More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PputW619_5159 on replicon NC_010501
Organism: Pseudomonas putida W619



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010501  PputW619_5159  major facilitator transporter  100 
 
 		 434 aa  854    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5611  major facilitator transporter  71.46 
 
 		 440 aa  610  1e-173  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.358621 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2492  major facilitator transporter  71 
 
 		 438 aa  600  1e-170  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0783563  normal  0.106757 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1147  major facilitator superfamily MFS_1  67.35 
 
 		 436 aa  577  1.0000000000000001e-163  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.114141  n/a   
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5140  major facilitator superfamily MFS_1  71.3 
 
 		 439 aa  560  1e-158  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0730511  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_31240  putative nrbE-like protein  66.67 
 
 		 436 aa  556  1e-157  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000000000011963  unclonable  4.15969e-22 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1768  major facilitator transporter  63.39 
 
 		 440 aa  535  1e-151  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.071428 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1582  MFS Ni2+ efflux pump NreB  62.79 
 
 		 440 aa  532  1e-150  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0336  major facilitator transporter  58.96 
 
 		 441 aa  515  1.0000000000000001e-145  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2242  major facilitator superfamily MFS_1  63.35 
 
 		 444 aa  513  1e-144  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.370083  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4728  major facilitator superfamily MFS_1  66.36 
 
 		 444 aa  507  9.999999999999999e-143  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.632201 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1884  major facilitator superfamily MFS_1  65.53 
 
 		 444 aa  452  1.0000000000000001e-126  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.672709 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_6144  MFS family nickel efflux transporter protein NreB  64.94 
 
 		 408 aa  449  1e-125  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4285  major facilitator superfamily MFS_1  55.63 
 
 		 444 aa  414  1e-114  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.181984  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3139  major facilitator superfamily MFS_1  53.03 
 
 		 453 aa  404  1e-111  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3189  major facilitator transporter  51.01 
 
 		 442 aa  380  1e-104  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00704959 
 
 
-
 
NC_008539  Arth_4264  major facilitator transporter  54.07 
 
 		 420 aa  377  1e-103  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0538931  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3358  major facilitator superfamily MFS_1  49.77 
 
 		 456 aa  369  1e-101  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2968  major facilitator transporter  47.87 
 
 		 442 aa  367  1e-100  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.433406  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3828  major facilitator transporter  54.59 
 
 		 421 aa  357  1.9999999999999998e-97  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0895  major facilitator superfamily MFS_1  57.89 
 
 		 457 aa  342  9e-93  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.29064 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3044  major facilitator transporter  43.56 
 
 		 464 aa  329  6e-89  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.264008 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3464  hypothetical protein  41.58 
 
 		 394 aa  270  4e-71  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.269124  normal  0.0966327 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1713  major facilitator superfamily MFS_1  50.84 
 
 		 432 aa  236  7e-61  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.300423  normal  0.77847 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2363  putative NreB protein  50.17 
 
 		 307 aa  224  2e-57  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.602638  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0479  major facilitator superfamily MFS_1  33.25 
 
 		 427 aa  170  6e-41  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.742618 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0698  major facilitator superfamily MFS_1  25.81 
 
 		 397 aa  83.6  0.000000000000007  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2302  major facilitator superfamily MFS_1  29.29 
 
 		 390 aa  80.9  0.00000000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.0000026904  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2046  hypothetical protein  30.73 
 
 		 448 aa  77.4  0.0000000000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.258697 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3061  major facilitator superfamily MFS_1  29.67 
 
 		 429 aa  75.1  0.000000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  decreased coverage  0.00310805  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2643  major facilitator transporter  28.28 
 
 		 399 aa  74.7  0.000000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.238963  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3467  thymidylate kinase  29.21 
 
 		 686 aa  73.9  0.000000000005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1539  major facilitator transporter  21.83 
 
 		 412 aa  73.6  0.000000000006  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  unclonable  0.000000151531  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1559  major facilitator transporter  21.83 
 
 		 412 aa  73.9  0.000000000006  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.00000341731  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1748  multidrug resistance protein; tetracycline resistance determinant  25.11 
 
 		 406 aa  72.8  0.00000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000069396  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1942  multidrug resistance protein; putative tetracycline resistance determinant  24.66 
 
 		 406 aa  71.6  0.00000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.0213e-35 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1971  thymidylate kinase  27.24 
 
 		 688 aa  70.5  0.00000000006  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.270362  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2582  permease, putative  23.35 
 
 		 408 aa  70.1  0.00000000008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2318  macrolide-efflux protein  23.05 
 
 		 408 aa  68.6  0.0000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.31097  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0692  major facilitator transporter  25.77 
 
 		 439 aa  68.6  0.0000000002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0056  major facilitator superfamily MFS_1  27.62 
 
 		 433 aa  67  0.0000000007  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2678  MFS family major facilitator transporter  30.63 
 
 		 410 aa  66.6  0.0000000008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2468  permease  28.57 
 
 		 412 aa  66.2  0.0000000009  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.000564968  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2631  putative permease  22.02 
 
 		 408 aa  66.6  0.0000000009  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0615976  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2649  permease  28.57 
 
 		 412 aa  66.2  0.0000000009  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.765576  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0543  major facilitator superfamily MFS_1  27.41 
 
 		 448 aa  66.2  0.000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2355  macrolide-efflux protein  22.92 
 
 		 408 aa  66.2  0.000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000199839  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0293  major facilitator superfamily MFS_1  25.08 
 
