94 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ksed_05630 on replicon NC_013169
Organism: Kytococcus sedentarius DSM 20547



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013169  Ksed_05630  arabinose efflux permease family protein  100 
 
 		 478 aa  904    Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.264902  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_05600  Major Facilitator Superfamily transporter  33.95 
 
 		 439 aa  156  9e-37  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.37691  normal  0.94686 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3357  major facilitator transporter  31.09 
 
 		 496 aa  118  1.9999999999999998e-25  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1226  major facilitator superfamily MFS_1  27.69 
 
 		 423 aa  72.8  0.00000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.403066 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1491  major facilitator transporter  20.92 
 
 		 390 aa  70.5  0.00000000007  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.326017  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1445  major facilitator transporter  20.92 
 
 		 390 aa  70.5  0.00000000007  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00616907  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1420  major facilitator superfamily MFS_1  25.46 
 
 		 420 aa  63.9  0.000000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3206  major facilitator transporter  26.33 
 
 		 413 aa  62.8  0.00000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.130501  normal  0.812744 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3031  major facilitator transporter  25 
 
 		 420 aa  63.2  0.00000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0036629 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4652  major facilitator superfamily MFS_1  28.4 
 
 		 406 aa  62  0.00000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0786  major facilitator transporter  28.09 
 
 		 406 aa  61.6  0.00000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0293  major facilitator transporter  22.2 
 
 		 413 aa  61.2  0.00000004  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.603169  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4311  major facilitator transporter  25.91 
 
 		 413 aa  60.8  0.00000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.481156  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4055  major facilitator transporter  25.91 
 
 		 413 aa  60.8  0.00000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4646  major facilitator transporter  28.09 
 
 		 409 aa  60.1  0.00000008  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_49890  membrame protein  25.93 
 
 		 454 aa  60.1  0.00000009  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4514  major facilitator transporter  28.09 
 
 		 406 aa  59.3  0.0000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8887  hypothetical protein  27.16 
 
 		 413 aa  58.9  0.0000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.889317 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1221  major facilitator transporter  25.41 
 
 		 451 aa  58.5  0.0000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0719879 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0365  major facilitator transporter  27.95 
 
 		 427 aa  57  0.0000007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0592694 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2952  major facilitator transporter  24.27 
 
 		 405 aa  56.6  0.0000008  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1278  major facilitator superfamily MFS_1  24.51 
 
 		 450 aa  55.8  0.000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1484  major facilitator transporter  24.39 
 
 		 406 aa  56.6  0.000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.178978  normal  0.0348378 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0844  major facilitator superfamily MFS_1  25.7 
 
 		 403 aa  55.5  0.000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2492  putative ABC transporter, permease protein  21.48 
 
 		 420 aa  55.5  0.000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.214398  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4337  major facilitator transporter  27.08 
 
 		 414 aa  55.5  0.000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4481  major facilitator transporter  24.56 
 
 		 416 aa  55.1  0.000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.646656  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5006  major facilitator transporter  24.78 
 
 		 416 aa  55.1  0.000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.641572  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7222  major facilitator transporter  28.38 
 
 		 441 aa  54.3  0.000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.237478  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2393  ABC transporter permease  22.22 
 
 		 393 aa  53.5  0.000008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0938241  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0691  major facilitator transporter  27.16 
 
 		 428 aa  53.5  0.000009  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.877498 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2227  ABC transporter permease  21.86 
 
 		 386 aa  52.8  0.00001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.401248  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2149  ABC transporter permease  26.76 
 
 		 393 aa  53.1  0.00001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00681394  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5268  MFS family transporter  26.28 
 
 		 403 aa  52.4  0.00002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2102  major facilitator transporter  27.08 
 
 		 427 aa  52.4  0.00002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0117925  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1991  major facilitator superfamily MFS_1  25.23 
 
 		 450 aa  52.8  0.00002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.762129  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3573  major facilitator transporter  24.89 
 
 		 416 aa  52.4  0.00002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_61170  putative transmembrane protein  25.9 
 
 		 403 aa  51.6  0.00003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0098  major facilitator superfamily MFS_1  30.93 
 
 		 428 aa  51.2  0.00004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2820  major facilitator superfamily MFS_1  27.3 
 
 		 421 aa  51.2  0.00004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.549151  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2435  putative ABC transporter, permease protein  20.31 
 
 		 414 aa  51.2  0.00004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.70932  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0118  major facilitator superfamily MFS_1  21.22 
 
 		 425 aa  50.8  0.00005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0830  major facilitator superfamily MFS_1  24.73 
 
 		 422 aa  50.8  0.00005  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0559019  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1539  major facilitator transporter  21.15 
 
 		 412 aa  51.2  0.00005  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  unclonable  0.000000151531  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2814  major facilitator superfamily MFS_1  26.19 
 
 		 402 aa  50.4  0.00006  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3970  protein of unknown function DUF894 DitE  28.48 
 
 		 535 aa  50.4  0.00007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0792  major facilitator transporter  25.7 
 
