More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_0534 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013595  Sros_0534  hypothetical protein  100 
 
 		 412 aa  780    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5551  major facilitator superfamily MFS_1  50 
 
 		 420 aa  349  6e-95  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.138486  normal  0.597938 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4585  putative membrane transport protein  49.23 
 
 		 403 aa  307  2.0000000000000002e-82  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.00668253  normal  0.163129 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5208  major facilitator superfamily MFS_1  38.86 
 
 		 432 aa  210  4e-53  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.377398  normal  0.900425 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3061  major facilitator superfamily MFS_1  36.08 
 
 		 429 aa  198  1.0000000000000001e-49  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  decreased coverage  0.00310805  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0062  putative membrane transport protein  34.42 
 
 		 418 aa  172  6.999999999999999e-42  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.640827  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1864  major facilitator transporter  27.99 
 
 		 417 aa  159  8e-38  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.436032 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4138  major facilitator superfamily MFS_1  33.6 
 
 		 435 aa  150  4e-35  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.496821  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0805  major facilitator superfamily MFS_1  31.32 
 
 		 459 aa  149  9e-35  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0062  major facilitator superfamily protein  33.33 
 
 		 431 aa  144  2e-33  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.378864  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0885  major facilitator transporter  30.69 
 
 		 415 aa  140  4.999999999999999e-32  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0801  major facilitator superfamily MFS_1  32.11 
 
 		 442 aa  139  7e-32  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.469185 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3679  major facilitator superfamily MFS_1  30.29 
 
 		 410 aa  138  2e-31  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.709991  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4528  major facilitator superfamily MFS_1  29.9 
 
 		 409 aa  121  3e-26  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.392098 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1827  putative transporter  27.32 
 
 		 420 aa  111  2.0000000000000002e-23  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1486  major facilitator transporter  27.76 
 
 		 420 aa  112  2.0000000000000002e-23  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.467645  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1892  transporter, putative  27 
 
 		 420 aa  108  1e-22  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0166254  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3515  putative transporter  27.08 
 
 		 420 aa  109  1e-22  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1940  putative transporter  27.5 
 
 		 420 aa  107  3e-22  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000531086  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1630  transporter  28.18 
 
 		 420 aa  107  3e-22  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1864  putative transporter  27.93 
 
 		 420 aa  105  1e-21  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.42079e-47 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1684  transporter  27.68 
 
 		 420 aa  104  3e-21  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1819  transporter  27.68 
 
 		 420 aa  104  3e-21  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000952932  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4147  H+ antiporter protein  27.89 
 
 		 424 aa  103  4e-21  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4301  H+ antiporter protein  27.89 
 
 		 424 aa  103  4e-21  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.100469  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3756  major facilitator superfamily MFS_1  24.06 
 
 		 409 aa  102  2e-20  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4617  major facilitator superfamily MFS_1  29.12 
 
 		 455 aa  100  6e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.117227  hitchhiker  0.000601374 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1974  hypothetical protein  23.7 
 
 		 424 aa  93.6  5e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.00936884  normal  0.989231 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1062  major facilitator superfamily MFS_1  28.13 
 
 		 423 aa  93.2  8e-18  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.264864  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3442  major facilitator superfamily MFS_1  27.54 
 
 		 440 aa  92.4  1e-17  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0102132  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1114  major facilitator superfamily MFS_1  22.45 
 
 		 415 aa  89.4  1e-16  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5814  major facilitator superfamily MFS_1  24.16 
 
 		 423 aa  89.4  1e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.915234  hitchhiker  0.00491963 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4580  H+ antiporter protein  27.44 
 
 		 443 aa  87.8  3e-16  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.120622 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1904  amino acid adenylation domain-containing protein  24.65 
 
 		 1833 aa  85.1  0.000000000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.844763  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0208  major facilitator superfamily MFS_1  24.18 
 
 		 433 aa  84.7  0.000000000000003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4415  major facilitator transporter  32.49 
 
 		 449 aa  84  0.000000000000005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0240  transporter, putative  21.34 
 
 		 393 aa  83.6  0.000000000000006  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_14790  Major Facilitator Superfamily transporter  30.05 
 
 		 464 aa  83.6  0.000000000000006  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.13794 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0532  major facilitator superfamily MFS_1  27.79 
 
 		 428 aa  81.6  0.00000000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3024  putative permease  23.98 
 
 		 406 aa  80.9  0.00000000000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1942  multidrug resistance protein; putative tetracycline resistance determinant  23.33 
 
 		 406 aa  80.1  0.00000000000006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.0213e-35 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2989  putative permease  23.5 
 
 		 362 aa  80.1  0.00000000000006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0536  major facilitator superfamily MFS_1  26.15 
 
 		 432 aa  80.1  0.00000000000006  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.187699  hitchhiker  0.000017573 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0684  major facilitator transporter  22.69 
 
 		 412 aa  80.1  0.00000000000007  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00476606  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3129  amino acid adenylation domain-containing protein  26.8 
 
 		 1816 aa  79.7  0.00000000000008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.975665  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2707  macrolide efflux protein  23.69 
 
 		 406 aa  79.3  0.0000000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0968867  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0968  major facilitator superfamily MFS_1  27.7 
 
 		 432 aa  79.3  0.0000000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.896564  normal  0.510346 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4889  major facilitator transporter  32.58 
 
 		 449 aa  79  0.0000000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.295208 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3588  major facilitator superfamily MFS_1  30.06 
 
 		 428 aa  79  0.0000000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.273478 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1748  multidrug resistance protein; tetracycline resistance determinant  23 
 
