292 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Arth_4264 on replicon NC_008539
Organism: Arthrobacter sp. FB24



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008539  Arth_4264  major facilitator transporter  100 
 
 
420 aa  820    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0538931  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3828  major facilitator transporter  78.86 
 
 
421 aa  579  1e-164  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2492  major facilitator transporter  54.98 
 
 
438 aa  407  1.0000000000000001e-112  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0783563  normal  0.106757 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2242  major facilitator superfamily MFS_1  59.57 
 
 
444 aa  400  9.999999999999999e-111  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.370083  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_31240  putative nrbE-like protein  55.39 
 
 
436 aa  393  1e-108  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000000000011963  unclonable  4.15969e-22 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1147  major facilitator superfamily MFS_1  52.62 
 
 
436 aa  389  1e-107  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.114141  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4728  major facilitator superfamily MFS_1  57.49 
 
 
444 aa  387  1e-106  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.632201 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5159  major facilitator transporter  54.07 
 
 
434 aa  387  1e-106  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5611  major facilitator transporter  56.65 
 
 
440 aa  384  1e-105  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.358621 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_6144  MFS family nickel efflux transporter protein NreB  55.75 
 
 
408 aa  373  1e-102  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0336  major facilitator transporter  51.12 
 
 
441 aa  365  1e-100  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1582  MFS Ni2+ efflux pump NreB  52.13 
 
 
440 aa  363  3e-99  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5140  major facilitator superfamily MFS_1  52.93 
 
 
439 aa  362  7.0000000000000005e-99  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0730511  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1768  major facilitator transporter  52.5 
 
 
440 aa  361  1e-98  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.071428 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1884  major facilitator superfamily MFS_1  56.76 
 
 
444 aa  338  1.9999999999999998e-91  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.672709 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4285  major facilitator superfamily MFS_1  53.3 
 
 
444 aa  328  1.0000000000000001e-88  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.181984  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3358  major facilitator superfamily MFS_1  50.77 
 
 
456 aa  323  4e-87  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2968  major facilitator transporter  44.68 
 
 
442 aa  319  7e-86  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.433406  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3139  major facilitator superfamily MFS_1  46.68 
 
 
453 aa  316  4e-85  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0895  major facilitator superfamily MFS_1  53.53 
 
 
457 aa  314  9.999999999999999e-85  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.29064 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3189  major facilitator transporter  45.08 
 
 
442 aa  311  2e-83  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00704959 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3044  major facilitator transporter  42.68 
 
 
464 aa  258  1e-67  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.264008 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1713  major facilitator superfamily MFS_1  52.69 
 
 
432 aa  254  1.0000000000000001e-66  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.300423  normal  0.77847 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3464  hypothetical protein  42.62 
 
 
394 aa  239  6.999999999999999e-62  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.269124  normal  0.0966327 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2363  putative NreB protein  43.9 
 
 
307 aa  192  1e-47  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.602638  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0479  major facilitator superfamily MFS_1  32.25 
 
 
427 aa  166  9e-40  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.742618 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0698  major facilitator superfamily MFS_1  27.35 
 
 
397 aa  109  1e-22  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0303  major facilitator superfamily MFS_1  31.44 
 
 
426 aa  76.3  0.000000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0634781  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2643  major facilitator transporter  27.31 
 
 
399 aa  74.7  0.000000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.238963  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1837  major facilitator superfamily MFS_1  24.17 
 
 
415 aa  71.2  0.00000000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00768254  normal  0.336306 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0872  H+ Antiporter protein  29.1 
 
 
405 aa  70.5  0.00000000006  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2526  H+ Antiporter protein  29.22 
 
 
411 aa  69.3  0.0000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000735797  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0968  major facilitator superfamily MFS_1  25.17 
 
 
432 aa  69.3  0.0000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.896564  normal  0.510346 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1861  major facilitator transporter  24.83 
 
 
413 aa  68.6  0.0000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0051281 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1991  major facilitator superfamily MFS_1  24.21 
 
 
450 aa  67.8  0.0000000003  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.762129  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3926  major facilitator transporter  30.63 
 
 
457 aa  67  0.0000000005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0752  transporter, putative  25.56 
 
 
446 aa  67  0.0000000006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1496  permease  28.05 
 
 
408 aa  66.6  0.0000000007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2302  major facilitator superfamily MFS_1  28.37 
 
 
390 aa  66.2  0.000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.0000026904  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1536  major facilitator transporter  28.05 
 
 
406 aa  65.5  0.000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.29974  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1539  major facilitator transporter  22.46 
 
 
412 aa  65.1  0.000000002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  unclonable  0.000000151531  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3061  major facilitator superfamily MFS_1  28.64 
 
 
429 aa  64.7  0.000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  decreased coverage  0.00310805  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2814  major facilitator superfamily MFS_1  21.47 
 
 
402 aa  64.7  0.000000003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1738  hypothetical protein  27.27 
 
 
406 aa  63.9  0.000000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.342222  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3588  major facilitator superfamily MFS_1  25 
 
 
428 aa  63.9  0.000000005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.273478 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0701  major facilitator superfamily MFS_1  22.25 
 
 
423 aa  63.9  0.000000005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1491  major facilitator transporter  22.19 
 
 
390 aa  63.9  0.000000006  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.326017  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1445  major facilitator transporter  22.19 
 
