247 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Syncc9902_0352 on replicon NC_007513
Organism: Synechococcus sp. CC9902



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007513  Syncc9902_0352  putative multidrug efflux MFS transporter  100 
 
 		 408 aa  794    Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.986848  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2339  putative multidrug efflux MFS transporter  78.13 
 
 		 407 aa  592  1e-168  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2338  putative multidrug efflux MFS transporter  70.66 
 
 		 409 aa  535  1e-151  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_02151  major facilitator superfamily multidrug-efflux transporter  68.33 
 
 		 411 aa  489  1e-137  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0792  putative multidrug efflux MFS transporter  43.83 
 
 		 411 aa  287  2e-76  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.0904033 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0176  major facilitator transporter  28.37 
 
 		 426 aa  112  1.0000000000000001e-23  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.379469  normal  0.234316 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3486  major facilitator transporter  29.67 
 
 		 450 aa  110  4.0000000000000004e-23  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.719238  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6343  major facilitator superfamily MFS_1  27.86 
 
 		 435 aa  104  3e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.510834  hitchhiker  0.000175269 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2952  major facilitator transporter  26.93 
 
 		 405 aa  101  2e-20  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2814  major facilitator superfamily MFS_1  27.27 
 
 		 402 aa  101  3e-20  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0968  major facilitator superfamily MFS_1  28.14 
 
 		 432 aa  98.6  2e-19  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.896564  normal  0.510346 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3206  major facilitator transporter  27.82 
 
 		 413 aa  98.2  3e-19  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.130501  normal  0.812744 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4055  major facilitator transporter  27.56 
 
 		 413 aa  97.8  3e-19  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4311  major facilitator transporter  27.56 
 
 		 413 aa  97.8  3e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.481156  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2847  major facilitator superfamily MFS_1  27.94 
 
 		 432 aa  97.4  4e-19  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1272  major facilitator transporter  28.02 
 
 		 418 aa  96.7  6e-19  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4358  major facilitator transporter  28.14 
 
 		 426 aa  96.3  9e-19  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.569485  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2024  major facilitator superfamily MFS_1  26.32 
 
 		 419 aa  95.9  1e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0056  major facilitator superfamily MFS_1  25.43 
 
 		 433 aa  95.1  2e-18  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0490  major facilitator superfamily MFS_1  27.37 
 
 		 461 aa  95.1  2e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1991  major facilitator superfamily MFS_1  26.37 
 
 		 450 aa  95.5  2e-18  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.762129  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1974  hypothetical protein  24.51 
 
 		 424 aa  94  5e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.00936884  normal  0.989231 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0875  major facilitator superfamily MFS_1  27.98 
 
 		 441 aa  92.4  1e-17  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  hitchhiker  0.00780765  normal  0.0882707 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2384  major facilitator transporter  27.8 
 
 		 441 aa  92.4  1e-17  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.930234  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3727  major facilitator transporter  26.44 
 
 		 416 aa  92  2e-17  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.274242  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3976  major facilitator transporter  24.74 
 
 		 407 aa  90.5  4e-17  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3926  major facilitator transporter  29.63 
 
 		 457 aa  90.5  4e-17  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5851  major facilitator superfamily MFS_1  27.47 
 
 		 425 aa  90.1  7e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.917844  normal  0.985013 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2206  major facilitator transporter  28 
 
 		 447 aa  89.4  1e-16  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0491  major facilitator superfamily MFS_1  28.21 
 
 		 424 aa  89  1e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1000  hypothetical protein  25.69 
 
 		 418 aa  88.2  2e-16  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00447157 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2627  major facilitator transporter  24.63 
 
 		 410 aa  88.2  2e-16  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1700  hypothetical protein  26.02 
 
 		 412 aa  87.8  3e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.761256  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0792  major facilitator transporter  27.49 
 
 		 450 aa  87.8  3e-16  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1224  major facilitator superfamily MFS_1  26.78 
 
 		 440 aa  87  5e-16  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1325  major facilitator superfamily MFS_1  27.76 
 
 		 419 aa  87  6e-16  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.327447 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0732  major facilitator superfamily MFS_1  25 
 
 		 412 aa  86.7  7e-16  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.000169813  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0395  permease  24.29 
 
 		 430 aa  85.9  0.000000000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0177527  normal  0.113221 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33950  arabinose efflux permease family protein  26.87 
 
 		 414 aa  85.9  0.000000000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.466548  normal  0.73086 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0062  major facilitator superfamily MFS_1  24.65 
 
 		 440 aa  85.5  0.000000000000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.175422  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5814  major facilitator superfamily MFS_1  22.66 
 
 		 423 aa  85.1  0.000000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.915234  hitchhiker  0.00491963 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0768  major facilitator superfamily MFS_1  26.24 
 
 		 456 aa  84.3  0.000000000000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1484  major facilitator transporter  24.39 
 
 		 406 aa  84.3  0.000000000000004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.178978  normal  0.0348378 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0087  major facilitator transporter  22.48 
 
 		 436 aa  83.6  0.000000000000006  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2022  major facilitator superfamily multidrug efflux transporter  24.5 
 
 		 446 aa  83.2  0.000000000000008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.384962  normal  0.0286256 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4296  major facilitator transporter  25.72 
 
 		 416 aa  82.4  0.00000000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.970953 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3037  major facilitator superfamily MFS_1  23.41 
 
 		 421 aa  82  0.00000000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1807  hypothetical protein  28.93 
 
 		 553 aa  82  0.00000000000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4326  major facilitator superfamily MFS_1  26.26 
 
