More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_4916 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_4916  major facilitator superfamily MFS_1  100 
 
 		 423 aa  785    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00150833  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6539  major facilitator superfamily MFS_1  37.13 
 
 		 415 aa  175  9.999999999999999e-43  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.6945  normal  0.0125799 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_27630  arabinose efflux permease family protein  34.39 
 
 		 417 aa  153  5e-36  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6250  major facilitator superfamily MFS_1  32.68 
 
 		 433 aa  149  6e-35  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.220883  normal  0.159364 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7785  major facilitator superfamily MFS_1  33.33 
 
 		 420 aa  140  4.999999999999999e-32  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.157303 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4269  major facilitator transporter  33.25 
 
 		 436 aa  137  3.0000000000000003e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.935574 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4491  major facilitator superfamily MFS_1  30.79 
 
 		 423 aa  132  2.0000000000000002e-29  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.783622  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1193  major facilitator superfamily MFS_1  31.2 
 
 		 412 aa  129  9.000000000000001e-29  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6327  major facilitator transporter  33.67 
 
 		 461 aa  129  1.0000000000000001e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.400788 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0189  major facilitator superfamily MFS_1  30.26 
 
 		 426 aa  128  2.0000000000000002e-28  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0572831  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2968  major facilitator superfamily MFS_1  32.43 
 
 		 441 aa  128  2.0000000000000002e-28  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0982222 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5406  major facilitator superfamily MFS_1  31.44 
 
 		 444 aa  128  2.0000000000000002e-28  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.283217 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8802  major facilitator superfamily MFS_1  31.18 
 
 		 405 aa  128  2.0000000000000002e-28  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.953446 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3134  major facilitator superfamily MFS_1  31.83 
 
 		 417 aa  128  2.0000000000000002e-28  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2303  major facilitator transporter  34.01 
 
 		 435 aa  126  6e-28  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.533597  normal  0.893433 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2540  major facilitator superfamily MFS_1  33.41 
 
 		 430 aa  124  4e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0689  major facilitator superfamily MFS_1  32.2 
 
 		 439 aa  124  4e-27  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6664  major facilitator transporter  33.25 
 
 		 414 aa  123  6e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.740991 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7117  major facilitator superfamily MFS_1  32.84 
 
 		 432 aa  119  9.999999999999999e-26  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4378  major facilitator transporter  30.63 
 
 		 431 aa  118  1.9999999999999998e-25  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4101  major facilitator superfamily MFS_1  29.02 
 
 		 432 aa  118  1.9999999999999998e-25  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.438153 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3246  permease, putative  24.93 
 
 		 417 aa  117  3e-25  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0277963  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2987  permease; tetracycline resistance determinant  25.27 
 
 		 414 aa  116  6e-25  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.105308  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3257  tetracycline resistance determinant TetV  24.93 
 
 		 414 aa  115  1.0000000000000001e-24  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.160876  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4089  major facilitator transporter  32.53 
 
 		 439 aa  112  1.0000000000000001e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8013  major facilitator transporter  29.95 
 
 		 408 aa  110  4.0000000000000004e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1861  major facilitator transporter  30.4 
 
 		 413 aa  107  3e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0051281 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1452  major facilitator family transporter  30.71 
 
 		 415 aa  106  7e-22  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2600  hypothetical protein  31.58 
 
 		 415 aa  104  3e-21  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1367  major facilitator family transporter  31.58 
 
 		 415 aa  103  7e-21  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1438  major facilitator superfamily MFS_1  32.36 
 
 		 416 aa  100  4e-20  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2902  major facilitator superfamily MFS_1  31.62 
 
 		 406 aa  100  5e-20  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.21173  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1230  putative transporter  32.06 
 
 		 378 aa  100  6e-20  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0199  putative transporter  32.06 
 
 		 378 aa  100  6e-20  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0474  putative transporter  32.06 
 
 		 378 aa  100  6e-20  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4496  major facilitator superfamily MFS_1  29.1 
 
 		 450 aa  99.4  1e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0239349  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1728  major facilitator superfamily MFS_1  30.6 
 
 		 417 aa  99  2e-19  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1000  hypothetical protein  28.57 
 
 		 418 aa  97.8  3e-19  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00447157 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0516  major facilitator superfamily MFS_1  28.54 
 
 		 420 aa  95.9  1e-18  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4282  major facilitator superfamily MFS_1  30.22 
 
 		 420 aa  95.5  1e-18  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.522642 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4170  major facilitator superfamily MFS_1  30.22 
 
 		 420 aa  95.5  1e-18  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4659  MFS family multidrug resistance protein  30.42 
 
 		 408 aa  95.5  2e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2962  major facilitator superfamily MFS_1  33.78 
 
 		 461 aa  95.1  2e-18  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.470581  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4222  major facilitator transporter  28.52 
 
 		 432 aa  95.5  2e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.399211  hitchhiker  0.00102981 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3353  major facilitator transporter  23.06 
 
 		 421 aa  94.4  3e-18  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1471  major facilitator transporter  31.73 
 
 		 420 aa  93.2  7e-18  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.981301  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1491  major facilitator transporter  24.86 
 
 		 390 aa  90.9  4e-17  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.326017  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1445  major facilitator transporter  24.86 
 
 		 390 aa  90.9  4e-17  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00616907  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0258  major facilitator superfamily MFS_1  30.89 
 
 		 451 aa  90.5  5e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.305305 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1600  major facilitator transporter  22.7 
 
 		 405 aa  89.7  8e-17  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1568  major facilitator transporter  22.7 
 
