151 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tcur_4972 on replicon NC_013510
Organism: Thermomonospora curvata DSM 43183



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013510  Tcur_4972  major facilitator superfamily MFS_1  100 
 
 
427 aa  816    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9367  hypothetical protein  48.35 
 
 
432 aa  343  4e-93  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.445461 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3101  hypothetical protein  53.85 
 
 
433 aa  338  1.9999999999999998e-91  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3570  major facilitator superfamily protein  49.76 
 
 
441 aa  309  5e-83  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.546301 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_9035  major facilitator superfamily MFS_1  44.58 
 
 
434 aa  303  4.0000000000000003e-81  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0246012  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1610  major facilitator transporter  45.3 
 
 
450 aa  251  2e-65  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.567421  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4847  major facilitator superfamily MFS_1  47.96 
 
 
431 aa  249  5e-65  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4530  hypothetical protein  44.69 
 
 
462 aa  246  6e-64  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7077  major facilitator superfamily MFS_1  43.81 
 
 
436 aa  244  1.9999999999999999e-63  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3708  major facilitator superfamily MFS_1  45.3 
 
 
435 aa  241  1e-62  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.757705  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5396  major facilitator superfamily MFS_1  37.65 
 
 
442 aa  236  5.0000000000000005e-61  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4834  major facilitator superfamily MFS_1  41.12 
 
 
434 aa  235  1.0000000000000001e-60  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.200782  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5077  major facilitator superfamily MFS_1  46.17 
 
 
416 aa  231  1e-59  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7320  major facilitator transporter  44.28 
 
 
476 aa  231  1e-59  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.38056  normal  0.447394 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_37850  Major Facilitator Superfamily transporter  40.76 
 
 
432 aa  220  3.9999999999999997e-56  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2529  major facilitator superfamily MFS_1  36.13 
 
 
428 aa  219  5e-56  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5841  hypothetical protein  36.87 
 
 
436 aa  218  2e-55  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4203  major facilitator superfamily MFS_1  43.87 
 
 
491 aa  216  5e-55  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.274526  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_6058  major facilitator superfamily transporter  38.68 
 
 
427 aa  211  1e-53  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.249131 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10036  integral membrane protein  37.47 
 
 
441 aa  204  3e-51  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.43551 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0849  major facilitator transporter  36.56 
 
 
454 aa  194  4e-48  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.534463  normal  0.0626526 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4220  major facilitator superfamily MFS_1  39.57 
 
 
441 aa  188  1e-46  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.665807  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3360  major facilitator superfamily MFS_1  40 
 
 
453 aa  188  1e-46  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5393  putative integral membrane protein  39.7 
 
 
427 aa  172  1e-41  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5482  putative integral membrane protein  39.7 
 
 
427 aa  172  1e-41  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0695382  normal  0.381838 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5769  putative integral membrane protein  39.7 
 
 
427 aa  172  1e-41  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0822708  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0985  hypothetical protein  25.56 
 
 
460 aa  77.4  0.0000000000005  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.309761  normal  0.0823053 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2540  major facilitator superfamily protein  24.88 
 
 
547 aa  71.2  0.00000000003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.824873  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2589  major facilitator superfamily MFS_1  23.4 
 
 
482 aa  70.9  0.00000000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0568188  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4605  major facilitator transporter  22.74 
 
 
462 aa  70.5  0.00000000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3528  major facilitator superfamily MFS_1  23.18 
 
 
482 aa  70.1  0.00000000007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2831  major facilitator superfamily MFS_1  24.95 
 
 
486 aa  66.6  0.0000000008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0218624 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0303  major facilitator superfamily MFS_1  28.46 
 
 
426 aa  66.6  0.0000000009  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0634781  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0543  major facilitator superfamily MFS_1  28.51 
 
 
437 aa  65.1  0.000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0728  major facilitator transporter  26.72 
 
 
543 aa  63.9  0.000000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.165324  normal  0.170195 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0240  transporter, putative  24.01 
 
 
393 aa  63.2  0.000000008  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0979  major facilitator superfamily MFS_1  27.59 
 
 
522 aa  61.2  0.00000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.684404 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19250  major facilitator superfamily MFS_1  22.81 
 
 
444 aa  60.8  0.00000004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00108172  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2016  MFS superfamily transporter  23.91 
 
 
459 aa  60.8  0.00000005  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.647427  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0698  major facilitator superfamily MFS_1  31.51 
 
 
397 aa  60.8  0.00000005  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2402  permease  23.5 
 
 
408 aa  58.9  0.0000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0859078  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2577  permease  23.5 
 
 
408 aa  58.9  0.0000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.659755  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3061  major facilitator superfamily MFS_1  27.84 
 
 
429 aa  58.9  0.0000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  decreased coverage  0.00310805  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2355  macrolide-efflux protein  22.72 
 
 
408 aa  58.2  0.0000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000199839  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2318  macrolide-efflux protein  23.24 
 
 
408 aa  58.2  0.0000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.31097  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2122  major facilitator transporter  27.67 
 
 
424 aa  58.2  0.0000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.74746  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6215  major facilitator superfamily MFS_1  29.95 
 
 
404 aa  57.8  0.0000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0532982  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0844  thymidylate kinase  29.92 
 
