148 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_2858 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_2858  major facilitator superfamily MFS_1  100 
 
 		 465 aa  840    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.192123  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2172  major facilitator superfamily MFS_1  60.09 
 
 		 478 aa  333  3e-90  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.647615  hitchhiker  0.0000450319 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2420  major facilitator transporter  47.32 
 
 		 417 aa  260  4e-68  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.13347  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0667  major facilitator superfamily MFS_1  38.53 
 
 		 430 aa  221  1.9999999999999999e-56  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.00302666  hitchhiker  0.0000374441 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_09700  Major Facilitator Superfamily transporter  38.79 
 
 		 469 aa  166  1.0000000000000001e-39  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.854337  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4461  H+ antiporter protein  31.96 
 
 		 414 aa  142  9.999999999999999e-33  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3958  drug antiporter protein  32.84 
 
 		 418 aa  140  7e-32  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4032  H+ antiporter protein  32.84 
 
 		 418 aa  140  7e-32  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0135  major facilitator transporter  35.13 
 
 		 445 aa  139  7.999999999999999e-32  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3972  H+ antiporter protein  32.59 
 
 		 418 aa  138  2e-31  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.14454  normal  0.0420605 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2234  H+ antiporter protein  31.96 
 
 		 412 aa  133  5e-30  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2769  major facilitator superfamily MFS_1  35.96 
 
 		 417 aa  132  2.0000000000000002e-29  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.172375  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0141  major facilitator transporter  38.12 
 
 		 478 aa  126  9e-28  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000428453 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11284  integral membrane transport protein  32.5 
 
 		 419 aa  100  4e-20  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0365  major facilitator transporter  30.89 
 
 		 427 aa  83.2  0.00000000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0592694 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1323  major facilitator superfamily MFS_1  25.06 
 
 		 429 aa  75.5  0.000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.107888  normal  0.120407 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6079  hypothetical protein  28.4 
 
 		 420 aa  74.7  0.000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.533874  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1564  major facilitator superfamily MFS_1  33.91 
 
 		 401 aa  73.6  0.000000000007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.194805  normal  0.215005 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21930  major facilitator superfamily MFS_1  24.01 
 
 		 432 aa  71.2  0.00000000004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1445  major facilitator transporter  22.87 
 
 		 390 aa  68.6  0.0000000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00616907  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1491  major facilitator transporter  22.87 
 
 		 390 aa  68.6  0.0000000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.326017  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2666  major facilitator transporter  28.65 
 
 		 412 aa  68.2  0.0000000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.178731  hitchhiker  0.000246371 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2483  major facilitator transporter  29.36 
 
 		 412 aa  66.6  0.0000000008  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6539  major facilitator superfamily MFS_1  28.41 
 
 		 415 aa  65.1  0.000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.6945  normal  0.0125799 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1568  major facilitator transporter  22.26 
 
 		 405 aa  65.5  0.000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1600  major facilitator transporter  22.26 
 
 		 405 aa  65.5  0.000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3705  major facilitator superfamily MFS_1  28.39 
 
 		 411 aa  65.5  0.000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.224607  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2685  major facilitator superfamily MFS_1  30.64 
 
 		 406 aa  65.1  0.000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.188987  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_36730  Major Facilitator Superfamily transporter  29.76 
 
 		 446 aa  64.3  0.000000005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.298448 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1974  hypothetical protein  29.07 
 
 		 424 aa  63.9  0.000000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.00936884  normal  0.989231 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4026  major facilitator superfamily MFS_1  28.53 
 
 		 416 aa  63.5  0.000000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.557727  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0786  major facilitator transporter  30.15 
 
 		 406 aa  63.2  0.000000009  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2402  permease  22.07 
 
 		 408 aa  62.8  0.00000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0859078  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2318  macrolide-efflux protein  21.98 
 
 		 408 aa  62.8  0.00000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.31097  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2577  permease  22.07 
 
 		 408 aa  62.8  0.00000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.659755  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7174  major facilitator superfamily MFS_1  32.67 
 
 		 428 aa  63.2  0.00000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.295435  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2582  permease, putative  21.45 
 
 		 408 aa  61.6  0.00000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4646  major facilitator transporter  30.95 
 
 		 409 aa  60.8  0.00000005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_61170  putative transmembrane protein  30.33 
 
 		 403 aa  60.5  0.00000007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1904  amino acid adenylation domain-containing protein  22.33 
 
 		 1833 aa  60.1  0.00000008  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.844763  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2972  major facilitator transporter  27.63 
 
 		 415 aa  58.9  0.0000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4652  major facilitator superfamily MFS_1  30.95 
 
 		 406 aa  58.2  0.0000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2355  macrolide-efflux protein  22.34 
 
 		 408 aa  57.8  0.0000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000199839  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2589  putative permease  21.45 
 
 		 408 aa  57.8  0.0000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.59543e-18 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4514  major facilitator transporter  29.59 
 
 		 406 aa  57.8  0.0000005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2631  putative permease  21.98 
 
 		 408 aa  56.6  0.0000009  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0615976  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0303  major facilitator superfamily MFS_1  28.49 
 
 		 426 aa  56.6  0.000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0634781  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2943  major facilitator superfamily MFS_1  29.48 
 
 		 406 aa  55.8  0.000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.747804  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_02090  Major Facilitator Superfamily transporter  27.63 
 
