More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_0356 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_0356  major facilitator superfamily MFS_1  100 
 
 		 407 aa  764    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3365  major facilitator superfamily protein  41.5 
 
 		 424 aa  244  1.9999999999999999e-63  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9059  hypothetical protein  40.99 
 
 		 431 aa  243  5e-63  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2261  major facilitator superfamily MFS_1  47.54 
 
 		 399 aa  226  7e-58  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0224254  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0543  major facilitator superfamily MFS_1  41.84 
 
 		 448 aa  223  4.9999999999999996e-57  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28870  arabinose efflux permease family protein  45.6 
 
 		 402 aa  221  1.9999999999999999e-56  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.447315 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2854  hypothetical protein  37.03 
 
 		 452 aa  201  1.9999999999999998e-50  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0548  major facilitator superfamily MFS_1  35.97 
 
 		 419 aa  180  2.9999999999999997e-44  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.010876  decreased coverage  0.00150074 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2953  major facilitator superfamily MFS_1  37.31 
 
 		 413 aa  180  4e-44  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0279289  hitchhiker  0.000525778 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2956  major facilitator superfamily MFS_1  37.76 
 
 		 412 aa  180  4.999999999999999e-44  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000194659 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1534  major facilitator superfamily MFS_1  37.32 
 
 		 438 aa  175  1.9999999999999998e-42  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.565747  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4460  major facilitator superfamily MFS_1  36.46 
 
 		 434 aa  167  4e-40  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3537  major facilitator transporter  34.77 
 
 		 465 aa  147  5e-34  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.833005  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3912  major facilitator transporter  33.49 
 
 		 465 aa  146  8.000000000000001e-34  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.31796 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4635  major facilitator superfamily MFS_1  29.84 
 
 		 437 aa  125  1e-27  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.10393  normal  0.0264415 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0921  major facilitator transporter  31.02 
 
 		 442 aa  113  7.000000000000001e-24  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7935  hypothetical protein  33.14 
 
 		 396 aa  95.9  1e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.46781  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2605  major facilitator superfamily MFS_1  28.97 
 
 		 407 aa  94.7  3e-18  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000338843  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4677  major facilitator transporter  31.3 
 
 		 425 aa  92.4  1e-17  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.126838  normal  0.395619 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4233  hypothetical protein  29.22 
 
 		 430 aa  89.4  1e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.121217  normal  0.0238527 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0087  major facilitator transporter  27.38 
 
 		 436 aa  89  1e-16  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0062  major facilitator superfamily MFS_1  26.87 
 
 		 440 aa  88.2  3e-16  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.175422  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0732  major facilitator superfamily MFS_1  29.43 
 
 		 412 aa  84  0.000000000000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.000169813  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0091  major facilitator superfamily MFS_1  30.14 
 
 		 442 aa  80.9  0.00000000000004  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0303  major facilitator superfamily MFS_1  26.69 
 
 		 426 aa  78.2  0.0000000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0634781  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0516  major facilitator superfamily MFS_1  28.94 
 
 		 420 aa  77.8  0.0000000000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3061  major facilitator superfamily MFS_1  33.33 
 
 		 429 aa  76.3  0.000000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  decreased coverage  0.00310805  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3952  major facilitator transporter  30.2 
 
 		 413 aa  74.7  0.000000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5333  hypothetical protein  27.89 
 
 		 415 aa  73.9  0.000000000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4247  major facilitator transporter  31.07 
 
 		 421 aa  73.2  0.000000000009  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.124967  normal  0.0481306 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2780  major facilitator superfamily MFS_1  32.63 
 
 		 423 aa  72  0.00000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.018642 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11210  major facilitator superfamily MFS_1  24.02 
 
 		 433 aa  71.2  0.00000000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2492  major facilitator transporter  29.37 
 
 		 438 aa  71.2  0.00000000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0783563  normal  0.106757 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2122  major facilitator transporter  27.62 
 
 		 424 aa  70.1  0.00000000006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.74746  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2947  macrolide-efflux protein  23.22 
 
 		 419 aa  69.7  0.00000000008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0495728  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0056  major facilitator superfamily MFS_1  29.44 
 
 		 433 aa  70.1  0.00000000008  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3626  major facilitator transporter  31.88 
 
 		 413 aa  68.9  0.0000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.348332  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3010  macrolide-efflux protein  23.22 
 
 		 419 aa  68.2  0.0000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3276  putative permease  23.22 
 
 		 419 aa  68.2  0.0000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.550677  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3025  permease  23.22 
 
 		 419 aa  67.8  0.0000000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3258  permease  23.22 
 
 		 419 aa  67.8  0.0000000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1155  major facilitator superfamily MFS_1  27.66 
 
 		 399 aa  67.4  0.0000000004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.128986 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2206  major facilitator transporter  26.09 
 
 		 447 aa  67.4  0.0000000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0752  transporter, putative  32.97 
 
 		 446 aa  67  0.0000000006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3555  major facilitator superfamily MFS_1  32.22 
 
 		 449 aa  67  0.0000000006  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.194127  normal  0.458265 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5212  major facilitator superfamily MFS_1  25.58 
 
 		 408 aa  66.6  0.0000000008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0948922  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0743  major facilitator transporter  27.69 
 
 		 410 aa  66.2  0.0000000009  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21930  major facilitator superfamily MFS_1  22.65 
 
 		 432 aa  66.2  0.000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3270  permease, putative  22.51 
 
 		 419 aa  65.9  0.000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.719917  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0046  major facilitator superfamily MFS_1  24.46 
 
