More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_3679 on replicon NC_014210
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014210  Ndas_3679  major facilitator superfamily MFS_1  100 
 
 		 410 aa  775    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.709991  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1864  major facilitator transporter  43.99 
 
 		 417 aa  322  7e-87  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.436032 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0885  major facilitator transporter  40.2 
 
 		 415 aa  255  9e-67  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0062  putative membrane transport protein  40.26 
 
 		 418 aa  236  5.0000000000000005e-61  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.640827  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0062  major facilitator superfamily protein  39.07 
 
 		 431 aa  204  2e-51  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.378864  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4138  major facilitator superfamily MFS_1  37.97 
 
 		 435 aa  193  4e-48  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.496821  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3061  major facilitator superfamily MFS_1  37.14 
 
 		 429 aa  192  1e-47  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  decreased coverage  0.00310805  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4528  major facilitator superfamily MFS_1  35.1 
 
 		 409 aa  173  5.999999999999999e-42  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.392098 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0805  major facilitator superfamily MFS_1  32.87 
 
 		 459 aa  164  3e-39  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5208  major facilitator superfamily MFS_1  37.3 
 
 		 432 aa  160  5e-38  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.377398  normal  0.900425 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1864  putative transporter  28.5 
 
 		 420 aa  146  6e-34  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.42079e-47 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1684  transporter  28.5 
 
 		 420 aa  145  1e-33  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1819  transporter  28.5 
 
 		 420 aa  145  1e-33  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000952932  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1630  transporter  28.5 
 
 		 420 aa  144  3e-33  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1940  putative transporter  28.75 
 
 		 420 aa  141  1.9999999999999998e-32  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000531086  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1892  transporter, putative  28.75 
 
 		 420 aa  140  4.999999999999999e-32  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0166254  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3515  putative transporter  28.25 
 
 		 420 aa  139  7.999999999999999e-32  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1827  putative transporter  28.14 
 
 		 420 aa  137  4e-31  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0534  hypothetical protein  30.03 
 
 		 412 aa  132  1.0000000000000001e-29  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5551  major facilitator superfamily MFS_1  29.92 
 
 		 420 aa  124  2e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.138486  normal  0.597938 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4585  putative membrane transport protein  31.62 
 
 		 403 aa  119  9.999999999999999e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.00668253  normal  0.163129 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1486  major facilitator transporter  30.87 
 
 		 420 aa  119  9.999999999999999e-26  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.467645  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0056  major facilitator superfamily MFS_1  28.88 
 
 		 433 aa  116  6e-25  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0091  major facilitator superfamily MFS_1  29.26 
 
 		 442 aa  103  4e-21  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0801  major facilitator superfamily MFS_1  31.44 
 
 		 442 aa  100  3e-20  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.469185 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4580  H+ antiporter protein  29.46 
 
 		 443 aa  100  7e-20  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.120622 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0087  major facilitator transporter  28.72 
 
 		 436 aa  99.8  8e-20  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0053  transporter, putative  27.46 
 
 		 431 aa  99.4  1e-19  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0536  major facilitator superfamily MFS_1  30.21 
 
 		 432 aa  98.2  2e-19  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.187699  hitchhiker  0.000017573 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0062  major facilitator superfamily MFS_1  29.04 
 
 		 440 aa  97.4  4e-19  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.175422  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1904  amino acid adenylation domain-containing protein  23.5 
 
 		 1833 aa  97.4  4e-19  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.844763  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0532  major facilitator superfamily MFS_1  29.55 
 
 		 428 aa  95.5  1e-18  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_2010  transporter, putative  26.79 
 
 		 429 aa  95.5  1e-18  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3952  major facilitator transporter  30.64 
 
 		 413 aa  94.7  3e-18  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0564  major facilitator superfamily MFS_1  30.67 
 
 		 439 aa  93.6  5e-18  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.60112  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0024  macrolide-efflux protein  25.71 
 
 		 397 aa  92.4  1e-17  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.0413389 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3575  major facilitator superfamily MFS_1  30.32 
 
 		 416 aa  92.8  1e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0210  major facilitator superfamily MFS_1  29.89 
 
 		 476 aa  92.4  1e-17  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4617  major facilitator superfamily MFS_1  29.31 
 
 		 455 aa  90.9  3e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.117227  hitchhiker  0.000601374 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5239  macrolide-efflux protein  25.06 
 
 		 397 aa  90.9  4e-17  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0427  transporter, putative  22.37 
 
 		 412 aa  90.5  5e-17  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_14790  Major Facilitator Superfamily transporter  30.55 
 
 		 464 aa  89.7  8e-17  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.13794 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4147  H+ antiporter protein  28.95 
 
 		 424 aa  89.7  9e-17  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4301  H+ antiporter protein  28.95 
 
 		 424 aa  89.7  9e-17  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.100469  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1664  permease; tetracycline resistance determinant  34.74 
 
 		 194 aa  88.6  2e-16  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1062  major facilitator superfamily MFS_1  30.62 
 
 		 423 aa  88.6  2e-16  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.264864  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2707  macrolide efflux protein  23.27 
 
 		 406 aa  87.4  4e-16  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0968867  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0092  major facilitator superfamily MFS_1  31.68 
 
 		 414 aa  87.4  4e-16  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.031642  normal  0.214383 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3024  putative permease  22.59 
 
 		 406 aa  86.3  8e-16  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4370  transporter, major facilitator family  22.05 
 
