More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcav_2968 on replicon NC_012669
Organism: Beutenbergia cavernae DSM 12333



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012669  Bcav_2968  major facilitator superfamily MFS_1  100 
 
 		 441 aa  840    Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0982222 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0689  major facilitator superfamily MFS_1  54.19 
 
 		 439 aa  359  6e-98  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_27630  arabinose efflux permease family protein  43.74 
 
 		 417 aa  286  4e-76  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6664  major facilitator transporter  46.39 
 
 		 414 aa  285  2.0000000000000002e-75  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.740991 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7785  major facilitator superfamily MFS_1  44.31 
 
 		 420 aa  273  3e-72  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.157303 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1438  major facilitator superfamily MFS_1  47.34 
 
 		 416 aa  266  5.999999999999999e-70  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2540  major facilitator superfamily MFS_1  39.91 
 
 		 430 aa  253  4.0000000000000004e-66  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8013  major facilitator transporter  40.81 
 
 		 408 aa  230  4e-59  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1728  major facilitator superfamily MFS_1  38.7 
 
 		 417 aa  210  4e-53  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4491  major facilitator superfamily MFS_1  35.49 
 
 		 423 aa  198  2.0000000000000003e-49  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.783622  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1471  major facilitator transporter  41.27 
 
 		 420 aa  196  1e-48  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.981301  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4378  major facilitator transporter  35.1 
 
 		 431 aa  195  2e-48  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2303  major facilitator transporter  36.9 
 
 		 435 aa  192  8e-48  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.533597  normal  0.893433 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4089  major facilitator transporter  38.2 
 
 		 439 aa  192  1e-47  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5406  major facilitator superfamily MFS_1  34.73 
 
 		 444 aa  192  1e-47  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.283217 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4174  major facilitator superfamily MFS_1  36.73 
 
 		 414 aa  187  3e-46  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.176115  normal  0.788258 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0189  major facilitator superfamily MFS_1  29.3 
 
 		 426 aa  186  1.0000000000000001e-45  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0572831  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6539  major facilitator superfamily MFS_1  38.69 
 
 		 415 aa  185  1.0000000000000001e-45  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.6945  normal  0.0125799 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7117  major facilitator superfamily MFS_1  34.98 
 
 		 432 aa  181  2.9999999999999997e-44  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1041  major facilitator transporter  36.73 
 
 		 428 aa  174  2.9999999999999996e-42  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4496  major facilitator superfamily MFS_1  33.09 
 
 		 450 aa  172  1e-41  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0239349  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6250  major facilitator superfamily MFS_1  34.47 
 
 		 433 aa  165  1.0000000000000001e-39  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.220883  normal  0.159364 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8802  major facilitator superfamily MFS_1  36.93 
 
 		 405 aa  162  9e-39  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.953446 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4269  major facilitator transporter  35.19 
 
 		 436 aa  162  1e-38  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.935574 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1193  major facilitator superfamily MFS_1  35.39 
 
 		 412 aa  160  4e-38  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2987  permease; tetracycline resistance determinant  25.25 
 
 		 414 aa  156  8e-37  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.105308  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1861  major facilitator transporter  35.1 
 
 		 413 aa  155  1e-36  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0051281 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3257  tetracycline resistance determinant TetV  25.06 
 
 		 414 aa  155  1e-36  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.160876  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3246  permease, putative  25.5 
 
 		 417 aa  154  2.9999999999999998e-36  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0277963  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6327  major facilitator transporter  33.17 
 
 		 461 aa  149  1.0000000000000001e-34  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.400788 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3353  major facilitator transporter  25.54 
 
 		 421 aa  141  1.9999999999999998e-32  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4101  major facilitator superfamily MFS_1  33.17 
 
 		 432 aa  140  6e-32  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.438153 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1600  major facilitator transporter  24.56 
 
 		 405 aa  139  8.999999999999999e-32  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1568  major facilitator transporter  24.56 
 
 		 405 aa  139  8.999999999999999e-32  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4659  MFS family multidrug resistance protein  32.18 
 
 		 408 aa  138  2e-31  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5398  major facilitator superfamily MFS_1  34.58 
 
 		 401 aa  130  5.0000000000000004e-29  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.154835  normal  0.293524 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3134  major facilitator superfamily MFS_1  31.36 
 
 		 417 aa  129  9.000000000000001e-29  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0516  major facilitator superfamily MFS_1  29.35 
 
 		 420 aa  129  1.0000000000000001e-28  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2261  major facilitator superfamily MFS_1  31.56 
 
 		 411 aa  123  5e-27  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.484467 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1452  major facilitator family transporter  29.31 
 
 		 415 aa  119  7.999999999999999e-26  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2600  hypothetical protein  29.08 
 
 		 415 aa  117  3.9999999999999997e-25  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2064  major facilitator transporter  30.1 
 
 		 426 aa  117  6e-25  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.230072 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1367  major facilitator family transporter  29.08 
 
 		 415 aa  116  8.999999999999998e-25  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7391  major facilitator transporter  32.87 
 
 		 434 aa  113  8.000000000000001e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.671193  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0365  major facilitator transporter  28.72 
 
 		 427 aa  112  1.0000000000000001e-23  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0592694 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2409  major facilitator transporter  29.89 
 
 		 402 aa  112  1.0000000000000001e-23  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0925995  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0419  major facilitator transporter  30.71 
 
 		 416 aa  111  3e-23  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1230  putative transporter  28.5 
 
 		 378 aa  110  7.000000000000001e-23  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0199  putative transporter  28.5 
 