 		 424 aa  55.1  0.000003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1837  major facilitator superfamily MFS_1  26.72 
 
 		 415 aa  55.1  0.000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00768254  normal  0.336306 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2024  major facilitator superfamily MFS_1  25.79 
 
 		 419 aa  55.1  0.000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0746  hypothetical protein  23.53 
 
 		 431 aa  54.3  0.000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0165656  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3228  hypothetical protein  28.17 
 
 		 405 aa  54.7  0.000004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.65431  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5268  MFS family transporter  30.12 
 
 		 403 aa  54.3  0.000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0258  major facilitator superfamily MFS_1  29.1 
 
 		 451 aa  53.1  0.00001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.305305 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0786  major facilitator transporter  19.44 
 
 		 403 aa  52.8  0.00001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.104451  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8013  major facilitator transporter  31.95 
 
 		 408 aa  53.1  0.00001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1738  hypothetical protein  21.71 
 
 		 406 aa  52  0.00002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.342222  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0516  major facilitator superfamily MFS_1  29.09 
 
 		 420 aa  52.4  0.00002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3179  major facilitator transporter  24.69 
 
 		 445 aa  52.8  0.00002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.110331 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7785  major facilitator superfamily MFS_1  27.27 
 
 		 420 aa  52.4  0.00002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.157303 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0684  major facilitator transporter  23.92 
 
 		 412 aa  52  0.00002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00476606  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5406  major facilitator superfamily MFS_1  30.81 
 
 		 444 aa  51.2  0.00003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.283217 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2540  major facilitator superfamily MFS_1  26.94 
 
 		 430 aa  51.2  0.00004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6664  major facilitator transporter  30.92 
 
 		 414 aa  50.4  0.00006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.740991 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1795  hypothetical protein  21.43 
 
 		 406 aa  50.4  0.00006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3365  major facilitator superfamily protein  29.41 
 
 		 424 aa  50.4  0.00006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19250  major facilitator superfamily MFS_1  23.67 
 
 		 444 aa  50.4  0.00007  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00108172  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1399  major facilitator transporter  30 
 
 		 360 aa  50.1  0.00008  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.41856  normal  0.33149 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2039  major facilitator superfamily MFS_1  36.73 
 
 		 428 aa  49.7  0.0001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2302  major facilitator superfamily MFS_1  29.89 
 
 		 390 aa  48.9  0.0002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.0000026904  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2072  major facilitator transporter  25.69 
 
 		 417 aa  48.9  0.0002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.205391  normal  0.200266 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0489  dTMP kinase  33.15 
 
 		 662 aa  49.3  0.0002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.042381  hitchhiker  0.00739513 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4894  hypothetical protein  29.67 
 
 		 412 aa  48.5  0.0003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4222  major facilitator transporter  28.32 
 
 		 432 aa  48.5  0.0003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.399211  hitchhiker  0.00102981 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0091  major facilitator superfamily MFS_1  26.13 
 
 		 442 aa  48.5  0.0003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0427  transporter, putative  21.99 
 
 		 412 aa  48.5  0.0003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2380  major facilitator transporter  22.7 
 
 		 474 aa  47.8  0.0004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0389897  normal  0.03889 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0953  major facilitator transporter  33.33 
 
 		 407 aa  47.8  0.0004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.204782  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5278  hypothetical protein  27.91 
 
 		 408 aa  48.1  0.0004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.306023  normal  0.251543 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0371  major facilitator transporter  23.06 
 
 		 405 aa  47.8  0.0004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3756  major facilitator superfamily MFS_1  22.29 
 
 		 409 aa  47.8  0.0004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0367  sugar transporter  23.32 
 
 		 410 aa  47.8  0.0005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000621781  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0377  major facilitator transporter  24.26 
 
 		 413 aa  47.8  0.0005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4238  major facilitator transporter  42.42 
 
 		 420 aa  47.4  0.0006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.375023 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2261  major facilitator superfamily MFS_1  29.14 
 
 		 399 aa  47.4  0.0006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0224254  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1496  permease  20.57 
 
 		 408 aa  47  0.0007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0335  hypothetical protein  29.32 
 
 		 408 aa  46.6  0.0009  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.294663  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2101  major facilitator superfamily MFS_1  29.01 
 
 		 479 aa  46.6  0.0009  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0376  major facilitator family transporter  23.51 
 
 		 410 aa  46.2  0.001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.118082  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1531  hypothetical protein  21.61 
 
 		 406 aa  46.6  0.001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1388  hypothetical protein  22.68 
 
 		 404 aa  46.2  0.001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0053  transporter, putative  28.26 
 
 		 431 aa  46.2  0.001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0390  major facilitator family transporter  23.51 
 
 		 410 aa  46.2  0.001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1650  hypothetical protein  21.61 
 
 		 406 aa  46.6  0.001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1471  major facilitator transporter  34.33 
 
 		 420 aa  46.2  0.001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.981301  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3284  major facilitator transporter  25.89 
 
 		 403 aa  46.2  0.001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1508  major facilitator superfamily permease  22.05 
 
 		 403 aa  46.2  0.001  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0434  major facilitator family transporter  23.32 
 
 		 410 aa  45.8  0.001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2357  major facilitator superfamily MFS_1  26.69 
 
 		 418 aa  46.2  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.561235  normal  0.233215 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>