 
707 aa  57.4  0.0000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2820  major facilitator superfamily MFS_1  26.79 
 
 
421 aa  57  0.0000006  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.549151  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3741  major facilitator transporter  26.07 
 
 
426 aa  57  0.0000006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.159847  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5208  major facilitator superfamily MFS_1  28.76 
 
 
432 aa  57  0.0000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.377398  normal  0.900425 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2540  major facilitator superfamily MFS_1  31.43 
 
 
430 aa  57  0.0000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0482  major facilitator superfamily MFS_1  29.9 
 
 
458 aa  56.6  0.0000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.787835  normal  0.855857 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0516  major facilitator superfamily MFS_1  27.08 
 
 
420 aa  56.6  0.0000008  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0763  major facilitator superfamily MFS_1  30.52 
 
 
421 aa  56.2  0.000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1445  major facilitator transporter  23.7 
 
 
390 aa  55.8  0.000001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00616907  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1491  major facilitator transporter  23.7 
 
 
390 aa  55.8  0.000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.326017  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2589  putative permease  23.24 
 
 
408 aa  56.2  0.000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.59543e-18 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4030  major facilitator transporter  29.08 
 
 
413 aa  55.5  0.000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00161616 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2631  putative permease  22.98 
 
 
408 aa  55.5  0.000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0615976  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2582  permease, putative  22.01 
 
 
408 aa  55.1  0.000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_21441  putative multidrug efflux transporter, MFS family protein  26.43 
 
 
471 aa  54.7  0.000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3365  major facilitator superfamily protein  30.38 
 
 
424 aa  53.9  0.000005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4419  hypothetical protein  28.12 
 
 
533 aa  53.9  0.000005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.438788  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1538  major facilitator transporter  26.47 
 
 
404 aa  53.9  0.000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.756552  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6155  major facilitator superfamily MFS_1  22.58 
 
 
414 aa  53.9  0.000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.601983  normal  0.199579 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1928  major facilitator superfamily MFS_1  29.17 
 
 
414 aa  53.9  0.000005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0688885  normal  0.183583 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7785  major facilitator superfamily MFS_1  25.9 
 
 
420 aa  53.9  0.000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.157303 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_05030  Major Facilitator Superfamily transporter  34.07 
 
 
414 aa  53.1  0.000008  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1539  major facilitator transporter  21.2 
 
 
412 aa  53.1  0.000008  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  unclonable  0.000000151531  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5239  major facilitator superfamily MFS_1  23.18 
 
 
459 aa  53.1  0.000009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.585847 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0872  H+ Antiporter protein  24.18 
 
 
405 aa  53.1  0.00001  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1498  macrolide efflux protein  26.06 
 
 
404 aa  51.6  0.00002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0655  MFS superfamily transporter  25.14 
 
 
460 aa  52.4  0.00002  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0801  major facilitator superfamily MFS_1  28.48 
 
 
442 aa  52  0.00002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.469185 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2935  transporter, putative  21.41 
 
 
400 aa  51.6  0.00003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00291638  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1719  putative permease  25.79 
 
 
404 aa  51.6  0.00003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0074  major facilitator superfamily MFS_1  21.52 
 
 
410 aa  50.8  0.00004  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.147937  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1226  major facilitator superfamily MFS_1  26.53 
 
 
423 aa  51.2  0.00004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.403066 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2729  putative permease  18.52 
 
 
434 aa  51.2  0.00004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0743225  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2897  putative transporter  21.41 
 
 
400 aa  51.2  0.00004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000603201 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1507  macrolide efflux protein  25.79 
 
 
404 aa  50.4  0.00005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.667551  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2726  macrolide efflux protein  24.42 
 
 
406 aa  50.4  0.00005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.277105  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2707  macrolide efflux protein  24.42 
 
 
406 aa  50.8  0.00005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0968867  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1533  permease  25.79 
 
 
404 aa  50.4  0.00006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2777  permease  24.42 
 
 
406 aa  50.4  0.00006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.145309  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2647  macrolide efflux protein  21.41 
 
 
400 aa  50.4  0.00006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0376776  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1652  permease  25.79 
 
 
404 aa  50.4  0.00006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.608559  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2988  permease  24.42 
 
 
406 aa  50.4  0.00006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3024  putative permease  23.84 
 
 
406 aa  50.4  0.00006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1438  major facilitator superfamily MFS_1  31.21 
 
 
416 aa  50.4  0.00006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2624  macrolide efflux protein  21.41 
 
 
400 aa  50.1  0.00007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2945  putative transporter  21.1 
 
 
400 aa  50.1  0.00007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000764756  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0258  major facilitator superfamily MFS_1  29.89 
 
 
451 aa  49.7  0.00009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.305305 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2702  major facilitator transporter  21.1 
 
 
400 aa  49.3  0.0001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00155167  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2912  putative transporter  21.1 
 
 
400 aa  49.3  0.0001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1381  major facilitator superfamily MFS_1  26.98 
 
 
407 aa  49.3  0.0001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000258845  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2896  transporter  21.1 
 
 
400 aa  48.5  0.0002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.550762  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0308  dTMP kinase  29.14 
 
 
709 aa  48.5  0.0002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.233817 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2334  putative transporter  21.1 
 
 
400 aa  48.9  0.0002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.609115  hitchhiker  0.000374493 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>