More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Strop_2754 on replicon NC_009380
Organism: Salinispora tropica CNB-440



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009380  Strop_2754  major facilitator transporter  100 
 
 		 417 aa  756    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.622633  normal  0.0858288 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4925  major facilitator superfamily MFS_1  41.08 
 
 		 420 aa  212  1e-53  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.455292  normal  0.164864 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4752  major facilitator superfamily MFS_1  36.78 
 
 		 427 aa  197  4.0000000000000005e-49  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3575  major facilitator superfamily MFS_1  34.88 
 
 		 416 aa  128  2.0000000000000002e-28  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4800  transporter  27.61 
 
 		 415 aa  127  3e-28  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4642  transporter  26.92 
 
 		 415 aa  127  3e-28  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4661  transporter  27.61 
 
 		 415 aa  127  3e-28  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5040  putative transporter  27.61 
 
 		 415 aa  127  3e-28  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5163  transporter  27.61 
 
 		 415 aa  127  3e-28  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0174  putative transporter  26.92 
 
 		 415 aa  126  6e-28  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5069  putative transporter  27.3 
 
 		 415 aa  125  1e-27  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5073  putative transporter  26.63 
 
 		 415 aa  125  2e-27  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4750  major facilitator transporter  26.83 
 
 		 415 aa  123  7e-27  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5067  transporter, putative  26.38 
 
 		 415 aa  120  3.9999999999999996e-26  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0056  major facilitator superfamily MFS_1  27.18 
 
 		 433 aa  116  7.999999999999999e-25  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0091  major facilitator superfamily MFS_1  27.54 
 
 		 442 aa  114  2.0000000000000002e-24  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3945  major facilitator transporter  34 
 
 		 421 aa  114  3e-24  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.736514  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1491  major facilitator transporter  26.14 
 
 		 390 aa  111  3e-23  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.326017  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1445  major facilitator transporter  26.14 
 
 		 390 aa  111  3e-23  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00616907  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0772  major facilitator superfamily MFS_1  29.32 
 
 		 431 aa  107  5e-22  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.98157  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3541  major facilitator transporter  26.07 
 
 		 415 aa  106  6e-22  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1486  major facilitator transporter  31.51 
 
 		 420 aa  106  7e-22  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.467645  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1625  major facilitator transporter  29.78 
 
 		 417 aa  105  1e-21  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.568704  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0062  major facilitator superfamily MFS_1  27.32 
 
 		 440 aa  103  5e-21  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.175422  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0380  major facilitator superfamily MFS_1  38.85 
 
 		 404 aa  100  3e-20  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0087  major facilitator transporter  27.42 
 
 		 436 aa  100  6e-20  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0395  permease  25.25 
 
 		 430 aa  98.6  2e-19  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0177527  normal  0.113221 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3061  major facilitator superfamily MFS_1  29.85 
 
 		 429 aa  95.5  1e-18  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  decreased coverage  0.00310805  normal  1 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0110  multidrug ABC transporter permease  25.06 
 
 		 416 aa  95.1  2e-18  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1539  major facilitator transporter  23.28 
 
 		 412 aa  94.4  3e-18  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  unclonable  0.000000151531  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1339  major facilitator superfamily MFS_1  32.46 
 
 		 429 aa  93.2  7e-18  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1559  major facilitator transporter  23.51 
 
 		 412 aa  93.2  8e-18  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.00000341731  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2289  major facilitator transporter  33.24 
 
 		 432 aa  92  2e-17  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.995339  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0053  transporter, putative  26.04 
 
 		 431 aa  90.9  4e-17  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1974  hypothetical protein  26.79 
 
 		 424 aa  89.7  9e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.00936884  normal  0.989231 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0516  major facilitator superfamily MFS_1  28.25 
 
 		 420 aa  87.4  4e-16  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0365  major facilitator transporter  31.87 
 
 		 427 aa  85.1  0.000000000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0592694 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5208  major facilitator superfamily MFS_1  29.57 
 
 		 432 aa  84.3  0.000000000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.377398  normal  0.900425 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2627  major facilitator transporter  27.59 
 
 		 410 aa  84.3  0.000000000000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0532  major facilitator superfamily MFS_1  29.79 
 
 		 428 aa  83.6  0.000000000000007  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3037  major facilitator superfamily MFS_1  25.79 
 
 		 421 aa  83.2  0.000000000000008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11210  major facilitator superfamily MFS_1  26.46 
 
 		 433 aa  82.4  0.00000000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2679  major facilitator superfamily MFS_1  30.56 
 
 		 453 aa  82.4  0.00000000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.000000322743  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1928  major facilitator superfamily MFS_1  25.96 
 
 		 414 aa  81.3  0.00000000000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0688885  normal  0.183583 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_2010  transporter, putative  24.41 
 
 		 429 aa  80.9  0.00000000000004  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0476  major facilitator transporter  28.24 
 
 		 474 aa  80.9  0.00000000000004  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7122  MFS permease  29.08 
 
 		 426 aa  80.5  0.00000000000005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1327  major facilitator superfamily MFS_1  30.25 
 
 		 433 aa  80.1  0.00000000000006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1000  hypothetical protein  28.09 
 
 		 418 aa  79.7  0.00000000000008  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00447157 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3952  major facilitator transporter  29.22 
 
 		 413 aa  79.7  0.0000000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0752  transporter, putative  26.43 
 
