More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_4752 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013131  Caci_4752  major facilitator superfamily MFS_1  100 
 
 		 427 aa  806    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2754  major facilitator transporter  37.11 
 
 		 417 aa  158  2e-37  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.622633  normal  0.0858288 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4925  major facilitator superfamily MFS_1  32.39 
 
 		 420 aa  142  9.999999999999999e-33  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.455292  normal  0.164864 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0210  major facilitator superfamily MFS_1  30.26 
 
 		 476 aa  91.3  3e-17  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1486  major facilitator transporter  26.26 
 
 		 420 aa  89.7  9e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.467645  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3061  major facilitator superfamily MFS_1  29.29 
 
 		 429 aa  85.5  0.000000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  decreased coverage  0.00310805  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1625  major facilitator transporter  25.18 
 
 		 417 aa  85.5  0.000000000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.568704  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5073  putative transporter  26.17 
 
 		 415 aa  83.2  0.000000000000008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0110  multidrug ABC transporter permease  29.57 
 
 		 416 aa  83.2  0.000000000000009  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4800  transporter  25.9 
 
 		 415 aa  81.6  0.00000000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4642  transporter  25.9 
 
 		 415 aa  81.6  0.00000000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4661  transporter  25.9 
 
 		 415 aa  81.6  0.00000000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5040  putative transporter  25.9 
 
 		 415 aa  81.6  0.00000000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5163  transporter  25.9 
 
 		 415 aa  81.6  0.00000000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5069  putative transporter  25.27 
 
 		 415 aa  80.9  0.00000000000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0174  putative transporter  25.27 
 
 		 415 aa  79.7  0.00000000000008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1827  putative transporter  24.78 
 
 		 420 aa  78.2  0.0000000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5067  transporter, putative  25.83 
 
 		 415 aa  76.3  0.000000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3515  putative transporter  25.07 
 
 		 420 aa  75.9  0.000000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1339  major facilitator superfamily MFS_1  27.55 
 
 		 429 aa  76.3  0.000000000001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4750  major facilitator transporter  24.72 
 
 		 415 aa  75.9  0.000000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7785  major facilitator superfamily MFS_1  31.38 
 
 		 420 aa  75.5  0.000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.157303 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3945  major facilitator transporter  40.29 
 
 		 421 aa  74.3  0.000000000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.736514  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1284  major facilitator superfamily MFS_1  25.52 
 
 		 431 aa  73.9  0.000000000005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0395  permease  25.21 
 
 		 430 aa  72.8  0.00000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0177527  normal  0.113221 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0091  major facilitator superfamily MFS_1  24.72 
 
 		 442 aa  71.6  0.00000000003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1630  transporter  23.48 
 
 		 420 aa  71.6  0.00000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1864  putative transporter  24.35 
 
 		 420 aa  71.2  0.00000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.42079e-47 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1940  putative transporter  23.67 
 
 		 420 aa  71.2  0.00000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000531086  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0875  major facilitator superfamily MFS_1  27.16 
 
 		 441 aa  70.5  0.00000000005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  hitchhiker  0.00780765  normal  0.0882707 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0801  major facilitator superfamily MFS_1  28.8 
 
 		 442 aa  70.1  0.00000000006  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.469185 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1662  major facilitator superfamily MFS_1  24.14 
 
 		 405 aa  70.5  0.00000000006  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3541  major facilitator transporter  25.14 
 
 		 415 aa  70.1  0.00000000007  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4177  major facilitator superfamily MFS_1  26.38 
 
 		 476 aa  70.1  0.00000000008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.192321  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5551  major facilitator superfamily MFS_1  30.08 
 
 		 420 aa  70.1  0.00000000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.138486  normal  0.597938 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1114  major facilitator superfamily MFS_1  25.67 
 
 		 415 aa  68.9  0.0000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1684  transporter  24.06 
 
 		 420 aa  69.7  0.0000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1819  transporter  24.06 
 
 		 420 aa  69.7  0.0000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000952932  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0110  major facilitator transporter  32.2 
 
 		 429 aa  69.3  0.0000000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0532  major facilitator superfamily MFS_1  28.39 
 
 		 428 aa  68.2  0.0000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11210  major facilitator superfamily MFS_1  26.6 
 
 		 433 aa  68.2  0.0000000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5212  major facilitator superfamily MFS_1  26.76 
 
 		 408 aa  67.8  0.0000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0948922  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3035  MFS family transporter  25.97 
 
 		 425 aa  67.4  0.0000000004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3575  major facilitator superfamily MFS_1  31.1 
 
 		 416 aa  67.4  0.0000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3762  major facilitator transporter  25.97 
 
 		 425 aa  67.4  0.0000000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0087  major facilitator transporter  25.43 
 
 		 436 aa  67  0.0000000007  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2289  major facilitator transporter  26.9 
 
 		 432 aa  66.6  0.0000000008  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.995339  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1928  major facilitator superfamily MFS_1  25.77 
 
 		 414 aa  66.6  0.0000000008  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0688885  normal  0.183583 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0732  major facilitator superfamily MFS_1  28.8 
 
 		 412 aa  66.2  0.000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.000169813  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1491  major facilitator transporter  24.54 
 
 		 390 aa  65.5  0.000000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.326017  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2847  major facilitator superfamily MFS_1  26.56 
 
 		 432 aa  65.5  0.000000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1445  major facilitator transporter  24.54 
 
