More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcav_0564 on replicon NC_012669
Organism: Beutenbergia cavernae DSM 12333



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012669  Bcav_0564  major facilitator superfamily MFS_1  100 
 
 
439 aa  860    Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.60112  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0536  major facilitator superfamily MFS_1  71.29 
 
 
432 aa  542  1e-153  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.187699  hitchhiker  0.000017573 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1011  major facilitator superfamily MFS_1  58.25 
 
 
458 aa  434  1e-120  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3442  major facilitator superfamily MFS_1  56.5 
 
 
440 aa  428  1e-118  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0102132  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1114  major facilitator superfamily MFS_1  48.96 
 
 
415 aa  380  1e-104  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5239  macrolide-efflux protein  46.12 
 
 
397 aa  340  2e-92  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1118  major facilitator superfamily MFS_1  44.53 
 
 
406 aa  337  1.9999999999999998e-91  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0024  macrolide-efflux protein  46.41 
 
 
397 aa  329  5.0000000000000004e-89  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.0413389 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0658  permease of the major facilitator superfamily  36.1 
 
 
485 aa  222  8e-57  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.590518  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1517  major facilitator superfamily MFS_1  30.53 
 
 
412 aa  202  9.999999999999999e-51  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.5366 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1250  major facilitator transporter  34.75 
 
 
425 aa  201  3e-50  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2526  H+ Antiporter protein  35.31 
 
 
411 aa  181  2e-44  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000735797  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1381  major facilitator superfamily MFS_1  28.28 
 
 
407 aa  175  9.999999999999999e-43  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000258845  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0872  H+ Antiporter protein  33.86 
 
 
405 aa  176  9.999999999999999e-43  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS05460  macrolide-efflux transmembrane protein  34.47 
 
 
450 aa  170  6e-41  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.810092  normal  0.114702 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2514  major facilitator superfamily MFS_1  30.21 
 
 
439 aa  166  1.0000000000000001e-39  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1904  amino acid adenylation domain-containing protein  28.5 
 
 
1833 aa  159  9e-38  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.844763  n/a   
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0001  major facilitator transporter  33.87 
 
 
434 aa  144  4e-33  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.51078  hitchhiker  0.00413697 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0871  macrolide efflux protein, putative  30.69 
 
 
394 aa  142  9.999999999999999e-33  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4328  major facilitator transporter  30.1 
 
 
430 aa  141  1.9999999999999998e-32  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3103  major facilitator superfamily MFS_1  26.89 
 
 
434 aa  138  2e-31  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  decreased coverage  0.00979206  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3019  major facilitator superfamily MFS_1  26.89 
 
 
434 aa  138  2e-31  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1747  major facilitator superfamily MFS_1  32.98 
 
 
463 aa  133  6.999999999999999e-30  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.192343  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3129  amino acid adenylation domain-containing protein  30.62 
 
 
1816 aa  131  2.0000000000000002e-29  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.975665  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2001  major facilitator transporter  27.66 
 
 
425 aa  131  2.0000000000000002e-29  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3179  major facilitator transporter  29.52 
 
 
445 aa  130  5.0000000000000004e-29  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.110331 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2925  major facilitator transporter  29.11 
 
 
425 aa  127  3e-28  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4661  major facilitator transporter  28.65 
 
 
454 aa  127  4.0000000000000003e-28  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.731341  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21930  major facilitator superfamily MFS_1  27.16 
 
 
432 aa  122  1.9999999999999998e-26  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_25090  Major facilitator superfamily transporter  30.51 
 
 
411 aa  122  1.9999999999999998e-26  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2407  major facilitator superfamily MFS_1  27 
 
 
437 aa  120  6e-26  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0245013  normal  0.811162 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2654  macrolide efflux protein, putative  26.87 
 
 
414 aa  119  9.999999999999999e-26  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0969  major facilitator superfamily permease  23.59 
 
 
410 aa  117  3.9999999999999997e-25  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00309098  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4706  major facilitator superfamily MFS_1  27.75 
 
 
445 aa  115  2.0000000000000002e-24  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal  0.93667 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6842  Non-ribosomal peptide synthetase modules and related protein-like protein  28.23 
 
 
1876 aa  111  2.0000000000000002e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.731708  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5433  major facilitator superfamily MFS_1  28.26 
 
 
417 aa  111  3e-23  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.317246  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0490  major facilitator superfamily MFS_1  27.79 
 
 
461 aa  111  3e-23  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4102  major facilitator transporter  27.54 
 
 
438 aa  109  8.000000000000001e-23  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.277859  normal  0.56542 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0193  major facilitator superfamily MFS_1  28.69 
 
 
448 aa  108  2e-22  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0593  major facilitator transporter  26.56 
 
 
413 aa  108  3e-22  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.00370301  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0578  major facilitator transporter  26.56 
 
 
413 aa  108  3e-22  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0133344  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1974  hypothetical protein  24.94 
 
 
424 aa  105  2e-21  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.00936884  normal  0.989231 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0532  major facilitator superfamily MFS_1  26.54 
 
 
428 aa  105  2e-21  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1862  putative permease  24.25 
 
 
422 aa  104  3e-21  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2046  hypothetical protein  25.27 
 
 
448 aa  104  3e-21  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.258697 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0692  major facilitator transporter  24.94 
 
 
439 aa  104  3e-21  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2208  Non-ribosomal peptide synthetase modules and related protein-like protein  26.8 
 
 
1829 aa  104  3e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.190766  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0491  major facilitator superfamily MFS_1  28.54 
 
 
424 aa  103  8e-21  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0087  major facilitator transporter  25.92 
 
