More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_4528 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013131  Caci_4528  major facilitator superfamily MFS_1  100 
 
 
409 aa  798    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.392098 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4138  major facilitator superfamily MFS_1  40.6 
 
 
435 aa  249  9e-65  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.496821  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3679  major facilitator superfamily MFS_1  35.1 
 
 
410 aa  195  2e-48  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.709991  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1864  major facilitator transporter  31.27 
 
 
417 aa  193  5e-48  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.436032 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0062  putative membrane transport protein  33.01 
 
 
418 aa  175  9.999999999999999e-43  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.640827  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3061  major facilitator superfamily MFS_1  31.55 
 
 
429 aa  161  2e-38  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  decreased coverage  0.00310805  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0885  major facilitator transporter  29.95 
 
 
415 aa  159  1e-37  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0805  major facilitator superfamily MFS_1  31.88 
 
 
459 aa  155  9e-37  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0062  major facilitator superfamily protein  32.91 
 
 
431 aa  153  5e-36  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.378864  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5551  major facilitator superfamily MFS_1  28.86 
 
 
420 aa  137  3.0000000000000003e-31  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.138486  normal  0.597938 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0534  hypothetical protein  29.2 
 
 
412 aa  134  3e-30  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5208  major facilitator superfamily MFS_1  30.1 
 
 
432 aa  131  3e-29  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.377398  normal  0.900425 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0801  major facilitator superfamily MFS_1  31.18 
 
 
442 aa  119  7.999999999999999e-26  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.469185 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4585  putative membrane transport protein  29.88 
 
 
403 aa  118  1.9999999999999998e-25  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.00668253  normal  0.163129 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0092  major facilitator superfamily MFS_1  30.81 
 
 
414 aa  109  1e-22  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.031642  normal  0.214383 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0684  major facilitator transporter  26.13 
 
 
412 aa  98.2  3e-19  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00476606  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1284  major facilitator superfamily MFS_1  27.78 
 
 
431 aa  94.7  3e-18  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0062  major facilitator superfamily MFS_1  27.54 
 
 
440 aa  94.7  3e-18  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.175422  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0087  major facilitator transporter  27.02 
 
 
436 aa  94.7  3e-18  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3756  major facilitator superfamily MFS_1  23.96 
 
 
409 aa  94  4e-18  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0752  transporter, putative  27.76 
 
 
446 aa  93.2  7e-18  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1486  major facilitator transporter  24.81 
 
 
420 aa  92.8  1e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.467645  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7163  major facilitator superfamily MFS_1  27.97 
 
 
414 aa  92.4  1e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.886054  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3025  permease, putative  26.57 
 
 
406 aa  91.7  2e-17  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.076608  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0056  major facilitator superfamily MFS_1  27.06 
 
 
433 aa  91.3  3e-17  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2255  putative permease  26.94 
 
 
404 aa  90.9  3e-17  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.134353 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0091  major facilitator superfamily MFS_1  28.35 
 
 
442 aa  90.5  5e-17  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0953  major facilitator transporter  27.17 
 
 
407 aa  89.4  1e-16  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.204782  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2707  macrolide efflux protein  25.12 
 
 
406 aa  89  2e-16  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0968867  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3037  major facilitator superfamily MFS_1  27.01 
 
 
421 aa  88.6  2e-16  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1000  hypothetical protein  28.61 
 
 
418 aa  88.6  2e-16  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00447157 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0532  major facilitator superfamily MFS_1  25.12 
 
 
428 aa  88.2  2e-16  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2777  permease  25.12 
 
 
406 aa  87.8  3e-16  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.145309  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2988  permease  25.12 
 
 
406 aa  87.8  3e-16  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0395  permease  26.67 
 
 
430 aa  87.8  3e-16  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0177527  normal  0.113221 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0053  transporter, putative  30.77 
 
 
431 aa  87.4  4e-16  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1491  major facilitator transporter  22.96 
 
 
390 aa  87  6e-16  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.326017  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1445  major facilitator transporter  22.96 
 
 
390 aa  87  6e-16  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00616907  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1062  major facilitator superfamily MFS_1  25.55 
 
 
423 aa  86.7  8e-16  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.264864  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3024  putative permease  25.86 
 
 
406 aa  86.3  9e-16  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1864  putative transporter  23.65 
 
 
420 aa  85.5  0.000000000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.42079e-47 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2679  major facilitator superfamily MFS_1  28.68 
 
 
453 aa  86.3  0.000000000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.000000322743  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1508  major facilitator superfamily permease  25.12 
 
 
403 aa  85.5  0.000000000000001  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3179  major facilitator transporter  26.54 
 
 
445 aa  85.5  0.000000000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.110331 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1684  transporter  23.65 
 
 
420 aa  84.7  0.000000000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2726  macrolide efflux protein  24.64 
 
 
406 aa  84.3  0.000000000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.277105  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1819  transporter  23.65 
 
 
420 aa  84.7  0.000000000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000952932  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1940  putative transporter  22.81 
 
 
420 aa  84.3  0.000000000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000531086  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1630  transporter  23.13 
 
 
420 aa  84  0.000000000000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1272  major facilitator transporter  26.65 
 
 
418 aa  83.6  0.000000000000005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1016  major facilitator transporter  32.06 
 
