More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_4491 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_4491  major facilitator superfamily MFS_1  100 
 
 		 423 aa  814    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.783622  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_27630  arabinose efflux permease family protein  41.21 
 
 		 417 aa  260  4e-68  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7785  major facilitator superfamily MFS_1  38.55 
 
 		 420 aa  221  1.9999999999999999e-56  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.157303 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6664  major facilitator transporter  39.78 
 
 		 414 aa  217  2.9999999999999998e-55  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.740991 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1193  major facilitator superfamily MFS_1  34.23 
 
 		 412 aa  209  5e-53  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2303  major facilitator transporter  34.47 
 
 		 435 aa  209  9e-53  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.533597  normal  0.893433 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2540  major facilitator superfamily MFS_1  36.47 
 
 		 430 aa  208  1e-52  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0189  major facilitator superfamily MFS_1  33.73 
 
 		 426 aa  206  4e-52  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0572831  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8013  major facilitator transporter  38.1 
 
 		 408 aa  205  2e-51  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1438  major facilitator superfamily MFS_1  40.1 
 
 		 416 aa  204  2e-51  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6250  major facilitator superfamily MFS_1  38.33 
 
 		 433 aa  203  4e-51  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.220883  normal  0.159364 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4269  major facilitator transporter  36.78 
 
 		 436 aa  199  5e-50  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.935574 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2968  major facilitator superfamily MFS_1  35.31 
 
 		 441 aa  194  3e-48  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0982222 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6539  major facilitator superfamily MFS_1  32.92 
 
 		 415 aa  182  7e-45  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.6945  normal  0.0125799 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4174  major facilitator superfamily MFS_1  34.29 
 
 		 414 aa  172  9e-42  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.176115  normal  0.788258 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4496  major facilitator superfamily MFS_1  31.07 
 
 		 450 aa  171  3e-41  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0239349  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5406  major facilitator superfamily MFS_1  31.03 
 
 		 444 aa  167  2.9999999999999998e-40  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.283217 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1471  major facilitator transporter  35.54 
 
 		 420 aa  167  2.9999999999999998e-40  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.981301  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0689  major facilitator superfamily MFS_1  32.18 
 
 		 439 aa  167  5e-40  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8802  major facilitator superfamily MFS_1  33.89 
 
 		 405 aa  166  9e-40  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.953446 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1728  major facilitator superfamily MFS_1  32.77 
 
 		 417 aa  164  2.0000000000000002e-39  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7117  major facilitator superfamily MFS_1  31.81 
 
 		 432 aa  164  2.0000000000000002e-39  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4378  major facilitator transporter  33.17 
 
 		 431 aa  164  3e-39  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4101  major facilitator superfamily MFS_1  31.55 
 
 		 432 aa  162  1e-38  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.438153 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4089  major facilitator transporter  33.65 
 
 		 439 aa  161  2e-38  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1041  major facilitator transporter  30.48 
 
 		 428 aa  157  3e-37  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0516  major facilitator superfamily MFS_1  28.77 
 
 		 420 aa  154  4e-36  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3353  major facilitator transporter  24.64 
 
 		 421 aa  145  1e-33  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1568  major facilitator transporter  24.28 
 
 		 405 aa  143  5e-33  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1600  major facilitator transporter  24.28 
 
 		 405 aa  143  5e-33  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3257  tetracycline resistance determinant TetV  24.49 
 
 		 414 aa  142  9.999999999999999e-33  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.160876  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1452  major facilitator family transporter  29.95 
 
 		 415 aa  140  6e-32  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3134  major facilitator superfamily MFS_1  28.39 
 
 		 417 aa  139  7e-32  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0365  major facilitator transporter  31.26 
 
 		 427 aa  139  7.999999999999999e-32  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0592694 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3246  permease, putative  23.72 
 
 		 417 aa  139  1e-31  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0277963  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2600  hypothetical protein  29.95 
 
 		 415 aa  139  1e-31  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1367  major facilitator family transporter  29.95 
 
 		 415 aa  138  2e-31  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2987  permease; tetracycline resistance determinant  23.72 
 
 		 414 aa  137  3.0000000000000003e-31  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.105308  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1861  major facilitator transporter  30.49 
 
 		 413 aa  137  5e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0051281 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1230  putative transporter  30.19 
 
 		 378 aa  132  1.0000000000000001e-29  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0199  putative transporter  30.19 
 
 		 378 aa  132  1.0000000000000001e-29  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0474  putative transporter  30.19 
 
 		 378 aa  132  1.0000000000000001e-29  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5398  major facilitator superfamily MFS_1  28.8 
 
 		 401 aa  127  5e-28  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.154835  normal  0.293524 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6327  major facilitator transporter  28.35 
 
 		 461 aa  123  8e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.400788 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2261  major facilitator superfamily MFS_1  34.11 
 
 		 411 aa  121  1.9999999999999998e-26  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.484467 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4659  MFS family multidrug resistance protein  30.21 
 
 		 408 aa  120  3.9999999999999996e-26  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2902  major facilitator superfamily MFS_1  29.08 
 
 		 406 aa  120  7e-26  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.21173  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4282  major facilitator superfamily MFS_1  31.82 
 
 		 420 aa  117  3.9999999999999997e-25  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.522642 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4170  major facilitator superfamily MFS_1  31.82 
 
 		 420 aa  117  3.9999999999999997e-25  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3952  major facilitator transporter  26.38 
 
