More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mvan_5800 on replicon NC_008726
Organism: Mycobacterium vanbaalenii PYR-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009338  Mflv_1033  major facilitator transporter  83.29 
 
 
417 aa  639    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.838691  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5800  major facilitator superfamily transporter  100 
 
 
415 aa  792    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0903  major facilitator transporter  72.71 
 
 
413 aa  539  9.999999999999999e-153  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0920  major facilitator superfamily transporter  72.71 
 
 
413 aa  539  9.999999999999999e-153  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.833738  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0909  major facilitator transporter  71.98 
 
 
413 aa  538  1e-151  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.485537  normal  0.0144612 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_2010  transporter, putative  27.44 
 
 
429 aa  111  2.0000000000000002e-23  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3756  major facilitator superfamily MFS_1  23.9 
 
 
409 aa  108  1e-22  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1813  major facilitator superfamily permease  25 
 
 
410 aa  108  2e-22  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2206  major facilitator transporter  25.84 
 
 
447 aa  106  6e-22  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1272  major facilitator transporter  24.51 
 
 
418 aa  104  4e-21  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2627  major facilitator transporter  29.57 
 
 
410 aa  103  4e-21  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0752  transporter, putative  27.22 
 
 
446 aa  102  1e-20  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0844  major facilitator superfamily MFS_1  29.29 
 
 
403 aa  101  2e-20  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3035  MFS family transporter  27.35 
 
 
425 aa  101  2e-20  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3762  major facilitator transporter  27.35 
 
 
425 aa  101  2e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2884  hypothetical protein  28.67 
 
 
543 aa  100  4e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2679  major facilitator superfamily MFS_1  26.67 
 
 
453 aa  98.2  2e-19  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.000000322743  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1974  hypothetical protein  27.62 
 
 
424 aa  97.8  3e-19  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.00936884  normal  0.989231 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2972  major facilitator transporter  27.61 
 
 
415 aa  97.8  4e-19  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0234  protein of unknown function DUF894, DitE  27.03 
 
 
419 aa  97.4  4e-19  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2024  major facilitator superfamily MFS_1  25.71 
 
 
419 aa  97.4  4e-19  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0736  protein of unknown function DUF894, DitE  28.42 
 
 
539 aa  97.1  6e-19  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1000  hypothetical protein  27.55 
 
 
418 aa  96.3  8e-19  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00447157 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2380  major facilitator transporter  26.96 
 
 
474 aa  94.7  2e-18  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0389897  normal  0.03889 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0176  major facilitator transporter  28.87 
 
 
426 aa  94.7  2e-18  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.379469  normal  0.234316 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0163  MFS permease  28.29 
 
 
542 aa  94  4e-18  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2303  protein of unknown function DUF894 DitE  30.08 
 
 
536 aa  93.2  7e-18  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0842  protein of unknown function DUF894 DitE  28.04 
 
 
586 aa  93.2  8e-18  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0875  major facilitator superfamily MFS_1  29.22 
 
 
441 aa  92.8  9e-18  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  hitchhiker  0.00780765  normal  0.0882707 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5851  major facilitator superfamily MFS_1  28.96 
 
 
425 aa  92.4  1e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.917844  normal  0.985013 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3486  major facilitator transporter  29.38 
 
 
450 aa  92  1e-17  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.719238  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1012  protein of unknown function DUF894, DitE  27.67 
 
 
409 aa  92.8  1e-17  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.171336 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4414  protein of unknown function DUF894, DitE  29.85 
 
 
557 aa  92.8  1e-17  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0612118  normal  0.91404 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0107  hypothetical protein  24.81 
 
 
423 aa  91.7  2e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0053883 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5125  protein of unknown function DUF894 DitE  28.65 
 
 
542 aa  91.3  3e-17  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0950  hypothetical protein  28.57 
 
 
414 aa  90.5  4e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1167  protein of unknown function DUF894, DitE  28.31 
 
 
529 aa  90.9  4e-17  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1491  major facilitator transporter  23.68 
 
 
390 aa  90.5  5e-17  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.326017  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1445  major facilitator transporter  23.68 
 
 
390 aa  90.5  5e-17  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00616907  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6034  major facilitator transporter  23.16 
 
 
412 aa  90.5  5e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0822285  normal  0.0406983 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5433  major facilitator superfamily MFS_1  29.82 
 
 
417 aa  90.1  6e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.317246  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2384  major facilitator transporter  27.7 
 
 
441 aa  90.1  7e-17  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.930234  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1677  hypothetical protein  26.01 
 
 
435 aa  89.7  9e-17  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4354  major facilitator superfamily MFS_1  29.68 
 
 
431 aa  89.7  9e-17  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.95952  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5163  protein of unknown function DUF894, DitE  28.24 
 
 
530 aa  89.7  9e-17  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.0799644 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0990  major facilitator transporter  30.37 
 
 
414 aa  89.4  1e-16  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  hitchhiker  0.00457828  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1620  major facilitator superfamily MFS_1  24.21 
 
 
417 aa  89  1e-16  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0762  protein of unknown function DUF894, DitE  28.61 
 
 
560 aa  89.4  1e-16  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.446257 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1508  major facilitator superfamily permease  24.1 
 
 
403 aa  88.2  2e-16  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3970  protein of unknown function DUF894 DitE  29.24 
 
