More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sare_2666 on replicon NC_009953
Organism: Salinispora arenicola CNS-205



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009953  Sare_2666  major facilitator transporter  100 
 
 
412 aa  771    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.178731  hitchhiker  0.000246371 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2483  major facilitator transporter  87.14 
 
 
412 aa  637    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2680  major facilitator superfamily MFS_1  34.52 
 
 
414 aa  171  2e-41  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2357  major facilitator superfamily MFS_1  37.37 
 
 
418 aa  169  6e-41  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.561235  normal  0.233215 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1323  major facilitator superfamily MFS_1  30.68 
 
 
429 aa  166  6.9999999999999995e-40  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.107888  normal  0.120407 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_36730  Major Facilitator Superfamily transporter  35.48 
 
 
446 aa  165  1.0000000000000001e-39  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.298448 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_02090  Major Facilitator Superfamily transporter  36.34 
 
 
424 aa  163  4.0000000000000004e-39  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5018  major facilitator superfamily MFS_1  34.79 
 
 
422 aa  133  3.9999999999999996e-30  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4461  H+ antiporter protein  30 
 
 
414 aa  110  5e-23  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0135  major facilitator transporter  35.61 
 
 
445 aa  110  6e-23  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3972  H+ antiporter protein  29.73 
 
 
418 aa  109  8.000000000000001e-23  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.14454  normal  0.0420605 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2039  major facilitator superfamily MFS_1  34.82 
 
 
428 aa  109  9.000000000000001e-23  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3958  drug antiporter protein  29.73 
 
 
418 aa  109  1e-22  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4032  H+ antiporter protein  29.73 
 
 
418 aa  109  1e-22  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2234  H+ antiporter protein  30.99 
 
 
412 aa  107  3e-22  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0141  major facilitator transporter  36.07 
 
 
478 aa  106  9e-22  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000428453 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2769  major facilitator superfamily MFS_1  31.65 
 
 
417 aa  104  3e-21  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.172375  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11284  integral membrane transport protein  28.32 
 
 
419 aa  93.6  6e-18  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4370  transporter, major facilitator family  23.86 
 
 
410 aa  87.8  3e-16  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  5.0052999999999995e-22 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1932  major facilitator superfamily MFS_1  27.99 
 
 
406 aa  81.3  0.00000000000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3575  major facilitator superfamily MFS_1  30.17 
 
 
416 aa  79.7  0.00000000000008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1600  major facilitator transporter  24.48 
 
 
405 aa  79.3  0.0000000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2303  major facilitator transporter  31.33 
 
 
435 aa  79.3  0.0000000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.533597  normal  0.893433 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1568  major facilitator transporter  24.48 
 
 
405 aa  79.3  0.0000000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5208  major facilitator superfamily MFS_1  31.28 
 
 
432 aa  76.3  0.000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.377398  normal  0.900425 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0786  major facilitator transporter  21.64 
 
 
403 aa  75.5  0.000000000002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.104451  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0516  major facilitator superfamily MFS_1  26.15 
 
 
420 aa  75.5  0.000000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9059  hypothetical protein  28.27 
 
 
431 aa  75.1  0.000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0062  major facilitator superfamily MFS_1  24.22 
 
 
440 aa  74.7  0.000000000003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.175422  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6664  major facilitator transporter  30.7 
 
 
414 aa  74.3  0.000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.740991 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_09700  Major Facilitator Superfamily transporter  27.14 
 
 
469 aa  74.3  0.000000000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.854337  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2318  macrolide-efflux protein  22.92 
 
 
408 aa  73.9  0.000000000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.31097  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2355  macrolide-efflux protein  23.62 
 
 
408 aa  73.6  0.000000000006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000199839  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1904  amino acid adenylation domain-containing protein  20.97 
 
 
1833 aa  73.6  0.000000000006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.844763  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1940  putative transporter  25.45 
 
 
420 aa  73.6  0.000000000007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000531086  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1491  major facilitator transporter  22.08 
 
 
390 aa  73.2  0.000000000007  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.326017  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1445  major facilitator transporter  22.08 
 
 
390 aa  73.2  0.000000000007  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00616907  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0087  major facilitator transporter  24.48 
 
 
436 aa  73.2  0.000000000008  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1564  major facilitator superfamily MFS_1  29.61 
 
 
401 aa  72.8  0.000000000009  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.194805  normal  0.215005 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2402  permease  23.02 
 
 
408 aa  71.2  0.00000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0859078  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2577  permease  23.02 
 
 
408 aa  71.2  0.00000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.659755  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3952  major facilitator transporter  25.75 
 
 
413 aa  70.9  0.00000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2589  putative permease  23.42 
 
 
408 aa  70.5  0.00000000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.59543e-18 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0476  major facilitator transporter  27.32 
 
 
474 aa  70.5  0.00000000005  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1892  transporter, putative  25.19 
 
 
420 aa  70.1  0.00000000006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0166254  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3061  major facilitator superfamily MFS_1  27.57 
 
 
429 aa  70.1  0.00000000007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  decreased coverage  0.00310805  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1630  transporter  25.32 
 
 
420 aa  69.7  0.00000000009  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1534  major facilitator superfamily MFS_1  29.44 
 
