporter  28.46 
 
 
416 aa  94  5e-18  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.646656  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4174  major facilitator superfamily MFS_1  29.41 
 
 
414 aa  93.2  8e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.176115  normal  0.788258 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4005  major facilitator superfamily MFS_1  28.82 
 
 
442 aa  93.2  8e-18  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal  0.0701044 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3228  hypothetical protein  26.86 
 
 
405 aa  92.8  9e-18  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.65431  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5006  major facilitator transporter  27.91 
 
 
416 aa  91.7  2e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.641572  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_27630  arabinose efflux permease family protein  25.19 
 
 
417 aa  92  2e-17  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0476  major facilitator transporter  29.05 
 
 
474 aa  91.7  2e-17  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0842  protein of unknown function DUF894 DitE  26.53 
 
 
586 aa  91.7  2e-17  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0062  major facilitator superfamily MFS_1  25.9 
 
 
440 aa  91.3  3e-17  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.175422  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0087  major facilitator transporter  24.61 
 
 
436 aa  91.3  3e-17  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4101  major facilitator superfamily MFS_1  29.37 
 
 
432 aa  90.1  6e-17  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.438153 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3134  major facilitator superfamily MFS_1  27.81 
 
 
417 aa  89.7  8e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4491  major facilitator superfamily MFS_1  27.07 
 
 
423 aa  89.7  9e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.783622  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0844  major facilitator superfamily MFS_1  27.81 
 
 
403 aa  89.4  1e-16  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6327  major facilitator transporter  29.11 
 
 
461 aa  89.4  1e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.400788 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8887  hypothetical protein  27.3 
 
 
413 aa  89  2e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.889317 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0091  major facilitator superfamily MFS_1  25.39 
 
 
442 aa  86.7  8e-16  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1420  major facilitator superfamily MFS_1  28.74 
 
 
420 aa  86.3  9e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3037  major facilitator superfamily MFS_1  25.5 
 
 
421 aa  86.3  9e-16  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1728  major facilitator superfamily MFS_1  26.55 
 
 
417 aa  86.3  0.000000000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4269  major facilitator transporter  27.02 
 
 
436 aa  86.3  0.000000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.935574 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5406  major facilitator superfamily MFS_1  27.43 
 
 
444 aa  85.9  0.000000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.283217 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0372  major facilitator superfamily MFS_1  25.85 
 
 
416 aa  86.3  0.000000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.862207  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2102  major facilitator transporter  26.76 
 
 
427 aa  86.3  0.000000000000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0117925  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3299  major facilitator transporter  27.7 
 
 
416 aa  85.9  0.000000000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.174226  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_61170  putative transmembrane protein  25.58 
 
 
403 aa  85.9  0.000000000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5069  major facilitator transporter  27.7 
 
 
416 aa  85.9  0.000000000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1007  hypothetical protein  27.79 
 
 
415 aa  85.5  0.000000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.767675  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0395  permease  24.22 
 
 
430 aa  85.1  0.000000000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0177527  normal  0.113221 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1452  major facilitator family transporter  25.31 
 
 
415 aa  85.1  0.000000000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0098  major facilitator superfamily MFS_1  26.59 
 
 
428 aa  84.7  0.000000000000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2101  major facilitator superfamily MFS_1  26.92 
 
 
479 aa  84.3  0.000000000000004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1367  major facilitator family transporter  25.31 
 
 
415 aa  84.3  0.000000000000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5351  major facilitator superfamily MFS_1  27.78 
 
 
401 aa  83.6  0.000000000000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.804378  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2600  hypothetical protein  25.31 
 
 
415 aa  83.6  0.000000000000006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2972  major facilitator transporter  25.41 
 
 
415 aa  83.6  0.000000000000006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1230  putative transporter  27.04 
 
 
378 aa  83.6  0.000000000000007  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1991  major facilitator superfamily MFS_1  25.99 
 
 
450 aa  83.6  0.000000000000007  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.762129  normal 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0199  putative transporter  27.04 
 
 
378 aa  83.6  0.000000000000007  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0474  putative transporter  27.04 
 
 
378 aa  83.6  0.000000000000007  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0684  major facilitator transporter  24.14 
 
 
412 aa  82.4  0.00000000000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00476606  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5216  major facilitator transporter  27.18 
 
 
416 aa  82.8  0.00000000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5268  MFS family transporter  25 
 
 
403 aa  82.4  0.00000000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2582  permease, putative  22.66 
 
 
408 aa  82  0.00000000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33950  arabinose efflux permease family protein  27.53 
 
 
414 aa  81.6  0.00000000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.466548  normal  0.73086 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0176  major facilitator transporter  26.54 
 
 
426 aa  82  0.00000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.379469  normal  0.234316 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6250  major facilitator superfamily MFS_1  26.75 
 
 
433 aa  82  0.00000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.220883  normal  0.159364 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3573  major facilitator transporter  27.18 
 
 
416 aa  81.6  0.00000000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4370  transporter, major facilitator family  23.02 
 
 
410 aa  82  0.00000000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  5.0052999999999995e-22 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1399  major facilitator transporter  26.06 
 
 
360 aa  82.4  0.00000000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.41856  normal  0.33149 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>