215 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Syncc9605_2339 on replicon NC_007516
Organism: Synechococcus sp. CC9605



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007516  Syncc9605_2339  putative multidrug efflux MFS transporter  100 
 
 		 407 aa  791    Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2338  putative multidrug efflux MFS transporter  72.73 
 
 		 409 aa  548  1e-155  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0352  putative multidrug efflux MFS transporter  78.13 
 
 		 408 aa  543  1e-153  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.986848  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_02151  major facilitator superfamily multidrug-efflux transporter  67.75 
 
 		 411 aa  492  9.999999999999999e-139  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0792  putative multidrug efflux MFS transporter  45.83 
 
 		 411 aa  283  5.000000000000001e-75  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.0904033 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0176  major facilitator transporter  29.73 
 
 		 426 aa  105  1e-21  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.379469  normal  0.234316 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0056  major facilitator superfamily MFS_1  26.53 
 
 		 433 aa  98.2  2e-19  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2206  major facilitator transporter  27.66 
 
 		 447 aa  97.1  5e-19  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2384  major facilitator transporter  26.09 
 
 		 441 aa  95.5  2e-18  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.930234  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3486  major facilitator transporter  28.9 
 
 		 450 aa  94.4  3e-18  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.719238  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0732  major facilitator superfamily MFS_1  26.49 
 
 		 412 aa  92.8  1e-17  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.000169813  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1807  hypothetical protein  30.92 
 
 		 553 aa  91.7  2e-17  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4358  major facilitator transporter  28.34 
 
 		 426 aa  90.5  5e-17  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.569485  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0181  major facilitator superfamily MFS_1  27.54 
 
 		 401 aa  90.1  7e-17  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0968  major facilitator superfamily MFS_1  26.81 
 
 		 432 aa  89.4  1e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.896564  normal  0.510346 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0875  major facilitator superfamily MFS_1  27.37 
 
 		 441 aa  87  5e-16  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  hitchhiker  0.00780765  normal  0.0882707 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2847  major facilitator superfamily MFS_1  28.03 
 
 		 432 aa  87  5e-16  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1000  hypothetical protein  27.61 
 
 		 418 aa  86.7  6e-16  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00447157 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0490  major facilitator superfamily MFS_1  28.5 
 
 		 461 aa  85.1  0.000000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5851  major facilitator superfamily MFS_1  29.09 
 
 		 425 aa  85.1  0.000000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.917844  normal  0.985013 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0062  major facilitator superfamily MFS_1  26.29 
 
 		 440 aa  83.2  0.000000000000008  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.175422  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1991  major facilitator superfamily MFS_1  26.5 
 
 		 450 aa  82.4  0.00000000000001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.762129  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3037  major facilitator superfamily MFS_1  24.23 
 
 		 421 aa  82  0.00000000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1272  major facilitator transporter  27.05 
 
 		 418 aa  81.6  0.00000000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0768  major facilitator superfamily MFS_1  27.02 
 
 		 456 aa  81.6  0.00000000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1974  hypothetical protein  23.89 
 
 		 424 aa  80.5  0.00000000000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.00936884  normal  0.989231 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3926  major facilitator transporter  29.22 
 
 		 457 aa  80.1  0.00000000000006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1224  major facilitator superfamily MFS_1  25.75 
 
 		 440 aa  78.6  0.0000000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0752  transporter, putative  25 
 
 		 446 aa  77.8  0.0000000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0053  transporter, putative  25.95 
 
 		 431 aa  77.8  0.0000000000003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3727  major facilitator transporter  24.93 
 
 		 416 aa  77.8  0.0000000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.274242  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0491  major facilitator superfamily MFS_1  27.64 
 
 		 424 aa  78.2  0.0000000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2392  major facilitator superfamily MFS_1  27.93 
 
 		 415 aa  77.4  0.0000000000004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.000384037  normal  0.689164 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2952  major facilitator transporter  26.24 
 
 		 405 aa  77  0.0000000000005  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5797  hypothetical protein  25.96 
 
 		 419 aa  77  0.0000000000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2627  major facilitator transporter  25.41 
 
 		 410 aa  77  0.0000000000006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0087  major facilitator transporter  23.1 
 
 		 436 aa  76.6  0.0000000000007  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3206  major facilitator transporter  26.67 
 
 		 413 aa  76.6  0.0000000000007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.130501  normal  0.812744 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_2010  transporter, putative  22.75 
 
 		 429 aa  76.3  0.0000000000009  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33950  arabinose efflux permease family protein  24.65 
 
 		 414 aa  76.3  0.0000000000009  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.466548  normal  0.73086 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2814  major facilitator superfamily MFS_1  26.1 
 
 		 402 aa  75.9  0.000000000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4055  major facilitator transporter  26.26 
 
 		 413 aa  75.9  0.000000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0792  major facilitator transporter  25.14 
 
 		 450 aa  75.9  0.000000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4311  major facilitator transporter  26.26 
 
 		 413 aa  75.9  0.000000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.481156  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1284  major facilitator superfamily MFS_1  25.86 
 
 		 431 aa  75.9  0.000000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1167  protein of unknown function DUF894, DitE  29.18 
 
 		 529 aa  75.9  0.000000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0746  hypothetical protein  26.56 
 
 		 431 aa  75.5  0.000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0165656  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3976  major facilitator transporter  24.57 
 
 		 407 aa  75.1  0.000000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4779  major facilitator transporter  25.21 
 
 		 428 aa  75.5  0.000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00000206756  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2022  major facilitator superfamily multidrug efflux transporter  24.59 
 