 
393 aa  83.6  0.000000000000006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.807332  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1904  amino acid adenylation domain-containing protein  22.25 
 
 
1833 aa  83.6  0.000000000000006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.844763  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3486  major facilitator transporter  29.83 
 
 
450 aa  83.2  0.000000000000008  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.719238  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6539  major facilitator superfamily MFS_1  29.25 
 
 
415 aa  82.4  0.00000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.6945  normal  0.0125799 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1538  major facilitator transporter  27.27 
 
 
404 aa  82.8  0.00000000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.756552  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2984  putative permease  24.64 
 
 
404 aa  82.4  0.00000000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000116191 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3926  major facilitator transporter  29.41 
 
 
457 aa  82.4  0.00000000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2326  major facilitator superfamily MFS_1  25.99 
 
 
410 aa  82  0.00000000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4147  H+ antiporter protein  25.13 
 
 
424 aa  82  0.00000000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4301  H+ antiporter protein  25.13 
 
 
424 aa  82  0.00000000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.100469  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3952  major facilitator transporter  31.94 
 
 
413 aa  80.5  0.00000000000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_2010  transporter, putative  25.91 
 
 
429 aa  80.1  0.00000000000006  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0210  major facilitator superfamily MFS_1  26.74 
 
 
476 aa  80.1  0.00000000000006  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0968  major facilitator superfamily MFS_1  27.04 
 
 
432 aa  79.7  0.00000000000008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.896564  normal  0.510346 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3626  major facilitator transporter  32.08 
 
 
413 aa  79.7  0.00000000000008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.348332  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1281  major facilitator transporter  23.04 
 
 
413 aa  79  0.0000000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.835892  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2380  major facilitator transporter  26.52 
 
 
474 aa  78.6  0.0000000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0389897  normal  0.03889 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0176  major facilitator transporter  27.62 
 
 
426 aa  79  0.0000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.379469  normal  0.234316 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3515  putative transporter  23.21 
 
 
420 aa  77.8  0.0000000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4706  major facilitator superfamily MFS_1  27.96 
 
 
445 aa  77.8  0.0000000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal  0.93667 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1498  macrolide efflux protein  25.09 
 
 
404 aa  77  0.0000000000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0832  major facilitator superfamily MFS_1  32.52 
 
 
443 aa  77  0.0000000000005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.533006  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1827  putative transporter  24.07 
 
 
420 aa  76.6  0.0000000000006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2627  major facilitator transporter  24.4 
 
 
410 aa  77  0.0000000000006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0830  major facilitator superfamily MFS_1  28.47 
 
 
422 aa  76.6  0.0000000000007  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0559019  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2475  major facilitator superfamily MFS_1  26.13 
 
 
494 aa  76.3  0.0000000000009  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.495662  normal  0.811847 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3246  permease, putative  23.01 
 
 
417 aa  75.5  0.000000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0277963  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5814  major facilitator superfamily MFS_1  27.15 
 
 
423 aa  75.9  0.000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.915234  hitchhiker  0.00491963 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21930  major facilitator superfamily MFS_1  23.74 
 
 
432 aa  76.3  0.000000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2206  major facilitator transporter  27.11 
 
 
447 aa  75.9  0.000000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0369  major facilitator transporter  23.78 
 
 
418 aa  76.3  0.000000000001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.616869  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1533  permease  25.09 
 
 
404 aa  75.1  0.000000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1507  macrolide efflux protein  25.09 
 
 
404 aa  75.5  0.000000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.667551  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1652  permease  25.09 
 
 
404 aa  75.1  0.000000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.608559  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0692  major facilitator transporter  23.18 
 
 
439 aa  75.5  0.000000000002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2384  major facilitator transporter  27.09 
 
 
441 aa  75.1  0.000000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.930234  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2989  putative permease  26.2 
 
 
362 aa  74.7  0.000000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1892  transporter, putative  23.1 
 
 
420 aa  74.7  0.000000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0166254  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3575  major facilitator superfamily MFS_1  25.6 
 
 
416 aa  74.7  0.000000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1224  major facilitator superfamily MFS_1  26.46 
 
 
440 aa  74.7  0.000000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3257  tetracycline resistance determinant TetV  21.33 
 
 
414 aa  73.9  0.000000000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.160876  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2024  major facilitator superfamily MFS_1  29.35 
 
 
419 aa  74.3  0.000000000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0516  major facilitator superfamily MFS_1  27.65 
 
 
420 aa  74.3  0.000000000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4102  major facilitator transporter  24.48 
 
 
438 aa  73.6  0.000000000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.277859  normal  0.56542 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3976  major facilitator transporter  26.85 
 
 
407 aa  73.6  0.000000000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5212  major facilitator superfamily MFS_1  26.45 
 
 
408 aa  73.9  0.000000000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0948922  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11210  major facilitator superfamily MFS_1  24.45 
 
 
433 aa  73.9  0.000000000005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4618  major facilitator transporter  31.82 
 
 
426 aa  73.9  0.000000000005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1719  putative permease  24.72 
 
 
404 aa  73.6  0.000000000006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0476  major facilitator transporter  28.01 
 
 
474 aa  73.6  0.000000000006  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>