More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_4460 on replicon NC_014210
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014210  Ndas_4460  major facilitator superfamily MFS_1  100 
 
 		 434 aa  839    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2854  hypothetical protein  56.16 
 
 		 452 aa  464  1e-129  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9059  hypothetical protein  45.12 
 
 		 431 aa  314  1.9999999999999998e-84  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3365  major facilitator superfamily protein  43.28 
 
 		 424 aa  307  3e-82  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0543  major facilitator superfamily MFS_1  43.61 
 
 		 448 aa  299  8e-80  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2953  major facilitator superfamily MFS_1  37.82 
 
 		 413 aa  224  2e-57  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0279289  hitchhiker  0.000525778 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2956  major facilitator superfamily MFS_1  38.27 
 
 		 412 aa  221  1.9999999999999999e-56  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000194659 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0548  major facilitator superfamily MFS_1  33.84 
 
 		 419 aa  210  4e-53  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.010876  decreased coverage  0.00150074 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0356  major facilitator superfamily MFS_1  37.56 
 
 		 407 aa  199  6e-50  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3912  major facilitator transporter  35.73 
 
 		 465 aa  184  2.0000000000000003e-45  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.31796 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2261  major facilitator superfamily MFS_1  42.17 
 
 		 399 aa  184  4.0000000000000006e-45  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0224254  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3537  major facilitator transporter  34.98 
 
 		 465 aa  181  2e-44  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.833005  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1534  major facilitator superfamily MFS_1  35.45 
 
 		 438 aa  176  6e-43  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.565747  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28870  arabinose efflux permease family protein  37.6 
 
 		 402 aa  173  6.999999999999999e-42  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.447315 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4635  major facilitator superfamily MFS_1  33.25 
 
 		 437 aa  163  5.0000000000000005e-39  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.10393  normal  0.0264415 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2605  major facilitator superfamily MFS_1  31.03 
 
 		 407 aa  128  2.0000000000000002e-28  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000338843  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7935  hypothetical protein  32.75 
 
 		 396 aa  117  3e-25  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.46781  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4677  major facilitator transporter  31.27 
 
 		 425 aa  115  1.0000000000000001e-24  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.126838  normal  0.395619 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4247  major facilitator transporter  32.99 
 
 		 421 aa  114  4.0000000000000004e-24  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.124967  normal  0.0481306 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0921  major facilitator transporter  32.6 
 
 		 442 aa  110  6e-23  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4233  hypothetical protein  28.06 
 
 		 430 aa  94.4  3e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.121217  normal  0.0238527 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2707  macrolide efflux protein  23.32 
 
 		 406 aa  82.4  0.00000000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0968867  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3575  major facilitator superfamily MFS_1  26.6 
 
 		 416 aa  80.1  0.00000000000008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2726  macrolide efflux protein  22.84 
 
 		 406 aa  77.8  0.0000000000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.277105  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2777  permease  22.84 
 
 		 406 aa  77.4  0.0000000000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.145309  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2988  permease  22.84 
 
 		 406 aa  77.4  0.0000000000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2255  putative permease  21.98 
 
 		 404 aa  77  0.0000000000006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.134353 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3025  permease, putative  22.78 
 
 		 406 aa  75.9  0.000000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.076608  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3024  putative permease  23.02 
 
 		 406 aa  75.9  0.000000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7122  MFS permease  26.49 
 
 		 426 aa  75.5  0.000000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2492  major facilitator transporter  28.96 
 
 		 438 aa  75.1  0.000000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0783563  normal  0.106757 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0968  major facilitator superfamily MFS_1  27.09 
 
 		 432 aa  75.1  0.000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.896564  normal  0.510346 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2984  putative permease  22.6 
 
 		 404 aa  74.7  0.000000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000116191 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1600  major facilitator transporter  22.26 
 
 		 405 aa  74.3  0.000000000004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1538  major facilitator transporter  23.29 
 
 		 404 aa  74.3  0.000000000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.756552  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1568  major facilitator transporter  22.26 
 
 		 405 aa  74.3  0.000000000004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0303  major facilitator superfamily MFS_1  30.86 
 
 		 426 aa  73.9  0.000000000005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0634781  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1364  major facilitator superfamily MFS_1  27.13 
 
 		 441 aa  72  0.00000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0393169 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19250  major facilitator superfamily MFS_1  23.67 
 
 		 444 aa  71.2  0.00000000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00108172  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2122  major facilitator transporter  25.65 
 
 		 424 aa  71.2  0.00000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.74746  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0336  major facilitator transporter  27.48 
 
 		 441 aa  71.6  0.00000000003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0752  transporter, putative  27.84 
 
 		 446 aa  70.9  0.00000000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0308  dTMP kinase  30.49 
 
 		 709 aa  70.9  0.00000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.233817 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1284  major facilitator superfamily MFS_1  26.69 
 
 		 431 aa  70.5  0.00000000006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4779  major facilitator transporter  26.73 
 
 		 428 aa  70.1  0.00000000007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00000206756  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0365  major facilitator transporter  26.97 
 
 		 427 aa  69.3  0.0000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0592694 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5140  major facilitator superfamily MFS_1  27.15 
 
 		 439 aa  69.3  0.0000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0730511  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1507  macrolide efflux protein  21.93 
 
 		 404 aa  68.6  0.0000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.667551  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5611  major facilitator transporter  26.7 
 
 		 440 aa  68.6  0.0000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.358621 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1539  major facilitator transporter  22.79 
 