 		 404 aa  81.6  0.00000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0181  major facilitator superfamily MFS_1  26.33 
 
 		 401 aa  82  0.00000000000002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1030  major facilitator superfamily MFS_1  27.82 
 
 		 419 aa  81.6  0.00000000000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3952  major facilitator transporter  26.72 
 
 		 413 aa  81.3  0.00000000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4779  major facilitator transporter  25.32 
 
 		 428 aa  80.9  0.00000000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00000206756  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0091  major facilitator superfamily MFS_1  25 
 
 		 442 aa  80.5  0.00000000000005  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2679  major facilitator superfamily MFS_1  30 
 
 		 453 aa  80.5  0.00000000000005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.000000322743  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0689  major facilitator superfamily MFS_1  25.19 
 
 		 413 aa  80.5  0.00000000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.549457  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0746  hypothetical protein  27.76 
 
 		 431 aa  80.5  0.00000000000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0165656  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5813  major facilitator superfamily MFS_1  24.71 
 
 		 446 aa  80.1  0.00000000000007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.243583  normal  0.354769 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7222  major facilitator transporter  27.79 
 
 		 441 aa  80.1  0.00000000000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.237478  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5163  protein of unknown function DUF894, DitE  27.3 
 
 		 530 aa  79.3  0.0000000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0799644 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1259  major facilitator transporter  30.19 
 
 		 491 aa  78.6  0.0000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0884652  normal  0.0333983 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0786  major facilitator transporter  24.29 
 
 		 418 aa  78.2  0.0000000000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0752  transporter, putative  26.34 
 
 		 446 aa  78.2  0.0000000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2519  major facilitator superfamily MFS_1  25 
 
 		 404 aa  77.8  0.0000000000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1167  protein of unknown function DUF894, DitE  28.21 
 
 		 529 aa  77.8  0.0000000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2027  major facilitator superfamily MFS_1  27.25 
 
 		 436 aa  77.8  0.0000000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1284  major facilitator superfamily MFS_1  23.82 
 
 		 431 aa  77.4  0.0000000000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0110  major facilitator transporter  25.68 
 
 		 429 aa  76.6  0.0000000000007  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_2010  transporter, putative  22.19 
 
 		 429 aa  75.5  0.000000000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2392  major facilitator superfamily MFS_1  25.99 
 
 		 415 aa  75.5  0.000000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.000384037  normal  0.689164 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0844  major facilitator superfamily MFS_1  26.56 
 
 		 403 aa  74.3  0.000000000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0053  transporter, putative  25.14 
 
 		 431 aa  74.3  0.000000000004  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1670  protein of unknown function DUF894 DitE  26.89 
 
 		 532 aa  73.9  0.000000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0165754  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3596  major facilitator superfamily MFS_1  27.88 
 
 		 417 aa  73.9  0.000000000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2848  major facilitator superfamily MFS_1  26.35 
 
 		 426 aa  73.6  0.000000000006  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0476  major facilitator transporter  24.81 
 
 		 474 aa  73.6  0.000000000006  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7122  MFS permease  26.67 
 
 		 426 aa  73.6  0.000000000007  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5212  major facilitator superfamily MFS_1  24.62 
 
 		 408 aa  73.2  0.000000000008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0948922  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3035  MFS family transporter  25.79 
 
 		 425 aa  72.8  0.00000000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5433  major facilitator superfamily MFS_1  26.7 
 
 		 417 aa  72.8  0.00000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.317246  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3762  major facilitator transporter  25.79 
 
 		 425 aa  72.8  0.00000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5797  hypothetical protein  23.6 
 
 		 419 aa  71.6  0.00000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2380  major facilitator transporter  24.29 
 
 		 474 aa  72.4  0.00000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0389897  normal  0.03889 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1272  protein of unknown function DUF894 DitE  30.55 
 
 		 551 aa  71.6  0.00000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.951526 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0420  major facilitator transporter  27.08 
 
 		 414 aa  71.2  0.00000000003  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3881  major facilitator transporter  23.26 
 
 		 509 aa  71.2  0.00000000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1250  major facilitator superfamily MFS_1  25.83 
 
 		 378 aa  71.2  0.00000000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1327  major facilitator superfamily MFS_1  23.27 
 
 		 433 aa  70.9  0.00000000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1049  major facilitator superfamily MFS_1  26.67 
 
 		 421 aa  70.5  0.00000000005  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0819  major facilitator superfamily MFS_1  28.23 
 
 		 452 aa  70.5  0.00000000006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5251  transporter, putative  27.2 
 
 		 532 aa  69.7  0.00000000008  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0684  major facilitator transporter  23.62 
 
 		 412 aa  69.7  0.00000000009  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00476606  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1508  major facilitator superfamily permease  22.8 
 
 		 403 aa  69.7  0.00000000009  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5002  MFS family membrane efflux protein  23.51 
 
 		 441 aa  68.9  0.0000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.151073  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3288  major facilitator superfamily protein  27.59 
 
 		 405 aa  68.9  0.0000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.234831 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3626  major facilitator transporter  24.53 
 
 		 413 aa  69.7  0.0000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.348332  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30800  arabinose efflux permease family protein  25.73 
 
 		 452 aa  69.3  0.0000000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4354  major facilitator superfamily MFS_1  22.81 
 
 		 431 aa  68.6  0.0000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.95952  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1620  major facilitator superfamily MFS_1  21.47 
 
 		 417 aa  67.4  0.0000000004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4005  major facilitator superfamily MFS_1  23.38 
 
 		 442 aa  67.4  0.0000000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.0701044 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>