More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_5406 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013131  Caci_5406  major facilitator superfamily MFS_1  100 
 
 		 444 aa  867    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.283217 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4101  major facilitator superfamily MFS_1  47.16 
 
 		 432 aa  338  9.999999999999999e-92  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.438153 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_27630  arabinose efflux permease family protein  36.94 
 
 		 417 aa  207  4e-52  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7785  major facilitator superfamily MFS_1  36.17 
 
 		 420 aa  199  7e-50  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.157303 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2540  major facilitator superfamily MFS_1  35.05 
 
 		 430 aa  186  9e-46  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6250  major facilitator superfamily MFS_1  36.19 
 
 		 433 aa  182  9.000000000000001e-45  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.220883  normal  0.159364 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8013  major facilitator transporter  36.8 
 
 		 408 aa  180  5.999999999999999e-44  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0189  major facilitator superfamily MFS_1  31.89 
 
 		 426 aa  179  1e-43  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0572831  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4269  major facilitator transporter  34.99 
 
 		 436 aa  177  2e-43  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.935574 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6539  major facilitator superfamily MFS_1  32.68 
 
 		 415 aa  169  9e-41  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.6945  normal  0.0125799 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6664  major facilitator transporter  35.04 
 
 		 414 aa  166  5.9999999999999996e-40  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.740991 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7117  major facilitator superfamily MFS_1  32.94 
 
 		 432 aa  166  8e-40  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4378  major facilitator transporter  30.9 
 
 		 431 aa  163  5.0000000000000005e-39  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1728  major facilitator superfamily MFS_1  35.56 
 
 		 417 aa  162  1e-38  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2968  major facilitator superfamily MFS_1  34.23 
 
 		 441 aa  158  2e-37  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0982222 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1438  major facilitator superfamily MFS_1  32.77 
 
 		 416 aa  157  3e-37  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3246  permease, putative  27.03 
 
 		 417 aa  155  1e-36  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0277963  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1041  major facilitator transporter  33.1 
 
 		 428 aa  154  2e-36  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3257  tetracycline resistance determinant TetV  27.44 
 
 		 414 aa  155  2e-36  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.160876  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8802  major facilitator superfamily MFS_1  34.17 
 
 		 405 aa  155  2e-36  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.953446 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2303  major facilitator transporter  33.01 
 
 		 435 aa  155  2e-36  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.533597  normal  0.893433 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2987  permease; tetracycline resistance determinant  27.69 
 
 		 414 aa  153  5.9999999999999996e-36  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.105308  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4491  major facilitator superfamily MFS_1  31.03 
 
 		 423 aa  153  7e-36  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.783622  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0689  major facilitator superfamily MFS_1  31.22 
 
 		 439 aa  148  2.0000000000000003e-34  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1861  major facilitator transporter  33.91 
 
 		 413 aa  143  7e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0051281 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4089  major facilitator transporter  33.41 
 
 		 439 aa  142  8e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1471  major facilitator transporter  34.22 
 
 		 420 aa  142  9.999999999999999e-33  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.981301  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1193  major facilitator superfamily MFS_1  32.32 
 
 		 412 aa  137  5e-31  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5398  major facilitator superfamily MFS_1  32.9 
 
 		 401 aa  136  7.000000000000001e-31  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.154835  normal  0.293524 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4174  major facilitator superfamily MFS_1  30.69 
 
 		 414 aa  134  1.9999999999999998e-30  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.176115  normal  0.788258 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4496  major facilitator superfamily MFS_1  29.57 
 
 		 450 aa  132  2.0000000000000002e-29  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0239349  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0258  major facilitator superfamily MFS_1  33.58 
 
 		 451 aa  131  2.0000000000000002e-29  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.305305 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6327  major facilitator transporter  32.12 
 
 		 461 aa  127  4.0000000000000003e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.400788 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0516  major facilitator superfamily MFS_1  27.95 
 
 		 420 aa  122  9.999999999999999e-27  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2318  macrolide-efflux protein  27.54 
 
 		 408 aa  112  1.0000000000000001e-23  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.31097  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2582  permease, putative  27.05 
 
 		 408 aa  112  2.0000000000000002e-23  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2631  putative permease  27.29 
 
 		 408 aa  111  3e-23  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0615976  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0656  major facilitator transporter  32.93 
 
 		 435 aa  108  1e-22  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0234  major facilitator superfamily MFS_1  30.81 
 
 		 442 aa  108  2e-22  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2355  macrolide-efflux protein  26.81 
 
 		 408 aa  107  3e-22  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000199839  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2643  major facilitator transporter  27.82 
 
 		 399 aa  108  3e-22  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.238963  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0417  major facilitator transporter  32.1 
 
 		 420 aa  108  3e-22  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00934872 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2402  permease  26.81 
 
 		 408 aa  107  5e-22  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0859078  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2577  permease  26.81 
 
 		 408 aa  107  5e-22  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.659755  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4282  major facilitator superfamily MFS_1  29.93 
 
 		 420 aa  106  6e-22  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.522642 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2589  putative permease  26.81 
 
 		 408 aa  106  6e-22  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.59543e-18 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4170  major facilitator superfamily MFS_1  29.93 
 
 		 420 aa  106  6e-22  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3134  major facilitator superfamily MFS_1  30.15 
 
 		 417 aa  106  9e-22  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2261  major facilitator superfamily MFS_1  33.77 
 
