More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmet_6144 on replicon NC_007971
Organism: Cupriavidus metallidurans CH34



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007971  Rmet_6144  MFS family nickel efflux transporter protein NreB  100 
 
 		 408 aa  804    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2492  major facilitator transporter  65.37 
 
 		 438 aa  499  1e-140  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0783563  normal  0.106757 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5611  major facilitator transporter  65.26 
 
 		 440 aa  487  1e-136  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.358621 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2242  major facilitator superfamily MFS_1  63.88 
 
 		 444 aa  475  1e-133  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.370083  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1147  major facilitator superfamily MFS_1  62.13 
 
 		 436 aa  470  1.0000000000000001e-131  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.114141  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5159  major facilitator transporter  64.94 
 
 		 434 aa  465  9.999999999999999e-131  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_31240  putative nrbE-like protein  62.28 
 
 		 436 aa  457  1e-127  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000000000011963  unclonable  4.15969e-22 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0336  major facilitator transporter  59.76 
 
 		 441 aa  452  1.0000000000000001e-126  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1768  major facilitator transporter  61.61 
 
 		 440 aa  448  1.0000000000000001e-124  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.071428 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1582  MFS Ni2+ efflux pump NreB  61.04 
 
 		 440 aa  444  1e-123  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5140  major facilitator superfamily MFS_1  63.88 
 
 		 439 aa  441  9.999999999999999e-123  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0730511  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4728  major facilitator superfamily MFS_1  61.19 
 
 		 444 aa  426  1e-118  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.632201 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3139  major facilitator superfamily MFS_1  53.56 
 
 		 453 aa  401  1e-111  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1884  major facilitator superfamily MFS_1  63.64 
 
 		 444 aa  400  9.999999999999999e-111  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.672709 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4285  major facilitator superfamily MFS_1  57.46 
 
 		 444 aa  377  1e-103  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.181984  n/a   
 
 
-
 
NC_008539  Arth_4264  major facilitator transporter  54.66 
 
 		 420 aa  368  1e-101  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0538931  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3828  major facilitator transporter  54.72 
 
 		 421 aa  349  4e-95  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3358  major facilitator superfamily MFS_1  51.53 
 
 		 456 aa  335  7e-91  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2968  major facilitator transporter  48.26 
 
 		 442 aa  332  7.000000000000001e-90  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.433406  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0895  major facilitator superfamily MFS_1  55.07 
 
 		 457 aa  331  2e-89  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.29064 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3189  major facilitator transporter  49.75 
 
 		 442 aa  327  2.0000000000000001e-88  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00704959 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3044  major facilitator transporter  47.38 
 
 		 464 aa  304  2.0000000000000002e-81  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.264008 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3464  hypothetical protein  40.2 
 
 		 394 aa  244  3e-63  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.269124  normal  0.0966327 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1713  major facilitator superfamily MFS_1  48.07 
 
 		 432 aa  206  4e-52  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.300423  normal  0.77847 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2363  putative NreB protein  46.37 
 
 		 307 aa  198  2.0000000000000003e-49  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.602638  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0479  major facilitator superfamily MFS_1  32.71 
 
 		 427 aa  169  1e-40  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.742618 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0698  major facilitator superfamily MFS_1  30.2 
 
 		 397 aa  87  5e-16  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1942  multidrug resistance protein; putative tetracycline resistance determinant  24.19 
 
 		 406 aa  83.2  0.000000000000007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.0213e-35 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1748  multidrug resistance protein; tetracycline resistance determinant  27.59 
 
 		 406 aa  81.6  0.00000000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000069396  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1559  major facilitator transporter  21.43 
 
 		 412 aa  80.1  0.00000000000007  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.00000341731  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3061  major facilitator superfamily MFS_1  28.47 
 
 		 429 aa  79  0.0000000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  decreased coverage  0.00310805  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1539  major facilitator transporter  21.07 
 
 		 412 aa  79  0.0000000000002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  unclonable  0.000000151531  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3037  major facilitator superfamily MFS_1  25.6 
 
 		 421 aa  78.6  0.0000000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0968  major facilitator superfamily MFS_1  26.4 
 
 		 432 aa  77.4  0.0000000000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.896564  normal  0.510346 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5813  major facilitator superfamily MFS_1  24.94 
 
 		 446 aa  75.5  0.000000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.243583  normal  0.354769 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2302  major facilitator superfamily MFS_1  28.36 
 
 		 390 aa  75.9  0.000000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.0000026904  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33950  arabinose efflux permease family protein  30.06 
 
 		 414 aa  75.9  0.000000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.466548  normal  0.73086 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2582  permease, putative  28.21 
 
 		 408 aa  74.7  0.000000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0303  major facilitator superfamily MFS_1  26.44 
 
 		 426 aa  75.5  0.000000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0634781  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2631  putative permease  25.9 
 
 		 408 aa  75.5  0.000000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0615976  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0875  major facilitator superfamily MFS_1  29.59 
 
 		 441 aa  73.9  0.000000000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  hitchhiker  0.00780765  normal  0.0882707 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0732  major facilitator superfamily MFS_1  28.85 
 
 		 412 aa  72.8  0.00000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.000169813  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2046  hypothetical protein  30.19 
 
 		 448 aa  72.4  0.00000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.258697 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1971  thymidylate kinase  28.3 
 
 		 688 aa  72.8  0.00000000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.270362  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1515  major facilitator superfamily MFS_1  26.8 
 
 		 416 aa  71.6  0.00000000002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000845442 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2848  major facilitator superfamily MFS_1  28.99 
 
 		 426 aa  71.6  0.00000000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2024  major facilitator superfamily MFS_1  24.36 
 