 		 410 aa  85.5  0.000000000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  5.0052999999999995e-22 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0310  major facilitator transporter  29.72 
 
 		 443 aa  84.3  0.000000000000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1974  hypothetical protein  25.79 
 
 		 424 aa  83.6  0.000000000000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.00936884  normal  0.989231 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2255  putative permease  23.02 
 
 		 404 aa  83.6  0.000000000000006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.134353 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3129  amino acid adenylation domain-containing protein  27.35 
 
 		 1816 aa  83.2  0.000000000000008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.975665  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2777  permease  23.02 
 
 		 406 aa  82.4  0.00000000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.145309  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2988  permease  23.02 
 
 		 406 aa  82.4  0.00000000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0684  major facilitator transporter  24.68 
 
 		 412 aa  82.8  0.00000000000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00476606  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2440  major facilitator superfamily MFS_1  32.17 
 
 		 424 aa  82  0.00000000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.293743  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3025  permease, putative  22.59 
 
 		 406 aa  81.3  0.00000000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.076608  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2726  macrolide efflux protein  22.76 
 
 		 406 aa  81.3  0.00000000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.277105  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2984  putative permease  22.74 
 
 		 404 aa  80.9  0.00000000000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000116191 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0752  transporter, putative  28.22 
 
 		 446 aa  80.1  0.00000000000007  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2435  putative ABC transporter, permease protein  27.03 
 
 		 414 aa  78.2  0.0000000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.70932  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1339  major facilitator superfamily MFS_1  30 
 
 		 429 aa  78.6  0.0000000000002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3626  major facilitator transporter  29.95 
 
 		 413 aa  79  0.0000000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.348332  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0395  permease  25.81 
 
 		 430 aa  79  0.0000000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0177527  normal  0.113221 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0593  major facilitator transporter  22.67 
 
 		 413 aa  77.4  0.0000000000004  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.00370301  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0578  major facilitator transporter  22.67 
 
 		 413 aa  77.4  0.0000000000004  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0133344  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1662  major facilitator superfamily MFS_1  21.43 
 
 		 405 aa  77  0.0000000000005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1114  major facilitator superfamily MFS_1  29.85 
 
 		 415 aa  77  0.0000000000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3442  major facilitator superfamily MFS_1  27.76 
 
 		 440 aa  76.6  0.0000000000007  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0102132  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0009  protein of unknown function DUF894, DitE  31.16 
 
 		 527 aa  76.6  0.0000000000007  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2511  ABC transporter, permease protein, putative  25.9 
 
 		 414 aa  75.9  0.000000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00150223  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0476  major facilitator transporter  30.99 
 
 		 474 aa  76.3  0.000000000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2576  putative ABC transporter, permease protein  26.56 
 
 		 415 aa  75.9  0.000000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00174173  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2989  putative permease  23.39 
 
 		 362 aa  75.5  0.000000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2679  major facilitator superfamily MFS_1  28.61 
 
 		 453 aa  73.9  0.000000000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.000000322743  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2286  major facilitator transporter  26.16 
 
 		 414 aa  72.8  0.000000000009  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0407537  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2384  major facilitator transporter  28.01 
 
 		 441 aa  72.8  0.00000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.930234  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1118  major facilitator superfamily MFS_1  25.2 
 
 		 406 aa  71.2  0.00000000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1000  hypothetical protein  28.5 
 
 		 418 aa  71.2  0.00000000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00447157 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1007  hypothetical protein  31.32 
 
 		 415 aa  71.2  0.00000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.767675  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0127  macrolide-efflux protein  27.34 
 
 		 412 aa  70.9  0.00000000004  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2100  major facilitator transporter  27.7 
 
 		 408 aa  70.9  0.00000000004  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1508  major facilitator superfamily permease  23.1 
 
 		 403 aa  70.5  0.00000000005  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0836  major facilitator superfamily MFS_1  30.77 
 
 		 443 aa  70.1  0.00000000006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4777  major facilitator superfamily MFS_1  28.79 
 
 		 414 aa  70.1  0.00000000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.881248  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0867  putative membrane transport protein  31.56 
 
 		 321 aa  70.1  0.00000000007  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0871  macrolide efflux protein, putative  27.09 
 
 		 394 aa  69.7  0.00000000009  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2480  ABC transporter permease  25.24 
 
 		 415 aa  69.7  0.00000000009  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0926781  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2501  putative ABC transporter, permease protein  25.48 
 
 		 415 aa  69.7  0.00000000009  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2305  ABC transporter permease  25.24 
 
 		 417 aa  69.3  0.0000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0193471  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2273  permease; macrolide-efflux protein  25.48 
 
 		 417 aa  69.3  0.0000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00046211  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4887  major facilitator superfamily MFS_1  31.47 
 
 		 424 aa  68.9  0.0000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0098  major facilitator superfamily MFS_1  26.95 
 
 		 428 aa  69.3  0.0000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3486  major facilitator transporter  31.12 
 
 		 450 aa  68.9  0.0000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.719238  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1991  major facilitator superfamily MFS_1  27.42 
 
 		 450 aa  69.7  0.0000000001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.762129  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4005  major facilitator superfamily MFS_1  30.37 
 
 		 442 aa  69.3  0.0000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.0701044 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5212  major facilitator superfamily MFS_1  28.89 
 
 		 408 aa  68.2  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0948922  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1272  major facilitator transporter  25.74 
 
 		 418 aa  68.9  0.0000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>