More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Arth_3357 on replicon NC_008541
Organism: Arthrobacter sp. FB24



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008541  Arth_3357  major facilitator transporter  100 
 
 		 496 aa  957    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1226  major facilitator superfamily MFS_1  34.49 
 
 		 423 aa  137  4e-31  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.403066 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_05630  arabinose efflux permease family protein  30.54 
 
 		 478 aa  134  3.9999999999999996e-30  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.264902  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_05600  Major Facilitator Superfamily transporter  30.28 
 
 		 439 aa  107  6e-22  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.37691  normal  0.94686 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0490  major facilitator superfamily MFS_1  31.1 
 
 		 461 aa  87.4  5e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0768  major facilitator superfamily MFS_1  25.77 
 
 		 456 aa  83.6  0.000000000000007  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0823  major facilitator superfamily MFS_1  27.89 
 
 		 418 aa  81.3  0.00000000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0875  major facilitator superfamily MFS_1  28.09 
 
 		 441 aa  78.6  0.0000000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  hitchhiker  0.00780765  normal  0.0882707 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3970  protein of unknown function DUF894 DitE  31.14 
 
 		 535 aa  77.4  0.0000000000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0242  putative integral membrane efflux protein  27.7 
 
 		 424 aa  76.6  0.0000000000008  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.305732  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21930  major facilitator superfamily MFS_1  21.5 
 
 		 432 aa  75.5  0.000000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1016  major facilitator transporter  30.98 
 
 		 393 aa  74.3  0.000000000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.807332  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5813  major facilitator superfamily MFS_1  25.17 
 
 		 446 aa  74.7  0.000000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.243583  normal  0.354769 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8887  hypothetical protein  28.49 
 
 		 413 aa  73.9  0.000000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.889317 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33950  arabinose efflux permease family protein  28.86 
 
 		 414 aa  73.9  0.000000000006  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.466548  normal  0.73086 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4177  major facilitator superfamily MFS_1  30.1 
 
 		 476 aa  73.6  0.000000000008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.192321  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1399  major facilitator transporter  29.17 
 
 		 360 aa  71.6  0.00000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.41856  normal  0.33149 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1991  major facilitator superfamily MFS_1  24.75 
 
 		 450 aa  70.5  0.00000000007  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.762129  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2326  major facilitator superfamily MFS_1  21.82 
 
 		 410 aa  70.1  0.0000000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0743  major facilitator transporter  30.74 
 
 		 410 aa  69.3  0.0000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0691  major facilitator transporter  28.33 
 
 		 428 aa  69.7  0.0000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.877498 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4246  major facilitator transporter  28.06 
 
 		 415 aa  69.3  0.0000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.000179551  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2848  major facilitator superfamily MFS_1  26.2 
 
 		 426 aa  68.9  0.0000000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2418  major facilitator superfamily MFS_1  29.7 
 
 		 412 aa  68.6  0.0000000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.269173 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0069  major facilitator superfamily MFS_1  32.55 
 
 		 406 aa  68.6  0.0000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0652  major facilitator transporter  28.52 
 
 		 423 aa  68.2  0.0000000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0291479  normal  0.182714 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1445  major facilitator transporter  23.48 
 
 		 390 aa  67.8  0.0000000004  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00616907  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1491  major facilitator transporter  23.48 
 
 		 390 aa  67.8  0.0000000004  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.326017  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0479  major facilitator superfamily MFS_1  26.43 
 
 		 427 aa  67.4  0.0000000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.742618 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0491  major facilitator superfamily MFS_1  30.43 
 
 		 424 aa  67  0.0000000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1747  major facilitator superfamily MFS_1  25.45 
 
 		 463 aa  67  0.0000000007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.192343  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4222  major facilitator transporter  27.51 
 
 		 432 aa  67  0.0000000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.399211  hitchhiker  0.00102981 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0578  major facilitator transporter  21.89 
 
 		 413 aa  67  0.0000000008  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0133344  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0593  major facilitator transporter  21.89 
 
 		 413 aa  67  0.0000000008  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.00370301  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1012  protein of unknown function DUF894, DitE  26.02 
 
 		 409 aa  66.2  0.000000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.171336 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3206  major facilitator transporter  27.61 
 
 		 413 aa  66.2  0.000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.130501  normal  0.812744 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2025  protein of unknown function DUF894, DitE  30.74 
 
 		 554 aa  65.9  0.000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.530345  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1837  major facilitator superfamily MFS_1  24.62 
 
 		 415 aa  65.5  0.000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00768254  normal  0.336306 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1532  major facilitator transporter  24.66 
 
 		 423 aa  65.5  0.000000002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.68199  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1030  major facilitator superfamily MFS_1  27.36 
 
 		 419 aa  65.1  0.000000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1572  major facilitator transporter  28.34 
 
 		 415 aa  65.1  0.000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.58248  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0536  major facilitator superfamily MFS_1  24.54 
 
 		 432 aa  64.7  0.000000004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.187699  hitchhiker  0.000017573 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0532  major facilitator superfamily MFS_1  24.47 
 
 		 428 aa  64.3  0.000000005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3588  major facilitator superfamily MFS_1  26.27 
 
 		 428 aa  64.3  0.000000005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.273478 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1554  protein of unknown function DUF894 DitE  32.06 
 
 		 553 aa  63.9  0.000000006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3776  major facilitator superfamily MFS_1  29.72 
 
 		 412 aa  63.5  0.000000008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3508  protein of unknown function DUF894, DitE  29.71 
 
 		 526 aa  63.5  0.000000008  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5251  transporter, putative  30 
 
