More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Namu_4215 on replicon NC_013235
Organism: Nakamurella multipartita DSM 44233



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013235  Namu_4215  major facilitator superfamily MFS_1  100 
 
 		 467 aa  872    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.251159  normal  0.128113 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0419  major facilitator transporter  44.23 
 
 		 416 aa  256  9e-67  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2064  major facilitator transporter  41.82 
 
 		 426 aa  192  1e-47  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.230072 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0656  major facilitator transporter  39.21 
 
 		 435 aa  190  4e-47  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2409  major facilitator transporter  37.84 
 
 		 402 aa  188  2e-46  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0925995  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2261  major facilitator superfamily MFS_1  39.24 
 
 		 411 aa  186  8e-46  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.484467 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4222  major facilitator transporter  33.84 
 
 		 432 aa  184  2.0000000000000003e-45  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.399211  hitchhiker  0.00102981 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_01200  Major Facilitator Superfamily transporter  37.31 
 
 		 411 aa  183  6e-45  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.780735  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7428  antibiotic efflux protein  38.56 
 
 		 406 aa  180  4.999999999999999e-44  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0620213 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2820  major facilitator superfamily MFS_1  33.71 
 
 		 421 aa  170  6e-41  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.549151  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7391  major facilitator transporter  40.37 
 
 		 434 aa  169  1e-40  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.671193  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_05030  Major Facilitator Superfamily transporter  32.58 
 
 		 414 aa  166  1.0000000000000001e-39  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8782  major facilitator superfamily MFS_1  33.94 
 
 		 429 aa  163  6e-39  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.753165 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2962  major facilitator superfamily MFS_1  34.39 
 
 		 461 aa  152  2e-35  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.470581  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1603  major facilitator superfamily MFS_1  32.27 
 
 		 432 aa  147  3e-34  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0347546  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0671  major facilitator transporter  30.94 
 
 		 456 aa  147  3e-34  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3278  major facilitator transporter  30.38 
 
 		 415 aa  147  4.0000000000000006e-34  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.471566  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0719  hypothetical protein  34.29 
 
 		 418 aa  144  2e-33  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.384757  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1671  putative transporter  34.39 
 
 		 418 aa  144  4e-33  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1705  putative transporter  34.39 
 
 		 418 aa  144  4e-33  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.167293  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1912  putative transporter  34.39 
 
 		 417 aa  144  4e-33  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0586  putative transporter  34.39 
 
 		 417 aa  144  4e-33  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2325  major facilitator superfamily permease  34.39 
 
 		 397 aa  143  6e-33  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0197346  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2244  major facilitator transporter  34.2 
 
 		 397 aa  143  7e-33  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0417  major facilitator transporter  31.29 
 
 		 420 aa  141  1.9999999999999998e-32  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00934872 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1093  major facilitator superfamily MFS_1  31.78 
 
 		 408 aa  140  3.9999999999999997e-32  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.400006 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0236  major facilitator transporter  37.57 
 
 		 402 aa  139  1e-31  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00072705 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0234  major facilitator superfamily MFS_1  32.11 
 
 		 442 aa  138  2e-31  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3773  major facilitator superfamily MFS_1  34.54 
 
 		 420 aa  138  2e-31  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.159588  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4165  major facilitator transporter  32.32 
 
 		 416 aa  135  1.9999999999999998e-30  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0148559  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2429  major facilitator superfamily MFS_1  35.47 
 
 		 418 aa  132  2.0000000000000002e-29  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.945021  normal  0.699098 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_27630  arabinose efflux permease family protein  31.54 
 
 		 417 aa  127  3e-28  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6746  hypothetical protein  34.33 
 
 		 427 aa  126  9e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.869375  normal  0.283343 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0258  major facilitator superfamily MFS_1  29.64 
 
 		 451 aa  125  1e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.305305 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0208  hypothetical protein  36.56 
 
 		 289 aa  125  2e-27  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2101  major facilitator superfamily MFS_1  28.78 
 
 		 447 aa  124  4e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0347  major facilitator transporter  29.82 
 
 		 425 aa  124  5e-27  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2910  major facilitator superfamily MFS_1  29.43 
 
 		 439 aa  123  6e-27  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.346093  normal  0.416861 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0074  major facilitator superfamily MFS_1  27.85 
 
 		 410 aa  120  3.9999999999999996e-26  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.147937  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5351  major facilitator superfamily MFS_1  29.8 
 
 		 401 aa  117  3.9999999999999997e-25  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.804378  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1221  major facilitator transporter  29.38 
 
 		 451 aa  113  7.000000000000001e-24  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0719879 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7785  major facilitator superfamily MFS_1  29.49 
 
 		 420 aa  108  2e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.157303 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1968  major facilitator superfamily MFS_1  33.5 
 
 		 405 aa  104  3e-21  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00000336752  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0516  major facilitator superfamily MFS_1  28.88 
 
 		 420 aa  102  1e-20  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4282  major facilitator superfamily MFS_1  30.77 
 
 		 420 aa  101  2e-20  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.522642 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4170  major facilitator superfamily MFS_1  30.77 
 
 		 420 aa  101  2e-20  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3134  major facilitator superfamily MFS_1  29.83 
 
 		 417 aa  99.8  9e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1420  major facilitator superfamily MFS_1  27.18 
 
 		 420 aa  99.8  1e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3031  major facilitator transporter  27.58 
 
 		 420 aa  99  1e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0036629 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2972  major facilitator transporter  28.28 
 