 		 450 aa  50.4  0.00007  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2286  major facilitator transporter  20.37 
 
 		 414 aa  50.4  0.00007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0407537  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1662  major facilitator superfamily MFS_1  21.15 
 
 		 405 aa  49.7  0.0001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4894  hypothetical protein  25.98 
 
 		 412 aa  49.3  0.0001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2101  major facilitator superfamily MFS_1  26.22 
 
 		 479 aa  49.3  0.0001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2576  putative ABC transporter, permease protein  19.58 
 
 		 415 aa  49.3  0.0002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00174173  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1952  major facilitator superfamily MFS_1  22.11 
 
 		 418 aa  48.9  0.0002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0331  major facilitator transporter  24.12 
 
 		 412 aa  48.5  0.0002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0801  major facilitator superfamily MFS_1  32 
 
 		 442 aa  48.9  0.0002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.469185 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2511  ABC transporter, permease protein, putative  20.11 
 
 		 414 aa  48.1  0.0003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00150223  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3926  major facilitator transporter  26.88 
 
 		 457 aa  48.1  0.0003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4889  major facilitator transporter  26.53 
 
 		 449 aa  47.8  0.0005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.295208 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_05410  arabinose efflux permease family protein  25.45 
 
 		 429 aa  47.4  0.0006  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0915887  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2423  ABC transporter, permease protein, putative  25.35 
 
 		 409 aa  47.4  0.0006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.162731  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3299  major facilitator transporter  25.17 
 
 		 416 aa  46.6  0.001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.174226  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5069  major facilitator transporter  25.17 
 
 		 416 aa  46.6  0.001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4222  major facilitator transporter  24.69 
 
 		 432 aa  46.6  0.001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.399211  hitchhiker  0.00102981 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1747  major facilitator superfamily MFS_1  24.93 
 
 		 463 aa  45.4  0.002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.192343  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5813  major facilitator superfamily MFS_1  24.36 
 
 		 446 aa  45.8  0.002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.243583  normal  0.354769 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5216  major facilitator transporter  25.26 
 
 		 416 aa  45.4  0.002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6746  hypothetical protein  35.54 
 
 		 427 aa  45.4  0.002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.869375  normal  0.283343 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21930  major facilitator superfamily MFS_1  18.25 
 
 		 432 aa  45.1  0.003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1731  permease  28.26 
 
 		 422 aa  45.1  0.003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1607  permease  28.26 
 
 		 422 aa  45.1  0.003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.137367  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2501  putative ABC transporter, permease protein  19.84 
 
 		 415 aa  45.1  0.003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1559  major facilitator transporter  21.3 
 
 		 412 aa  45.1  0.003  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.00000341731  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3705  major facilitator superfamily MFS_1  23.85 
 
 		 411 aa  45.1  0.003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.224607  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0768  major facilitator superfamily MFS_1  24.73 
 
 		 456 aa  45.1  0.003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4751  major facilitator superfamily protein  26.2 
 
 		 421 aa  45.1  0.003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.092373  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2273  permease; macrolide-efflux protein  19.84 
 
 		 417 aa  44.7  0.004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00046211  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2418  major facilitator superfamily MFS_1  24.54 
 
 		 412 aa  44.7  0.004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.269173 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0234  major facilitator superfamily MFS_1  26.44 
 
 		 442 aa  44.7  0.004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4296  major facilitator transporter  22.7 
 
 		 416 aa  44.3  0.005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.970953 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1206  major facilitator transporter  26.89 
 
 		 408 aa  44.3  0.005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.208797  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2641  major facilitator transporter  26.21 
 
 		 499 aa  44.3  0.006  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.893021  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0743  major facilitator transporter  30.68 
 
 		 410 aa  43.9  0.006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2480  ABC transporter permease  19.84 
 
 		 415 aa  43.9  0.007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0926781  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2305  ABC transporter permease  19.84 
 
 		 417 aa  43.9  0.007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0193471  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0598  major facilitator transporter  23.43 
 
 		 427 aa  43.9  0.007  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  unclonable  0.00000000170409  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0972  major facilitator transporter  26.89 
 
 		 408 aa  43.5  0.008  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.619052  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1023  major facilitator transporter  26.89 
 
 		 408 aa  43.5  0.008  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3278  major facilitator transporter  27.55 
 
 		 415 aa  43.5  0.008  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.471566  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3856  major facilitator transporter  28.57 
 
 		 405 aa  43.5  0.008  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.437041  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0875  major facilitator superfamily MFS_1  27.88 
 
 		 441 aa  43.5  0.008  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  hitchhiker  0.00780765  normal  0.0882707 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3679  major facilitator superfamily MFS_1  35.68 
 
 		 410 aa  43.5  0.008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.709991  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3145  major facilitator superfamily MFS_1  28.31 
 
 		 440 aa  43.5  0.009  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.985088  normal  0.131643 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2685  major facilitator superfamily MFS_1  23.26 
 
 		 406 aa  43.1  0.01  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.188987  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2699  permease, putative  20.98 
 
 		 410 aa  43.1  0.01  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.000249599  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>