More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_6746 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013595  Sros_6746  hypothetical protein  100 
 
 		 427 aa  801    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.869375  normal  0.283343 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0719  hypothetical protein  50.49 
 
 		 418 aa  348  1e-94  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.384757  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1671  putative transporter  50.25 
 
 		 418 aa  347  2e-94  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1705  putative transporter  50.25 
 
 		 418 aa  347  2e-94  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.167293  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1912  putative transporter  50.25 
 
 		 417 aa  347  2e-94  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0586  putative transporter  50.25 
 
 		 417 aa  347  2e-94  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2244  major facilitator transporter  50.5 
 
 		 397 aa  342  1e-92  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2325  major facilitator superfamily permease  50.25 
 
 		 397 aa  340  2e-92  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0197346  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2429  major facilitator superfamily MFS_1  57.53 
 
 		 418 aa  317  3e-85  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.945021  normal  0.699098 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0671  major facilitator transporter  46.26 
 
 		 456 aa  304  2.0000000000000002e-81  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0656  major facilitator transporter  43.64 
 
 		 435 aa  223  4e-57  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2064  major facilitator transporter  40.42 
 
 		 426 aa  216  7e-55  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.230072 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2261  major facilitator superfamily MFS_1  40.49 
 
 		 411 aa  194  2e-48  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.484467 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4222  major facilitator transporter  35.28 
 
 		 432 aa  169  9e-41  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.399211  hitchhiker  0.00102981 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8782  major facilitator superfamily MFS_1  35.01 
 
 		 429 aa  156  8e-37  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.753165 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2409  major facilitator transporter  35.36 
 
 		 402 aa  150  5e-35  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0925995  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7391  major facilitator transporter  35.36 
 
 		 434 aa  148  2.0000000000000003e-34  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.671193  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0417  major facilitator transporter  33.97 
 
 		 420 aa  141  1.9999999999999998e-32  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00934872 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3773  major facilitator superfamily MFS_1  39.73 
 
 		 420 aa  137  3.0000000000000003e-31  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.159588  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4215  major facilitator superfamily MFS_1  33.58 
 
 		 467 aa  135  1.9999999999999998e-30  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.251159  normal  0.128113 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_05030  Major Facilitator Superfamily transporter  32.72 
 
 		 414 aa  134  3e-30  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2820  major facilitator superfamily MFS_1  30.56 
 
 		 421 aa  131  3e-29  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.549151  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0419  major facilitator transporter  30.98 
 
 		 416 aa  129  1.0000000000000001e-28  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_01200  Major Facilitator Superfamily transporter  35.9 
 
 		 411 aa  128  2.0000000000000002e-28  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.780735  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4165  major facilitator transporter  33.71 
 
 		 416 aa  127  3e-28  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0148559  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7428  antibiotic efflux protein  33.68 
 
 		 406 aa  125  2e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0620213 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3278  major facilitator transporter  32.34 
 
 		 415 aa  124  4e-27  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.471566  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0347  major facilitator transporter  34.06 
 
 		 425 aa  123  6e-27  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0234  major facilitator superfamily MFS_1  32.07 
 
 		 442 aa  117  3e-25  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0236  major facilitator transporter  37.89 
 
 		 402 aa  117  3e-25  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00072705 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1093  major facilitator superfamily MFS_1  32.35 
 
 		 408 aa  115  2.0000000000000002e-24  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.400006 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2962  major facilitator superfamily MFS_1  33.33 
 
 		 461 aa  112  1.0000000000000001e-23  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.470581  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1603  major facilitator superfamily MFS_1  31.23 
 
 		 432 aa  112  2.0000000000000002e-23  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0347546  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_27630  arabinose efflux permease family protein  33.42 
 
 		 417 aa  110  4.0000000000000004e-23  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4659  MFS family multidrug resistance protein  34.59 
 
 		 408 aa  108  1e-22  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2910  major facilitator superfamily MFS_1  27.58 
 
 		 439 aa  108  2e-22  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.346093  normal  0.416861 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0258  major facilitator superfamily MFS_1  29.95 
 
 		 451 aa  108  3e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.305305 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4989  hypothetical protein  30.03 
 
 		 342 aa  106  6e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0208  hypothetical protein  39.51 
 
 		 289 aa  106  9e-22  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6664  major facilitator transporter  30.83 
 
 		 414 aa  105  2e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.740991 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7785  major facilitator superfamily MFS_1  30.49 
 
 		 420 aa  104  4e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.157303 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8013  major facilitator transporter  31.34 
 
 		 408 aa  103  6e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0578  major facilitator transporter  25.54 
 
 		 413 aa  98.6  2e-19  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0133344  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1193  major facilitator superfamily MFS_1  30.03 
 
 		 412 aa  98.2  2e-19  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0593  major facilitator transporter  25.54 
 
 		 413 aa  98.6  2e-19  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.00370301  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1452  major facilitator family transporter  34.32 
 
 		 415 aa  98.2  3e-19  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0516  major facilitator superfamily MFS_1  28 
 
 		 420 aa  96.3  9e-19  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5351  major facilitator superfamily MFS_1  31.72 
 
 		 401 aa  95.9  1e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.804378  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2600  hypothetical protein  34.05 
 
 		 415 aa  95.9  1e-18  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4370  transporter, major facilitator family  28.07 
 
