166 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Arth_0953 on replicon NC_008541
Organism: Arthrobacter sp. FB24



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008541  Arth_0953  major facilitator transporter  100 
 
 
407 aa  800    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.204782  n/a   
 
 
-
 
NC_009705  YpsIP31758_B0066  hypothetical protein  25.17 
 
 
410 aa  80.9  0.00000000000004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4370  transporter, major facilitator family  24.93 
 
 
410 aa  77.8  0.0000000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  5.0052999999999995e-22 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4528  major facilitator superfamily MFS_1  30.17 
 
 
409 aa  74.3  0.000000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.392098 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1508  major facilitator superfamily permease  22.25 
 
 
403 aa  73.6  0.000000000006  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0885  major facilitator transporter  27.96 
 
 
415 aa  71.6  0.00000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1904  amino acid adenylation domain-containing protein  26.04 
 
 
1833 aa  71.2  0.00000000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.844763  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2318  macrolide-efflux protein  22.5 
 
 
408 aa  66.6  0.0000000007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.31097  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2582  permease, putative  23.2 
 
 
408 aa  65.5  0.000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2402  permease  22.78 
 
 
408 aa  65.1  0.000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0859078  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2468  permease  22.99 
 
 
412 aa  65.5  0.000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.000564968  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2577  permease  22.78 
 
 
408 aa  65.1  0.000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.659755  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2649  permease  22.99 
 
 
412 aa  65.5  0.000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.765576  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0872  H+ Antiporter protein  22.4 
 
 
405 aa  65.1  0.000000002  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2393  permease; macrolide-efflux protein  22.41 
 
 
412 aa  63.9  0.000000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.366369  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2432  permease  22.41 
 
 
412 aa  63.5  0.000000006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0771594  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2667  putative permease  22.41 
 
 
412 aa  63.5  0.000000006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000524828 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2631  putative permease  22.4 
 
 
408 aa  63.5  0.000000006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0615976  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3575  major facilitator superfamily MFS_1  25.49 
 
 
416 aa  63.2  0.000000009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5208  major facilitator superfamily MFS_1  26.48 
 
 
432 aa  63.2  0.000000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.377398  normal  0.900425 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1808  permease, putative  23.55 
 
 
422 aa  62.4  0.00000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2355  macrolide-efflux protein  22.22 
 
 
408 aa  62.8  0.00000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000199839  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1559  multidrug resistance protein; tetracycline resistance determinant  23.82 
 
 
422 aa  62.8  0.00000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.285528  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1862  putative permease  23.82 
 
 
422 aa  62.4  0.00000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2678  MFS family major facilitator transporter  23.19 
 
 
410 aa  62.8  0.00000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2633  putative permease  24.06 
 
 
410 aa  62.8  0.00000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.778605  hitchhiker  0.00000416081 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1607  permease  24.1 
 
 
422 aa  62  0.00000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.137367  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1731  permease  24.1 
 
 
422 aa  62  0.00000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0598  major facilitator transporter  25.9 
 
 
427 aa  61.2  0.00000003  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  unclonable  0.00000000170409  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0548  major facilitator superfamily MFS_1  26.67 
 
 
419 aa  60.5  0.00000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.010876  decreased coverage  0.00150074 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3594  putative permease  21.84 
 
 
422 aa  60.5  0.00000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2526  H+ Antiporter protein  23.04 
 
 
411 aa  60.5  0.00000006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000735797  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1782  putative permease  23.27 
 
 
422 aa  60.5  0.00000006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1568  multidrug resistance protein; tetracycline resistance determinant  22.73 
 
 
422 aa  58.9  0.0000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.766892  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0356  major facilitator superfamily MFS_1  31.61 
 
 
407 aa  59.3  0.0000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0968  major facilitator superfamily MFS_1  29.72 
 
 
432 aa  59.7  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.896564  normal  0.510346 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1607  major facilitator transporter  22.44 
 
 
422 aa  59.3  0.0000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0422221  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2720  putative permease  22.29 
 
 
412 aa  58.5  0.0000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.093304  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1749  putative permease  22.91 
 
 
422 aa  58.2  0.0000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2682  permease, putative  21.89 
 
 
440 aa  57.8  0.0000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00193571  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2589  putative permease  21.94 
 
 
408 aa  58.2  0.0000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.59543e-18 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0352  putative multidrug efflux MFS transporter  31.1 
 
 
408 aa  56.6  0.0000007  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.986848  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21930  major facilitator superfamily MFS_1  22.49 
 
 
432 aa  56.6  0.0000007  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1536  major facilitator transporter  23.05 
 
 
406 aa  56.6  0.0000008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.29974  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0871  macrolide efflux protein, putative  23.63 
 
 
394 aa  55.8  0.000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3037  major facilitator superfamily MFS_1  23.98 
 
 
421 aa  55.8  0.000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2302  major facilitator superfamily MFS_1  28.36 
 
 
390 aa  55.5  0.000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.0000026904  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2339  putative multidrug efflux MFS transporter  27.98 
 
 
407 aa  55.5  0.000002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1364  major facilitator superfamily MFS_1  26.21 
 
 
441 aa  55.1  0.000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.0393169 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2487  major facilitator transporter  21.84 
 