 		 419 aa  71.6  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2402  permease  27.38 
 
 		 408 aa  71.2  0.00000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0859078  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2577  permease  27.38 
 
 		 408 aa  71.2  0.00000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.659755  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2589  putative permease  26.69 
 
 		 408 aa  71.6  0.00000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.59543e-18 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3952  major facilitator transporter  26.29 
 
 		 413 aa  70.9  0.00000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2318  macrolide-efflux protein  26.23 
 
 		 408 aa  70.5  0.00000000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.31097  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2380  major facilitator transporter  27.84 
 
 		 474 aa  70.5  0.00000000006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0389897  normal  0.03889 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2206  major facilitator transporter  29.47 
 
 		 447 aa  70.1  0.00000000006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1991  major facilitator superfamily MFS_1  26.04 
 
 		 450 aa  70.1  0.00000000008  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.762129  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3926  major facilitator transporter  24.63 
 
 		 457 aa  69.7  0.00000000009  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0066  macrolide-efflux protein  29 
 
 		 441 aa  69.7  0.0000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.00000000000436229  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3626  major facilitator transporter  27.59 
 
 		 413 aa  69.3  0.0000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.348332  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0491  major facilitator superfamily MFS_1  25.93 
 
 		 424 aa  68.6  0.0000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0752  transporter, putative  25.81 
 
 		 446 aa  67.8  0.0000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2847  major facilitator superfamily MFS_1  27.22 
 
 		 432 aa  68.2  0.0000000003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0293  major facilitator superfamily MFS_1  28.57 
 
 		 710 aa  67.8  0.0000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.189593  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3588  major facilitator superfamily MFS_1  24.34 
 
 		 428 aa  67.4  0.0000000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.273478 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5814  major facilitator superfamily MFS_1  25.38 
 
 		 423 aa  67.4  0.0000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.915234  hitchhiker  0.00491963 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1974  hypothetical protein  22.39 
 
 		 424 aa  67  0.0000000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.00936884  normal  0.989231 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2208  Non-ribosomal peptide synthetase modules and related protein-like protein  27.14 
 
 		 1829 aa  66.6  0.0000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.190766  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30800  arabinose efflux permease family protein  23.57 
 
 		 452 aa  66.6  0.0000000008  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2355  macrolide-efflux protein  26.07 
 
 		 408 aa  66.6  0.0000000008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000199839  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2286  major facilitator transporter  25.48 
 
 		 414 aa  65.9  0.000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0407537  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2654  macrolide efflux protein, putative  26.63 
 
 		 414 aa  65.1  0.000000002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1753  major facilitator superfamily MFS_1  23.15 
 
 		 393 aa  64.7  0.000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19250  major facilitator superfamily MFS_1  26.37 
 
 		 444 aa  65.1  0.000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00108172  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1000  hypothetical protein  25.51 
 
 		 418 aa  65.5  0.000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00447157 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0490  major facilitator superfamily MFS_1  29.03 
 
 		 461 aa  65.1  0.000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2384  major facilitator transporter  23.23 
 
 		 441 aa  65.1  0.000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.930234  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2435  putative ABC transporter, permease protein  27.18 
 
 		 414 aa  64.7  0.000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.70932  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11210  major facilitator superfamily MFS_1  23.66 
 
 		 433 aa  64.7  0.000000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4706  major facilitator superfamily MFS_1  28.7 
 
 		 445 aa  64.7  0.000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.93667 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2814  major facilitator superfamily MFS_1  22.97 
 
 		 402 aa  64.3  0.000000004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0768  major facilitator superfamily MFS_1  25.95 
 
 		 456 aa  63.9  0.000000004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0331  major facilitator transporter  29.55 
 
 		 412 aa  64.3  0.000000004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3976  major facilitator transporter  25 
 
 		 407 aa  64.3  0.000000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1016  major facilitator transporter  30.57 
 
 		 393 aa  63.9  0.000000005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.807332  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9221  dTMP kinase  31.69 
 
 		 688 aa  63.9  0.000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.625222  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2707  macrolide efflux protein  20.27 
 
 		 406 aa  63.5  0.000000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0968867  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0871  macrolide efflux protein, putative  25.6 
 
 		 394 aa  63.2  0.000000009  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6215  major facilitator superfamily MFS_1  30.16 
 
 		 404 aa  63.2  0.000000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0532982  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0792  major facilitator transporter  26.59 
 
 		 450 aa  63.2  0.000000009  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3467  thymidylate kinase  32.62 
 
 		 686 aa  62.4  0.00000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2511  ABC transporter, permease protein, putative  26.4 
 
 		 414 aa  62.4  0.00000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00150223  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2305  ABC transporter permease  26.42 
 
 		 417 aa  62.4  0.00000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0193471  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0098  major facilitator superfamily MFS_1  26.98 
 
 		 428 aa  62.4  0.00000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1904  amino acid adenylation domain-containing protein  24.06 
 
 		 1833 aa  62.4  0.00000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.844763  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0872  H+ Antiporter protein  22.79 
 
 		 405 aa  61.6  0.00000002  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0990  major facilitator transporter  29.18 
 
 		 414 aa  62  0.00000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  hitchhiker  0.00457828  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2480  ABC transporter permease  26.29 
 
 		 415 aa  62.4  0.00000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0926781  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2988  permease  19.93 
 
 		 406 aa  61.6  0.00000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2925  major facilitator transporter  25.6 
 
 		 425 aa  61.6  0.00000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1049  major facilitator superfamily MFS_1  28.28 
 
 		 421 aa  61.6  0.00000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2122  major facilitator transporter  28.68 
 
 		 424 aa  61.6  0.00000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.74746  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>