 		 405 aa  89.7  8e-17  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8782  major facilitator superfamily MFS_1  32.65 
 
 		 429 aa  89.7  9e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.753165 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2318  macrolide-efflux protein  24.76 
 
 		 408 aa  89.7  1e-16  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.31097  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0419  major facilitator transporter  29.32 
 
 		 416 aa  88.2  2e-16  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0395  permease  25.07 
 
 		 430 aa  88.6  2e-16  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0177527  normal  0.113221 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3179  major facilitator transporter  29.28 
 
 		 445 aa  87.8  3e-16  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.110331 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2582  permease, putative  24.15 
 
 		 408 aa  86.7  8e-16  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1041  major facilitator transporter  28.13 
 
 		 428 aa  86.7  8e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2355  macrolide-efflux protein  24.63 
 
 		 408 aa  85.5  0.000000000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000199839  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2631  putative permease  24.14 
 
 		 408 aa  84.7  0.000000000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0615976  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0365  major facilitator transporter  31.85 
 
 		 427 aa  84.7  0.000000000000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0592694 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1364  major facilitator superfamily MFS_1  27.41 
 
 		 441 aa  84.3  0.000000000000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0393169 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0684  major facilitator transporter  27.27 
 
 		 412 aa  84  0.000000000000004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00476606  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2627  major facilitator transporter  26.58 
 
 		 410 aa  83.6  0.000000000000006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4370  transporter, major facilitator family  21.14 
 
 		 410 aa  83.6  0.000000000000007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  5.0052999999999995e-22 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2589  putative permease  24.88 
 
 		 408 aa  83.2  0.000000000000008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.59543e-18 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2402  permease  24.88 
 
 		 408 aa  82.8  0.00000000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0859078  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2577  permease  24.88 
 
 		 408 aa  82.8  0.00000000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.659755  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0369  major facilitator transporter  23.18 
 
 		 418 aa  82  0.00000000000002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.616869  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0593  major facilitator transporter  24.06 
 
 		 413 aa  82.4  0.00000000000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.00370301  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0578  major facilitator transporter  24.06 
 
 		 413 aa  82.4  0.00000000000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0133344  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6842  Non-ribosomal peptide synthetase modules and related protein-like protein  28.65 
 
 		 1876 aa  81.3  0.00000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.731708  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4215  major facilitator superfamily MFS_1  32.8 
 
 		 467 aa  80.5  0.00000000000006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.251159  normal  0.128113 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2261  major facilitator superfamily MFS_1  31.49 
 
 		 411 aa  80.1  0.00000000000007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.484467 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1747  major facilitator superfamily MFS_1  28.91 
 
 		 463 aa  80.1  0.00000000000007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.192343  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1974  hypothetical protein  24.81 
 
 		 424 aa  79.7  0.00000000000009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.00936884  normal  0.989231 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0752  transporter, putative  26.13 
 
 		 446 aa  79.3  0.0000000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0875  major facilitator superfamily MFS_1  25 
 
 		 441 aa  79.7  0.0000000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  hitchhiker  0.00780765  normal  0.0882707 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3952  major facilitator transporter  27.34 
 
 		 413 aa  79  0.0000000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4174  major facilitator superfamily MFS_1  29.88 
 
 		 414 aa  79.3  0.0000000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.176115  normal  0.788258 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2647  major facilitator transporter  28.93 
 
 		 524 aa  79.3  0.0000000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5212  major facilitator superfamily MFS_1  30.88 
 
 		 408 aa  78.6  0.0000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0948922  normal  1 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0001  major facilitator transporter  29.69 
 
 		 434 aa  79  0.0000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.51078  hitchhiker  0.00413697 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11210  major facilitator superfamily MFS_1  25.68 
 
 		 433 aa  77.4  0.0000000000004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0968  major facilitator superfamily MFS_1  26.06 
 
 		 432 aa  77.4  0.0000000000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.896564  normal  0.510346 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1607  permease  26.67 
 
 		 422 aa  77  0.0000000000006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.137367  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0056  major facilitator superfamily MFS_1  26.49 
 
 		 433 aa  77  0.0000000000006  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1731  permease  26.67 
 
 		 422 aa  77  0.0000000000006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1813  major facilitator superfamily permease  22.47 
 
 		 410 aa  77  0.0000000000006  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2024  major facilitator superfamily MFS_1  23.48 
 
 		 419 aa  77  0.0000000000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2511  ABC transporter, permease protein, putative  25.94 
 
 		 414 aa  76.6  0.0000000000007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00150223  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1864  putative transporter  27.51 
 
 		 420 aa  76.3  0.0000000000009  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.42079e-47 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1559  multidrug resistance protein; tetracycline resistance determinant  27 
 
 		 422 aa  75.9  0.000000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.285528  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1572  major facilitator transporter  28.68 
 
 		 415 aa  75.9  0.000000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.58248  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0417  major facilitator transporter  27.3 
 
 		 420 aa  76.3  0.000000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00934872 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1862  putative permease  26.26 
 
 		 422 aa  75.9  0.000000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2208  Non-ribosomal peptide synthetase modules and related protein-like protein  30.53 
 
 		 1829 aa  75.1  0.000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.190766  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2286  major facilitator transporter  25.9 
 
 		 414 aa  75.1  0.000000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0407537  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1568  multidrug resistance protein; tetracycline resistance determinant  25.99 
 
 		 422 aa  75.5  0.000000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.766892  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2064  major facilitator transporter  29.65 
 
 		 426 aa  75.1  0.000000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.230072 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>