295 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_4285 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_4285  major facilitator superfamily MFS_1  100 
 
 		 444 aa  830    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.181984  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5611  major facilitator transporter  59.59 
 
 		 440 aa  465  9.999999999999999e-131  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.358621 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0336  major facilitator transporter  57.21 
 
 		 441 aa  449  1e-125  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2492  major facilitator transporter  57.66 
 
 		 438 aa  447  1.0000000000000001e-124  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0783563  normal  0.106757 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_31240  putative nrbE-like protein  57.79 
 
 		 436 aa  442  1e-123  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000000000011963  unclonable  4.15969e-22 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2242  major facilitator superfamily MFS_1  59.42 
 
 		 444 aa  441  9.999999999999999e-123  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.370083  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1147  major facilitator superfamily MFS_1  56.21 
 
 		 436 aa  439  9.999999999999999e-123  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.114141  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5159  major facilitator transporter  55.63 
 
 		 434 aa  433  1e-120  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5140  major facilitator superfamily MFS_1  58.01 
 
 		 439 aa  420  1e-116  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0730511  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1768  major facilitator transporter  54.73 
 
 		 440 aa  416  9.999999999999999e-116  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.071428 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1582  MFS Ni2+ efflux pump NreB  53.83 
 
 		 440 aa  414  1e-114  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4728  major facilitator superfamily MFS_1  58.65 
 
 		 444 aa  407  1.0000000000000001e-112  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.632201 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3139  major facilitator superfamily MFS_1  54.24 
 
 		 453 aa  400  9.999999999999999e-111  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_6144  MFS family nickel efflux transporter protein NreB  57.46 
 
 		 408 aa  393  1e-108  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2968  major facilitator transporter  51.24 
 
 		 442 aa  383  1e-105  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.433406  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1884  major facilitator superfamily MFS_1  58.43 
 
 		 444 aa  379  1e-104  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.672709 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3189  major facilitator transporter  51.69 
 
 		 442 aa  374  1e-102  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00704959 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3358  major facilitator superfamily MFS_1  52.75 
 
 		 456 aa  373  1e-102  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008539  Arth_4264  major facilitator transporter  51.8 
 
 		 420 aa  335  1e-90  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0538931  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0895  major facilitator superfamily MFS_1  57.42 
 
 		 457 aa  323  5e-87  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.29064 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3828  major facilitator transporter  53.49 
 
 		 421 aa  316  6e-85  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3044  major facilitator transporter  41.86 
 
 		 464 aa  302  7.000000000000001e-81  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.264008 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3464  hypothetical protein  43.44 
 
 		 394 aa  247  3e-64  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.269124  normal  0.0966327 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1713  major facilitator superfamily MFS_1  54.97 
 
 		 432 aa  215  9.999999999999999e-55  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.300423  normal  0.77847 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2363  putative NreB protein  48.94 
 
 		 307 aa  201  1.9999999999999998e-50  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.602638  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0479  major facilitator superfamily MFS_1  31.63 
 
 		 427 aa  159  1e-37  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.742618 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0490  major facilitator superfamily MFS_1  30.39 
 
 		 461 aa  76.3  0.000000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2582  permease, putative  28.12 
 
 		 408 aa  74.3  0.000000000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2318  macrolide-efflux protein  24.67 
 
 		 408 aa  73.6  0.000000000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.31097  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3467  thymidylate kinase  30.29 
 
 		 686 aa  73.6  0.000000000007  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2402  permease  24.33 
 
 		 408 aa  73.2  0.00000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0859078  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3061  major facilitator superfamily MFS_1  30.93 
 
 		 429 aa  73.2  0.00000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  decreased coverage  0.00310805  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2577  permease  24.33 
 
 		 408 aa  73.2  0.00000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.659755  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2122  major facilitator transporter  25.81 
 
 		 424 aa  73.2  0.00000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.74746  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1971  thymidylate kinase  31.13 
 
 		 688 aa  73.2  0.00000000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.270362  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2355  macrolide-efflux protein  24.33 
 
 		 408 aa  71.6  0.00000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000199839  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1861  major facilitator transporter  29.71 
 
 		 413 aa  71.2  0.00000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0051281 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33950  arabinose efflux permease family protein  28.15 
 
 		 414 aa  71.2  0.00000000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.466548  normal  0.73086 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9221  dTMP kinase  34.51 
 
 		 688 aa  70.9  0.00000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.625222  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2631  putative permease  25.34 
 
 		 408 aa  70.9  0.00000000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0615976  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2643  major facilitator transporter  26.37 
 
 		 399 aa  69.7  0.0000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.238963  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2589  putative permease  24 
 
 		 408 aa  69.7  0.0000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.59543e-18 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1991  major facilitator superfamily MFS_1  24.92 
 
 		 450 aa  69.3  0.0000000001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.762129  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2487  major facilitator transporter  32.14 
 
 		 412 aa  68.9  0.0000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000357828  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2302  major facilitator superfamily MFS_1  34.25 
 
 		 390 aa  67.8  0.0000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.0000026904  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0698  major facilitator superfamily MFS_1  19.85 
 
 		 397 aa  66.6  0.0000000008  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0491  major facilitator superfamily MFS_1  31.96 
 
 		 424 aa  66.6  0.0000000009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11210  major facilitator superfamily MFS_1  26.27 
 
 		 433 aa  65.5  0.000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4177  major facilitator superfamily MFS_1  30.14 
 
