More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Snas_2956 on replicon NC_013947
Organism: Stackebrandtia nassauensis DSM 44728



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013947  Snas_2956  major facilitator superfamily MFS_1  100 
 
 		 412 aa  790    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000194659 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2953  major facilitator superfamily MFS_1  77.97 
 
 		 413 aa  591  1e-168  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0279289  hitchhiker  0.000525778 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3365  major facilitator superfamily protein  44.95 
 
 		 424 aa  287  2.9999999999999996e-76  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0543  major facilitator superfamily MFS_1  46.6 
 
 		 448 aa  277  2e-73  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9059  hypothetical protein  44.1 
 
 		 431 aa  269  7e-71  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2854  hypothetical protein  42.28 
 
 		 452 aa  253  5.000000000000001e-66  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2261  major facilitator superfamily MFS_1  46.53 
 
 		 399 aa  216  5.9999999999999996e-55  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0224254  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0356  major facilitator superfamily MFS_1  38.78 
 
 		 407 aa  204  2e-51  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4460  major facilitator superfamily MFS_1  38.52 
 
 		 434 aa  204  3e-51  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28870  arabinose efflux permease family protein  38.44 
 
 		 402 aa  193  4e-48  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.447315 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3537  major facilitator transporter  35.05 
 
 		 465 aa  178  1e-43  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.833005  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1534  major facilitator superfamily MFS_1  37.6 
 
 		 438 aa  178  2e-43  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.565747  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3912  major facilitator transporter  34.42 
 
 		 465 aa  177  3e-43  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.31796 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0548  major facilitator superfamily MFS_1  31.9 
 
 		 419 aa  167  4e-40  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.010876  decreased coverage  0.00150074 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4635  major facilitator superfamily MFS_1  30.75 
 
 		 437 aa  164  2.0000000000000002e-39  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.10393  normal  0.0264415 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0921  major facilitator transporter  32.21 
 
 		 442 aa  136  8e-31  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2605  major facilitator superfamily MFS_1  33.81 
 
 		 407 aa  132  2.0000000000000002e-29  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000338843  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4677  major facilitator transporter  35.47 
 
 		 425 aa  130  3e-29  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.126838  normal  0.395619 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7935  hypothetical protein  35.88 
 
 		 396 aa  127  5e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.46781  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4247  major facilitator transporter  35.18 
 
 		 421 aa  109  8.000000000000001e-23  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.124967  normal  0.0481306 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0308  dTMP kinase  29.76 
 
 		 709 aa  90.1  6e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.233817 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3575  major facilitator superfamily MFS_1  28.98 
 
 		 416 aa  88.2  3e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3061  major facilitator superfamily MFS_1  30.27 
 
 		 429 aa  88.2  3e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  decreased coverage  0.00310805  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0763  major facilitator superfamily MFS_1  30.41 
 
 		 421 aa  87  6e-16  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1533  permease  22.47 
 
 		 404 aa  85.5  0.000000000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1719  putative permease  22.19 
 
 		 404 aa  85.5  0.000000000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1652  permease  22.47 
 
 		 404 aa  85.5  0.000000000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.608559  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1507  macrolide efflux protein  22.47 
 
 		 404 aa  84.7  0.000000000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.667551  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4233  hypothetical protein  28.64 
 
 		 430 aa  84.3  0.000000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.121217  normal  0.0238527 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1498  macrolide efflux protein  23.14 
 
 		 404 aa  83.2  0.000000000000008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4306  thymidylate kinase  28.34 
 
 		 730 aa  83.2  0.000000000000008  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_03951  hypothetical protein  24.69 
 
 		 432 aa  82.8  0.000000000000009  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1538  major facilitator transporter  23.47 
 
 		 404 aa  82.4  0.00000000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.756552  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1272  major facilitator transporter  24.52 
 
 		 418 aa  82  0.00000000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1940  putative transporter  27.2 
 
 		 420 aa  81.3  0.00000000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000531086  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1892  transporter, putative  33.53 
 
 		 420 aa  79.3  0.0000000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0166254  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0066  macrolide-efflux protein  27.25 
 
 		 441 aa  79.3  0.0000000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.00000000000436229  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1630  transporter  26.42 
 
 		 420 aa  78.6  0.0000000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_36730  Major Facilitator Superfamily transporter  31.71 
 
 		 446 aa  78.2  0.0000000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.298448 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1864  putative transporter  26.42 
 
 		 420 aa  78.6  0.0000000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.42079e-47 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1684  transporter  26.42 
 
 		 420 aa  77.4  0.0000000000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1819  transporter  26.42 
 
 		 420 aa  77.4  0.0000000000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000952932  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3952  major facilitator transporter  27.65 
 
 		 413 aa  77  0.0000000000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1827  putative transporter  32.54 
 
 		 420 aa  77  0.0000000000006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3515  putative transporter  32.35 
 
 		 420 aa  76.3  0.0000000000008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3179  major facilitator transporter  24.55 
 
 		 445 aa  76.3  0.0000000000009  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.110331 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1663  multidrug resistance protein; tetracycline resistance determinant  32.54 
 
 		 209 aa  75.9  0.000000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0056  major facilitator superfamily MFS_1  26.93 
 
 		 433 aa  75.9  0.000000000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2122  major facilitator transporter  29.73 
 
 		 424 aa  75.9  0.000000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.74746  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0395  permease  24.09 
 
 		 430 aa  75.9  0.000000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0177527  normal  0.113221 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4101  major facilitator superfamily MFS_1  32 
 
