250 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpau_3358 on replicon NC_014158
Organism: Tsukamurella paurometabola DSM 20162



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014158  Tpau_3358  major facilitator superfamily MFS_1  100 
 
 		 456 aa  880    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3139  major facilitator superfamily MFS_1  56.39 
 
 		 453 aa  461  1e-129  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5611  major facilitator transporter  54.59 
 
 		 440 aa  426  1e-118  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.358621 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2492  major facilitator transporter  51.03 
 
 		 438 aa  414  1e-114  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0783563  normal  0.106757 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2242  major facilitator superfamily MFS_1  51.58 
 
 		 444 aa  393  1e-108  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.370083  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1582  MFS Ni2+ efflux pump NreB  49.67 
 
 		 440 aa  380  1e-104  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5159  major facilitator transporter  50.23 
 
 		 434 aa  380  1e-104  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_31240  putative nrbE-like protein  50.23 
 
 		 436 aa  379  1e-104  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000000000011963  unclonable  4.15969e-22 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1147  major facilitator superfamily MFS_1  48.74 
 
 		 436 aa  378  1e-103  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.114141  n/a   
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5140  major facilitator superfamily MFS_1  50.92 
 
 		 439 aa  374  1e-102  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0730511  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0336  major facilitator transporter  47.53 
 
 		 441 aa  372  1e-101  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1768  major facilitator transporter  48.56 
 
 		 440 aa  367  1e-100  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.071428 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3189  major facilitator transporter  48.75 
 
 		 442 aa  365  1e-100  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00704959 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4728  major facilitator superfamily MFS_1  49.67 
 
 		 444 aa  362  9e-99  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.632201 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2968  major facilitator transporter  48.86 
 
 		 442 aa  361  2e-98  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.433406  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4285  major facilitator superfamily MFS_1  52.75 
 
 		 444 aa  357  1.9999999999999998e-97  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.181984  n/a   
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_6144  MFS family nickel efflux transporter protein NreB  51.36 
 
 		 408 aa  333  4e-90  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1884  major facilitator superfamily MFS_1  51 
 
 		 444 aa  325  8.000000000000001e-88  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.672709 
 
 
-
 
NC_008539  Arth_4264  major facilitator transporter  50.77 
 
 		 420 aa  323  5e-87  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0538931  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3828  major facilitator transporter  47.46 
 
 		 421 aa  311  2e-83  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0895  major facilitator superfamily MFS_1  53.28 
 
 		 457 aa  306  7e-82  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.29064 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3044  major facilitator transporter  40.34 
 
 		 464 aa  299  6e-80  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.264008 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3464  hypothetical protein  37.97 
 
 		 394 aa  214  1.9999999999999998e-54  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.269124  normal  0.0966327 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1713  major facilitator superfamily MFS_1  47.66 
 
 		 432 aa  205  2e-51  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.300423  normal  0.77847 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2363  putative NreB protein  42.35 
 
 		 307 aa  168  2e-40  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.602638  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0479  major facilitator superfamily MFS_1  31.61 
 
 		 427 aa  147  3e-34  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.742618 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2302  major facilitator superfamily MFS_1  31.5 
 
 		 390 aa  73.9  0.000000000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.0000026904  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0066  macrolide-efflux protein  29.26 
 
 		 441 aa  72.8  0.00000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.00000000000436229  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0532  major facilitator superfamily MFS_1  27.46 
 
 		 428 aa  71.6  0.00000000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4661  major facilitator transporter  27.92 
 
 		 454 aa  69.3  0.0000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.731341  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1904  amino acid adenylation domain-containing protein  24.93 
 
 		 1833 aa  69.3  0.0000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.844763  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0303  major facilitator superfamily MFS_1  24.72 
 
 		 426 aa  67.8  0.0000000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0634781  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2046  hypothetical protein  29.03 
 
 		 448 aa  66.2  0.000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.258697 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2984  putative permease  22.34 
 
 		 404 aa  64.7  0.000000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000116191 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2777  permease  22.71 
 
 		 406 aa  63.5  0.000000007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.145309  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2988  permease  22.71 
 
 		 406 aa  63.5  0.000000007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2707  macrolide efflux protein  22.34 
 
 		 406 aa  63.2  0.000000009  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0968867  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0701  major facilitator superfamily MFS_1  19.43 
 
 		 423 aa  63.2  0.00000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3025  permease, putative  22.55 
 
 		 406 aa  62  0.00000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.076608  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2435  putative ABC transporter, permease protein  29.9 
 
 		 414 aa  62  0.00000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.70932  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2726  macrolide efflux protein  22.34 
 
 		 406 aa  62.4  0.00000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.277105  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2255  putative permease  21.98 
 
 		 404 aa  62  0.00000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.134353 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0356  major facilitator superfamily MFS_1  33.63 
 
 		 407 aa  61.6  0.00000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1438  major facilitator superfamily MFS_1  26.12 
 
 		 416 aa  61.2  0.00000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2393  permease; macrolide-efflux protein  27.75 
 
 		 412 aa  61.6  0.00000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.366369  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3024  putative permease  22.34 
 
 		 406 aa  61.6  0.00000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2678  MFS family major facilitator transporter  29.59 
 
 		 410 aa  61.6  0.00000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3741  major facilitator transporter  27.93 
 
 		 426 aa  61.6  0.00000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.159847  normal  1 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0001  major facilitator transporter  27.27 
 
