291 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Psyc_1582 on replicon NC_007204
Organism: Psychrobacter arcticus 273-4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007204  Psyc_1582  MFS Ni2+ efflux pump NreB  100 
 
 		 440 aa  876    Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1768  major facilitator transporter  96.14 
 
 		 440 aa  805    Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.071428 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2492  major facilitator transporter  67.51 
 
 		 438 aa  586  1e-166  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0783563  normal  0.106757 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5611  major facilitator transporter  67.43 
 
 		 440 aa  568  1e-161  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.358621 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_31240  putative nrbE-like protein  64.76 
 
 		 436 aa  536  1e-151  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000000000011963  unclonable  4.15969e-22 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1147  major facilitator superfamily MFS_1  62.01 
 
 		 436 aa  534  1e-150  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.114141  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5159  major facilitator transporter  62.79 
 
 		 434 aa  531  1e-149  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5140  major facilitator superfamily MFS_1  64.24 
 
 		 439 aa  522  1e-147  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0730511  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2242  major facilitator superfamily MFS_1  64.35 
 
 		 444 aa  523  1e-147  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.370083  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0336  major facilitator transporter  57.98 
 
 		 441 aa  504  9.999999999999999e-143  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4728  major facilitator superfamily MFS_1  63 
 
 		 444 aa  496  1e-139  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.632201 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1884  major facilitator superfamily MFS_1  62.33 
 
 		 444 aa  442  1e-123  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.672709 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_6144  MFS family nickel efflux transporter protein NreB  61.04 
 
 		 408 aa  435  1e-121  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3139  major facilitator superfamily MFS_1  51.22 
 
 		 453 aa  399  9.999999999999999e-111  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4285  major facilitator superfamily MFS_1  53.6 
 
 		 444 aa  394  1e-108  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.181984  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3358  major facilitator superfamily MFS_1  49.45 
 
 		 456 aa  369  1e-101  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3189  major facilitator transporter  47.06 
 
 		 442 aa  351  2e-95  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00704959 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2968  major facilitator transporter  44.77 
 
 		 442 aa  351  2e-95  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.433406  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0895  major facilitator superfamily MFS_1  58.22 
 
 		 457 aa  350  3e-95  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.29064 
 
 
-
 
NC_008539  Arth_4264  major facilitator transporter  52.13 
 
 		 420 aa  343  2.9999999999999997e-93  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0538931  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3828  major facilitator transporter  52.7 
 
 		 421 aa  339  7e-92  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3044  major facilitator transporter  41.81 
 
 		 464 aa  322  7e-87  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.264008 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3464  hypothetical protein  40.99 
 
 		 394 aa  263  6.999999999999999e-69  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.269124  normal  0.0966327 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1713  major facilitator superfamily MFS_1  48.04 
 
 		 432 aa  215  1.9999999999999998e-54  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.300423  normal  0.77847 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2363  putative NreB protein  46.23 
 
 		 307 aa  211  2e-53  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.602638  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0479  major facilitator superfamily MFS_1  31.93 
 
 		 427 aa  149  8e-35  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.742618 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2302  major facilitator superfamily MFS_1  28.26 
 
 		 390 aa  78.6  0.0000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.0000026904  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1942  multidrug resistance protein; putative tetracycline resistance determinant  21.53 
 
 		 406 aa  78.6  0.0000000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.0213e-35 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1748  multidrug resistance protein; tetracycline resistance determinant  20.98 
 
 		 406 aa  75.9  0.000000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000069396  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2582  permease, putative  26.83 
 
 		 408 aa  75.9  0.000000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0698  major facilitator superfamily MFS_1  22.17 
 
 		 397 aa  73.9  0.000000000006  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3588  major facilitator superfamily MFS_1  26.64 
 
 		 428 aa  72  0.00000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.273478 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2631  putative permease  26.37 
 
 		 408 aa  70.9  0.00000000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0615976  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3061  major facilitator superfamily MFS_1  26.21 
 
 		 429 aa  70.9  0.00000000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  decreased coverage  0.00310805  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1539  major facilitator transporter  21.13 
 
 		 412 aa  69.7  0.0000000001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  unclonable  0.000000151531  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2402  permease  23.14 
 
 		 408 aa  69.3  0.0000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0859078  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2318  macrolide-efflux protein  26.24 
 
 		 408 aa  69.7  0.0000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.31097  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2577  permease  23.14 
 
 		 408 aa  69.3  0.0000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.659755  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2589  putative permease  25.74 
 
 		 408 aa  68.9  0.0000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.59543e-18 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2355  macrolide-efflux protein  25.6 
 
 		 408 aa  68.9  0.0000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000199839  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33950  arabinose efflux permease family protein  29.31 
 
 		 414 aa  67.8  0.0000000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.466548  normal  0.73086 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0066  macrolide-efflux protein  27.1 
 
 		 441 aa  67.8  0.0000000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.00000000000436229  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1559  major facilitator transporter  21.13 
 
 		 412 aa  67.4  0.0000000005  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.00000341731  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4370  transporter, major facilitator family  22.88 
 
 		 410 aa  65.9  0.000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  5.0052999999999995e-22 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0692  major facilitator transporter  22.09 
 
 		 439 aa  66.2  0.000000001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1904  amino acid adenylation domain-containing protein  23.91 
 
 		 1833 aa  64.7  0.000000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.844763  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0543  major facilitator superfamily MFS_1  27.35 
 
 		 448 aa  64.3  0.000000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2046  hypothetical protein  30.41 
 
 		 448 aa  63.5  0.000000008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.258697 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3926  major facilitator transporter  24.09 
 