 		 411 aa  106  9e-22  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.484467 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2380  major facilitator transporter  27.55 
 
 		 474 aa  105  1e-21  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0389897  normal  0.03889 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4222  major facilitator transporter  29.01 
 
 		 432 aa  105  1e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.399211  hitchhiker  0.00102981 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3353  major facilitator transporter  22.75 
 
 		 421 aa  105  2e-21  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1600  major facilitator transporter  23.14 
 
 		 405 aa  104  3e-21  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1568  major facilitator transporter  23.14 
 
 		 405 aa  104  3e-21  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3278  major facilitator transporter  32.08 
 
 		 415 aa  104  4e-21  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.471566  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0365  major facilitator transporter  27.87 
 
 		 427 aa  103  5e-21  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0592694 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0684  major facilitator transporter  26 
 
 		 412 aa  103  5e-21  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00476606  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4659  MFS family multidrug resistance protein  30.34 
 
 		 408 aa  103  5e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1603  major facilitator superfamily MFS_1  29.32 
 
 		 432 aa  100  5e-20  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0347546  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2600  hypothetical protein  30.9 
 
 		 415 aa  98.6  2e-19  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3061  major facilitator superfamily MFS_1  35.21 
 
 		 429 aa  98.2  3e-19  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  decreased coverage  0.00310805  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1452  major facilitator family transporter  30.9 
 
 		 415 aa  97.8  3e-19  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0698  major facilitator superfamily MFS_1  24.72 
 
 		 397 aa  97.8  4e-19  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1367  major facilitator family transporter  30.9 
 
 		 415 aa  97.4  4e-19  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1093  major facilitator superfamily MFS_1  30.92 
 
 		 408 aa  97.1  5e-19  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.400006 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0395  permease  24.09 
 
 		 430 aa  96.7  7e-19  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0177527  normal  0.113221 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0056  major facilitator superfamily MFS_1  26.72 
 
 		 433 aa  96.7  8e-19  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2679  major facilitator superfamily MFS_1  28.53 
 
 		 453 aa  96.3  9e-19  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.000000322743  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4177  major facilitator superfamily MFS_1  29.58 
 
 		 476 aa  94.7  3e-18  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.192321  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0875  major facilitator superfamily MFS_1  26.78 
 
 		 441 aa  94.7  3e-18  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  hitchhiker  0.00780765  normal  0.0882707 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1000  hypothetical protein  27.2 
 
 		 418 aa  94.7  3e-18  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00447157 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3727  major facilitator transporter  27.43 
 
 		 416 aa  94.4  3e-18  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.274242  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1272  major facilitator transporter  24.82 
 
 		 418 aa  94.4  3e-18  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1230  putative transporter  31.23 
 
 		 378 aa  93.6  6e-18  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0199  putative transporter  31.23 
 
 		 378 aa  93.6  6e-18  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0474  putative transporter  31.23 
 
 		 378 aa  93.6  6e-18  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2820  major facilitator superfamily MFS_1  27.43 
 
 		 421 aa  93.2  7e-18  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.549151  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0482  major facilitator superfamily MFS_1  28.26 
 
 		 458 aa  93.2  9e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.787835  normal  0.855857 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0762  protein of unknown function DUF894, DitE  26.62 
 
 		 560 aa  92  2e-17  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.446257 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2064  major facilitator transporter  31.11 
 
 		 426 aa  92.4  2e-17  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.230072 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1030  major facilitator superfamily MFS_1  31.73 
 
 		 419 aa  91.7  2e-17  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0476  major facilitator transporter  26.9 
 
 		 474 aa  91.3  3e-17  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1700  hypothetical protein  26.99 
 
 		 412 aa  91.3  3e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.761256  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3206  major facilitator transporter  27.64 
 
 		 413 aa  91.3  3e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.130501  normal  0.812744 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3952  major facilitator transporter  27.74 
 
 		 413 aa  91.7  3e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2409  major facilitator transporter  28.01 
 
 		 402 aa  91.3  3e-17  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0925995  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2814  major facilitator superfamily MFS_1  28.42 
 
 		 402 aa  90.9  4e-17  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4055  major facilitator transporter  28.19 
 
 		 413 aa  90.9  4e-17  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4311  major facilitator transporter  28.19 
 
 		 413 aa  90.9  4e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.481156  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1613  major facilitator superfamily MFS_1  28.99 
 
 		 418 aa  90.5  5e-17  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000260989  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2384  protein of unknown function DUF894 DitE  30.71 
 
 		 549 aa  90.5  6e-17  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.123744  normal  0.932575 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0752  transporter, putative  27.19 
 
 		 446 aa  89.4  1e-16  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2754  major facilitator superfamily MFS_1  28.64 
 
 		 453 aa  89.4  1e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.192829  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0823  major facilitator superfamily MFS_1  29.19 
 
 		 418 aa  89  1e-16  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0110  major facilitator transporter  30.28 
 
 		 429 aa  89.4  1e-16  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3288  major facilitator superfamily protein  29.13 
 
 		 405 aa  88.2  2e-16  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.234831 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0347  major facilitator transporter  32.29 
 
 		 425 aa  88.6  2e-16  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2902  major facilitator superfamily MFS_1  30.79 
 
 		 406 aa  87.8  3e-16  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.21173  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0786  major facilitator transporter  29.21 
 
 		 418 aa  88.2  3e-16  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4165  major facilitator transporter  29.76 
 
 		 416 aa  87.8  3e-16  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0148559  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>