More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_4222 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013595  Sros_4222  major facilitator transporter  100 
 
 		 432 aa  840    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.399211  hitchhiker  0.00102981 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2409  major facilitator transporter  53.35 
 
 		 402 aa  346  4e-94  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0925995  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0234  major facilitator superfamily MFS_1  47.22 
 
 		 442 aa  301  1e-80  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2820  major facilitator superfamily MFS_1  42.36 
 
 		 421 aa  294  3e-78  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.549151  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0417  major facilitator transporter  43.03 
 
 		 420 aa  293  6e-78  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00934872 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1093  major facilitator superfamily MFS_1  44.42 
 
 		 408 aa  282  7.000000000000001e-75  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.400006 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3278  major facilitator transporter  44.42 
 
 		 415 aa  279  7e-74  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.471566  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0347  major facilitator transporter  42.71 
 
 		 425 aa  264  2e-69  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1603  major facilitator superfamily MFS_1  40.77 
 
 		 432 aa  258  2e-67  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0347546  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1968  major facilitator superfamily MFS_1  46.06 
 
 		 405 aa  254  2.0000000000000002e-66  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00000336752  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_05030  Major Facilitator Superfamily transporter  36.94 
 
 		 414 aa  237  3e-61  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0656  major facilitator transporter  40.05 
 
 		 435 aa  216  5.9999999999999996e-55  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2064  major facilitator transporter  37.62 
 
 		 426 aa  196  5.000000000000001e-49  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.230072 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2261  major facilitator superfamily MFS_1  38.62 
 
 		 411 aa  196  7e-49  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.484467 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0419  major facilitator transporter  37.64 
 
 		 416 aa  187  3e-46  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8782  major facilitator superfamily MFS_1  35.14 
 
 		 429 aa  180  4e-44  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.753165 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_01200  Major Facilitator Superfamily transporter  34.53 
 
 		 411 aa  179  1e-43  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.780735  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0258  major facilitator superfamily MFS_1  32.13 
 
 		 451 aa  176  8e-43  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.305305 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4165  major facilitator transporter  35.57 
 
 		 416 aa  175  9.999999999999999e-43  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0148559  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0236  major facilitator transporter  39.71 
 
 		 402 aa  172  1e-41  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00072705 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7391  major facilitator transporter  35.48 
 
 		 434 aa  172  2e-41  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.671193  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7428  antibiotic efflux protein  36.6 
 
 		 406 aa  161  2e-38  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0620213 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0208  hypothetical protein  41.04 
 
 		 289 aa  148  2.0000000000000003e-34  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2429  major facilitator superfamily MFS_1  35.21 
 
 		 418 aa  146  9e-34  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.945021  normal  0.699098 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3773  major facilitator superfamily MFS_1  34.22 
 
 		 420 aa  142  8e-33  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.159588  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0365  major facilitator transporter  31.75 
 
 		 427 aa  140  6e-32  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0592694 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0671  major facilitator transporter  30.03 
 
 		 456 aa  139  7.999999999999999e-32  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0516  major facilitator superfamily MFS_1  29.61 
 
 		 420 aa  136  6.0000000000000005e-31  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1671  putative transporter  28.42 
 
 		 418 aa  133  6e-30  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0719  hypothetical protein  28.42 
 
 		 418 aa  133  6e-30  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.384757  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0586  putative transporter  28.42 
 
 		 417 aa  133  6e-30  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1705  putative transporter  28.42 
 
 		 418 aa  133  6e-30  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.167293  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1912  putative transporter  28.42 
 
 		 417 aa  133  6e-30  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2244  major facilitator transporter  28.29 
 
 		 397 aa  132  1.0000000000000001e-29  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2325  major facilitator superfamily permease  28.29 
 
 		 397 aa  131  2.0000000000000002e-29  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0197346  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2910  major facilitator superfamily MFS_1  28.41 
 
 		 439 aa  129  1.0000000000000001e-28  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.346093  normal  0.416861 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4215  major facilitator superfamily MFS_1  35.32 
 
 		 467 aa  128  2.0000000000000002e-28  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.251159  normal  0.128113 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2962  major facilitator superfamily MFS_1  32.23 
 
 		 461 aa  127  3e-28  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.470581  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6746  hypothetical protein  34.99 
 
 		 427 aa  126  6e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.869375  normal  0.283343 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0578  major facilitator transporter  27.35 
 
 		 413 aa  124  3e-27  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0133344  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0593  major facilitator transporter  27.35 
 
 		 413 aa  124  3e-27  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.00370301  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1272  major facilitator transporter  26.15 
 
 		 418 aa  121  3e-26  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0074  major facilitator superfamily MFS_1  27.25 
 
 		 410 aa  120  6e-26  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.147937  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5351  major facilitator superfamily MFS_1  34.96 
 
 		 401 aa  118  1.9999999999999998e-25  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.804378  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1600  major facilitator transporter  23.48 
 
 		 405 aa  117  3e-25  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1568  major facilitator transporter  23.48 
 
 		 405 aa  117  3e-25  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8013  major facilitator transporter  30.18 
 
 		 408 aa  115  2.0000000000000002e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0476  major facilitator transporter  31 
 
 		 474 aa  114  5e-24  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3228  hypothetical protein  27.32 
 
 		 405 aa  112  1.0000000000000001e-23  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.65431  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4481  major facilitator transporter  27.78 
 