 		 710 aa  65.9  0.000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.189593  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9221  dTMP kinase  31.69 
 
 		 688 aa  65.9  0.000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.625222  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2589  putative permease  22.75 
 
 		 408 aa  65.9  0.000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.59543e-18 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2122  major facilitator transporter  29.69 
 
 		 424 aa  65.9  0.000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.74746  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2432  permease  28.04 
 
 		 412 aa  65.5  0.000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0771594  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2393  permease; macrolide-efflux protein  28.57 
 
 		 412 aa  65.1  0.000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.366369  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2667  putative permease  28.04 
 
 		 412 aa  65.5  0.000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000524828 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2654  macrolide efflux protein, putative  24.02 
 
 		 414 aa  64.7  0.000000003  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4661  major facilitator transporter  29.57 
 
 		 454 aa  64.7  0.000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.731341  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2402  permease  23.78 
 
 		 408 aa  64.7  0.000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0859078  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0193  major facilitator superfamily MFS_1  28.12 
 
 		 448 aa  64.7  0.000000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2577  permease  23.78 
 
 		 408 aa  64.7  0.000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.659755  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1862  major facilitator transporter  27.18 
 
 		 432 aa  64.3  0.000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1904  amino acid adenylation domain-containing protein  24.93 
 
 		 1833 aa  64.3  0.000000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.844763  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4779  major facilitator transporter  23.17 
 
 		 428 aa  64.3  0.000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00000206756  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2777  permease  20.86 
 
 		 406 aa  63.9  0.000000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.145309  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2988  permease  20.86 
 
 		 406 aa  63.9  0.000000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3450  major facilitator superfamily MFS_1  24.79 
 
 		 499 aa  63.5  0.000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00033474 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11210  major facilitator superfamily MFS_1  26.2 
 
 		 433 aa  63.2  0.000000008  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2984  putative permease  21.05 
 
 		 404 aa  63.2  0.000000008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000116191 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1991  major facilitator superfamily MFS_1  22.38 
 
 		 450 aa  63.2  0.000000009  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.762129  normal  1 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0066  macrolide-efflux protein  30.59 
 
 		 441 aa  63.2  0.000000009  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.00000000000436229  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2633  putative permease  30 
 
 		 410 aa  63.2  0.000000009  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.778605  hitchhiker  0.00000416081 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0752  transporter, putative  26.67 
 
 		 446 aa  62.4  0.00000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3025  permease, putative  20.2 
 
 		 406 aa  62.8  0.00000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.076608  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3246  permease, putative  23.92 
 
 		 417 aa  62.4  0.00000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0277963  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2720  putative permease  26.53 
 
 		 412 aa  62.8  0.00000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.093304  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2707  macrolide efflux protein  20.86 
 
 		 406 aa  62.8  0.00000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0968867  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0356  major facilitator superfamily MFS_1  27.11 
 
 		 407 aa  63.2  0.00000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0009  protein of unknown function DUF894, DitE  24.69 
 
 		 527 aa  62.8  0.00000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0516  major facilitator superfamily MFS_1  26.3 
 
 		 420 aa  62  0.00000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2726  macrolide efflux protein  20.93 
 
 		 406 aa  62.4  0.00000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.277105  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1677  hypothetical protein  24.35 
 
 		 435 aa  62  0.00000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3257  tetracycline resistance determinant TetV  23.92 
 
 		 414 aa  62.4  0.00000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.160876  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0490  major facilitator superfamily MFS_1  27.48 
 
 		 461 aa  62  0.00000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33950  arabinose efflux permease family protein  27.27 
 
 		 414 aa  61.2  0.00000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.466548  normal  0.73086 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2487  major facilitator transporter  29.38 
 
 		 412 aa  61.2  0.00000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000357828  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2255  putative permease  29.93 
 
 		 404 aa  60.8  0.00000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.134353 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2682  permease, putative  28.12 
 
 		 440 aa  60.5  0.00000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00193571  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1515  major facilitator superfamily MFS_1  24.92 
 
 		 416 aa  60.5  0.00000005  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000845442 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0098  major facilitator superfamily MFS_1  28.63 
 
 		 428 aa  60.1  0.00000008  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0701  major facilitator superfamily MFS_1  20.93 
 
 		 423 aa  60.1  0.00000008  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4378  major facilitator transporter  25.24 
 
 		 431 aa  60.1  0.00000009  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1532  major facilitator transporter  22.4 
 
 		 423 aa  59.3  0.0000001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.68199  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1445  major facilitator transporter  23.48 
 
 		 390 aa  59.7  0.0000001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00616907  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1491  major facilitator transporter  23.48 
 
 		 390 aa  59.7  0.0000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.326017  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0875  major facilitator superfamily MFS_1  24.5 
 
 		 441 aa  58.9  0.0000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  hitchhiker  0.00780765  normal  0.0882707 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5814  major facilitator superfamily MFS_1  21.01 
 
 		 423 aa  58.9  0.0000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.915234  hitchhiker  0.00491963 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1861  major facilitator transporter  26.15 
 
 		 413 aa  58.5  0.0000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0051281 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1398  major facilitator transporter  25.44 
 
 		 422 aa  58.5  0.0000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.902897  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19250  major facilitator superfamily MFS_1  21.41 
 
 		 444 aa  58.5  0.0000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00108172  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2733  major facilitator superfamily MFS_1  28.23 
 
 		 424 aa  58.5  0.0000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2206  major facilitator transporter  26.67 
 
 		 447 aa  58.9  0.0000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>