More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TBFG_11284 on replicon NC_009565
Organism: Mycobacterium tuberculosis F11



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009565  TBFG_11284  integral membrane transport protein  100 
 
 
419 aa  811    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4461  H+ antiporter protein  69.83 
 
 
414 aa  544  1e-153  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3958  drug antiporter protein  68.8 
 
 
418 aa  513  1e-144  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4032  H+ antiporter protein  68.8 
 
 
418 aa  513  1e-144  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3972  H+ antiporter protein  68.55 
 
 
418 aa  512  1e-144  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.14454  normal  0.0420605 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2234  H+ antiporter protein  69.25 
 
 
412 aa  513  1e-144  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0135  major facilitator transporter  49.75 
 
 
445 aa  313  3.9999999999999997e-84  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0141  major facilitator transporter  50.66 
 
 
478 aa  302  8.000000000000001e-81  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000428453 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2769  major facilitator superfamily MFS_1  36.53 
 
 
417 aa  190  2.9999999999999997e-47  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.172375  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1564  major facilitator superfamily MFS_1  37.64 
 
 
401 aa  167  2.9999999999999998e-40  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.194805  normal  0.215005 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_09700  Major Facilitator Superfamily transporter  32.91 
 
 
469 aa  125  2e-27  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.854337  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0667  major facilitator superfamily MFS_1  30.81 
 
 
430 aa  125  2e-27  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.00302666  hitchhiker  0.0000374441 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_36730  Major Facilitator Superfamily transporter  30.62 
 
 
446 aa  118  1.9999999999999998e-25  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.298448 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1323  major facilitator superfamily MFS_1  30.79 
 
 
429 aa  117  3.9999999999999997e-25  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.107888  normal  0.120407 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2666  major facilitator transporter  28.32 
 
 
412 aa  109  9.000000000000001e-23  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.178731  hitchhiker  0.000246371 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2420  major facilitator transporter  30.5 
 
 
417 aa  106  7e-22  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.13347  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2483  major facilitator transporter  27.04 
 
 
412 aa  100  5e-20  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2680  major facilitator superfamily MFS_1  29.98 
 
 
414 aa  98.2  2e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2858  major facilitator superfamily MFS_1  32.28 
 
 
465 aa  97.1  5e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.192123  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1568  major facilitator transporter  23.1 
 
 
405 aa  89  2e-16  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1600  major facilitator transporter  23.1 
 
 
405 aa  89  2e-16  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0684  major facilitator transporter  24.07 
 
 
412 aa  87.8  3e-16  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00476606  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1508  major facilitator superfamily permease  23.47 
 
 
403 aa  86.7  7e-16  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4370  transporter, major facilitator family  25.97 
 
 
410 aa  84  0.000000000000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  5.0052999999999995e-22 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2357  major facilitator superfamily MFS_1  30.87 
 
 
418 aa  82.8  0.000000000000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.561235  normal  0.233215 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1904  amino acid adenylation domain-containing protein  20.05 
 
 
1833 aa  82.8  0.00000000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.844763  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1747  major facilitator superfamily MFS_1  25 
 
 
463 aa  82.4  0.00000000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.192343  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3145  major facilitator superfamily MFS_1  29.09 
 
 
440 aa  82.8  0.00000000000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.985088  normal  0.131643 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_02090  Major Facilitator Superfamily transporter  30 
 
 
424 aa  81.6  0.00000000000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2326  major facilitator superfamily MFS_1  23.22 
 
 
410 aa  80.1  0.00000000000006  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2039  major facilitator superfamily MFS_1  29.62 
 
 
428 aa  80.1  0.00000000000007  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0732  major facilitator superfamily MFS_1  26.57 
 
 
412 aa  77  0.0000000000006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.000169813  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0476  major facilitator transporter  28.29 
 
 
474 aa  76.6  0.0000000000008  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1327  major facilitator superfamily MFS_1  26.2 
 
 
433 aa  76.3  0.000000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1491  major facilitator transporter  20.96 
 
 
390 aa  75.5  0.000000000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.326017  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2589  putative permease  24.88 
 
 
408 aa  75.1  0.000000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.59543e-18 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1445  major facilitator transporter  20.96 
 
 
390 aa  75.5  0.000000000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00616907  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0516  major facilitator superfamily MFS_1  28.4 
 
 
420 aa  73.6  0.000000000006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0056  major facilitator superfamily MFS_1  26.04 
 
 
433 aa  73.6  0.000000000007  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2402  permease  24.88 
 
 
408 aa  73.2  0.000000000009  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0859078  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2577  permease  24.88 
 
 
408 aa  73.2  0.000000000009  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.659755  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2001  major facilitator transporter  29.48 
 
 
434 aa  72.8  0.00000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.548346  hitchhiker  0.00155149 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2582  permease, putative  24.3 
 
 
408 aa  72.8  0.00000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2355  macrolide-efflux protein  25.27 
 
 
408 aa  72.8  0.00000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000199839  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2318  macrolide-efflux protein  24.42 
 
 
408 aa  72.8  0.00000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.31097  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1613  major facilitator superfamily MFS_1  27.64 
 
 
418 aa  72.8  0.00000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000260989  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0578  major facilitator transporter  24.36 
 
 
413 aa  71.6  0.00000000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0133344  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1250  major facilitator transporter  29.23 
 
 
425 aa  72  0.00000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4328  major facilitator transporter  26.88 
 
