265 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcryo_1768 on replicon NC_007969
Organism: Psychrobacter cryohalolentis K5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007204  Psyc_1582  MFS Ni2+ efflux pump NreB  96.14 
 
 		 440 aa  805    Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1768  major facilitator transporter  100 
 
 		 440 aa  871    Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.071428 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2492  major facilitator transporter  67.58 
 
 		 438 aa  589  1e-167  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0783563  normal  0.106757 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5611  major facilitator transporter  66.97 
 
 		 440 aa  565  1e-160  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.358621 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5159  major facilitator transporter  63.39 
 
 		 434 aa  535  1e-151  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_31240  putative nrbE-like protein  64.91 
 
 		 436 aa  535  1e-151  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000000000011963  unclonable  4.15969e-22 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5140  major facilitator superfamily MFS_1  64.69 
 
 		 439 aa  526  1e-148  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0730511  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1147  major facilitator superfamily MFS_1  61.33 
 
 		 436 aa  527  1e-148  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.114141  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2242  major facilitator superfamily MFS_1  64.21 
 
 		 444 aa  516  1.0000000000000001e-145  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.370083  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0336  major facilitator transporter  58.88 
 
 		 441 aa  506  9.999999999999999e-143  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4728  major facilitator superfamily MFS_1  63 
 
 		 444 aa  494  9.999999999999999e-139  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.632201 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1884  major facilitator superfamily MFS_1  62.53 
 
 		 444 aa  445  1.0000000000000001e-124  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.672709 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_6144  MFS family nickel efflux transporter protein NreB  61.61 
 
 		 408 aa  439  9.999999999999999e-123  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4285  major facilitator superfamily MFS_1  54.38 
 
 		 444 aa  397  1e-109  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.181984  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3139  major facilitator superfamily MFS_1  51.45 
 
 		 453 aa  396  1e-109  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3358  major facilitator superfamily MFS_1  48.34 
 
 		 456 aa  357  1.9999999999999998e-97  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2968  major facilitator transporter  45.12 
 
 		 442 aa  349  6e-95  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.433406  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3189  major facilitator transporter  47.06 
 
 		 442 aa  348  1e-94  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00704959 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0895  major facilitator superfamily MFS_1  58.22 
 
 		 457 aa  346  4e-94  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.29064 
 
 
-
 
NC_008539  Arth_4264  major facilitator transporter  52.63 
 
 		 420 aa  341  1e-92  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0538931  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3828  major facilitator transporter  52.97 
 
 		 421 aa  336  5.999999999999999e-91  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3044  major facilitator transporter  42.03 
 
 		 464 aa  318  9e-86  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.264008 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3464  hypothetical protein  41.34 
 
 		 394 aa  263  4e-69  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.269124  normal  0.0966327 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2363  putative NreB protein  47.9 
 
 		 307 aa  217  4e-55  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.602638  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1713  major facilitator superfamily MFS_1  48.04 
 
 		 432 aa  211  2e-53  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.300423  normal  0.77847 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0479  major facilitator superfamily MFS_1  30.34 
 
 		 427 aa  150  4e-35  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.742618 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1942  multidrug resistance protein; putative tetracycline resistance determinant  23.62 
 
 		 406 aa  77.8  0.0000000000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.0213e-35 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1748  multidrug resistance protein; tetracycline resistance determinant  24.49 
 
 		 406 aa  76.3  0.000000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000069396  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3588  major facilitator superfamily MFS_1  28.62 
 
 		 428 aa  73.6  0.000000000006  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.273478 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3061  major facilitator superfamily MFS_1  27.18 
 
 		 429 aa  73.6  0.000000000007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  decreased coverage  0.00310805  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2302  major facilitator superfamily MFS_1  27.54 
 
 		 390 aa  72.8  0.00000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.0000026904  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2582  permease, putative  26.34 
 
 		 408 aa  70.9  0.00000000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0698  major facilitator superfamily MFS_1  21.27 
 
 		 397 aa  69.3  0.0000000001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3926  major facilitator transporter  24.89 
 
 		 457 aa  68.2  0.0000000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1539  major facilitator transporter  21.39 
 
 		 412 aa  67.8  0.0000000004  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  unclonable  0.000000151531  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33950  arabinose efflux permease family protein  29.89 
 
 		 414 aa  67  0.0000000006  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.466548  normal  0.73086 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1559  major facilitator transporter  21.39 
 
 		 412 aa  67  0.0000000007  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.00000341731  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2631  putative permease  25.37 
 
 		 408 aa  65.9  0.000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0615976  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2589  putative permease  25.25 
 
 		 408 aa  64.7  0.000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.59543e-18 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2318  macrolide-efflux protein  25.74 
 
 		 408 aa  64.7  0.000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.31097  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2355  macrolide-efflux protein  25.12 
 
 		 408 aa  64.3  0.000000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000199839  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0692  major facilitator transporter  22.69 
 
 		 439 aa  63.5  0.000000006  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2402  permease  25.25 
 
 		 408 aa  63.9  0.000000006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0859078  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2577  permease  25.25 
 
 		 408 aa  63.9  0.000000006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.659755  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0875  major facilitator superfamily MFS_1  29.09 
 
 		 441 aa  63.5  0.000000007  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  hitchhiker  0.00780765  normal  0.0882707 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0543  major facilitator superfamily MFS_1  26.13 
 
 		 448 aa  63.2  0.000000009  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1904  amino acid adenylation domain-containing protein  24.17 
 
 		 1833 aa  63.2  0.000000009  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.844763  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0193  major facilitator superfamily MFS_1  27.78 
 