 
438 aa  69.7  0.00000000009  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.565747  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0732  major facilitator superfamily MFS_1  26.79 
 
 
412 aa  68.9  0.0000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.000169813  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19250  major facilitator superfamily MFS_1  26.5 
 
 
444 aa  68.2  0.0000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00108172  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1864  putative transporter  25.06 
 
 
420 aa  68.2  0.0000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.42079e-47 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0365  major facilitator transporter  28.27 
 
 
427 aa  68.6  0.0000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0592694 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7785  major facilitator superfamily MFS_1  27.3 
 
 
420 aa  68.6  0.0000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.157303 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1827  putative transporter  26.02 
 
 
420 aa  68.9  0.0000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2631  putative permease  23.95 
 
 
408 aa  68.2  0.0000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0615976  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2699  permease, putative  22.7 
 
 
410 aa  67.4  0.0000000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.000249599  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3276  putative permease  22.87 
 
 
419 aa  67.4  0.0000000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.550677  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3010  macrolide-efflux protein  22.87 
 
 
419 aa  67.4  0.0000000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2582  permease, putative  21.88 
 
 
408 aa  67  0.0000000006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3270  permease, putative  22.87 
 
 
419 aa  67  0.0000000006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.719917  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1684  transporter  24.42 
 
 
420 aa  66.6  0.0000000007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1662  major facilitator superfamily MFS_1  22.13 
 
 
405 aa  67  0.0000000007  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3970  protein of unknown function DUF894 DitE  29.62 
 
 
535 aa  66.6  0.0000000007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1819  transporter  24.42 
 
 
420 aa  66.6  0.0000000007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000952932  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1250  major facilitator transporter  25.59 
 
 
425 aa  66.6  0.0000000007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3515  putative transporter  25.77 
 
 
420 aa  66.6  0.0000000007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3246  putative permease  22.25 
 
 
419 aa  66.6  0.0000000008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2733  major facilitator superfamily MFS_1  27.56 
 
 
424 aa  66.2  0.0000000009  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1861  major facilitator transporter  25.54 
 
 
413 aa  66.2  0.000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0051281 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3365  major facilitator superfamily protein  30.25 
 
 
424 aa  66.2  0.000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2686  tetracycline resistance determinant TetV  22.22 
 
 
432 aa  65.1  0.000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2412  permease  21.47 
 
 
434 aa  65.1  0.000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2947  macrolide-efflux protein  23.17 
 
 
419 aa  65.5  0.000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0495728  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1603  putative permease  26.75 
 
 
421 aa  65.5  0.000000002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.282172  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0395  permease  24.23 
 
 
430 aa  65.1  0.000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0177527  normal  0.113221 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2679  putative permease  21.74 
 
 
434 aa  65.1  0.000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000144821 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3025  permease  23.17 
 
 
419 aa  64.7  0.000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0091  major facilitator superfamily MFS_1  24.75 
 
 
442 aa  64.7  0.000000003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3258  permease  23.17 
 
 
419 aa  64.7  0.000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0234  protein of unknown function DUF894, DitE  26.09 
 
 
419 aa  64.3  0.000000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0056  major facilitator superfamily MFS_1  25.14 
 
 
433 aa  64.7  0.000000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2481  permease  21.74 
 
 
434 aa  64.3  0.000000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.199316  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0369  major facilitator transporter  21.77 
 
 
418 aa  64.3  0.000000004  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.616869  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2664  permease  21.74 
 
 
434 aa  64.3  0.000000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4222  major facilitator transporter  26.26 
 
 
432 aa  63.9  0.000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.399211  hitchhiker  0.00102981 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0885  major facilitator transporter  29.17 
 
 
415 aa  63.5  0.000000006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2289  major facilitator transporter  31.92 
 
 
432 aa  63.5  0.000000006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.995339  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1114  major facilitator superfamily MFS_1  23.62 
 
 
415 aa  63.5  0.000000007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4101  major facilitator superfamily MFS_1  28 
 
 
432 aa  63.2  0.000000008  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.438153 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0593  major facilitator transporter  23.02 
 
 
413 aa  62.4  0.00000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.00370301  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11210  major facilitator superfamily MFS_1  24.07 
 
 
433 aa  62.4  0.00000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2443  permease  21.74 
 
 
434 aa  62.8  0.00000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00000794944  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_23190  arabinose efflux permease family protein  27.99 
 
 
424 aa  62.4  0.00000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.108135  normal  0.595786 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0578  major facilitator transporter  23.02 
 
 
413 aa  62.4  0.00000001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0133344  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3573  major facilitator transporter  28.41 
 
 
416 aa  62  0.00000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3450  major facilitator superfamily MFS_1  26.74 
 
 
499 aa  62  0.00000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00033474 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2625  tetracycline resistance determinant TetV  22.49 
 
 
431 aa  62  0.00000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000010691 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0303  major facilitator superfamily MFS_1  32.84 
 
 
426 aa  62  0.00000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0634781  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0667  major facilitator superfamily MFS_1  27 
 
 
430 aa  62.4  0.00000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.00302666  hitchhiker  0.0000374441 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1012  protein of unknown function DUF894, DitE  28.29 
 
 
409 aa  61.6  0.00000003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.171336 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>