More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bpro_2492 on replicon NC_007948
Organism: Polaromonas sp. JS666



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007948  Bpro_2492  major facilitator transporter  100 
 
 		 438 aa  851    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0783563  normal  0.106757 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5611  major facilitator transporter  71.98 
 
 		 440 aa  607  1e-173  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.358621 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5140  major facilitator superfamily MFS_1  73.68 
 
 		 439 aa  585  1e-166  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0730511  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5159  major facilitator transporter  71 
 
 		 434 aa  578  1e-164  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1768  major facilitator transporter  67.58 
 
 		 440 aa  573  1.0000000000000001e-162  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.071428 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1582  MFS Ni2+ efflux pump NreB  67.51 
 
 		 440 aa  570  1e-161  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1147  major facilitator superfamily MFS_1  65.45 
 
 		 436 aa  550  1e-155  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.114141  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_31240  putative nrbE-like protein  65.45 
 
 		 436 aa  549  1e-155  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000000000011963  unclonable  4.15969e-22 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2242  major facilitator superfamily MFS_1  65.54 
 
 		 444 aa  525  1e-148  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.370083  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0336  major facilitator transporter  61.99 
 
 		 441 aa  525  1e-148  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4728  major facilitator superfamily MFS_1  65.91 
 
 		 444 aa  504  1e-141  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.632201 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_6144  MFS family nickel efflux transporter protein NreB  65.37 
 
 		 408 aa  467  9.999999999999999e-131  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1884  major facilitator superfamily MFS_1  65.01 
 
 		 444 aa  457  1e-127  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.672709 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3139  major facilitator superfamily MFS_1  52.8 
 
 		 453 aa  418  9.999999999999999e-116  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4285  major facilitator superfamily MFS_1  56.08 
 
 		 444 aa  410  1e-113  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.181984  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3358  major facilitator superfamily MFS_1  50.68 
 
 		 456 aa  381  1e-104  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2968  major facilitator transporter  48.65 
 
 		 442 aa  371  1e-101  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.433406  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3189  major facilitator transporter  50.33 
 
 		 442 aa  369  1e-101  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00704959 
 
 
-
 
NC_008539  Arth_4264  major facilitator transporter  54.98 
 
 		 420 aa  370  1e-101  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0538931  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3828  major facilitator transporter  56.22 
 
 		 421 aa  358  9.999999999999999e-98  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0895  major facilitator superfamily MFS_1  60.56 
 
 		 457 aa  353  2.9999999999999997e-96  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.29064 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3044  major facilitator transporter  45.34 
 
 		 464 aa  331  2e-89  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.264008 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3464  hypothetical protein  45.34 
 
 		 394 aa  271  2e-71  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.269124  normal  0.0966327 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1713  major facilitator superfamily MFS_1  53.35 
 
 		 432 aa  240  4e-62  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.300423  normal  0.77847 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2363  putative NreB protein  47.9 
 
 		 307 aa  212  1e-53  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.602638  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0479  major facilitator superfamily MFS_1  31.12 
 
 		 427 aa  159  1e-37  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.742618 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3061  major facilitator superfamily MFS_1  30.73 
 
 		 429 aa  86.3  9e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  decreased coverage  0.00310805  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2302  major facilitator superfamily MFS_1  30.91 
 
 		 390 aa  85.5  0.000000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.0000026904  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1559  major facilitator transporter  21.83 
 
 		 412 aa  79  0.0000000000002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.00000341731  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1539  major facilitator transporter  22.08 
 
 		 412 aa  77.4  0.0000000000004  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  unclonable  0.000000151531  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1942  multidrug resistance protein; putative tetracycline resistance determinant  27.73 
 
 		 406 aa  76.6  0.0000000000007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.0213e-35 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1748  multidrug resistance protein; tetracycline resistance determinant  26.36 
 
 		 406 aa  75.5  0.000000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000069396  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2355  macrolide-efflux protein  23.67 
 
 		 408 aa  75.1  0.000000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000199839  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0066  macrolide-efflux protein  31.46 
 
 		 441 aa  75.5  0.000000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.00000000000436229  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0698  major facilitator superfamily MFS_1  22.55 
 
 		 397 aa  75.1  0.000000000002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2582  permease, putative  25.85 
 
 		 408 aa  74.7  0.000000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1861  major facilitator transporter  29.72 
 
 		 413 aa  74.7  0.000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0051281 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2589  putative permease  23.49 
 
 		 408 aa  74.3  0.000000000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.59543e-18 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0692  major facilitator transporter  22.69 
 
 		 439 aa  73.9  0.000000000005  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0875  major facilitator superfamily MFS_1  26.83 
 
 		 441 aa  73.6  0.000000000006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  hitchhiker  0.00780765  normal  0.0882707 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2402  permease  23.49 
 
 		 408 aa  73.6  0.000000000006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0859078  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2577  permease  23.49 
 
 		 408 aa  73.6  0.000000000006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.659755  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33950  arabinose efflux permease family protein  30.88 
 
 		 414 aa  73.2  0.000000000009  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.466548  normal  0.73086 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2318  macrolide-efflux protein  24.13 
 
 		 408 aa  72.8  0.00000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.31097  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4661  major facilitator transporter  30.04 
 
 		 454 aa  72.8  0.00000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.731341  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3467  thymidylate kinase  29.6 
 
 		 686 aa  72  0.00000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2631  putative permease  23.56 
 
 		 408 aa  71.6  0.00000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0615976  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0356  major facilitator superfamily MFS_1  29.37 
 
 		 407 aa  71.2  0.00000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3588  major facilitator superfamily MFS_1  26.87 
 