 
390 aa  63.9  0.000000006  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00616907  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2854  hypothetical protein  27.35 
 
 
452 aa  63.5  0.000000006  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1795  hypothetical protein  26.82 
 
 
406 aa  63.5  0.000000007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1559  major facilitator transporter  22.25 
 
 
412 aa  63.2  0.000000008  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.00000341731  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1531  hypothetical protein  27.15 
 
 
406 aa  62.8  0.00000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0684  major facilitator transporter  21.8 
 
 
412 aa  62.8  0.00000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00476606  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1650  hypothetical protein  27.15 
 
 
406 aa  62.8  0.00000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1226  major facilitator superfamily MFS_1  28.53 
 
 
423 aa  62.4  0.00000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.403066 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11210  major facilitator superfamily MFS_1  23.58 
 
 
433 aa  62.8  0.00000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0875  major facilitator superfamily MFS_1  23.08 
 
 
441 aa  61.2  0.00000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  hitchhiker  0.00780765  normal  0.0882707 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19250  major facilitator superfamily MFS_1  22.86 
 
 
444 aa  61.2  0.00000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00108172  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0476  major facilitator transporter  27.61 
 
 
474 aa  61.6  0.00000003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2122  major facilitator transporter  25.56 
 
 
424 aa  60.8  0.00000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.74746  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1717  hypothetical protein  27.27 
 
 
387 aa  60.5  0.00000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1677  hypothetical protein  26.48 
 
 
435 aa  60.5  0.00000005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4370  transporter, major facilitator family  29.05 
 
 
410 aa  60.5  0.00000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  5.0052999999999995e-22 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1505  permease; multidrug resistance protein  27.27 
 
 
406 aa  60.1  0.00000006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0948022  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3976  major facilitator transporter  28.02 
 
 
407 aa  60.5  0.00000006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0258  major facilitator superfamily MFS_1  27.3 
 
 
451 aa  59.7  0.00000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.305305 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3952  major facilitator transporter  26.86 
 
 
413 aa  58.9  0.0000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0181  major facilitator superfamily MFS_1  27.21 
 
 
401 aa  59.7  0.0000001  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2582  permease, putative  23.94 
 
 
408 aa  58.5  0.0000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2046  hypothetical protein  27.5 
 
 
448 aa  58.5  0.0000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.258697 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33950  arabinose efflux permease family protein  29.21 
 
 
414 aa  58.9  0.0000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.466548  normal  0.73086 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1971  thymidylate kinase  27.36 
 
 
688 aa  58.9  0.0000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.270362  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1030  major facilitator superfamily MFS_1  25.69 
 
 
419 aa  57.4  0.0000005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0543  major facilitator superfamily MFS_1  27.47 
 
 
448 aa  57  0.0000006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0356  major facilitator superfamily MFS_1  27.27 
 
 
407 aa  57  0.0000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1041  major facilitator transporter  26.6 
 
 
428 aa  57  0.0000007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0009  protein of unknown function DUF894, DitE  27.05 
 
 
527 aa  56.6  0.0000007  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3206  major facilitator transporter  22.8 
 
 
413 aa  56.6  0.0000008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.130501  normal  0.812744 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3467  thymidylate kinase  29.63 
 
 
686 aa  56.6  0.0000008  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3626  major facilitator transporter  27.43 
 
 
413 aa  56.6  0.0000009  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.348332  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4779  major facilitator transporter  22 
 
 
428 aa  56.2  0.000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00000206756  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2756  major facilitator transporter  25.16 
 
 
420 aa  55.8  0.000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.366084  normal  0.663227 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0053  transporter, putative  23.93 
 
 
431 aa  55.8  0.000001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0331  major facilitator transporter  23.1 
 
 
412 aa  56.2  0.000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5813  major facilitator superfamily MFS_1  24.61 
 
 
446 aa  55.8  0.000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.243583  normal  0.354769 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2972  major facilitator transporter  25.08 
 
 
415 aa  55.5  0.000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2355  macrolide-efflux protein  23.57 
 
 
408 aa  55.1  0.000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000199839  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2631  putative permease  22.87 
 
 
408 aa  55.5  0.000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0615976  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1000  hypothetical protein  25.08 
 
 
418 aa  55.5  0.000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00447157 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42320  major facilitator transpoter  26.35 
 
 
535 aa  55.5  0.000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.956299  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4661  major facilitator transporter  26.64 
 
 
454 aa  55.5  0.000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.731341  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4460  major facilitator superfamily MFS_1  26.07 
 
 
434 aa  55.1  0.000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3450  major facilitator superfamily MFS_1  27.57 
 
 
499 aa  55.5  0.000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00033474 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0516  major facilitator superfamily MFS_1  24.73 
 
 
420 aa  55.8  0.000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30800  arabinose efflux permease family protein  28.72 
 
 
452 aa  55.5  0.000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2678  MFS family major facilitator transporter  28.02 
 
 
410 aa  55.1  0.000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4055  major facilitator transporter  21.99 
 
 
413 aa  55.1  0.000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4311  major facilitator transporter  21.99 
 
 
413 aa  55.1  0.000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.481156  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2318  macrolide-efflux protein  23.4 
 
 
408 aa  54.3  0.000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.31097  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3741  major facilitator transporter  25.32 
 
 
426 aa  54.3  0.000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.159847  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>