 
535 aa  88.2  2e-16  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1613  major facilitator superfamily MFS_1  24.93 
 
 
418 aa  88.2  3e-16  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000260989  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_19310  hypothetical protein  28.53 
 
 
571 aa  87.8  3e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3508  protein of unknown function DUF894, DitE  27.04 
 
 
526 aa  87.8  3e-16  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2384  protein of unknown function DUF894 DitE  27.07 
 
 
549 aa  87.4  4e-16  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.123744  normal  0.932575 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5333  hypothetical protein  27.58 
 
 
415 aa  87.8  4e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5471  major facilitator transporter  23.77 
 
 
412 aa  87.4  4e-16  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5391  major facilitator transporter  23.77 
 
 
412 aa  87.4  4e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.667839  normal  0.033436 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0056  major facilitator superfamily MFS_1  24.66 
 
 
433 aa  87  5e-16  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1662  hypothetical protein  28.53 
 
 
572 aa  87.4  5e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0792  major facilitator transporter  29.71 
 
 
450 aa  87  6e-16  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2102  major facilitator transporter  28.37 
 
 
427 aa  86.7  7e-16  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0117925  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0684  major facilitator transporter  25.58 
 
 
412 aa  85.9  0.000000000000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00476606  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3362  protein of unknown function DUF894 DitE  27.56 
 
 
569 aa  85.9  0.000000000000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.394214  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4879  major facilitator transporter  23.51 
 
 
412 aa  85.5  0.000000000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_29210  putative MFS transporter  28.75 
 
 
529 aa  86.3  0.000000000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.512014 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4005  major facilitator superfamily MFS_1  27.34 
 
 
442 aa  85.9  0.000000000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal  0.0701044 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1224  major facilitator superfamily MFS_1  28.25 
 
 
440 aa  85.9  0.000000000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4012  protein of unknown function DUF894, DitE  27.56 
 
 
569 aa  86.3  0.000000000000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0181  major facilitator superfamily MFS_1  23.6 
 
 
401 aa  85.1  0.000000000000002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0637  protein of unknown function DUF894, DitE  28.39 
 
 
536 aa  85.5  0.000000000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.167725  normal  0.197731 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5797  hypothetical protein  26.24 
 
 
419 aa  84.7  0.000000000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0691  major facilitator transporter  28.65 
 
 
428 aa  84.3  0.000000000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.877498 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0062  major facilitator superfamily MFS_1  24.81 
 
 
440 aa  84.7  0.000000000000003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.175422  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5251  transporter, putative  25.12 
 
 
532 aa  84.3  0.000000000000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1807  hypothetical protein  25.83 
 
 
553 aa  83.6  0.000000000000006  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1991  major facilitator superfamily MFS_1  29.3 
 
 
450 aa  83.2  0.000000000000008  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.762129  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3596  major facilitator superfamily MFS_1  24.68 
 
 
417 aa  82.8  0.00000000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2772  major facilitator transporter  26.44 
 
 
400 aa  82.8  0.00000000000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.584702 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3978  transmembrane transport protein  27.94 
 
 
528 aa  82.4  0.00000000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4288  hypothetical protein  25.07 
 
 
433 aa  82  0.00000000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4151  MFS permease  26.11 
 
 
410 aa  81.6  0.00000000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2685  major facilitator superfamily MFS_1  27.3 
 
 
406 aa  82  0.00000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.188987  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0768  major facilitator superfamily MFS_1  28.14 
 
 
456 aa  80.9  0.00000000000004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0823  major facilitator superfamily MFS_1  27.9 
 
 
418 aa  80.5  0.00000000000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3437  protein of unknown function DUF894 DitE  29.19 
 
 
551 aa  80.5  0.00000000000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.545505  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4699  major facilitator transporter  24.46 
 
 
412 aa  80.5  0.00000000000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.440552  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4649  protein of unknown function DUF894, DitE  27.47 
 
 
574 aa  80.5  0.00000000000005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7163  major facilitator superfamily MFS_1  23.1 
 
 
414 aa  80.1  0.00000000000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.886054  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0476  major facilitator transporter  27.68 
 
 
474 aa  79.7  0.00000000000008  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2943  major facilitator superfamily MFS_1  28.95 
 
 
406 aa  79.7  0.00000000000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.747804  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1327  major facilitator superfamily MFS_1  27.14 
 
 
433 aa  79.7  0.00000000000009  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_49890  membrame protein  26.48 
 
 
454 aa  79.7  0.00000000000009  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4656  hypothetical protein  25.33 
 
 
427 aa  79.3  0.0000000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4706  major facilitator superfamily MFS_1  28.68 
 
 
445 aa  79.3  0.0000000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal  0.93667 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2665  protein of unknown function DUF894, DitE  28.32 
 
 
542 aa  79.3  0.0000000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0627895  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3460  major facilitator transporter  26.16 
 
 
421 aa  79.3  0.0000000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0454626  hitchhiker  0.00919031 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3881  major facilitator transporter  26.96 
 
 
509 aa  79.3  0.0000000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0490  major facilitator superfamily MFS_1  28.39 
 
 
461 aa  78.2  0.0000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0087  major facilitator transporter  24.86 
 
 
436 aa  78.6  0.0000000000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0091  major facilitator superfamily MFS_1  24.16 
 
 
442 aa  78.6  0.0000000000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>