 		 428 aa  71.2  0.00000000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.273478 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4460  major facilitator superfamily MFS_1  28.11 
 
 		 434 aa  69.3  0.0000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4177  major facilitator superfamily MFS_1  28.3 
 
 		 476 aa  68.6  0.0000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.192321  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1991  major facilitator superfamily MFS_1  23.82 
 
 		 450 aa  67.8  0.0000000004  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.762129  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1515  major facilitator superfamily MFS_1  27.52 
 
 		 416 aa  67.4  0.0000000005  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000845442 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0242  putative integral membrane efflux protein  27.63 
 
 		 424 aa  67.4  0.0000000005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.305732  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2643  major facilitator transporter  25.73 
 
 		 399 aa  67.4  0.0000000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.238963  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1837  major facilitator superfamily MFS_1  23.54 
 
 		 415 aa  67  0.0000000006  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00768254  normal  0.336306 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0792  major facilitator transporter  27.95 
 
 		 450 aa  66.6  0.0000000008  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0490  major facilitator superfamily MFS_1  27.07 
 
 		 461 aa  66.6  0.0000000009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2847  major facilitator superfamily MFS_1  28.63 
 
 		 432 aa  65.1  0.000000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2046  hypothetical protein  28.92 
 
 		 448 aa  64.7  0.000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.258697 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0193  major facilitator superfamily MFS_1  27.73 
 
 		 448 aa  64.7  0.000000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2435  putative ABC transporter, permease protein  31.02 
 
 		 414 aa  64.3  0.000000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.70932  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1971  thymidylate kinase  28.24 
 
 		 688 aa  63.9  0.000000005  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.270362  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0293  major facilitator superfamily MFS_1  27.66 
 
 		 710 aa  63.9  0.000000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.189593  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2122  major facilitator transporter  28.12 
 
 		 424 aa  63.9  0.000000006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.74746  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1284  major facilitator superfamily MFS_1  28.09 
 
 		 431 aa  63.5  0.000000008  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2654  macrolide efflux protein, putative  25.13 
 
 		 414 aa  63.2  0.000000009  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2953  major facilitator superfamily MFS_1  28.87 
 
 		 413 aa  63.2  0.000000009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0279289  hitchhiker  0.000525778 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0752  transporter, putative  29 
 
 		 446 aa  62.4  0.00000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3626  major facilitator transporter  27.59 
 
 		 413 aa  62.8  0.00000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.348332  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4706  major facilitator superfamily MFS_1  28.38 
 
 		 445 aa  62.8  0.00000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.93667 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3952  major facilitator transporter  24.89 
 
 		 413 aa  62.4  0.00000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0543  major facilitator superfamily MFS_1  27.48 
 
 		 448 aa  62.8  0.00000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2984  putative permease  20.09 
 
 		 404 aa  62.4  0.00000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000116191 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9221  dTMP kinase  32.33 
 
 		 688 aa  63.2  0.00000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.625222  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3926  major facilitator transporter  24.91 
 
 		 457 aa  62.4  0.00000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0303  major facilitator superfamily MFS_1  32.82 
 
 		 426 aa  62  0.00000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0634781  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2707  macrolide efflux protein  19.82 
 
 		 406 aa  61.6  0.00000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0968867  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1491  major facilitator transporter  23.9 
 
 		 390 aa  62  0.00000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.326017  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9059  hypothetical protein  29.65 
 
 		 431 aa  62.4  0.00000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1904  amino acid adenylation domain-containing protein  22.43 
 
 		 1833 aa  62  0.00000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.844763  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1445  major facilitator transporter  23.9 
 
 		 390 aa  62  0.00000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00616907  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2777  permease  19.82 
 
 		 406 aa  61.6  0.00000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.145309  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2726  macrolide efflux protein  19.82 
 
 		 406 aa  61.6  0.00000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.277105  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0491  major facilitator superfamily MFS_1  28.7 
 
 		 424 aa  61.2  0.00000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2988  permease  19.82 
 
 		 406 aa  61.6  0.00000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0768  major facilitator superfamily MFS_1  29.47 
 
 		 456 aa  61.2  0.00000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1486  major facilitator transporter  27.43 
 
 		 420 aa  60.8  0.00000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.467645  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0506  major facilitator transporter  27.68 
 
 		 426 aa  60.8  0.00000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.204304  hitchhiker  0.00963798 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5814  major facilitator superfamily MFS_1  25.31 
 
 		 423 aa  60.8  0.00000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.915234  hitchhiker  0.00491963 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19250  major facilitator superfamily MFS_1  23.63 
 
 		 444 aa  60.8  0.00000004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00108172  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2511  ABC transporter, permease protein, putative  27.64 
 
 		 414 aa  60.5  0.00000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00150223  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0548  major facilitator superfamily MFS_1  28 
 
 		 419 aa  60.8  0.00000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.010876  decreased coverage  0.00150074 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2027  major facilitator superfamily MFS_1  29.32 
 
 		 436 aa  60.8  0.00000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1753  major facilitator superfamily MFS_1  24.7 
 
 		 393 aa  60.5  0.00000005  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8887  hypothetical protein  26.62 
 
 		 413 aa  60.8  0.00000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.889317 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6215  major facilitator superfamily MFS_1  29.73 
 
 		 404 aa  60.5  0.00000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0532982  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0819  major facilitator superfamily MFS_1  28.09 
 
 		 452 aa  60.5  0.00000005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2487  major facilitator transporter  27.56 
 
 		 412 aa  60.5  0.00000006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000357828  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2848  major facilitator superfamily MFS_1  28.57 
 
 		 426 aa  60.5  0.00000006  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>