 		 416 aa  110  4.0000000000000004e-23  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.646656  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2101  major facilitator superfamily MFS_1  27.81 
 
 		 447 aa  109  9.000000000000001e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_27630  arabinose efflux permease family protein  27.6 
 
 		 417 aa  109  1e-22  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0786  major facilitator transporter  27.07 
 
 		 406 aa  108  1e-22  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5006  major facilitator transporter  27.22 
 
 		 416 aa  108  2e-22  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.641572  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2668  protein of unknown function DUF894, DitE  26.02 
 
 		 541 aa  106  8e-22  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4514  major facilitator transporter  27.07 
 
 		 406 aa  104  2e-21  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1747  major facilitator superfamily MFS_1  30.83 
 
 		 463 aa  105  2e-21  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.192343  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4652  major facilitator superfamily MFS_1  27.07 
 
 		 406 aa  104  3e-21  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1399  major facilitator transporter  31.48 
 
 		 360 aa  103  4e-21  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.41856  normal  0.33149 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2326  major facilitator superfamily MFS_1  24.06 
 
 		 410 aa  103  6e-21  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4646  major facilitator transporter  27.07 
 
 		 409 aa  103  6e-21  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5406  major facilitator superfamily MFS_1  29.01 
 
 		 444 aa  103  6e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.283217 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3573  major facilitator transporter  27.2 
 
 		 416 aa  103  6e-21  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0684  major facilitator transporter  25.27 
 
 		 412 aa  103  8e-21  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00476606  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6664  major facilitator transporter  26.78 
 
 		 414 aa  102  1e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.740991 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21930  major facilitator superfamily MFS_1  26.87 
 
 		 432 aa  102  1e-20  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0395  permease  24.93 
 
 		 430 aa  101  3e-20  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0177527  normal  0.113221 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1677  hypothetical protein  28.49 
 
 		 435 aa  100  4e-20  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4370  transporter, major facilitator family  24.63 
 
 		 410 aa  100  6e-20  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  5.0052999999999995e-22 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0189  major facilitator superfamily MFS_1  24.66 
 
 		 426 aa  100  7e-20  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0572831  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5278  hypothetical protein  26.84 
 
 		 408 aa  99.8  1e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.306023  normal  0.251543 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1000  hypothetical protein  29.02 
 
 		 418 aa  99  1e-19  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00447157 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0736  protein of unknown function DUF894, DitE  28.85 
 
 		 539 aa  99.4  1e-19  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0087  major facilitator transporter  27.2 
 
 		 436 aa  99  1e-19  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2582  permease, putative  26.16 
 
 		 408 aa  99  2e-19  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4269  major facilitator transporter  26.46 
 
 		 436 aa  99  2e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.935574 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6327  major facilitator transporter  29.95 
 
 		 461 aa  98.2  2e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.400788 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0842  protein of unknown function DUF894 DitE  27.35 
 
 		 586 aa  98.2  3e-19  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2631  putative permease  26.43 
 
 		 408 aa  98.2  3e-19  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0615976  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0234  protein of unknown function DUF894, DitE  27.12 
 
 		 419 aa  98.2  3e-19  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3460  major facilitator transporter  27.14 
 
 		 421 aa  98.2  3e-19  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0454626  hitchhiker  0.00919031 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1012  protein of unknown function DUF894, DitE  27.12 
 
 		 409 aa  97.4  4e-19  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.171336 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0490  major facilitator superfamily MFS_1  28.07 
 
 		 461 aa  97.1  5e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0124  major facilitator transporter  26.76 
 
 		 403 aa  97.1  5e-19  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.137137  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1684  transporter  27.04 
 
 		 420 aa  96.7  7e-19  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1819  transporter  27.04 
 
 		 420 aa  96.7  7e-19  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000952932  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5216  major facilitator transporter  27.5 
 
 		 416 aa  96.7  8e-19  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0691  major facilitator transporter  28.14 
 
 		 428 aa  96.3  9e-19  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.877498 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3299  major facilitator transporter  27.22 
 
 		 416 aa  95.9  1e-18  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.174226  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3061  major facilitator superfamily MFS_1  28.72 
 
 		 429 aa  96.3  1e-18  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  decreased coverage  0.00310805  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5069  major facilitator transporter  27.22 
 
 		 416 aa  95.9  1e-18  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1864  putative transporter  27.04 
 
 		 420 aa  95.9  1e-18  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.42079e-47 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3970  protein of unknown function DUF894 DitE  28.88 
 
 		 535 aa  95.1  2e-18  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7785  major facilitator superfamily MFS_1  28.11 
 
 		 420 aa  95.1  2e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.157303 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5814  major facilitator superfamily MFS_1  26.24 
 
 		 423 aa  94.4  3e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.915234  hitchhiker  0.00491963 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2355  macrolide-efflux protein  26.78 
 
 		 408 aa  94.7  3e-18  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000199839  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2318  macrolide-efflux protein  26.16 
 
 		 408 aa  94.7  3e-18  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.31097  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5163  protein of unknown function DUF894, DitE  29.64 
 
 		 530 aa  94  4e-18  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0799644 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4491  major facilitator superfamily MFS_1  28.49 
 
 		 423 aa  94  4e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.783622  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6250  major facilitator superfamily MFS_1  25 
 
 		 433 aa  93.6  5e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.220883  normal  0.159364 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>