 
436 aa  103  8e-21  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5583  Non-ribosomal peptide synthetase modules and related protein-like protein  28.57 
 
 
1806 aa  102  1e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.786514 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3450  major facilitator superfamily MFS_1  27.4 
 
 
499 aa  102  1e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00033474 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1782  putative permease  24.8 
 
 
422 aa  102  2e-20  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3334  Non-ribosomal peptide synthetase modules and related protein-like protein  30.28 
 
 
1776 aa  101  2e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.311515  normal  0.562431 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3679  major facilitator superfamily MFS_1  30.67 
 
 
410 aa  102  2e-20  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.709991  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3486  major facilitator transporter  27.47 
 
 
450 aa  101  2e-20  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.719238  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0369  major facilitator transporter  25.94 
 
 
418 aa  102  2e-20  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.616869  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30800  arabinose efflux permease family protein  29.35 
 
 
452 aa  101  3e-20  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1991  major facilitator superfamily MFS_1  26.43 
 
 
450 aa  101  3e-20  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.762129  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4889  major facilitator transporter  28.26 
 
 
449 aa  101  3e-20  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.295208 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1662  major facilitator superfamily MFS_1  23.11 
 
 
405 aa  101  3e-20  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3555  major facilitator superfamily MFS_1  25.23 
 
 
449 aa  100  4e-20  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.194127  normal  0.458265 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1607  major facilitator transporter  22.47 
 
 
422 aa  100  6e-20  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0422221  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1749  putative permease  24.8 
 
 
422 aa  99.8  9e-20  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1808  permease, putative  24.54 
 
 
422 aa  99.8  1e-19  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1607  permease  24.54 
 
 
422 aa  99.4  1e-19  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.137367  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1731  permease  24.54 
 
 
422 aa  99.4  1e-19  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3926  major facilitator transporter  26.51 
 
 
457 aa  99.4  1e-19  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1559  multidrug resistance protein; tetracycline resistance determinant  24.28 
 
 
422 aa  99  2e-19  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.285528  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33950  arabinose efflux permease family protein  27.52 
 
 
414 aa  99  2e-19  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.466548  normal  0.73086 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0062  major facilitator superfamily MFS_1  25.51 
 
 
440 aa  98.6  2e-19  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.175422  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3594  putative permease  23.29 
 
 
422 aa  98.2  3e-19  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4415  major facilitator transporter  28.11 
 
 
449 aa  98.2  3e-19  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5075  amino acid adenylation domain protein  26.63 
 
 
1769 aa  98.2  3e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.944137  normal  0.714561 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0091  major facilitator superfamily MFS_1  24.53 
 
 
442 aa  97.8  4e-19  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4120  Non-ribosomal peptide synthetase modules and related protein-like protein  28.61 
 
 
2720 aa  97.4  4e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0715236 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2187  major facilitator family transporter  29.97 
 
 
495 aa  96.7  7e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.189175  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1398  major facilitator transporter  22.25 
 
 
422 aa  96.7  8e-19  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.902897  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0844  major facilitator superfamily MFS_1  29.77 
 
 
403 aa  96.7  8e-19  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1568  multidrug resistance protein; tetracycline resistance determinant  24.02 
 
 
422 aa  96.3  1e-18  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.766892  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5813  major facilitator superfamily MFS_1  28.46 
 
 
446 aa  95.9  1e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.243583  normal  0.354769 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6160  major facilitator superfamily MFS_1  30.15 
 
 
438 aa  95.9  1e-18  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.48405  normal  0.204358 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0768  major facilitator superfamily MFS_1  27.11 
 
 
456 aa  95.9  1e-18  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0056  major facilitator superfamily MFS_1  23.69 
 
 
433 aa  96.3  1e-18  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0823  major facilitator superfamily MFS_1  28 
 
 
418 aa  95.1  2e-18  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2024  major facilitator superfamily MFS_1  23.99 
 
 
419 aa  94.7  3e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3346  Non-ribosomal peptide synthetase modules and related protein-like protein  25.75 
 
 
1864 aa  94  4e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0153259 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1325  major facilitator superfamily MFS_1  30.11 
 
 
419 aa  93.6  6e-18  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.327447 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3952  major facilitator transporter  25.61 
 
 
413 aa  93.6  6e-18  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1007  hypothetical protein  25.84 
 
 
415 aa  92.4  1e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.767675  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1000  hypothetical protein  23.84 
 
 
418 aa  91.7  2e-17  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00447157 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8887  hypothetical protein  25.13 
 
 
413 aa  91.7  2e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.889317 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0476  major facilitator transporter  23.66 
 
 
474 aa  91.7  3e-17  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4779  major facilitator transporter  24.72 
 
 
428 aa  91.3  3e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00000206756  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0534  hypothetical protein  27.11 
 
 
412 aa  91.3  3e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2608  major facilitator superfamily MFS_1  29.24 
 
 
426 aa  90.9  4e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.669442  normal  0.388396 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3588  major facilitator superfamily MFS_1  26.92 
 
 
428 aa  90.9  4e-17  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.273478 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33800  Major Facilitator Superfamily transporter  26.7 
 
 
505 aa  90.5  5e-17  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.714924  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2420  Non-ribosomal peptide synthetase modules and related protein-like protein  26.76 
 
 
1839 aa  90.1  6e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.452144  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2707  macrolide efflux protein  26.1 
 
 
406 aa  89.7  8e-17  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0968867  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2380  major facilitator transporter  27.07 
 
 
474 aa  89.4  1e-16  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0389897  normal  0.03889 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>