More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene LEUM_0918 on replicon NC_008531
Organism: Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008531  LEUM_0918  major facilitator superfamily permease  100 
 
 
402 aa  790    Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1662  major facilitator superfamily MFS_1  30.31 
 
 
405 aa  157  2e-37  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0427  transporter, putative  25.98 
 
 
412 aa  132  1.0000000000000001e-29  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3037  major facilitator superfamily MFS_1  23.27 
 
 
421 aa  112  1.0000000000000001e-23  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3594  putative permease  25.2 
 
 
422 aa  112  1.0000000000000001e-23  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1398  major facilitator transporter  25.54 
 
 
422 aa  111  2.0000000000000002e-23  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.902897  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1782  putative permease  25 
 
 
422 aa  111  2.0000000000000002e-23  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1808  permease, putative  25 
 
 
422 aa  110  3e-23  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1749  putative permease  25.54 
 
 
422 aa  110  4.0000000000000004e-23  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1862  putative permease  25.6 
 
 
422 aa  109  8.000000000000001e-23  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1568  multidrug resistance protein; tetracycline resistance determinant  24.19 
 
 
422 aa  109  1e-22  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.766892  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1607  permease  24.46 
 
 
422 aa  108  2e-22  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.137367  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1731  permease  24.46 
 
 
422 aa  108  2e-22  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1559  multidrug resistance protein; tetracycline resistance determinant  24.19 
 
 
422 aa  107  3e-22  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.285528  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1607  major facilitator transporter  25.8 
 
 
422 aa  107  3e-22  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0422221  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0062  major facilitator superfamily MFS_1  23.9 
 
 
440 aa  107  3e-22  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.175422  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3486  major facilitator transporter  24.79 
 
 
450 aa  97.4  3e-19  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.719238  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0056  major facilitator superfamily MFS_1  24.52 
 
 
433 aa  97.8  3e-19  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0087  major facilitator transporter  22.76 
 
 
436 aa  94.4  3e-18  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2326  major facilitator superfamily MFS_1  22.14 
 
 
410 aa  90.5  4e-17  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0875  major facilitator superfamily MFS_1  21.68 
 
 
441 aa  90.5  5e-17  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  hitchhiker  0.00780765  normal  0.0882707 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1272  major facilitator transporter  23.32 
 
 
418 aa  90.1  6e-17  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1030  major facilitator superfamily MFS_1  25.06 
 
 
419 aa  89.4  9e-17  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3756  major facilitator superfamily MFS_1  27.37 
 
 
409 aa  89  1e-16  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8887  hypothetical protein  24.27 
 
 
413 aa  88.2  2e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.889317 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0823  major facilitator superfamily MFS_1  25.21 
 
 
418 aa  88.2  3e-16  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2679  major facilitator superfamily MFS_1  24.19 
 
 
453 aa  87.8  3e-16  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.000000322743  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0395  permease  23.82 
 
 
430 aa  87  5e-16  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0177527  normal  0.113221 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0506  major facilitator transporter  25.49 
 
 
426 aa  86.7  7e-16  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.204304  hitchhiker  0.00963798 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0110  major facilitator transporter  24.92 
 
 
429 aa  86.7  7e-16  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2206  major facilitator transporter  20.94 
 
 
447 aa  86.3  9e-16  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1250  major facilitator superfamily MFS_1  25.98 
 
 
378 aa  86.3  0.000000000000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_2010  transporter, putative  22.93 
 
 
429 aa  85.5  0.000000000000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1000  hypothetical protein  22.84 
 
 
418 aa  85.9  0.000000000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00447157 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0240  transporter, putative  23.19 
 
 
393 aa  85.1  0.000000000000002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0844  major facilitator superfamily MFS_1  22.73 
 
 
403 aa  85.1  0.000000000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3926  major facilitator transporter  23 
 
 
457 aa  85.5  0.000000000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19250  major facilitator superfamily MFS_1  23.39 
 
 
444 aa  85.1  0.000000000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00108172  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0337  major facilitator superfamily permease  25.06 
 
 
402 aa  85.5  0.000000000000002  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11210  major facilitator superfamily MFS_1  22.71 
 
 
433 aa  84.7  0.000000000000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0752  transporter, putative  22.25 
 
 
446 aa  84  0.000000000000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1491  major facilitator transporter  22.41 
 
 
390 aa  83.6  0.000000000000006  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.326017  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1445  major facilitator transporter  22.41 
 
 
390 aa  83.6  0.000000000000006  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00616907  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0746  hypothetical protein  23.94 
 
 
431 aa  83.6  0.000000000000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0165656  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0792  major facilitator transporter  26.56 
 
 
450 aa  83.6  0.000000000000006  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0768  major facilitator superfamily MFS_1  22.87 
 
 
456 aa  82  0.00000000000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5851  major facilitator superfamily MFS_1  22.34 
 
 
425 aa  82.4  0.00000000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.917844  normal  0.985013 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0091  major facilitator superfamily MFS_1  21.23 
 
 
442 aa  81.6  0.00000000000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1620  major facilitator superfamily MFS_1  23.02 
 
 
417 aa  81.6  0.00000000000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3288  major facilitator superfamily protein  22.37 
 
 
405 aa  82  0.00000000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.234831 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0786  major facilitator transporter  23.75 
 
 
418 aa  81.3  0.00000000000003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2380  major facilitator transporter  24.4 
 