 		 434 aa  60.8  0.00000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.51078  hitchhiker  0.00413697 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1747  major facilitator superfamily MFS_1  25 
 
 		 463 aa  61.2  0.00000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.192343  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2468  permease  28.4 
 
 		 412 aa  60.5  0.00000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.000564968  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2432  permease  27.17 
 
 		 412 aa  60.8  0.00000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0771594  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2649  permease  28.4 
 
 		 412 aa  60.5  0.00000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.765576  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2286  major facilitator transporter  28.5 
 
 		 414 aa  60.8  0.00000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0407537  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2667  putative permease  27.17 
 
 		 412 aa  60.8  0.00000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000524828 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2487  major facilitator transporter  28.98 
 
 		 412 aa  60.5  0.00000007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000357828  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2682  permease, putative  27.17 
 
 		 440 aa  60.1  0.00000008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00193571  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2720  putative permease  27.17 
 
 		 412 aa  60.1  0.00000009  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.093304  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3061  major facilitator superfamily MFS_1  29.02 
 
 		 429 aa  59.3  0.0000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  decreased coverage  0.00310805  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1971  thymidylate kinase  26.03 
 
 		 688 aa  59.7  0.0000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.270362  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0516  major facilitator superfamily MFS_1  24.23 
 
 		 420 aa  58.5  0.0000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3450  major facilitator superfamily MFS_1  29.53 
 
 		 499 aa  58.9  0.0000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00033474 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4370  transporter, major facilitator family  21.26 
 
 		 410 aa  58.5  0.0000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  5.0052999999999995e-22 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3952  major facilitator transporter  26.33 
 
 		 413 aa  58.9  0.0000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8399  thymidylate kinase  25.68 
 
 		 901 aa  58.2  0.0000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3467  thymidylate kinase  28.4 
 
 		 686 aa  57.8  0.0000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0871  macrolide efflux protein, putative  27.61 
 
 		 394 aa  57.8  0.0000005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0193  major facilitator superfamily MFS_1  29.36 
 
 		 448 aa  57.4  0.0000005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0310  major facilitator transporter  29.19 
 
 		 443 aa  57.4  0.0000005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5406  major facilitator superfamily MFS_1  27.82 
 
 		 444 aa  57  0.0000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.283217 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2654  macrolide efflux protein, putative  25.97 
 
 		 414 aa  57  0.0000007  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2582  permease, putative  24.76 
 
 		 408 aa  56.6  0.0000009  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1862  major facilitator transporter  28.05 
 
 		 432 aa  56.6  0.0000009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0752  transporter, putative  25.84 
 
 		 446 aa  56.2  0.000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2511  ABC transporter, permease protein, putative  28.43 
 
 		 414 aa  56.6  0.000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00150223  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0548  major facilitator superfamily MFS_1  28.76 
 
 		 419 aa  55.8  0.000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.010876  decreased coverage  0.00150074 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0308  dTMP kinase  25.88 
 
 		 709 aa  56.2  0.000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.233817 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0698  major facilitator superfamily MFS_1  20.91 
 
 		 397 aa  55.8  0.000001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0098  major facilitator superfamily MFS_1  27.07 
 
 		 428 aa  55.8  0.000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2208  Non-ribosomal peptide synthetase modules and related protein-like protein  26.54 
 
 		 1829 aa  55.5  0.000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.190766  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1861  major facilitator transporter  25.32 
 
 		 413 aa  55.8  0.000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0051281 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1572  major facilitator transporter  30.32 
 
 		 415 aa  55.8  0.000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.58248  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2273  permease; macrolide-efflux protein  27.98 
 
 		 417 aa  54.7  0.000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00046211  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2227  permease; macrolide-efflux protein  27.98 
 
 		 417 aa  55.1  0.000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0120958  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2480  ABC transporter permease  27.98 
 
 		 415 aa  54.7  0.000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0926781  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2647  major facilitator transporter  30.21 
 
 		 524 aa  55.1  0.000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2501  putative ABC transporter, permease protein  27.98 
 
 		 415 aa  54.7  0.000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2305  ABC transporter permease  27.98 
 
 		 417 aa  54.3  0.000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0193471  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1568  multidrug resistance protein; tetracycline resistance determinant  21.93 
 
 		 422 aa  54.7  0.000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.766892  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1536  major facilitator transporter  23.74 
 
 		 406 aa  54.7  0.000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.29974  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2589  putative permease  22.74 
 
 		 408 aa  53.9  0.000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.59543e-18 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2355  macrolide-efflux protein  23.26 
 
 		 408 aa  54.3  0.000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000199839  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1559  multidrug resistance protein; tetracycline resistance determinant  22.39 
 
 		 422 aa  54.3  0.000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.285528  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1486  major facilitator transporter  25.55 
 
 		 420 aa  54.3  0.000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.467645  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3912  major facilitator transporter  27.44 
 
 		 465 aa  54.3  0.000005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.31796 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1942  multidrug resistance protein; putative tetracycline resistance determinant  20.51 
 
 		 406 aa  53.9  0.000006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.0213e-35 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2668  protein of unknown function DUF894, DitE  25.41 
 
 		 541 aa  53.9  0.000006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0968  major facilitator superfamily MFS_1  26.07 
 
 		 432 aa  53.5  0.000007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.896564  normal  0.510346 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2318  macrolide-efflux protein  23.1 
 
 		 408 aa  53.5  0.000007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.31097  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4460  major facilitator superfamily MFS_1  27.27 
 
 		 434 aa  53.5  0.000007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>