 		 410 aa  94  4e-18  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  5.0052999999999995e-22 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1367  major facilitator family transporter  34.05 
 
 		 415 aa  94.4  4e-18  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3134  major facilitator superfamily MFS_1  34.78 
 
 		 417 aa  94  5e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5006  major facilitator transporter  33.09 
 
 		 416 aa  93.6  6e-18  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.641572  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4481  major facilitator transporter  33.09 
 
 		 416 aa  92.4  1e-17  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.646656  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3573  major facilitator transporter  32.97 
 
 		 416 aa  92.8  1e-17  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1230  putative transporter  33.78 
 
 		 378 aa  92  2e-17  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1420  major facilitator superfamily MFS_1  31.53 
 
 		 420 aa  91.7  2e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2540  major facilitator superfamily MFS_1  29.03 
 
 		 430 aa  91.7  2e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3031  major facilitator transporter  31.53 
 
 		 420 aa  91.7  2e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0036629 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0199  putative transporter  33.78 
 
 		 378 aa  92  2e-17  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0474  putative transporter  33.78 
 
 		 378 aa  92  2e-17  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2968  major facilitator superfamily MFS_1  32.87 
 
 		 441 aa  91.3  3e-17  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0982222 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1600  major facilitator transporter  22.42 
 
 		 405 aa  91.3  3e-17  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1968  major facilitator superfamily MFS_1  34.75 
 
 		 405 aa  91.3  3e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00000336752  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1568  major facilitator transporter  22.42 
 
 		 405 aa  91.3  3e-17  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4170  major facilitator superfamily MFS_1  32.87 
 
 		 420 aa  89.4  1e-16  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1491  major facilitator transporter  24.85 
 
 		 390 aa  89.4  1e-16  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.326017  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1445  major facilitator transporter  24.85 
 
 		 390 aa  89.4  1e-16  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00616907  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0365  major facilitator transporter  31 
 
 		 427 aa  89.4  1e-16  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0592694 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4282  major facilitator superfamily MFS_1  32.87 
 
 		 420 aa  89.4  1e-16  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.522642 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3061  major facilitator superfamily MFS_1  32.89 
 
 		 429 aa  87.4  4e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  decreased coverage  0.00310805  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0189  major facilitator superfamily MFS_1  25.06 
 
 		 426 aa  86.3  0.000000000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0572831  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4378  major facilitator transporter  28.29 
 
 		 431 aa  85.1  0.000000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4491  major facilitator superfamily MFS_1  31.62 
 
 		 423 aa  85.5  0.000000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.783622  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2902  major facilitator superfamily MFS_1  31.16 
 
 		 406 aa  84  0.000000000000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.21173  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3299  major facilitator transporter  33.33 
 
 		 416 aa  84  0.000000000000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.174226  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5069  major facilitator transporter  33.33 
 
 		 416 aa  84  0.000000000000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5406  major facilitator superfamily MFS_1  30.05 
 
 		 444 aa  83.2  0.000000000000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.283217 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0074  major facilitator superfamily MFS_1  23.37 
 
 		 410 aa  83.2  0.000000000000008  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.147937  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0062  major facilitator superfamily MFS_1  27.85 
 
 		 440 aa  82.4  0.00000000000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.175422  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5216  major facilitator transporter  33.33 
 
 		 416 aa  82.8  0.00000000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1221  major facilitator transporter  31.82 
 
 		 451 aa  82  0.00000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0719879 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5398  major facilitator superfamily MFS_1  31.27 
 
 		 401 aa  81.6  0.00000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.154835  normal  0.293524 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0591  hypothetical protein  31.97 
 
 		 416 aa  80.5  0.00000000000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_49890  membrame protein  33.61 
 
 		 454 aa  79.7  0.00000000000008  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1728  major facilitator superfamily MFS_1  30.87 
 
 		 417 aa  80.1  0.00000000000008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2392  major facilitator superfamily MFS_1  28.61 
 
 		 415 aa  79.3  0.0000000000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.000384037  normal  0.689164 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4151  MFS permease  27.38 
 
 		 410 aa  78.6  0.0000000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1438  major facilitator superfamily MFS_1  31.13 
 
 		 416 aa  79  0.0000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3284  major facilitator transporter  28.35 
 
 		 403 aa  78.6  0.0000000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6539  major facilitator superfamily MFS_1  29.64 
 
 		 415 aa  79  0.0000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.6945  normal  0.0125799 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0369  major facilitator transporter  24.49 
 
 		 418 aa  78.6  0.0000000000002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.616869  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0087  major facilitator transporter  27.51 
 
 		 436 aa  79  0.0000000000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4656  hypothetical protein  29.29 
 
 		 427 aa  77.4  0.0000000000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0743  major facilitator transporter  28.84 
 
 		 410 aa  77.8  0.0000000000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0053  transporter, putative  27.94 
 
 		 431 aa  77.4  0.0000000000005  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0691  major facilitator transporter  28.9 
 
 		 428 aa  77  0.0000000000006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.877498 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1864  putative transporter  26.86 
 
 		 420 aa  77  0.0000000000006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.42079e-47 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1630  transporter  26.86 
 
 		 420 aa  76.6  0.0000000000007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0395  permease  27.48 
 
 		 430 aa  76.6  0.0000000000007  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0177527  normal  0.113221 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>