 		 406 aa  77.8  0.0000000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000069396  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1662  major facilitator superfamily MFS_1  22.93 
 
 		 405 aa  77.8  0.0000000000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0564  major facilitator superfamily MFS_1  26.82 
 
 		 439 aa  77.8  0.0000000000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.60112  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0732  major facilitator superfamily MFS_1  26.89 
 
 		 412 aa  77.4  0.0000000000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.000169813  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3025  permease, putative  23.69 
 
 		 406 aa  76.6  0.0000000000008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.076608  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4752  major facilitator superfamily MFS_1  33.5 
 
 		 427 aa  76.3  0.000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0303  major facilitator superfamily MFS_1  28.93 
 
 		 426 aa  75.1  0.000000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0634781  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1491  major facilitator transporter  22.02 
 
 		 390 aa  74.7  0.000000000003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.326017  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4296  major facilitator transporter  29.38 
 
 		 416 aa  74.7  0.000000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.970953 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1272  major facilitator transporter  25.87 
 
 		 418 aa  74.7  0.000000000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8887  hypothetical protein  28.32 
 
 		 413 aa  74.3  0.000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.889317 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1445  major facilitator transporter  22.02 
 
 		 390 aa  74.7  0.000000000003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00616907  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1000  hypothetical protein  26.7 
 
 		 418 aa  73.9  0.000000000004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00447157 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0369  major facilitator transporter  22.49 
 
 		 418 aa  74.3  0.000000000004  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.616869  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2255  putative permease  23.19 
 
 		 404 aa  74.3  0.000000000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.134353 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1398  major facilitator transporter  22.72 
 
 		 422 aa  74.3  0.000000000004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.902897  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2726  macrolide efflux protein  23.44 
 
 		 406 aa  73.9  0.000000000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.277105  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0181  major facilitator superfamily MFS_1  25.06 
 
 		 401 aa  73.9  0.000000000005  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33950  arabinose efflux permease family protein  28.88 
 
 		 414 aa  73.6  0.000000000006  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.466548  normal  0.73086 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0310  major facilitator transporter  27.74 
 
 		 443 aa  73.6  0.000000000006  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2289  major facilitator transporter  33.15 
 
 		 432 aa  73.6  0.000000000006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.995339  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2984  putative permease  23.69 
 
 		 404 aa  73.6  0.000000000007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000116191 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2654  macrolide efflux protein, putative  21.51 
 
 		 414 aa  72.4  0.00000000001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4370  transporter, major facilitator family  23.88 
 
 		 410 aa  72.8  0.00000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  5.0052999999999995e-22 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0830  major facilitator superfamily MFS_1  28.05 
 
 		 422 aa  72.4  0.00000000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0559019  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_25090  Major facilitator superfamily transporter  26.19 
 
 		 411 aa  72  0.00000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1284  major facilitator superfamily MFS_1  26.24 
 
 		 431 aa  72.4  0.00000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2777  permease  23.19 
 
 		 406 aa  72  0.00000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.145309  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2988  permease  23.19 
 
 		 406 aa  72  0.00000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1607  major facilitator transporter  22.58 
 
 		 422 aa  72  0.00000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0422221  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1568  multidrug resistance protein; tetracycline resistance determinant  22.73 
 
 		 422 aa  71.2  0.00000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.766892  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1700  hypothetical protein  28.86 
 
 		 412 aa  71.2  0.00000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.761256  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5813  major facilitator superfamily MFS_1  27.17 
 
 		 446 aa  71.2  0.00000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.243583  normal  0.354769 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3727  major facilitator transporter  28.82 
 
 		 416 aa  71.6  0.00000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.274242  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2024  major facilitator superfamily MFS_1  22.91 
 
 		 419 aa  70.9  0.00000000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0427  transporter, putative  20.71 
 
 		 412 aa  70.9  0.00000000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1600  major facilitator transporter  20.48 
 
 		 405 aa  70.5  0.00000000005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0844  major facilitator superfamily MFS_1  28.29 
 
 		 403 aa  70.5  0.00000000005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1568  major facilitator transporter  20.48 
 
 		 405 aa  70.5  0.00000000005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1808  permease, putative  23.04 
 
 		 422 aa  70.1  0.00000000007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1325  major facilitator superfamily MFS_1  27.25 
 
 		 419 aa  70.1  0.00000000007  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.327447 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4120  Non-ribosomal peptide synthetase modules and related protein-like protein  29.97 
 
 		 2720 aa  70.1  0.00000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0715236 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0092  major facilitator superfamily MFS_1  29.12 
 
 		 414 aa  69.7  0.00000000008  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.031642  normal  0.214383 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1991  major facilitator superfamily MFS_1  28.21 
 
 		 450 aa  69.3  0.0000000001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.762129  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1118  major facilitator superfamily MFS_1  23.08 
 
 		 406 aa  69.7  0.0000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4530  major facilitator superfamily MFS_1  26.53 
 
 		 444 aa  69.3  0.0000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1932  major facilitator superfamily MFS_1  30 
 
 		 406 aa  69.3  0.0000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1620  major facilitator superfamily MFS_1  23.12 
 
 		 417 aa  69.3  0.0000000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0490  major facilitator superfamily MFS_1  30.58 
 
 		 461 aa  68.2  0.0000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0491  major facilitator superfamily MFS_1  29.34 
 
 		 424 aa  68.9  0.0000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1862  putative permease  22.59 
 
 		 422 aa  68.6  0.0000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>