 		 390 aa  65.5  0.000000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00616907  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0534  hypothetical protein  31.98 
 
 		 412 aa  65.5  0.000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0772  major facilitator superfamily MFS_1  25.9 
 
 		 431 aa  64.7  0.000000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.98157  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0656  major facilitator transporter  33.53 
 
 		 435 aa  64.7  0.000000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19250  major facilitator superfamily MFS_1  23.69 
 
 		 444 aa  64.7  0.000000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00108172  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0427  transporter, putative  24.27 
 
 		 412 aa  64.7  0.000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3756  major facilitator superfamily MFS_1  23.48 
 
 		 409 aa  65.1  0.000000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1942  multidrug resistance protein; putative tetracycline resistance determinant  25.47 
 
 		 406 aa  64.3  0.000000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.0213e-35 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2952  major facilitator transporter  26.9 
 
 		 405 aa  63.9  0.000000005  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2001  major facilitator transporter  24.39 
 
 		 425 aa  63.9  0.000000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1892  transporter, putative  23.37 
 
 		 420 aa  62.8  0.00000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0166254  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0598  major facilitator transporter  22.1 
 
 		 427 aa  62.8  0.00000001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  unclonable  0.00000000170409  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1748  multidrug resistance protein; tetracycline resistance determinant  24.84 
 
 		 406 aa  62.8  0.00000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000069396  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0823  major facilitator superfamily MFS_1  27.71 
 
 		 418 aa  62.4  0.00000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3486  major facilitator transporter  29.23 
 
 		 450 aa  62.8  0.00000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.719238  normal  1 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2641  major facilitator transporter  28.35 
 
 		 499 aa  62.8  0.00000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.893021  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3952  major facilitator transporter  28.46 
 
 		 413 aa  62.8  0.00000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5208  major facilitator superfamily MFS_1  28.04 
 
 		 432 aa  62  0.00000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.377398  normal  0.900425 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0506  major facilitator transporter  28 
 
 		 426 aa  61.6  0.00000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.204304  hitchhiker  0.00963798 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0331  major facilitator transporter  24.14 
 
 		 412 aa  62  0.00000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1118  major facilitator superfamily MFS_1  25.69 
 
 		 406 aa  62  0.00000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0062  major facilitator superfamily MFS_1  25.5 
 
 		 440 aa  61.6  0.00000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.175422  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2027  major facilitator superfamily MFS_1  28.69 
 
 		 436 aa  62.4  0.00000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0056  major facilitator superfamily MFS_1  25.69 
 
 		 433 aa  62  0.00000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4601  major facilitator superfamily MFS_1  28.65 
 
 		 415 aa  61.6  0.00000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.621145  hitchhiker  0.00480988 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0476  major facilitator transporter  26.21 
 
 		 474 aa  61.2  0.00000003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2326  major facilitator superfamily MFS_1  23.12 
 
 		 410 aa  61.6  0.00000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0242  putative integral membrane efflux protein  26.02 
 
 		 424 aa  60.8  0.00000004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.305732  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2540  major facilitator superfamily MFS_1  32.54 
 
 		 430 aa  61.2  0.00000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5814  major facilitator superfamily MFS_1  25.27 
 
 		 423 aa  60.5  0.00000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.915234  hitchhiker  0.00491963 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0768  major facilitator superfamily MFS_1  29.94 
 
 		 456 aa  60.1  0.00000007  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5251  transporter, putative  28.99 
 
 		 532 aa  59.7  0.00000009  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1325  major facilitator superfamily MFS_1  27.3 
 
 		 419 aa  59.7  0.00000009  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.327447 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0844  major facilitator superfamily MFS_1  27.11 
 
 		 403 aa  59.7  0.00000009  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0918  major facilitator superfamily permease  20.44 
 
 		 402 aa  59.7  0.00000009  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0310  major facilitator transporter  26.96 
 
 		 443 aa  59.7  0.00000009  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2814  major facilitator superfamily MFS_1  27.46 
 
 		 402 aa  58.9  0.0000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7222  major facilitator transporter  27.88 
 
 		 441 aa  58.9  0.0000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.237478  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4580  H+ antiporter protein  27 
 
 		 443 aa  59.3  0.0000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.120622 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_27630  arabinose efflux permease family protein  29.2 
 
 		 417 aa  58.5  0.0000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2769  major facilitator superfamily MFS_1  26.93 
 
 		 417 aa  58.5  0.0000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.172375  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1000  hypothetical protein  28.53 
 
 		 418 aa  58.9  0.0000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00447157 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4585  putative membrane transport protein  33.51 
 
 		 403 aa  58.9  0.0000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.00668253  normal  0.163129 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2413  major facilitator transporter  28.07 
 
 		 412 aa  58.2  0.0000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  decreased coverage  0.00423271  normal  0.219014 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1600  major facilitator transporter  23.6 
 
 		 405 aa  57.4  0.0000004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1568  major facilitator transporter  23.6 
 
 		 405 aa  57.4  0.0000004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5813  major facilitator superfamily MFS_1  26.72 
 
 		 446 aa  57.4  0.0000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.243583  normal  0.354769 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0490  major facilitator superfamily MFS_1  28.32 
 
 		 461 aa  57.4  0.0000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2679  major facilitator superfamily MFS_1  27.13 
 
 		 453 aa  57  0.0000006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.000000322743  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>