 		 446 aa  74.3  0.000000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.384962  normal  0.0286256 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1030  major facilitator superfamily MFS_1  28.49 
 
 		 419 aa  73.9  0.000000000005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5813  major facilitator superfamily MFS_1  24.59 
 
 		 446 aa  73.9  0.000000000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.243583  normal  0.354769 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6343  major facilitator superfamily MFS_1  23.1 
 
 		 435 aa  73.6  0.000000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.510834  hitchhiker  0.000175269 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5163  protein of unknown function DUF894, DitE  28.31 
 
 		 530 aa  73.2  0.000000000008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0799644 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2024  major facilitator superfamily MFS_1  22.74 
 
 		 419 aa  73.2  0.000000000008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3952  major facilitator transporter  26.24 
 
 		 413 aa  73.2  0.000000000009  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5814  major facilitator superfamily MFS_1  23.69 
 
 		 423 aa  72.8  0.00000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.915234  hitchhiker  0.00491963 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3035  MFS family transporter  27.25 
 
 		 425 aa  72  0.00000000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1700  hypothetical protein  24.72 
 
 		 412 aa  71.6  0.00000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.761256  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0395  permease  21.97 
 
 		 430 aa  71.2  0.00000000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0177527  normal  0.113221 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7222  major facilitator transporter  28.38 
 
 		 441 aa  71.2  0.00000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.237478  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0476  major facilitator transporter  26.46 
 
 		 474 aa  71.2  0.00000000003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42320  major facilitator transpoter  29.63 
 
 		 535 aa  71.2  0.00000000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.956299  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3762  major facilitator transporter  27 
 
 		 425 aa  70.9  0.00000000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2848  major facilitator superfamily MFS_1  26.26 
 
 		 426 aa  70.5  0.00000000005  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2384  protein of unknown function DUF894 DitE  25.64 
 
 		 549 aa  70.1  0.00000000006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.123744  normal  0.932575 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4296  major facilitator transporter  24.65 
 
 		 416 aa  70.1  0.00000000007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.970953 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0110  major facilitator transporter  26.56 
 
 		 429 aa  69.7  0.00000000009  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4222  major facilitator transporter  26.45 
 
 		 432 aa  68.9  0.0000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.399211  hitchhiker  0.00102981 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0684  major facilitator transporter  24.16 
 
 		 412 aa  69.3  0.0000000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00476606  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0091  major facilitator superfamily MFS_1  26.06 
 
 		 442 aa  68.9  0.0000000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4005  major facilitator superfamily MFS_1  26.56 
 
 		 442 aa  68.6  0.0000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.0701044 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1620  major facilitator superfamily MFS_1  22.1 
 
 		 417 aa  68.6  0.0000000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0009  protein of unknown function DUF894, DitE  28.29 
 
 		 527 aa  68.9  0.0000000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0844  major facilitator superfamily MFS_1  27.25 
 
 		 403 aa  67.8  0.0000000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2519  major facilitator superfamily MFS_1  25.13 
 
 		 404 aa  67.8  0.0000000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1325  major facilitator superfamily MFS_1  27.33 
 
 		 419 aa  67.8  0.0000000003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.327447 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0689  major facilitator superfamily MFS_1  25.38 
 
 		 413 aa  67  0.0000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.549457  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2027  major facilitator superfamily MFS_1  27.3 
 
 		 436 aa  67  0.0000000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0234  protein of unknown function DUF894, DitE  26.51 
 
 		 419 aa  67  0.0000000006  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4326  major facilitator superfamily MFS_1  23.71 
 
 		 404 aa  67  0.0000000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5212  major facilitator superfamily MFS_1  24.22 
 
 		 408 aa  66.6  0.0000000008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0948922  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1677  hypothetical protein  24.81 
 
 		 435 aa  65.5  0.000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1491  major facilitator transporter  26.45 
 
 		 390 aa  65.9  0.000000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.326017  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1445  major facilitator transporter  26.45 
 
 		 390 aa  65.9  0.000000001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00616907  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1484  major facilitator transporter  23.16 
 
 		 406 aa  65.9  0.000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.178978  normal  0.0348378 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2380  major facilitator transporter  25.14 
 
 		 474 aa  65.5  0.000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0389897  normal  0.03889 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_29210  putative MFS transporter  28.61 
 
 		 529 aa  65.1  0.000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.512014 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1578  MFS family transporter  28.81 
 
 		 529 aa  64.7  0.000000003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0176553  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3596  major facilitator superfamily MFS_1  26.8 
 
 		 417 aa  64.7  0.000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0098  major facilitator superfamily MFS_1  23.56 
 
 		 428 aa  64.3  0.000000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0242  putative integral membrane efflux protein  24.16 
 
 		 424 aa  63.9  0.000000004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.305732  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0651  major facilitator superfamily MFS_1  25.13 
 
 		 413 aa  63.9  0.000000005  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1670  protein of unknown function DUF894 DitE  28.87 
 
 		 532 aa  63.5  0.000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0165754  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3978  transmembrane transport protein  28.46 
 
 		 528 aa  63.5  0.000000006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_19310  hypothetical protein  24.58 
 
 		 571 aa  63.2  0.000000007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30800  arabinose efflux permease family protein  25.27 
 
 		 452 aa  63.2  0.000000008  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3970  protein of unknown function DUF894 DitE  26.23 
 
 		 535 aa  63.2  0.000000008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2679  major facilitator superfamily MFS_1  25.93 
 
 		 453 aa  62.4  0.00000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.000000322743  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1327  major facilitator superfamily MFS_1  22.41 
 
 		 433 aa  62.8  0.00000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>