 		 405 aa  65.9  0.000000001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5140  major facilitator superfamily MFS_1  30.09 
 
 		 439 aa  65.5  0.000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0730511  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_2010  transporter, putative  28.43 
 
 		 429 aa  65.1  0.000000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0176  major facilitator transporter  29.44 
 
 		 426 aa  65.5  0.000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.379469  normal  0.234316 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0698  major facilitator superfamily MFS_1  24.54 
 
 		 397 aa  64.3  0.000000003  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2302  major facilitator superfamily MFS_1  27.57 
 
 		 390 aa  64.7  0.000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.0000026904  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1747  major facilitator superfamily MFS_1  28.42 
 
 		 463 aa  64.3  0.000000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.192343  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2729  putative permease  20.29 
 
 		 434 aa  64.3  0.000000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0743225  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3575  major facilitator superfamily MFS_1  30 
 
 		 416 aa  63.5  0.000000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3596  major facilitator superfamily MFS_1  27.72 
 
 		 417 aa  63.5  0.000000007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19250  major facilitator superfamily MFS_1  23.45 
 
 		 444 aa  63.5  0.000000007  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00108172  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5433  major facilitator superfamily MFS_1  30.23 
 
 		 417 aa  63.2  0.000000008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.317246  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0098  major facilitator superfamily MFS_1  24.57 
 
 		 428 aa  63.2  0.000000009  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2384  major facilitator transporter  26.28 
 
 		 441 aa  63.2  0.000000009  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.930234  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2654  macrolide efflux protein, putative  25.58 
 
 		 414 aa  62.8  0.00000001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3284  major facilitator transporter  23.98 
 
 		 403 aa  62.4  0.00000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3246  putative permease  22.27 
 
 		 419 aa  62.4  0.00000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1380  major facilitator superfamily MFS_1  30.1 
 
 		 401 aa  62.8  0.00000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.185265  hitchhiker  0.00924404 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1491  major facilitator transporter  24.52 
 
 		 390 aa  61.6  0.00000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.326017  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4368  major facilitator superfamily permease  30.9 
 
 		 431 aa  62.4  0.00000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3213  major facilitator superfamily MFS_1  31.35 
 
 		 432 aa  62  0.00000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  decreased coverage  0.00199749  hitchhiker  0.0000000669375 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1445  major facilitator transporter  24.52 
 
 		 390 aa  61.6  0.00000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00616907  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3871  major facilitator superfamily MFS_1  25.33 
 
 		 433 aa  61.2  0.00000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0205552  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1284  major facilitator superfamily MFS_1  25.48 
 
 		 431 aa  61.2  0.00000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8887  hypothetical protein  29.19 
 
 		 413 aa  61.6  0.00000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.889317 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7174  major facilitator superfamily MFS_1  31.89 
 
 		 428 aa  60.8  0.00000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.295435  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2412  permease  20.29 
 
 		 434 aa  60.8  0.00000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1768  major facilitator transporter  28.51 
 
 		 440 aa  61.2  0.00000004  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.071428 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_31240  putative nrbE-like protein  30.22 
 
 		 436 aa  60.8  0.00000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000000000011963  unclonable  4.15969e-22 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1486  major facilitator transporter  28.64 
 
 		 420 aa  60.5  0.00000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.467645  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1364  major facilitator superfamily MFS_1  26.71 
 
 		 441 aa  60.5  0.00000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0393169 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1974  hypothetical protein  21.66 
 
 		 424 aa  60.5  0.00000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.00936884  normal  0.989231 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0689  major facilitator superfamily MFS_1  27.49 
 
 		 413 aa  60.5  0.00000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.549457  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0823  major facilitator superfamily MFS_1  30.43 
 
 		 418 aa  60.5  0.00000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1582  MFS Ni2+ efflux pump NreB  28.7 
 
 		 440 aa  60.5  0.00000006  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3139  major facilitator superfamily MFS_1  33.63 
 
 		 453 aa  60.5  0.00000006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1932  major facilitator superfamily MFS_1  23.82 
 
 		 406 aa  60.1  0.00000006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3024  putative permease  21.2 
 
 		 406 aa  60.1  0.00000007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0297  major facilitator superfamily MFS_1  30.69 
 
 		 423 aa  60.1  0.00000008  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.0210722  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1000  hypothetical protein  26.45 
 
 		 418 aa  59.7  0.00000008  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00447157 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4358  major facilitator transporter  29.8 
 
 		 426 aa  60.1  0.00000008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.569485  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2777  permease  23.9 
 
 		 406 aa  59.7  0.00000009  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.145309  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2443  permease  20.54 
 
 		 434 aa  59.7  0.00000009  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00000794944  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2707  macrolide efflux protein  23.9 
 
 		 406 aa  59.7  0.00000009  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0968867  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1677  hypothetical protein  30.73 
 
 		 435 aa  59.7  0.00000009  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2988  permease  23.9 
 
 		 406 aa  59.7  0.00000009  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2726  macrolide efflux protein  23.9 
 
 		 406 aa  59.7  0.0000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.277105  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3288  major facilitator superfamily protein  27.32 
 
 		 405 aa  58.9  0.0000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.234831 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4728  major facilitator superfamily MFS_1  30.45 
 
 		 444 aa  58.9  0.0000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.632201 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1753  major facilitator superfamily MFS_1  21.3 
 
 		 393 aa  58.9  0.0000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5611  major facilitator transporter  28.12 
 
 		 440 aa  58.9  0.0000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.358621 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>