 		 476 aa  64.7  0.000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.192321  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4706  major facilitator superfamily MFS_1  32.37 
 
 		 445 aa  65.1  0.000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.93667 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3588  major facilitator superfamily MFS_1  27.88 
 
 		 428 aa  65.1  0.000000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.273478 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0875  major facilitator superfamily MFS_1  25.84 
 
 		 441 aa  64.3  0.000000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  hitchhiker  0.00780765  normal  0.0882707 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0303  major facilitator superfamily MFS_1  29.69 
 
 		 426 aa  63.9  0.000000005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0634781  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0768  major facilitator superfamily MFS_1  28.9 
 
 		 456 aa  63.5  0.000000006  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4370  transporter, major facilitator family  21.15 
 
 		 410 aa  63.5  0.000000007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  5.0052999999999995e-22 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2678  MFS family major facilitator transporter  28.72 
 
 		 410 aa  63.5  0.000000008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0968  major facilitator superfamily MFS_1  26.47 
 
 		 432 aa  62.4  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.896564  normal  0.510346 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0395  permease  21.98 
 
 		 430 aa  62.4  0.00000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0177527  normal  0.113221 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3450  major facilitator superfamily MFS_1  29.05 
 
 		 499 aa  61.6  0.00000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00033474 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0792  major facilitator transporter  26.82 
 
 		 450 aa  62  0.00000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0701  major facilitator superfamily MFS_1  22.01 
 
 		 423 aa  61.6  0.00000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2393  permease; macrolide-efflux protein  26.48 
 
 		 412 aa  61.6  0.00000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.366369  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1677  hypothetical protein  26.1 
 
 		 435 aa  61.2  0.00000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0356  major facilitator superfamily MFS_1  32.02 
 
 		 407 aa  61.2  0.00000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8399  thymidylate kinase  33.61 
 
 		 901 aa  61.6  0.00000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0110  major facilitator transporter  29.46 
 
 		 429 aa  61.6  0.00000003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2633  putative permease  30.36 
 
 		 410 aa  61.2  0.00000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.778605  hitchhiker  0.00000416081 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1264  major facilitator superfamily MFS_1  30.05 
 
 		 422 aa  60.8  0.00000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.62642  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0181  major facilitator superfamily MFS_1  26.62 
 
 		 401 aa  60.1  0.00000007  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0752  transporter, putative  27.72 
 
 		 446 aa  60.1  0.00000008  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3952  major facilitator transporter  27.27 
 
 		 413 aa  60.1  0.00000009  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2682  permease, putative  28.57 
 
 		 440 aa  59.7  0.00000009  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00193571  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2468  permease  26.48 
 
 		 412 aa  60.1  0.00000009  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.000564968  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2649  permease  26.48 
 
 		 412 aa  60.1  0.00000009  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.765576  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2720  putative permease  26.48 
 
 		 412 aa  60.1  0.00000009  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.093304  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0532  major facilitator superfamily MFS_1  27.51 
 
 		 428 aa  59.7  0.0000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2432  permease  26.03 
 
 		 412 aa  59.3  0.0000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0771594  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2667  putative permease  26.03 
 
 		 412 aa  59.3  0.0000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000524828 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2206  major facilitator transporter  28.22 
 
 		 447 aa  59.3  0.0000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0548  major facilitator superfamily MFS_1  28.83 
 
 		 419 aa  59.7  0.0000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.010876  decreased coverage  0.00150074 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0066  macrolide-efflux protein  29.07 
 
 		 441 aa  58.5  0.0000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.00000000000436229  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0543  major facilitator superfamily MFS_1  29.23 
 
 		 448 aa  58.9  0.0000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1398  major facilitator transporter  24.69 
 
 		 422 aa  58.9  0.0000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.902897  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0176  major facilitator transporter  29.03 
 
 		 426 aa  58.5  0.0000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.379469  normal  0.234316 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0056  major facilitator superfamily MFS_1  24.67 
 
 		 433 aa  58.5  0.0000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4779  major facilitator transporter  23.81 
 
 		 428 aa  58.2  0.0000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00000206756  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2046  hypothetical protein  30.6 
 
 		 448 aa  58.5  0.0000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.258697 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4306  thymidylate kinase  24.73 
 
 		 730 aa  57.8  0.0000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3926  major facilitator transporter  24.03 
 
 		 457 aa  58.2  0.0000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5433  major facilitator superfamily MFS_1  27.93 
 
 		 417 aa  57.8  0.0000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.317246  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2273  permease; macrolide-efflux protein  25 
 
 		 417 aa  57.4  0.0000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00046211  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2848  major facilitator superfamily MFS_1  28.78 
 
 		 426 aa  57.4  0.0000005  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1486  major facilitator transporter  31.19 
 
 		 420 aa  57.4  0.0000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.467645  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1862  major facilitator transporter  27.23 
 
 		 432 aa  57  0.0000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2227  permease; macrolide-efflux protein  24.76 
 
 		 417 aa  57  0.0000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0120958  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2501  putative ABC transporter, permease protein  25 
 
 		 415 aa  57.4  0.0000006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_35790  thymidylate kinase  25.72 
 
 		 642 aa  57  0.0000007  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.157442 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1030  major facilitator superfamily MFS_1  27.23 
 
 		 419 aa  57  0.0000007  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0091  major facilitator superfamily MFS_1  24.63 
 
 		 442 aa  56.6  0.0000008  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3486  major facilitator transporter  25.81 
 
 		 450 aa  56.6  0.0000009  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.719238  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>