 		 413 aa  115  2.0000000000000002e-24  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_01200  Major Facilitator Superfamily transporter  29.59 
 
 		 411 aa  110  5e-23  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.780735  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0258  major facilitator superfamily MFS_1  27.18 
 
 		 451 aa  109  9.000000000000001e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.305305 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4222  major facilitator transporter  28.49 
 
 		 432 aa  108  1e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.399211  hitchhiker  0.00102981 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0684  major facilitator transporter  23.72 
 
 		 412 aa  108  1e-22  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00476606  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1000  hypothetical protein  26.19 
 
 		 418 aa  104  2e-21  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00447157 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_05030  Major Facilitator Superfamily transporter  28.16 
 
 		 414 aa  104  3e-21  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0476  major facilitator transporter  27.99 
 
 		 474 aa  103  5e-21  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2820  major facilitator superfamily MFS_1  27.14 
 
 		 421 aa  103  7e-21  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.549151  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0656  major facilitator transporter  32.03 
 
 		 435 aa  102  9e-21  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0056  major facilitator superfamily MFS_1  26.85 
 
 		 433 aa  102  1e-20  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4165  major facilitator transporter  27.75 
 
 		 416 aa  102  1e-20  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0148559  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0732  major facilitator superfamily MFS_1  25.64 
 
 		 412 aa  102  2e-20  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.000169813  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4370  transporter, major facilitator family  22.9 
 
 		 410 aa  102  2e-20  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  5.0052999999999995e-22 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1272  major facilitator transporter  27.21 
 
 		 418 aa  101  3e-20  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2064  major facilitator transporter  32.08 
 
 		 426 aa  100  4e-20  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.230072 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0091  major facilitator superfamily MFS_1  25.06 
 
 		 442 aa  99  1e-19  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0698  major facilitator superfamily MFS_1  25.18 
 
 		 397 aa  96.3  9e-19  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0701  major facilitator superfamily MFS_1  23.63 
 
 		 423 aa  95.9  1e-18  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0671  major facilitator transporter  26.24 
 
 		 456 aa  94.7  3e-18  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0419  major facilitator transporter  29.2 
 
 		 416 aa  94.7  3e-18  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2392  major facilitator superfamily MFS_1  27.21 
 
 		 415 aa  94.4  4e-18  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.000384037  normal  0.689164 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1093  major facilitator superfamily MFS_1  29.28 
 
 		 408 aa  93.6  5e-18  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.400006 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6800  major facilitator superfamily MFS_1  27.46 
 
 		 437 aa  92.4  1e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7391  major facilitator transporter  31.37 
 
 		 434 aa  91.7  2e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.671193  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0234  major facilitator superfamily MFS_1  27.27 
 
 		 442 aa  92  2e-17  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4916  major facilitator superfamily MFS_1  29.41 
 
 		 423 aa  91.7  3e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00150833  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3871  major facilitator superfamily MFS_1  28.11 
 
 		 433 aa  90.9  4e-17  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0205552  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0176  major facilitator transporter  28.12 
 
 		 426 aa  90.9  4e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.379469  normal  0.234316 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2009  major facilitator transporter  25.77 
 
 		 418 aa  90.9  4e-17  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0610699  normal  0.51216 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1613  major facilitator superfamily MFS_1  22.87 
 
 		 418 aa  90.5  5e-17  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000260989  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2409  major facilitator transporter  28.69 
 
 		 402 aa  90.1  6e-17  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0925995  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3365  major facilitator superfamily protein  29.53 
 
 		 424 aa  90.1  7e-17  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1603  major facilitator superfamily MFS_1  26.98 
 
 		 432 aa  89.7  8e-17  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0347546  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3626  major facilitator transporter  24.17 
 
 		 413 aa  89.7  8e-17  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.348332  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3278  major facilitator transporter  28.31 
 
 		 415 aa  89.7  8e-17  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.471566  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1445  major facilitator transporter  22.07 
 
 		 390 aa  88.6  2e-16  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00616907  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1491  major facilitator transporter  22.07 
 
 		 390 aa  88.6  2e-16  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.326017  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2326  major facilitator superfamily MFS_1  21.82 
 
 		 410 aa  87.8  3e-16  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2854  hypothetical protein  29.36 
 
 		 452 aa  87.8  3e-16  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4461  H+ antiporter protein  27.25 
 
 		 414 aa  87.8  3e-16  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2631  putative permease  21.93 
 
 		 408 aa  87.4  4e-16  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0615976  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0417  major facilitator transporter  27.62 
 
 		 420 aa  87.8  4e-16  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00934872 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4215  major facilitator superfamily MFS_1  29.81 
 
 		 467 aa  86.7  7e-16  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.251159  normal  0.128113 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8887  hypothetical protein  27.07 
 
 		 413 aa  86.3  9e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.889317 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2582  permease, putative  21.41 
 
 		 408 aa  85.9  0.000000000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2477  major facilitator transporter  25.5 
 
 		 415 aa  85.1  0.000000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0062  major facilitator superfamily MFS_1  24.11 
 
 		 440 aa  85.5  0.000000000000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.175422  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2355  macrolide-efflux protein  22.83 
 
 		 408 aa  85.5  0.000000000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000199839  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1864  putative transporter  24.57 
 
 		 420 aa  85.1  0.000000000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.42079e-47 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3037  major facilitator superfamily MFS_1  22.97 
 
 		 421 aa  84.3  0.000000000000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>