 		 432 aa  75.9  0.000000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.438153 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5212  major facilitator superfamily MFS_1  27.81 
 
 		 408 aa  75.5  0.000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0948922  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5406  major facilitator superfamily MFS_1  30.22 
 
 		 444 aa  75.5  0.000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.283217 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0297  major facilitator superfamily MFS_1  34.59 
 
 		 423 aa  74.7  0.000000000003  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.0210722  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2780  major facilitator superfamily MFS_1  27.27 
 
 		 423 aa  74.3  0.000000000004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.018642 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1572  major facilitator transporter  26.38 
 
 		 415 aa  73.9  0.000000000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.58248  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2302  major facilitator superfamily MFS_1  30.11 
 
 		 390 aa  73.9  0.000000000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.0000026904  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1155  major facilitator superfamily MFS_1  26.7 
 
 		 399 aa  73.9  0.000000000005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.128986 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1559  major facilitator transporter  24.29 
 
 		 412 aa  73.6  0.000000000007  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.00000341731  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2072  major facilitator transporter  28.35 
 
 		 417 aa  73.2  0.000000000008  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.205391  normal  0.200266 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0516  major facilitator superfamily MFS_1  26.17 
 
 		 420 aa  72.4  0.00000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4605  major facilitator transporter  26.09 
 
 		 462 aa  72.4  0.00000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0303  major facilitator superfamily MFS_1  32.57 
 
 		 426 aa  72.8  0.00000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0634781  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0752  transporter, putative  24.74 
 
 		 446 aa  72  0.00000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0746  hypothetical protein  25.33 
 
 		 431 aa  71.6  0.00000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0165656  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1539  major facilitator transporter  22.54 
 
 		 412 aa  70.9  0.00000000004  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  unclonable  0.000000151531  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7122  MFS permease  25.6 
 
 		 426 aa  70.1  0.00000000006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2707  macrolide efflux protein  23.22 
 
 		 406 aa  70.1  0.00000000007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0968867  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2392  major facilitator superfamily MFS_1  27.13 
 
 		 415 aa  70.1  0.00000000007  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.000384037  normal  0.689164 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8802  major facilitator superfamily MFS_1  27.05 
 
 		 405 aa  70.1  0.00000000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.953446 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1033  hypothetical protein  24.51 
 
 		 273 aa  70.1  0.00000000007  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2016  MFS superfamily transporter  25.98 
 
 		 459 aa  69.3  0.0000000001  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.647427  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0985  hypothetical protein  25.51 
 
 		 460 aa  69.3  0.0000000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.309761  normal  0.0823053 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2777  permease  24 
 
 		 406 aa  68.9  0.0000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.145309  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1974  hypothetical protein  27.23 
 
 		 424 aa  68.6  0.0000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.00936884  normal  0.989231 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2756  major facilitator transporter  25.72 
 
 		 420 aa  68.6  0.0000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.366084  normal  0.663227 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2988  permease  24 
 
 		 406 aa  68.9  0.0000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1000  hypothetical protein  24.12 
 
 		 418 aa  68.9  0.0000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00447157 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3555  major facilitator superfamily MFS_1  28.94 
 
 		 449 aa  68.9  0.0000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.194127  normal  0.458265 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0698  major facilitator superfamily MFS_1  21.83 
 
 		 397 aa  67.8  0.0000000003  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0768  major facilitator superfamily MFS_1  26.62 
 
 		 456 aa  68.2  0.0000000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19250  major facilitator superfamily MFS_1  23.88 
 
 		 444 aa  67.8  0.0000000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00108172  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5433  major facilitator superfamily MFS_1  24.46 
 
 		 417 aa  68.2  0.0000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.317246  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1904  amino acid adenylation domain-containing protein  22.58 
 
 		 1833 aa  68.2  0.0000000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.844763  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2726  macrolide efflux protein  24 
 
 		 406 aa  67.4  0.0000000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.277105  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0046  major facilitator superfamily MFS_1  25 
 
 		 405 aa  67.4  0.0000000004  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3528  major facilitator superfamily MFS_1  23.65 
 
 		 482 aa  67  0.0000000006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2519  major facilitator superfamily MFS_1  26.86 
 
 		 404 aa  67  0.0000000006  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2589  major facilitator superfamily MFS_1  23.65 
 
 		 482 aa  66.6  0.0000000007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0568188  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4269  major facilitator transporter  28.21 
 
 		 436 aa  66.6  0.0000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.935574 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6250  major facilitator superfamily MFS_1  26.93 
 
 		 433 aa  66.6  0.0000000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.220883  normal  0.159364 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0293  major facilitator superfamily MFS_1  28.11 
 
 		 710 aa  66.2  0.0000000009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.189593  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3450  major facilitator superfamily MFS_1  26.11 
 
 		 499 aa  66.2  0.0000000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00033474 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1284  major facilitator superfamily MFS_1  25.36 
 
 		 431 aa  66.2  0.0000000009  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1380  major facilitator superfamily MFS_1  28.09 
 
 		 401 aa  65.9  0.000000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.185265  hitchhiker  0.00924404 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1445  major facilitator transporter  21.24 
 
 		 390 aa  66.2  0.000000001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00616907  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1491  major facilitator transporter  21.24 
 
 		 390 aa  66.2  0.000000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.326017  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6215  major facilitator superfamily MFS_1  27.86 
 
 		 404 aa  65.1  0.000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0532982  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11210  major facilitator superfamily MFS_1  23.17 
 
 		 433 aa  65.1  0.000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2647  major facilitator transporter  27.43 
 
 		 524 aa  65.5  0.000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>