 
430 aa  71.6  0.00000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2631  putative permease  24.19 
 
 
408 aa  71.6  0.00000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0615976  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3365  major facilitator superfamily protein  31.88 
 
 
424 aa  72  0.00000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4751  major facilitator superfamily protein  26.27 
 
 
421 aa  71.6  0.00000000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.092373  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0593  major facilitator transporter  24.36 
 
 
413 aa  71.6  0.00000000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.00370301  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1572  major facilitator transporter  27.4 
 
 
415 aa  71.2  0.00000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.58248  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1662  major facilitator superfamily MFS_1  22.51 
 
 
405 aa  70.9  0.00000000004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2384  major facilitator transporter  27.3 
 
 
441 aa  70.9  0.00000000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.930234  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1864  major facilitator transporter  25 
 
 
417 aa  70.5  0.00000000005  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.436032 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5208  major facilitator superfamily MFS_1  27.99 
 
 
432 aa  70.5  0.00000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.377398  normal  0.900425 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2392  major facilitator superfamily MFS_1  27.91 
 
 
415 aa  70.1  0.00000000006  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.000384037  normal  0.689164 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0786  major facilitator transporter  28.84 
 
 
418 aa  70.5  0.00000000006  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4779  major facilitator transporter  25.94 
 
 
428 aa  69.7  0.0000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00000206756  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5018  major facilitator superfamily MFS_1  27.67 
 
 
422 aa  68.9  0.0000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3575  major facilitator superfamily MFS_1  27.25 
 
 
416 aa  68.9  0.0000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1250  major facilitator superfamily MFS_1  25.77 
 
 
378 aa  68.6  0.0000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3976  major facilitator transporter  25.67 
 
 
407 aa  68.6  0.0000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0365  major facilitator transporter  26.19 
 
 
427 aa  67.8  0.0000000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0592694 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1399  major facilitator transporter  29.68 
 
 
360 aa  67.8  0.0000000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.41856  normal  0.33149 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3926  major facilitator transporter  28.91 
 
 
457 aa  67.8  0.0000000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1221  major facilitator transporter  27.43 
 
 
451 aa  67.8  0.0000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0719879 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2420  Non-ribosomal peptide synthetase modules and related protein-like protein  26.81 
 
 
1839 aa  67  0.0000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.452144  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8887  hypothetical protein  26.55 
 
 
413 aa  67  0.0000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.889317 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0062  major facilitator superfamily MFS_1  25.77 
 
 
440 aa  67  0.0000000006  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.175422  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1539  major facilitator transporter  22.73 
 
 
412 aa  66.6  0.0000000008  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  unclonable  0.000000151531  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1114  major facilitator superfamily MFS_1  22.73 
 
 
415 aa  65.9  0.000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0768  major facilitator superfamily MFS_1  26.97 
 
 
456 aa  65.5  0.000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0053  transporter, putative  25.86 
 
 
431 aa  65.5  0.000000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0872  H+ Antiporter protein  22.42 
 
 
405 aa  65.5  0.000000002  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0234  protein of unknown function DUF894, DitE  24.67 
 
 
419 aa  65.1  0.000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4750  major facilitator transporter  23.58 
 
 
415 aa  65.1  0.000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3129  amino acid adenylation domain-containing protein  23.51 
 
 
1816 aa  65.5  0.000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.975665  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1155  major facilitator superfamily MFS_1  28.21 
 
 
399 aa  65.5  0.000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.128986 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8013  major facilitator transporter  29.09 
 
 
408 aa  65.5  0.000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11210  major facilitator superfamily MFS_1  22.35 
 
 
433 aa  65.5  0.000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4925  major facilitator superfamily MFS_1  27.76 
 
 
420 aa  64.7  0.000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.455292  normal  0.164864 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4102  major facilitator transporter  25.7 
 
 
438 aa  65.1  0.000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.277859  normal  0.56542 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1224  major facilitator superfamily MFS_1  24.63 
 
 
440 aa  64.7  0.000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0087  major facilitator transporter  25.9 
 
 
436 aa  64.7  0.000000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3596  major facilitator superfamily MFS_1  27.67 
 
 
417 aa  64.3  0.000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2812  hypothetical protein  25.21 
 
 
399 aa  63.9  0.000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.287004  normal  0.40248 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_27630  arabinose efflux permease family protein  26.49 
 
 
417 aa  63.9  0.000000005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3037  major facilitator superfamily MFS_1  25.35 
 
 
421 aa  63.9  0.000000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1000  hypothetical protein  25.34 
 
 
418 aa  63.5  0.000000006  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00447157 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7785  major facilitator superfamily MFS_1  26.06 
 
 
420 aa  63.5  0.000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.157303 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1991  major facilitator superfamily MFS_1  26.4 
 
 
450 aa  63.5  0.000000007  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.762129  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5069  putative transporter  23.11 
 
 
415 aa  63.2  0.000000008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2027  major facilitator superfamily MFS_1  27.27 
 
 
436 aa  63.2  0.000000008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2289  major facilitator transporter  29.26 
 
 
432 aa  63.2  0.000000009  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.995339  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1974  hypothetical protein  25.88 
 
 
424 aa  62.4  0.00000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.00936884  normal  0.989231 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4715  major facilitator transporter  26.93 
 
 
428 aa  62.8  0.00000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2380  major facilitator transporter  24.88 
 
 
474 aa  62.8  0.00000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0389897  normal  0.03889 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>