 		 448 aa  63.2  0.000000009  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2046  hypothetical protein  30.99 
 
 		 448 aa  63.2  0.00000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.258697 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0066  macrolide-efflux protein  27.49 
 
 		 441 aa  62  0.00000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.00000000000436229  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0356  major facilitator superfamily MFS_1  27.95 
 
 		 407 aa  62  0.00000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2953  major facilitator superfamily MFS_1  27.27 
 
 		 413 aa  61.6  0.00000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0279289  hitchhiker  0.000525778 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0062  major facilitator superfamily MFS_1  23.53 
 
 		 440 aa  61.2  0.00000004  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.175422  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0752  transporter, putative  24.17 
 
 		 446 aa  60.1  0.00000007  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0968  major facilitator superfamily MFS_1  24.31 
 
 		 432 aa  60.1  0.00000007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.896564  normal  0.510346 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1991  major facilitator superfamily MFS_1  26.28 
 
 		 450 aa  59.7  0.00000009  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.762129  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6215  major facilitator superfamily MFS_1  32.26 
 
 		 404 aa  59.7  0.0000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0532982  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4661  major facilitator transporter  26.55 
 
 		 454 aa  58.5  0.0000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.731341  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4370  transporter, major facilitator family  22.5 
 
 		 410 aa  58.5  0.0000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  5.0052999999999995e-22 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2435  putative ABC transporter, permease protein  25.81 
 
 		 414 aa  58.9  0.0000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.70932  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7163  major facilitator superfamily MFS_1  27.41 
 
 		 414 aa  58.2  0.0000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.886054  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5814  major facilitator superfamily MFS_1  23.53 
 
 		 423 aa  58.2  0.0000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.915234  hitchhiker  0.00491963 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2643  major facilitator transporter  25.85 
 
 		 399 aa  58.2  0.0000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.238963  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0490  major facilitator superfamily MFS_1  27.95 
 
 		 461 aa  58.5  0.0000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11210  major facilitator superfamily MFS_1  23.22 
 
 		 433 aa  58.5  0.0000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2627  major facilitator transporter  23.79 
 
 		 410 aa  57.8  0.0000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1532  major facilitator transporter  22.6 
 
 		 423 aa  57.4  0.0000005  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.68199  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4177  major facilitator superfamily MFS_1  25.62 
 
 		 476 aa  57.4  0.0000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.192321  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2122  major facilitator transporter  22.18 
 
 		 424 aa  57.4  0.0000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.74746  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0768  major facilitator superfamily MFS_1  26.44 
 
 		 456 aa  57.4  0.0000005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2511  ABC transporter, permease protein, putative  25.81 
 
 		 414 aa  57.4  0.0000006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00150223  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2847  major facilitator superfamily MFS_1  26.92 
 
 		 432 aa  57  0.0000007  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0792  major facilitator transporter  27.81 
 
 		 450 aa  57  0.0000007  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2468  permease  31.54 
 
 		 412 aa  56.6  0.0000008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.000564968  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9059  hypothetical protein  25.68 
 
 		 431 aa  56.6  0.0000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2649  permease  31.54 
 
 		 412 aa  56.6  0.0000008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.765576  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1971  thymidylate kinase  26.98 
 
 		 688 aa  56.6  0.0000008  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.270362  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9221  dTMP kinase  28.03 
 
 		 688 aa  56.6  0.0000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.625222  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3952  major facilitator transporter  26.58 
 
 		 413 aa  56.6  0.0000009  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2393  permease; macrolide-efflux protein  29.08 
 
 		 412 aa  56.2  0.000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.366369  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1607  major facilitator transporter  21.69 
 
 		 422 aa  56.2  0.000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0422221  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2286  major facilitator transporter  24.19 
 
 		 414 aa  56.2  0.000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0407537  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4147  H+ antiporter protein  26.82 
 
 		 424 aa  56.6  0.000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4301  H+ antiporter protein  26.82 
 
 		 424 aa  56.6  0.000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.100469  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2678  MFS family major facilitator transporter  30.5 
 
 		 410 aa  56.2  0.000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2654  macrolide efflux protein, putative  23.66 
 
 		 414 aa  55.1  0.000002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2305  ABC transporter permease  25.27 
 
 		 417 aa  55.5  0.000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0193471  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2273  permease; macrolide-efflux protein  24.76 
 
 		 417 aa  55.5  0.000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00046211  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2432  permease  30.87 
 
 		 412 aa  55.8  0.000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0771594  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2667  putative permease  30.87 
 
 		 412 aa  55.8  0.000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000524828 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2227  permease; macrolide-efflux protein  24.75 
 
 		 417 aa  55.5  0.000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0120958  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2480  ABC transporter permease  25.27 
 
 		 415 aa  55.5  0.000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0926781  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8887  hypothetical protein  26.32 
 
 		 413 aa  55.5  0.000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.889317 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2501  putative ABC transporter, permease protein  24.76 
 
 		 415 aa  55.8  0.000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0395  permease  20.12 
 
 		 430 aa  55.8  0.000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0177527  normal  0.113221 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0310  major facilitator transporter  34.09 
 
 		 443 aa  55.8  0.000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3450  major facilitator superfamily MFS_1  25.41 
 
 		 499 aa  55.1  0.000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00033474 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0087  major facilitator transporter  22.6 
 
 		 436 aa  55.5  0.000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0548  major facilitator superfamily MFS_1  26.46 
 
 		 419 aa  55.8  0.000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.010876  decreased coverage  0.00150074 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0516  major facilitator superfamily MFS_1  24.2 
 
 		 420 aa  55.5  0.000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>