 		 532 aa  62.8  0.00000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1046  major facilitator transporter  28 
 
 		 437 aa  63.2  0.00000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.340511  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4055  major facilitator transporter  26.94 
 
 		 413 aa  62.8  0.00000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_61170  putative transmembrane protein  28.89 
 
 		 403 aa  63.2  0.00000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0792  major facilitator transporter  25.64 
 
 		 450 aa  63.2  0.00000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4311  major facilitator transporter  26.94 
 
 		 413 aa  62.8  0.00000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.481156  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0369  major facilitator transporter  23.08 
 
 		 418 aa  62.8  0.00000001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.616869  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5800  major facilitator superfamily transporter  28.05 
 
 		 415 aa  62.8  0.00000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2699  permease, putative  21.65 
 
 		 410 aa  62  0.00000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.000249599  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30800  arabinose efflux permease family protein  23.75 
 
 		 452 aa  62.4  0.00000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1539  major facilitator transporter  20.96 
 
 		 412 aa  62.8  0.00000002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  unclonable  0.000000151531  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3024  putative permease  21.88 
 
 		 406 aa  62  0.00000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1325  major facilitator superfamily MFS_1  29.93 
 
 		 419 aa  62.4  0.00000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.327447 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2707  macrolide efflux protein  21.63 
 
 		 406 aa  61.6  0.00000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0968867  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2952  major facilitator transporter  25.85 
 
 		 405 aa  61.6  0.00000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3031  major facilitator transporter  26.97 
 
 		 420 aa  61.6  0.00000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0036629 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0844  major facilitator superfamily MFS_1  27.65 
 
 		 403 aa  61.6  0.00000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3288  major facilitator superfamily protein  22.86 
 
 		 405 aa  61.2  0.00000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.234831 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2102  major facilitator transporter  26.4 
 
 		 427 aa  61.2  0.00000004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0117925  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_23190  arabinose efflux permease family protein  25.59 
 
 		 424 aa  61.2  0.00000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.108135  normal  0.595786 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1559  major facilitator transporter  20.96 
 
 		 412 aa  60.8  0.00000006  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.00000341731  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4296  major facilitator transporter  25.26 
 
 		 416 aa  60.8  0.00000006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.970953 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4580  H+ antiporter protein  24.68 
 
 		 443 aa  60.8  0.00000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.120622 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1272  protein of unknown function DUF894 DitE  28.19 
 
 		 551 aa  60.5  0.00000007  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.951526 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2726  macrolide efflux protein  21.63 
 
 		 406 aa  60.5  0.00000007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.277105  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2261  major facilitator superfamily MFS_1  32.99 
 
 		 411 aa  60.5  0.00000007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.484467 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3025  permease, putative  21.95 
 
 		 406 aa  60.1  0.00000008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.076608  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2777  permease  21.83 
 
 		 406 aa  60.1  0.00000008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.145309  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2988  permease  21.83 
 
 		 406 aa  60.1  0.00000008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2022  major facilitator superfamily multidrug efflux transporter  25 
 
 		 446 aa  60.5  0.00000008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.384962  normal  0.0286256 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3926  major facilitator transporter  26.86 
 
 		 457 aa  60.1  0.00000008  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2847  major facilitator superfamily MFS_1  28.99 
 
 		 432 aa  60.1  0.00000009  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_05410  arabinose efflux permease family protein  27.05 
 
 		 429 aa  60.1  0.00000009  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0915887  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0303  major facilitator superfamily MFS_1  30.51 
 
 		 426 aa  60.1  0.0000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0634781  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3145  major facilitator superfamily MFS_1  26.89 
 
 		 440 aa  59.3  0.0000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.985088  normal  0.131643 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2255  putative permease  21.48 
 
 		 404 aa  60.1  0.0000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.134353 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1719  major facilitator superfamily MFS_1  28.11 
 
 		 447 aa  59.3  0.0000001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1700  hypothetical protein  26.26 
 
 		 412 aa  59.3  0.0000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.761256  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2686  tetracycline resistance determinant TetV  20.11 
 
 		 432 aa  59.7  0.0000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2989  putative permease  24.13 
 
 		 362 aa  59.3  0.0000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0098  major facilitator superfamily MFS_1  23.53 
 
 		 428 aa  59.7  0.0000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0762  protein of unknown function DUF894, DitE  28.53 
 
 		 560 aa  59.7  0.0000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.446257 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1221  major facilitator transporter  25.71 
 
 		 451 aa  59.3  0.0000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0719879 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5268  MFS family transporter  28.21 
 
 		 403 aa  59.3  0.0000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2984  putative permease  21.88 
 
 		 404 aa  58.9  0.0000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000116191 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2027  major facilitator superfamily MFS_1  28.7 
 
 		 436 aa  58.9  0.0000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7117  major facilitator superfamily MFS_1  28.63 
 
 		 432 aa  58.9  0.0000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1862  major facilitator transporter  28.8 
 
 		 432 aa  59.3  0.0000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0234  protein of unknown function DUF894, DitE  26.83 
 
 		 419 aa  58.9  0.0000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0786  major facilitator transporter  27.7 
 
 		 418 aa  58.9  0.0000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2625  tetracycline resistance determinant TetV  20.11 
 
 		 431 aa  59.3  0.0000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000010691 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1342  major facilitator superfamily MFS_1  23.38 
 
 		 401 aa  58.5  0.0000002  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000002456 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1420  major facilitator superfamily MFS_1  25.63 
 
 		 420 aa  58.9  0.0000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>