 		 415 aa  97.8  4e-19  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4491  major facilitator superfamily MFS_1  28.86 
 
 		 423 aa  95.9  1e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.783622  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2968  major facilitator superfamily MFS_1  28.64 
 
 		 441 aa  95.5  2e-18  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0982222 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5216  major facilitator transporter  26.77 
 
 		 416 aa  94.4  4e-18  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3573  major facilitator transporter  27.27 
 
 		 416 aa  94.4  4e-18  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4659  MFS family multidrug resistance protein  29.46 
 
 		 408 aa  94.4  4e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1438  major facilitator superfamily MFS_1  30.89 
 
 		 416 aa  94.4  4e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0189  major facilitator superfamily MFS_1  26.98 
 
 		 426 aa  91.7  2e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0572831  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3299  major facilitator transporter  26.01 
 
 		 416 aa  92  2e-17  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.174226  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5069  major facilitator transporter  26.01 
 
 		 416 aa  92  2e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1600  major facilitator transporter  21.59 
 
 		 405 aa  90.9  5e-17  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1568  major facilitator transporter  21.59 
 
 		 405 aa  90.9  5e-17  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4378  major facilitator transporter  28.78 
 
 		 431 aa  90.5  6e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2902  major facilitator superfamily MFS_1  28.5 
 
 		 406 aa  89.4  1e-16  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.21173  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6250  major facilitator superfamily MFS_1  26.07 
 
 		 433 aa  88.6  2e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.220883  normal  0.159364 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8013  major facilitator transporter  30.93 
 
 		 408 aa  88.6  2e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6664  major facilitator transporter  29.1 
 
 		 414 aa  88.6  2e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.740991 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6539  major facilitator superfamily MFS_1  30.22 
 
 		 415 aa  87.4  5e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.6945  normal  0.0125799 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4174  major facilitator superfamily MFS_1  32.05 
 
 		 414 aa  87  6e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.176115  normal  0.788258 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0684  major facilitator transporter  23.96 
 
 		 412 aa  86.7  7e-16  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00476606  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4101  major facilitator superfamily MFS_1  28.91 
 
 		 432 aa  85.5  0.000000000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.438153 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4481  major facilitator transporter  26.75 
 
 		 416 aa  85.1  0.000000000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.646656  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1471  major facilitator transporter  29.35 
 
 		 420 aa  85.5  0.000000000000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.981301  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2384  protein of unknown function DUF894 DitE  28.61 
 
 		 549 aa  84.7  0.000000000000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.123744  normal  0.932575 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5406  major facilitator superfamily MFS_1  28.33 
 
 		 444 aa  84.7  0.000000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.283217 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1193  major facilitator superfamily MFS_1  26.65 
 
 		 412 aa  84.3  0.000000000000004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5006  major facilitator transporter  26.5 
 
 		 416 aa  83.2  0.000000000000009  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.641572  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2326  major facilitator superfamily MFS_1  24.53 
 
 		 410 aa  81.3  0.00000000000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4269  major facilitator transporter  28.63 
 
 		 436 aa  81.6  0.00000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.935574 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0743  major facilitator transporter  28.39 
 
 		 410 aa  81.3  0.00000000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6327  major facilitator transporter  31.65 
 
 		 461 aa  81.6  0.00000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.400788 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0365  major facilitator transporter  29.34 
 
 		 427 aa  81.3  0.00000000000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0592694 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0591  hypothetical protein  26.72 
 
 		 416 aa  79.7  0.0000000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8802  major facilitator superfamily MFS_1  30.86 
 
 		 405 aa  79.7  0.0000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.953446 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2303  major facilitator transporter  28.72 
 
 		 435 aa  78.6  0.0000000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.533597  normal  0.893433 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0476  major facilitator transporter  27.45 
 
 		 474 aa  79  0.0000000000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3970  protein of unknown function DUF894 DitE  27.95 
 
 		 535 aa  79  0.0000000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5163  protein of unknown function DUF894, DitE  26.76 
 
 		 530 aa  78.6  0.0000000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0799644 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3776  major facilitator superfamily MFS_1  28.61 
 
 		 412 aa  77.4  0.0000000000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0372  major facilitator superfamily MFS_1  25.24 
 
 		 416 aa  77  0.0000000000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.862207  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0056  major facilitator superfamily MFS_1  26.6 
 
 		 433 aa  77  0.0000000000007  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_49890  membrame protein  28.89 
 
 		 454 aa  76.6  0.000000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_2010  transporter, putative  26.06 
 
 		 429 aa  76.3  0.000000000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7117  major facilitator superfamily MFS_1  27.68 
 
 		 432 aa  75.9  0.000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3284  major facilitator transporter  22.67 
 
 		 403 aa  75.9  0.000000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4026  major facilitator superfamily MFS_1  24.18 
 
 		 416 aa  75.1  0.000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.557727  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2631  putative permease  22.55 
 
 		 408 aa  74.7  0.000000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0615976  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3145  major facilitator superfamily MFS_1  27.16 
 
 		 440 aa  73.9  0.000000000005  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.985088  normal  0.131643 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1728  major facilitator superfamily MFS_1  28.43 
 
 		 417 aa  73.6  0.000000000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0689  major facilitator superfamily MFS_1  28.99 
 
 		 439 aa  73.6  0.000000000008  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2540  major facilitator superfamily MFS_1  28.75 
 
 		 430 aa  73.2  0.000000000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>