More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Snas_1226 on replicon NC_013947
Organism: Stackebrandtia nassauensis DSM 44728



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013947  Snas_1226  major facilitator superfamily MFS_1  100 
 
 		 423 aa  809    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.403066 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3357  major facilitator transporter  34.24 
 
 		 496 aa  121  1.9999999999999998e-26  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_05600  Major Facilitator Superfamily transporter  32.33 
 
 		 439 aa  95.5  2e-18  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.37691  normal  0.94686 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0578  major facilitator transporter  24.55 
 
 		 413 aa  81.3  0.00000000000003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0133344  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0593  major facilitator transporter  24.55 
 
 		 413 aa  81.3  0.00000000000003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.00370301  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1016  major facilitator transporter  29.24 
 
 		 393 aa  79  0.0000000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.807332  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0698  major facilitator superfamily MFS_1  23.85 
 
 		 397 aa  77.4  0.0000000000004  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21930  major facilitator superfamily MFS_1  22.57 
 
 		 432 aa  77  0.0000000000006  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_05630  arabinose efflux permease family protein  27.69 
 
 		 478 aa  76.3  0.000000000001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.264902  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1572  major facilitator transporter  29.04 
 
 		 415 aa  74.7  0.000000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.58248  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_29210  putative MFS transporter  29.96 
 
 		 529 aa  73.9  0.000000000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.512014 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1007  hypothetical protein  27.94 
 
 		 415 aa  73.9  0.000000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.767675  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3978  transmembrane transport protein  29.96 
 
 		 528 aa  72.8  0.00000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4222  major facilitator transporter  27.83 
 
 		 432 aa  70.9  0.00000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.399211  hitchhiker  0.00102981 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2647  major facilitator transporter  32.62 
 
 		 524 aa  70.5  0.00000000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2413  major facilitator transporter  32.81 
 
 		 412 aa  70.1  0.00000000007  Frankia sp. CcI3  Bacteria  decreased coverage  0.00423271  normal  0.219014 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1398  major facilitator transporter  25.38 
 
 		 422 aa  68.2  0.0000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.902897  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_31240  putative nrbE-like protein  28.27 
 
 		 436 aa  68.9  0.0000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000000000011963  unclonable  4.15969e-22 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2668  protein of unknown function DUF894, DitE  25.08 
 
 		 541 aa  68.2  0.0000000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0479  major facilitator superfamily MFS_1  31.22 
 
 		 427 aa  67  0.0000000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.742618 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42320  major facilitator transpoter  29.18 
 
 		 535 aa  67  0.0000000006  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.956299  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1670  protein of unknown function DUF894 DitE  27.43 
 
 		 532 aa  67  0.0000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0165754  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8887  hypothetical protein  27.24 
 
 		 413 aa  66.6  0.0000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.889317 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3508  protein of unknown function DUF894, DitE  32.31 
 
 		 526 aa  67  0.0000000007  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3594  putative permease  25.27 
 
 		 422 aa  66.2  0.000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2526  H+ Antiporter protein  35.33 
 
 		 411 aa  66.2  0.000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000735797  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1147  major facilitator superfamily MFS_1  28.57 
 
 		 436 aa  65.9  0.000000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.114141  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2665  protein of unknown function DUF894, DitE  28.85 
 
 		 542 aa  65.1  0.000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0627895  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11210  major facilitator superfamily MFS_1  31.21 
 
 		 433 aa  64.7  0.000000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3486  major facilitator transporter  27.17 
 
 		 450 aa  64.7  0.000000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.719238  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5813  major facilitator superfamily MFS_1  28.46 
 
 		 446 aa  65.1  0.000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.243583  normal  0.354769 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1399  major facilitator transporter  33.53 
 
 		 360 aa  64.3  0.000000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.41856  normal  0.33149 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1030  major facilitator superfamily MFS_1  26.34 
 
 		 419 aa  63.5  0.000000006  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0875  major facilitator superfamily MFS_1  27.99 
 
 		 441 aa  63.9  0.000000006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  hitchhiker  0.00780765  normal  0.0882707 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1607  major facilitator transporter  24.45 
 
 		 422 aa  63.5  0.000000007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0422221  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2847  major facilitator superfamily MFS_1  25.6 
 
 		 432 aa  63.5  0.000000007  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5333  hypothetical protein  25.97 
 
 		 415 aa  63.2  0.000000008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0872  H+ Antiporter protein  28.85 
 
 		 405 aa  63.2  0.000000008  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2972  major facilitator transporter  27.24 
 
 		 415 aa  62.8  0.00000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5006  major facilitator transporter  31.29 
 
 		 416 aa  62.4  0.00000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.641572  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0836  major facilitator superfamily MFS_1  27.36 
 
 		 443 aa  62.4  0.00000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3976  major facilitator transporter  32.62 
 
 		 407 aa  62.8  0.00000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3288  major facilitator superfamily protein  30.37 
 
 		 405 aa  62.4  0.00000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.234831 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5251  transporter, putative  35.46 
 
 		 532 aa  62.4  0.00000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1991  major facilitator superfamily MFS_1  27.17 
 
 		 450 aa  62  0.00000002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.762129  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1568  multidrug resistance protein; tetracycline resistance determinant  24.46 
 
 		 422 aa  62  0.00000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.766892  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0418  major facilitator transporter  26.5 
 
 		 426 aa  62  0.00000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.752628 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1808  permease, putative  24.82 
 
 		 422 aa  61.2  0.00000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0506  major facilitator transporter  26.18 
 
 		 426 aa  61.2  0.00000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.204304  hitchhiker  0.00963798 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1753  major facilitator superfamily MFS_1  21.74 
 