 
412 aa  55.1  0.000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000357828  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1213  major facilitator superfamily MFS_1  26.91 
 
 
405 aa  54.7  0.000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.979166 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3129  amino acid adenylation domain-containing protein  25.63 
 
 
1816 aa  54.7  0.000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.975665  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_25090  Major facilitator superfamily transporter  25.52 
 
 
411 aa  54.3  0.000004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3365  major facilitator superfamily protein  29.62 
 
 
424 aa  53.9  0.000005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1016  major facilitator transporter  32.39 
 
 
393 aa  53.5  0.000006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.807332  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1795  hypothetical protein  22.81 
 
 
406 aa  53.1  0.000007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0875  major facilitator superfamily MFS_1  27.59 
 
 
441 aa  53.1  0.000008  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  hitchhiker  0.00780765  normal  0.0882707 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1323  major facilitator superfamily MFS_1  26.12 
 
 
429 aa  53.1  0.000009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.107888  normal  0.120407 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1747  major facilitator superfamily MFS_1  24.03 
 
 
463 aa  53.1  0.000009  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.192343  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0752  transporter, putative  27.67 
 
 
446 aa  52.4  0.00001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1505  permease; multidrug resistance protein  22.7 
 
 
406 aa  52.8  0.00001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0948022  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1496  permease  21.99 
 
 
408 aa  52.4  0.00001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2338  putative multidrug efflux MFS transporter  31.55 
 
 
409 aa  52.8  0.00001  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2101  major facilitator superfamily MFS_1  29.95 
 
 
447 aa  52.4  0.00001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2483  major facilitator transporter  29.93 
 
 
412 aa  52.8  0.00001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1738  hypothetical protein  22.46 
 
 
406 aa  52.4  0.00002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.342222  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1531  hypothetical protein  22.7 
 
 
406 aa  52  0.00002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1650  hypothetical protein  22.7 
 
 
406 aa  52  0.00002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2679  major facilitator superfamily MFS_1  26.42 
 
 
453 aa  51.6  0.00002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.000000322743  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0479  major facilitator superfamily MFS_1  28.31 
 
 
427 aa  52  0.00002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.742618 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9059  hypothetical protein  31.34 
 
 
431 aa  50.8  0.00004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3246  permease, putative  22.83 
 
 
417 aa  50.4  0.00006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0277963  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4774  major facilitator transporter  24.02 
 
 
443 aa  50.4  0.00006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2666  major facilitator transporter  29.69 
 
 
412 aa  50.1  0.00006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.178731  hitchhiker  0.000246371 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3257  tetracycline resistance determinant TetV  23.99 
 
 
414 aa  50.1  0.00006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.160876  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2987  permease; tetracycline resistance determinant  23.51 
 
 
414 aa  50.1  0.00007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.105308  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0543  major facilitator superfamily MFS_1  31.41 
 
 
448 aa  50.1  0.00007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4102  major facilitator transporter  21.61 
 
 
438 aa  50.1  0.00007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.277859  normal  0.56542 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2420  major facilitator transporter  30.52 
 
 
417 aa  50.1  0.00007  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.13347  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3025  permease  24.3 
 
 
419 aa  49.7  0.00008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3258  permease  24.3 
 
 
419 aa  49.7  0.00008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0297  major facilitator superfamily MFS_1  26.05 
 
 
423 aa  50.1  0.00008  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.0210722  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1398  major facilitator transporter  20.06 
 
 
422 aa  49.7  0.00009  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.902897  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1000  hypothetical protein  21.37 
 
 
418 aa  49.3  0.0001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00447157 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1861  major facilitator transporter  25.63 
 
 
413 aa  49.3  0.0001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0051281 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0990  major facilitator transporter  26.45 
 
 
414 aa  49.3  0.0001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  hitchhiker  0.00457828  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3270  permease, putative  24.19 
 
 
419 aa  48.1  0.0002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.719917  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1339  hypothetical protein  28.75 
 
 
395 aa  48.1  0.0002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1484  major facilitator transporter  27.12 
 
 
406 aa  48.5  0.0002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.178978  normal  0.0348378 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_36730  Major Facilitator Superfamily transporter  26.67 
 
 
446 aa  48.5  0.0002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.298448 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6842  Non-ribosomal peptide synthetase modules and related protein-like protein  27.16 
 
 
1876 aa  48.1  0.0003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.731708  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1884  major facilitator transporter  23.97 
 
 
427 aa  48.1  0.0003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.019643  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7163  major facilitator superfamily MFS_1  24.3 
 
 
414 aa  47.8  0.0003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.886054  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2947  macrolide-efflux protein  24.3 
 
 
419 aa  47.4  0.0004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0495728  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3256  putative permease  25.4 
 
 
314 aa  47.8  0.0004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1864  major facilitator transporter  30.32 
 
 
417 aa  47.4  0.0004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.436032 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3246  putative permease  24.65 
 
 
419 aa  47.8  0.0004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1753  major facilitator superfamily MFS_1  23.03 
 
 
393 aa  47.4  0.0005  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5797  hypothetical protein  26.7 
 
 
419 aa  47.4  0.0005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3103  major facilitator superfamily MFS_1  23.44 
 
 
434 aa  47.4  0.0005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  decreased coverage  0.00979206  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>