 		 446 aa  78.6  0.0000000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1508  major facilitator superfamily permease  22.78 
 
 		 403 aa  78.6  0.0000000000002  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5404  major facilitator transporter  32.57 
 
 		 418 aa  77.4  0.0000000000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0801  major facilitator superfamily MFS_1  27.47 
 
 		 442 aa  77  0.0000000000005  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.469185 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0310  major facilitator transporter  29.68 
 
 		 443 aa  77  0.0000000000005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7117  major facilitator superfamily MFS_1  28.96 
 
 		 432 aa  77  0.0000000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5212  major facilitator superfamily MFS_1  26.1 
 
 		 408 aa  76.6  0.0000000000007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0948922  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3365  major facilitator superfamily protein  35.27 
 
 		 424 aa  76.6  0.0000000000007  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0844  major facilitator superfamily MFS_1  31.33 
 
 		 403 aa  76.3  0.0000000000009  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19250  major facilitator superfamily MFS_1  24.15 
 
 		 444 aa  76.3  0.000000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00108172  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2952  major facilitator transporter  27.73 
 
 		 405 aa  75.1  0.000000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1864  putative transporter  25.77 
 
 		 420 aa  75.1  0.000000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.42079e-47 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2384  major facilitator transporter  25.8 
 
 		 441 aa  75.1  0.000000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.930234  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4601  major facilitator superfamily MFS_1  32.98 
 
 		 415 aa  74.7  0.000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.621145  hitchhiker  0.00480988 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2206  major facilitator transporter  27.8 
 
 		 447 aa  74.7  0.000000000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2814  major facilitator superfamily MFS_1  28.53 
 
 		 402 aa  74.3  0.000000000004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4580  H+ antiporter protein  28.42 
 
 		 443 aa  73.9  0.000000000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.120622 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0732  major facilitator superfamily MFS_1  28.81 
 
 		 412 aa  73.6  0.000000000006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.000169813  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1684  transporter  25.53 
 
 		 420 aa  73.6  0.000000000006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1819  transporter  25.53 
 
 		 420 aa  73.6  0.000000000006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000952932  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5814  major facilitator superfamily MFS_1  23.14 
 
 		 423 aa  73.2  0.000000000008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.915234  hitchhiker  0.00491963 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3206  major facilitator transporter  28.57 
 
 		 413 aa  73.2  0.000000000008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.130501  normal  0.812744 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2380  major facilitator transporter  25.73 
 
 		 474 aa  73.2  0.000000000009  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0389897  normal  0.03889 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4147  H+ antiporter protein  29.87 
 
 		 424 aa  72.8  0.00000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4301  H+ antiporter protein  29.87 
 
 		 424 aa  72.8  0.00000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.100469  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1940  putative transporter  26.06 
 
 		 420 aa  71.6  0.00000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000531086  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_14790  Major Facilitator Superfamily transporter  30.03 
 
 		 464 aa  72  0.00000000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.13794 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4887  major facilitator superfamily MFS_1  31.25 
 
 		 424 aa  72  0.00000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1630  transporter  25.3 
 
 		 420 aa  70.9  0.00000000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1991  major facilitator superfamily MFS_1  28.76 
 
 		 450 aa  70.9  0.00000000004  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.762129  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4055  major facilitator transporter  28.57 
 
 		 413 aa  70.5  0.00000000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0189  major facilitator superfamily MFS_1  27.16 
 
 		 426 aa  70.9  0.00000000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0572831  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4311  major facilitator transporter  28.57 
 
 		 413 aa  70.5  0.00000000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.481156  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1224  major facilitator superfamily MFS_1  28.18 
 
 		 440 aa  70.5  0.00000000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4296  major facilitator transporter  30.05 
 
 		 416 aa  70.5  0.00000000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.970953 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1603  major facilitator superfamily MFS_1  28.79 
 
 		 432 aa  70.5  0.00000000006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0347546  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5813  major facilitator superfamily MFS_1  26.93 
 
 		 446 aa  70.5  0.00000000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.243583  normal  0.354769 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3515  putative transporter  26.56 
 
 		 420 aa  70.1  0.00000000008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0593  major facilitator transporter  23.85 
 
 		 413 aa  69.3  0.0000000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.00370301  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5851  major facilitator superfamily MFS_1  28.97 
 
 		 425 aa  69.3  0.0000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.917844  normal  0.985013 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2729  putative permease  20.57 
 
 		 434 aa  69.3  0.0000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0743225  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3727  major facilitator transporter  28.2 
 
 		 416 aa  68.9  0.0000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.274242  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0578  major facilitator transporter  23.85 
 
 		 413 aa  69.3  0.0000000001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0133344  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1250  major facilitator transporter  27.81 
 
 		 425 aa  68.9  0.0000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6079  hypothetical protein  28.97 
 
 		 420 aa  68.9  0.0000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.533874  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1118  major facilitator superfamily MFS_1  22.83 
 
 		 406 aa  68.2  0.0000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1538  major facilitator transporter  24.28 
 
 		 404 aa  68.6  0.0000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.756552  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0417  major facilitator transporter  28.84 
 
 		 420 aa  68.9  0.0000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00934872 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3762  major facilitator transporter  28.39 
 
 		 425 aa  67.8  0.0000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1272  major facilitator transporter  24.74 
 
 		 418 aa  68.2  0.0000000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>