More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tbis_3365 on replicon NC_014165
Organism: Thermobispora bispora DSM 43833



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014165  Tbis_3365  major facilitator superfamily protein  100 
 
 
424 aa  818    Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9059  hypothetical protein  69.21 
 
 
431 aa  533  1e-150  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0543  major facilitator superfamily MFS_1  62.13 
 
 
448 aa  442  1e-123  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2854  hypothetical protein  44.83 
 
 
452 aa  310  4e-83  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2953  major facilitator superfamily MFS_1  44.44 
 
 
413 aa  265  1e-69  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0279289  hitchhiker  0.000525778 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4460  major facilitator superfamily MFS_1  43.03 
 
 
434 aa  263  4.999999999999999e-69  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2956  major facilitator superfamily MFS_1  43.99 
 
 
412 aa  259  6e-68  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000194659 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0356  major facilitator superfamily MFS_1  41.5 
 
 
407 aa  244  1.9999999999999999e-63  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1534  major facilitator superfamily MFS_1  44.81 
 
 
438 aa  242  1e-62  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.565747  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3537  major facilitator transporter  40.96 
 
 
465 aa  235  1.0000000000000001e-60  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.833005  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3912  major facilitator transporter  39.49 
 
 
465 aa  231  1e-59  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.31796 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0548  major facilitator superfamily MFS_1  38.46 
 
 
419 aa  224  3e-57  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.010876  decreased coverage  0.00150074 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2261  major facilitator superfamily MFS_1  46.57 
 
 
399 aa  218  2e-55  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0224254  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28870  arabinose efflux permease family protein  40.57 
 
 
402 aa  206  9e-52  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.447315 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4677  major facilitator transporter  40 
 
 
425 aa  187  3e-46  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.126838  normal  0.395619 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0921  major facilitator transporter  38.65 
 
 
442 aa  174  2.9999999999999996e-42  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4247  major facilitator transporter  39.85 
 
 
421 aa  173  5e-42  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.124967  normal  0.0481306 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4635  major facilitator superfamily MFS_1  32.71 
 
 
437 aa  172  1e-41  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.10393  normal  0.0264415 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2605  major facilitator superfamily MFS_1  38.02 
 
 
407 aa  155  1e-36  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000338843  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7935  hypothetical protein  36.57 
 
 
396 aa  143  7e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.46781  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4233  hypothetical protein  30.05 
 
 
430 aa  117  3.9999999999999997e-25  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.121217  normal  0.0238527 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1498  macrolide efflux protein  24.83 
 
 
404 aa  103  4e-21  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1538  major facilitator transporter  25.42 
 
 
404 aa  103  5e-21  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.756552  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1533  permease  25.09 
 
 
404 aa  101  2e-20  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1507  macrolide efflux protein  25.09 
 
 
404 aa  102  2e-20  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.667551  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1652  permease  25.09 
 
 
404 aa  101  2e-20  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.608559  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1719  putative permease  24.39 
 
 
404 aa  99  1e-19  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3061  major facilitator superfamily MFS_1  31.87 
 
 
429 aa  95.5  1e-18  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  decreased coverage  0.00310805  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0303  major facilitator superfamily MFS_1  31.65 
 
 
426 aa  92  2e-17  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0634781  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2302  major facilitator superfamily MFS_1  32.73 
 
 
390 aa  90.9  4e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.0000026904  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1630  transporter  26.54 
 
 
420 aa  90.5  5e-17  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1864  putative transporter  26.27 
 
 
420 aa  89  2e-16  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.42079e-47 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1684  transporter  26.01 
 
 
420 aa  87.8  3e-16  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1819  transporter  26.01 
 
 
420 aa  87.8  3e-16  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000952932  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0752  transporter, putative  27.62 
 
 
446 aa  87  6e-16  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1940  putative transporter  26.27 
 
 
420 aa  85.5  0.000000000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000531086  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0698  major facilitator superfamily MFS_1  24.55 
 
 
397 aa  84.3  0.000000000000004  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_03951  hypothetical protein  24.34 
 
 
432 aa  84.3  0.000000000000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1827  putative transporter  26.87 
 
 
420 aa  83.2  0.000000000000008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8802  major facilitator superfamily MFS_1  28.3 
 
 
405 aa  82.8  0.00000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.953446 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2540  major facilitator superfamily MFS_1  30.65 
 
 
430 aa  82.8  0.00000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0763  major facilitator superfamily MFS_1  26.65 
 
 
421 aa  81.6  0.00000000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0516  major facilitator superfamily MFS_1  32.89 
 
 
420 aa  82  0.00000000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3575  major facilitator superfamily MFS_1  30.32 
 
 
416 aa  82  0.00000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3515  putative transporter  26.62 
 
 
420 aa  81.6  0.00000000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1892  transporter, putative  31.36 
 
 
420 aa  80.5  0.00000000000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0166254  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4269  major facilitator transporter  28.57 
 
 
436 aa  79.7  0.00000000000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.935574 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2122  major facilitator transporter  27.89 
 
 
424 aa  80.1  0.00000000000008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.74746  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1364  major facilitator superfamily MFS_1  28.57 
 
 
441 aa  79  0.0000000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.0393169 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4491  major facilitator superfamily MFS_1  29.91 
 
 
423 aa  79.3  0.0000000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.783622  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1974  hypothetical protein  26.42 
 