 
474 aa  81.3  0.00000000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0389897  normal  0.03889 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1114  major facilitator superfamily MFS_1  21.86 
 
 
415 aa  80.9  0.00000000000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2413  major facilitator transporter  22.44 
 
 
412 aa  80.1  0.00000000000006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  decreased coverage  0.00423271  normal  0.219014 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0242  putative integral membrane efflux protein  23.02 
 
 
424 aa  80.1  0.00000000000007  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.305732  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4779  major facilitator transporter  22.11 
 
 
428 aa  79.7  0.00000000000008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00000206756  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2384  major facilitator transporter  23.23 
 
 
441 aa  79.7  0.00000000000008  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.930234  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0418  major facilitator transporter  24.72 
 
 
426 aa  79  0.0000000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.752628 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4177  major facilitator superfamily MFS_1  21.69 
 
 
476 aa  79  0.0000000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.192321  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1928  major facilitator superfamily MFS_1  23.62 
 
 
414 aa  78.6  0.0000000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0688885  normal  0.183583 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0684  major facilitator transporter  22.31 
 
 
412 aa  79  0.0000000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00476606  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2526  H+ Antiporter protein  22.57 
 
 
411 aa  78.6  0.0000000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000735797  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2027  major facilitator superfamily MFS_1  21.24 
 
 
436 aa  78.2  0.0000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21930  major facilitator superfamily MFS_1  24.83 
 
 
432 aa  79  0.0000000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3762  major facilitator transporter  23.5 
 
 
425 aa  77.8  0.0000000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1118  major facilitator superfamily MFS_1  22.19 
 
 
406 aa  77.8  0.0000000000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1813  major facilitator superfamily permease  22.25 
 
 
410 aa  78.2  0.0000000000003  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0598  major facilitator transporter  25.75 
 
 
427 aa  77.4  0.0000000000004  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  unclonable  0.00000000170409  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3035  MFS family transporter  23.5 
 
 
425 aa  77.4  0.0000000000004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2754  major facilitator superfamily MFS_1  20.97 
 
 
453 aa  77  0.0000000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.192829  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0692  major facilitator transporter  26.07 
 
 
439 aa  77  0.0000000000006  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0968  major facilitator superfamily MFS_1  23.17 
 
 
432 aa  77  0.0000000000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.896564  normal  0.510346 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3508  protein of unknown function DUF894, DitE  20.79 
 
 
526 aa  77  0.0000000000006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1991  major facilitator superfamily MFS_1  20.44 
 
 
450 aa  76.6  0.0000000000007  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.762129  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0369  major facilitator transporter  22.69 
 
 
418 aa  76.6  0.0000000000007  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.616869  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1484  major facilitator transporter  21.85 
 
 
406 aa  76.3  0.0000000000008  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.178978  normal  0.0348378 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2305  ABC transporter permease  23.48 
 
 
417 aa  76.3  0.0000000000008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0193471  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1613  major facilitator superfamily MFS_1  24.06 
 
 
418 aa  76.3  0.0000000000008  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000260989  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2480  ABC transporter permease  23.48 
 
 
415 aa  76.3  0.0000000000008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0926781  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8792  major facilitator superfamily MFS_1  23.4 
 
 
420 aa  76.3  0.000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.462854  normal  0.589111 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0053  transporter, putative  20.89 
 
 
431 aa  75.9  0.000000000001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2627  major facilitator transporter  22.7 
 
 
410 aa  75.9  0.000000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5814  major facilitator superfamily MFS_1  23.72 
 
 
423 aa  75.5  0.000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.915234  hitchhiker  0.00491963 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1508  major facilitator superfamily permease  24.37 
 
 
403 aa  75.5  0.000000000002  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0476  major facilitator transporter  23.12 
 
 
474 aa  75.5  0.000000000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4120  Non-ribosomal peptide synthetase modules and related protein-like protein  22.34 
 
 
2720 aa  75.1  0.000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0715236 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2227  permease; macrolide-efflux protein  23.22 
 
 
417 aa  74.3  0.000000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0120958  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2501  putative ABC transporter, permease protein  23.22 
 
 
415 aa  74.7  0.000000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2128  hypothetical protein  25 
 
 
429 aa  73.9  0.000000000004  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30800  arabinose efflux permease family protein  19.84 
 
 
452 aa  73.9  0.000000000004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2318  macrolide-efflux protein  23.58 
 
 
408 aa  73.9  0.000000000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.31097  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0490  major facilitator superfamily MFS_1  22.08 
 
 
461 aa  73.9  0.000000000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2273  permease; macrolide-efflux protein  23.22 
 
 
417 aa  73.6  0.000000000006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00046211  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2511  ABC transporter, permease protein, putative  23.36 
 
 
414 aa  73.2  0.000000000007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00150223  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7222  major facilitator transporter  22.46 
 
 
441 aa  73.2  0.000000000008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.237478  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2631  putative permease  22.69 
 
 
408 aa  73.2  0.000000000009  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0615976  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2582  permease, putative  23.1 
 
 
408 aa  72.4  0.00000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2355  macrolide-efflux protein  23.04 
 
 
408 aa  72.8  0.00000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000199839  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0297  major facilitator superfamily MFS_1  21.52 
 
 
423 aa  72.8  0.00000000001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.0210722  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4706  major facilitator superfamily MFS_1  23.65 
 
 
445 aa  72.4  0.00000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal  0.93667 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>