 		 412 aa  68.9  0.0000000002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  unclonable  0.000000151531  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1517  major facilitator superfamily MFS_1  21.16 
 
 		 412 aa  68.9  0.0000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.5366 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1559  major facilitator transporter  22.95 
 
 		 412 aa  68.2  0.0000000003  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.00000341731  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1991  major facilitator superfamily MFS_1  25.36 
 
 		 450 aa  67.8  0.0000000003  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.762129  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1498  macrolide efflux protein  23.89 
 
 		 404 aa  67.4  0.0000000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_36730  Major Facilitator Superfamily transporter  27.4 
 
 		 446 aa  67  0.0000000007  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.298448 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0823  major facilitator superfamily MFS_1  27.7 
 
 		 418 aa  66.6  0.0000000007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1533  permease  22.69 
 
 		 404 aa  65.1  0.000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1213  major facilitator superfamily MFS_1  29.15 
 
 		 405 aa  65.1  0.000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.979166 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0056  major facilitator superfamily MFS_1  23.59 
 
 		 433 aa  65.5  0.000000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2780  major facilitator superfamily MFS_1  29.37 
 
 		 423 aa  65.5  0.000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.018642 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1652  permease  22.69 
 
 		 404 aa  65.1  0.000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.608559  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4706  major facilitator superfamily MFS_1  26.16 
 
 		 445 aa  65.5  0.000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.93667 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1904  amino acid adenylation domain-containing protein  25 
 
 		 1833 aa  65.5  0.000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.844763  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2302  major facilitator superfamily MFS_1  31.46 
 
 		 390 aa  64.7  0.000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.0000026904  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1702  major facilitator superfamily MFS_1  24.08 
 
 		 438 aa  64.7  0.000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.101015  normal  0.0466104 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1272  major facilitator transporter  22.08 
 
 		 418 aa  64.7  0.000000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2072  major facilitator transporter  28.25 
 
 		 417 aa  64.7  0.000000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.205391  normal  0.200266 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1264  major facilitator superfamily MFS_1  25.46 
 
 		 422 aa  65.1  0.000000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.62642  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3881  major facilitator transporter  25.35 
 
 		 509 aa  64.3  0.000000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21930  major facilitator superfamily MFS_1  23.13 
 
 		 432 aa  63.9  0.000000005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4177  major facilitator superfamily MFS_1  29.19 
 
 		 476 aa  63.9  0.000000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.192321  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0242  putative integral membrane efflux protein  25.25 
 
 		 424 aa  63.5  0.000000007  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.305732  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2392  major facilitator superfamily MFS_1  25 
 
 		 415 aa  63.5  0.000000007  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.000384037  normal  0.689164 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0732  major facilitator superfamily MFS_1  25.49 
 
 		 412 aa  63.5  0.000000007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.000169813  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1719  putative permease  21.19 
 
 		 404 aa  63.2  0.000000009  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0516  major facilitator superfamily MFS_1  26.84 
 
 		 420 aa  63.2  0.00000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4491  major facilitator superfamily MFS_1  29.18 
 
 		 423 aa  62.8  0.00000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.783622  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0293  major facilitator superfamily MFS_1  28.49 
 
 		 710 aa  62.8  0.00000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.189593  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11210  major facilitator superfamily MFS_1  21.8 
 
 		 433 aa  62.4  0.00000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0698  major facilitator superfamily MFS_1  24.68 
 
 		 397 aa  62.4  0.00000001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3588  major facilitator superfamily MFS_1  27.25 
 
 		 428 aa  62.4  0.00000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.273478 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_31240  putative nrbE-like protein  28.38 
 
 		 436 aa  62.4  0.00000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000000000011963  unclonable  4.15969e-22 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0885  major facilitator transporter  30.69 
 
 		 415 aa  62.4  0.00000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0490  major facilitator superfamily MFS_1  26.27 
 
 		 461 aa  61.6  0.00000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1250  major facilitator transporter  27.97 
 
 		 425 aa  61.2  0.00000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2412  permease  21.66 
 
 		 434 aa  61.6  0.00000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4306  thymidylate kinase  28.25 
 
 		 730 aa  61.2  0.00000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2481  permease  22.46 
 
 		 434 aa  60.8  0.00000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.199316  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2664  permease  22.46 
 
 		 434 aa  60.8  0.00000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1932  major facilitator superfamily MFS_1  26.26 
 
 		 406 aa  60.5  0.00000005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3189  major facilitator transporter  25.79 
 
 		 442 aa  60.8  0.00000005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00704959 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3129  amino acid adenylation domain-containing protein  26.62 
 
 		 1816 aa  60.5  0.00000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.975665  n/a   
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_6144  MFS family nickel efflux transporter protein NreB  26.36 
 
 		 408 aa  60.5  0.00000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2443  permease  22.1 
 
 		 434 aa  60.5  0.00000006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00000794944  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3061  major facilitator superfamily MFS_1  27.53 
 
 		 429 aa  60.5  0.00000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  decreased coverage  0.00310805  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0425  major facilitator transporter  26.55 
 
 		 430 aa  60.5  0.00000006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0395  permease  25.28 
 
 		 430 aa  60.1  0.00000007  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0177527  normal  0.113221 
 
 
-
 
NC_008539  Arth_4264  major facilitator transporter  26.98 
 
 		 420 aa  60.1  0.00000007  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0538931  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3952  major facilitator transporter  27.27 
 
 		 413 aa  60.1  0.00000007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2519  major facilitator superfamily MFS_1  25.58 
 
 		 404 aa  60.1  0.00000008  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>