 
424 aa  78.6  0.0000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.00936884  normal  0.989231 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4461  H+ antiporter protein  32.88 
 
 
414 aa  79  0.0000000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1663  multidrug resistance protein; tetracycline resistance determinant  32 
 
 
209 aa  77.4  0.0000000000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0684  major facilitator transporter  23.64 
 
 
412 aa  77  0.0000000000006  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00476606  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0056  major facilitator superfamily MFS_1  25.13 
 
 
433 aa  77  0.0000000000006  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2206  major facilitator transporter  26.04 
 
 
447 aa  76.6  0.0000000000007  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19250  major facilitator superfamily MFS_1  25.61 
 
 
444 aa  76.3  0.000000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00108172  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2046  hypothetical protein  24.33 
 
 
448 aa  75.9  0.000000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.258697 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2402  permease  21.96 
 
 
408 aa  75.5  0.000000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0859078  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0701  major facilitator superfamily MFS_1  24.55 
 
 
423 aa  75.1  0.000000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2355  macrolide-efflux protein  21.96 
 
 
408 aa  75.5  0.000000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000199839  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2577  permease  21.96 
 
 
408 aa  75.5  0.000000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.659755  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0732  major facilitator superfamily MFS_1  26.9 
 
 
412 aa  75.5  0.000000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.000169813  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2631  putative permease  21.5 
 
 
408 aa  74.7  0.000000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0615976  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1797  putative permease  23.4 
 
 
379 aa  74.3  0.000000000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0593  major facilitator transporter  22.73 
 
 
413 aa  73.9  0.000000000004  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.00370301  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0578  major facilitator transporter  22.73 
 
 
413 aa  73.9  0.000000000004  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0133344  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2643  major facilitator transporter  24.16 
 
 
399 aa  73.9  0.000000000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.238963  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5433  major facilitator superfamily MFS_1  26.55 
 
 
417 aa  73.6  0.000000000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.317246  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1572  major facilitator transporter  27.46 
 
 
415 aa  73.6  0.000000000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.58248  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6215  major facilitator superfamily MFS_1  29.12 
 
 
404 aa  73.6  0.000000000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0532982  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0308  dTMP kinase  29.11 
 
 
709 aa  73.6  0.000000000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.233817 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2582  permease, putative  21.96 
 
 
408 aa  73.2  0.000000000009  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0968  major facilitator superfamily MFS_1  27.02 
 
 
432 aa  72.8  0.00000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.896564  normal  0.510346 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2318  macrolide-efflux protein  21.03 
 
 
408 aa  72.4  0.00000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.31097  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2016  MFS superfamily transporter  23.49 
 
 
459 aa  72.8  0.00000000001  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.647427  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0189  major facilitator superfamily MFS_1  25.41 
 
 
426 aa  72.8  0.00000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0572831  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2589  putative permease  22.43 
 
 
408 aa  72  0.00000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.59543e-18 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21930  major facilitator superfamily MFS_1  21.3 
 
 
432 aa  72  0.00000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2024  major facilitator superfamily MFS_1  25.27 
 
 
419 aa  71.6  0.00000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0297  major facilitator superfamily MFS_1  29.96 
 
 
423 aa  71.2  0.00000000003  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.0210722  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1928  major facilitator superfamily MFS_1  29.08 
 
 
414 aa  71.6  0.00000000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0688885  normal  0.183583 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0091  major facilitator superfamily MFS_1  25.71 
 
 
442 aa  70.9  0.00000000004  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1539  major facilitator transporter  21.79 
 
 
412 aa  70.9  0.00000000004  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  unclonable  0.000000151531  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6327  major facilitator transporter  30.61 
 
 
461 aa  70.5  0.00000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.400788 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2707  macrolide efflux protein  22.64 
 
 
406 aa  70.1  0.00000000007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0968867  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2255  putative permease  21.97 
 
 
404 aa  70.1  0.00000000008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.134353 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4089  major facilitator transporter  32.02 
 
 
439 aa  69.7  0.00000000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3257  tetracycline resistance determinant TetV  25.48 
 
 
414 aa  69.7  0.00000000009  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.160876  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6250  major facilitator superfamily MFS_1  31.49 
 
 
433 aa  68.9  0.0000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.220883  normal  0.159364 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2987  permease; tetracycline resistance determinant  25 
 
 
414 aa  69.7  0.0000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.105308  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4370  transporter, major facilitator family  27.73 
 
 
410 aa  69.3  0.0000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  5.0052999999999995e-22 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2234  H+ antiporter protein  31.55 
 
 
412 aa  69.3  0.0000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7785  major facilitator superfamily MFS_1  27.43 
 
 
420 aa  68.9  0.0000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.157303 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2647  major facilitator transporter  30.8 
 
 
524 aa  69.3  0.0000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_36730  Major Facilitator Superfamily transporter  27.66 
 
 
446 aa  68.9  0.0000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.298448 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3555  major facilitator superfamily MFS_1  28.16 
 
 
449 aa  68.6  0.0000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.194127  normal  0.458265 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11210  major facilitator superfamily MFS_1  23.66 
 
 
433 aa  68.6  0.0000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3024  putative permease  21.7 
 
 
406 aa  68.6  0.0000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1532  major facilitator transporter  25.18 
 
 
423 aa  68.2  0.0000000003  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.68199  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>