 		 378 aa  110  7.000000000000001e-23  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0474  putative transporter  28.5 
 
 		 378 aa  110  7.000000000000001e-23  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4370  transporter, major facilitator family  25.63 
 
 		 410 aa  108  1e-22  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  5.0052999999999995e-22 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0656  major facilitator transporter  31 
 
 		 435 aa  108  2e-22  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8782  major facilitator superfamily MFS_1  28.99 
 
 		 429 aa  108  2e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.753165 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7428  antibiotic efflux protein  28.43 
 
 		 406 aa  107  6e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0620213 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1093  major facilitator superfamily MFS_1  30.06 
 
 		 408 aa  106  7e-22  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.400006 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0258  major facilitator superfamily MFS_1  30.67 
 
 		 451 aa  106  9e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.305305 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4238  major facilitator transporter  28.3 
 
 		 420 aa  104  3e-21  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.375023 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_05030  Major Facilitator Superfamily transporter  28.92 
 
 		 414 aa  101  3e-20  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3871  major facilitator superfamily MFS_1  27.32 
 
 		 433 aa  99.8  9e-20  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0205552  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_01200  Major Facilitator Superfamily transporter  32.1 
 
 		 411 aa  99.4  1e-19  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.780735  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2820  major facilitator superfamily MFS_1  28.03 
 
 		 421 aa  99.4  1e-19  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.549151  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4222  major facilitator transporter  24.62 
 
 		 432 aa  98.2  3e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.399211  hitchhiker  0.00102981 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2072  major facilitator transporter  29.46 
 
 		 417 aa  97.8  3e-19  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.205391  normal  0.200266 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2902  major facilitator superfamily MFS_1  29.09 
 
 		 406 aa  96.7  8e-19  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.21173  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4665  hypothetical protein  29.35 
 
 		 445 aa  95.5  1e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0402536 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0482  major facilitator superfamily MFS_1  27.18 
 
 		 458 aa  94.7  3e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.787835  normal  0.855857 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0719  hypothetical protein  28.39 
 
 		 418 aa  94.7  3e-18  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.384757  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0427  transporter, putative  21.11 
 
 		 412 aa  94.4  3e-18  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1912  putative transporter  28.14 
 
 		 417 aa  94  5e-18  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0586  putative transporter  28.14 
 
 		 417 aa  94  5e-18  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1671  putative transporter  28.14 
 
 		 418 aa  93.6  6e-18  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1705  putative transporter  28.14 
 
 		 418 aa  93.6  6e-18  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.167293  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1364  major facilitator superfamily MFS_1  27.32 
 
 		 441 aa  93.2  7e-18  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0393169 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4916  major facilitator superfamily MFS_1  32.27 
 
 		 423 aa  92  2e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00150833  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4165  major facilitator transporter  27.47 
 
 		 416 aa  92.4  2e-17  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0148559  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4282  major facilitator superfamily MFS_1  29.23 
 
 		 420 aa  90.9  4e-17  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.522642 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4170  major facilitator superfamily MFS_1  29.23 
 
 		 420 aa  90.9  4e-17  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0593  major facilitator transporter  24.16 
 
 		 413 aa  90.1  6e-17  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.00370301  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0671  major facilitator transporter  26.93 
 
 		 456 aa  90.1  6e-17  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0578  major facilitator transporter  24.16 
 
 		 413 aa  90.1  6e-17  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0133344  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2962  major facilitator superfamily MFS_1  26.77 
 
 		 461 aa  90.1  7e-17  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.470581  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0417  major facilitator transporter  27.91 
 
 		 420 aa  89.4  1e-16  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00934872 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0698  major facilitator superfamily MFS_1  25.54 
 
 		 397 aa  88.6  2e-16  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2627  major facilitator transporter  25.69 
 
 		 410 aa  88.6  2e-16  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1662  major facilitator superfamily MFS_1  23.44 
 
 		 405 aa  88.2  3e-16  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2244  major facilitator transporter  28.38 
 
 		 397 aa  87.4  4e-16  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3952  major facilitator transporter  24.59 
 
 		 413 aa  87  5e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3213  major facilitator superfamily MFS_1  29.9 
 
 		 432 aa  86.7  8e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  decreased coverage  0.00199749  hitchhiker  0.0000000669375 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0176  major facilitator transporter  24.5 
 
 		 426 aa  85.9  0.000000000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.379469  normal  0.234316 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1928  major facilitator superfamily MFS_1  24.76 
 
 		 414 aa  85.1  0.000000000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0688885  normal  0.183583 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3278  major facilitator transporter  27.07 
 
 		 415 aa  84.7  0.000000000000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.471566  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2325  major facilitator superfamily permease  27.84 
 
 		 397 aa  84  0.000000000000006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0197346  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1603  major facilitator superfamily MFS_1  29.07 
 
 		 432 aa  83.6  0.000000000000007  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0347546  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0476  major facilitator transporter  27.46 
 
 		 474 aa  83.2  0.000000000000008  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1607  permease  24.67 
 
 		 422 aa  82.8  0.00000000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.137367  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2477  major facilitator transporter  28.66 
 
 		 415 aa  82.4  0.00000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0234  major facilitator superfamily MFS_1  28.26 
 
 		 442 aa  82.8  0.00000000000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1731  permease  24.67 
 
 		 422 aa  82.8  0.00000000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0701  major facilitator superfamily MFS_1  23.3 
 
 		 423 aa  82.8  0.00000000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0875  major facilitator superfamily MFS_1  25.19 
 
 		 441 aa  82.4  0.00000000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  hitchhiker  0.00780765  normal  0.0882707 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>