 		 393 aa  61.6  0.00000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4706  major facilitator superfamily MFS_1  26.73 
 
 		 445 aa  61.6  0.00000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.93667 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6079  hypothetical protein  28.24 
 
 		 420 aa  60.8  0.00000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.533874  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0652  major facilitator transporter  27.57 
 
 		 423 aa  60.8  0.00000005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0291479  normal  0.182714 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1012  protein of unknown function DUF894, DitE  26.72 
 
 		 409 aa  60.5  0.00000005  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.171336 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4481  major facilitator transporter  31.29 
 
 		 416 aa  60.8  0.00000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.646656  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1749  putative permease  25.27 
 
 		 422 aa  60.5  0.00000006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2418  major facilitator superfamily MFS_1  30.13 
 
 		 412 aa  60.5  0.00000006  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.269173 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3573  major facilitator transporter  31.9 
 
 		 416 aa  60.5  0.00000006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0240  transporter, putative  27.51 
 
 		 393 aa  60.1  0.00000007  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1011  major facilitator superfamily MFS_1  28.33 
 
 		 458 aa  60.1  0.00000007  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5239  macrolide-efflux protein  24.87 
 
 		 397 aa  60.1  0.00000007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1807  hypothetical protein  37.69 
 
 		 553 aa  60.1  0.00000007  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1952  major facilitator superfamily MFS_1  24.38 
 
 		 418 aa  60.1  0.00000008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3588  major facilitator superfamily MFS_1  31.15 
 
 		 428 aa  60.1  0.00000008  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.273478 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0532  major facilitator superfamily MFS_1  26.38 
 
 		 428 aa  59.3  0.0000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3442  major facilitator superfamily MFS_1  26.58 
 
 		 440 aa  59.7  0.0000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0102132  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0176  major facilitator transporter  27.08 
 
 		 426 aa  59.3  0.0000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.379469  normal  0.234316 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3075  major facilitator transporter  31.94 
 
 		 423 aa  59.7  0.0000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1155  major facilitator superfamily MFS_1  26.1 
 
 		 399 aa  58.9  0.0000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.128986 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0637  protein of unknown function DUF894, DitE  31.15 
 
 		 536 aa  59.3  0.0000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.167725  normal  0.197731 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3139  major facilitator superfamily MFS_1  28.32 
 
 		 453 aa  58.5  0.0000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0331  major facilitator transporter  23.83 
 
 		 412 aa  58.5  0.0000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0303  major facilitator superfamily MFS_1  25.7 
 
 		 426 aa  58.9  0.0000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0634781  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2812  hypothetical protein  23.74 
 
 		 399 aa  58.5  0.0000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.287004  normal  0.40248 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1904  amino acid adenylation domain-containing protein  23.6 
 
 		 1833 aa  58.9  0.0000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.844763  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3555  major facilitator superfamily MFS_1  28.46 
 
 		 449 aa  58.5  0.0000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.194127  normal  0.458265 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0701  major facilitator superfamily MFS_1  22.22 
 
 		 423 aa  58.9  0.0000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4177  major facilitator superfamily MFS_1  29.51 
 
 		 476 aa  58.9  0.0000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.192321  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2848  major facilitator superfamily MFS_1  27.18 
 
 		 426 aa  58.9  0.0000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1342  major facilitator superfamily MFS_1  26.05 
 
 		 401 aa  58.5  0.0000002  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000002456 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3926  major facilitator transporter  27.17 
 
 		 457 aa  58.9  0.0000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1118  major facilitator superfamily MFS_1  29.93 
 
 		 406 aa  58.9  0.0000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2733  major facilitator superfamily MFS_1  25.81 
 
 		 415 aa  58.2  0.0000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.862267  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1325  major facilitator superfamily MFS_1  30.57 
 
 		 419 aa  58.2  0.0000003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.327447 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2027  major facilitator superfamily MFS_1  28.25 
 
 		 436 aa  58.2  0.0000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0832  major facilitator superfamily MFS_1  32.05 
 
 		 443 aa  58.2  0.0000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.533006  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3031  major facilitator transporter  34.78 
 
 		 420 aa  58.2  0.0000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0036629 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3299  major facilitator transporter  31.29 
 
 		 416 aa  58.2  0.0000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.174226  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4311  major facilitator superfamily MFS_1  29.18 
 
 		 432 aa  58.2  0.0000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.204415  normal  1 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1508  major facilitator superfamily permease  21.02 
 
 		 403 aa  57.8  0.0000003  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5069  major facilitator transporter  31.29 
 
 		 416 aa  58.2  0.0000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4201  major facilitator superfamily MFS_1  29.18 
 
 		 432 aa  58.2  0.0000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5002  MFS family membrane efflux protein  29 
 
 		 441 aa  57.8  0.0000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.151073  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1445  major facilitator transporter  22.7 
 
 		 390 aa  57.4  0.0000005  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00616907  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0069  major facilitator superfamily MFS_1  33.58 
 
 		 406 aa  57.4  0.0000005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1259  major facilitator transporter  26.59 
 
 		 491 aa  57.4  0.0000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0884652  normal  0.0333983 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1491  major facilitator transporter  22.7 
 
 		 390 aa  57.4  0.0000005  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.326017  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5814  major facilitator superfamily MFS_1  25.1 
 
 		 423 aa  57.4  0.0000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.915234  hitchhiker  0.00491963 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0762  protein of unknown function DUF894, DitE  29.2 
 
 		 560 aa  57.4  0.0000005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.446257 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1837  major facilitator superfamily MFS_1  31.09 
 
 		 415 aa  57  0.0000006  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00768254  normal  0.336306 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>