 		 457 aa  63.2  0.000000009  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0062  major facilitator superfamily MFS_1  22.91 
 
 		 440 aa  63.2  0.00000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.175422  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2511  ABC transporter, permease protein, putative  24.69 
 
 		 414 aa  62  0.00000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00150223  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0968  major facilitator superfamily MFS_1  23.69 
 
 		 432 aa  61.6  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.896564  normal  0.510346 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2435  putative ABC transporter, permease protein  27.42 
 
 		 414 aa  62  0.00000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.70932  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0875  major facilitator superfamily MFS_1  27.88 
 
 		 441 aa  62.4  0.00000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  hitchhiker  0.00780765  normal  0.0882707 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0752  transporter, putative  24.64 
 
 		 446 aa  61.6  0.00000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0356  major facilitator superfamily MFS_1  28.11 
 
 		 407 aa  61.2  0.00000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11210  major facilitator superfamily MFS_1  24.31 
 
 		 433 aa  61.2  0.00000004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0193  major facilitator superfamily MFS_1  26.19 
 
 		 448 aa  60.8  0.00000004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1607  major facilitator transporter  21.69 
 
 		 422 aa  60.8  0.00000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0422221  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9059  hypothetical protein  24.77 
 
 		 431 aa  59.7  0.0000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2468  permease  24.04 
 
 		 412 aa  59.3  0.0000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.000564968  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2273  permease; macrolide-efflux protein  25.37 
 
 		 417 aa  59.3  0.0000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00046211  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1991  major facilitator superfamily MFS_1  25.64 
 
 		 450 aa  59.3  0.0000001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.762129  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2227  permease; macrolide-efflux protein  25.37 
 
 		 417 aa  59.7  0.0000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0120958  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2393  permease; macrolide-efflux protein  24.33 
 
 		 412 aa  59.3  0.0000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.366369  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2501  putative ABC transporter, permease protein  25.37 
 
 		 415 aa  59.7  0.0000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2480  ABC transporter permease  24.3 
 
 		 415 aa  59.3  0.0000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0926781  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2649  permease  24.04 
 
 		 412 aa  59.3  0.0000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.765576  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4661  major facilitator transporter  26.46 
 
 		 454 aa  59.3  0.0000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.731341  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1532  major facilitator transporter  22.95 
 
 		 423 aa  59.3  0.0000001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.68199  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6215  major facilitator superfamily MFS_1  29.73 
 
 		 404 aa  59.3  0.0000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0532982  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2627  major facilitator transporter  23.92 
 
 		 410 aa  59.3  0.0000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1534  major facilitator superfamily MFS_1  26.69 
 
 		 438 aa  58.9  0.0000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.565747  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0490  major facilitator superfamily MFS_1  27.95 
 
 		 461 aa  58.5  0.0000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0548  major facilitator superfamily MFS_1  26.91 
 
 		 419 aa  58.9  0.0000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.010876  decreased coverage  0.00150074 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2305  ABC transporter permease  24.3 
 
 		 417 aa  58.9  0.0000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0193471  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0532  major facilitator superfamily MFS_1  25.72 
 
 		 428 aa  58.9  0.0000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2286  major facilitator transporter  25.81 
 
 		 414 aa  58.9  0.0000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0407537  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2122  major facilitator transporter  22.57 
 
 		 424 aa  58.9  0.0000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.74746  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2643  major facilitator transporter  24.02 
 
 		 399 aa  58.5  0.0000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.238963  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2720  putative permease  26.63 
 
 		 412 aa  58.5  0.0000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.093304  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0768  major facilitator superfamily MFS_1  26.92 
 
 		 456 aa  58.9  0.0000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2953  major facilitator superfamily MFS_1  25.67 
 
 		 413 aa  58.5  0.0000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0279289  hitchhiker  0.000525778 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3594  putative permease  21.69 
 
 		 422 aa  58.5  0.0000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1016  major facilitator transporter  27.43 
 
 		 393 aa  58.2  0.0000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.807332  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4147  H+ antiporter protein  26.32 
 
 		 424 aa  57.8  0.0000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4301  H+ antiporter protein  26.32 
 
 		 424 aa  57.8  0.0000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.100469  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2678  MFS family major facilitator transporter  27.84 
 
 		 410 aa  58.2  0.0000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0732  major facilitator superfamily MFS_1  25.89 
 
 		 412 aa  57.8  0.0000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.000169813  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2432  permease  24.04 
 
 		 412 aa  57.8  0.0000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0771594  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2667  putative permease  24.04 
 
 		 412 aa  57.8  0.0000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000524828 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0310  major facilitator transporter  32.58 
 
 		 443 aa  57.8  0.0000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1971  thymidylate kinase  27.78 
 
 		 688 aa  57.8  0.0000004  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.270362  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0087  major facilitator transporter  21.98 
 
 		 436 aa  57.4  0.0000004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19250  major facilitator superfamily MFS_1  19.16 
 
 		 444 aa  57.4  0.0000005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00108172  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5814  major facilitator superfamily MFS_1  23.08 
 
 		 423 aa  57.4  0.0000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.915234  hitchhiker  0.00491963 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9221  dTMP kinase  28.03 
 
 		 688 aa  57  0.0000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.625222  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3952  major facilitator transporter  25.09 
 
 		 413 aa  57  0.0000007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1515  major facilitator superfamily MFS_1  22.5 
 
 		 416 aa  57  0.0000007  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000845442 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0792  major facilitator transporter  27.84 
 
 		 450 aa  57  0.0000007  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>