More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Strop_0671 on replicon NC_009380
Organism: Salinispora tropica CNB-440



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009380  Strop_0671  major facilitator transporter  100 
 
 		 456 aa  893    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0719  hypothetical protein  43.97 
 
 		 418 aa  289  8e-77  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.384757  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0586  putative transporter  42.72 
 
 		 417 aa  288  1e-76  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1912  putative transporter  42.72 
 
 		 417 aa  288  1e-76  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1671  putative transporter  43.72 
 
 		 418 aa  287  2e-76  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1705  putative transporter  43.72 
 
 		 418 aa  287  2e-76  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.167293  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2429  major facilitator superfamily MFS_1  46.54 
 
 		 418 aa  284  2.0000000000000002e-75  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.945021  normal  0.699098 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2244  major facilitator transporter  44.13 
 
 		 397 aa  283  3.0000000000000004e-75  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2325  major facilitator superfamily permease  43.62 
 
 		 397 aa  281  2e-74  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0197346  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6746  hypothetical protein  46.73 
 
 		 427 aa  277  3e-73  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.869375  normal  0.283343 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2064  major facilitator transporter  35.58 
 
 		 426 aa  196  6e-49  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.230072 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0656  major facilitator transporter  37.14 
 
 		 435 aa  193  6e-48  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2261  major facilitator superfamily MFS_1  35.5 
 
 		 411 aa  171  2e-41  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.484467 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7391  major facilitator transporter  33.33 
 
 		 434 aa  162  9e-39  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.671193  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4222  major facilitator transporter  30.03 
 
 		 432 aa  142  9.999999999999999e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.399211  hitchhiker  0.00102981 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2409  major facilitator transporter  32.18 
 
 		 402 aa  134  3e-30  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0925995  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2820  major facilitator superfamily MFS_1  29.97 
 
 		 421 aa  127  3e-28  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.549151  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4215  major facilitator superfamily MFS_1  30.13 
 
 		 467 aa  127  4.0000000000000003e-28  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.251159  normal  0.128113 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_01200  Major Facilitator Superfamily transporter  30.53 
 
 		 411 aa  125  2e-27  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.780735  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0417  major facilitator transporter  29.47 
 
 		 420 aa  122  9.999999999999999e-27  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00934872 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2962  major facilitator superfamily MFS_1  29.95 
 
 		 461 aa  121  3e-26  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.470581  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3773  major facilitator superfamily MFS_1  34.23 
 
 		 420 aa  121  3e-26  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.159588  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4165  major facilitator transporter  27.22 
 
 		 416 aa  116  1.0000000000000001e-24  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0148559  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3278  major facilitator transporter  27.75 
 
 		 415 aa  114  3e-24  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.471566  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8782  major facilitator superfamily MFS_1  28.64 
 
 		 429 aa  112  2.0000000000000002e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.753165 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0258  major facilitator superfamily MFS_1  30.31 
 
 		 451 aa  111  3e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.305305 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0236  major facilitator transporter  32.58 
 
 		 402 aa  110  6e-23  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00072705 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_05030  Major Facilitator Superfamily transporter  27.94 
 
 		 414 aa  108  1e-22  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2910  major facilitator superfamily MFS_1  29.17 
 
 		 439 aa  109  1e-22  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.346093  normal  0.416861 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0234  major facilitator superfamily MFS_1  28.3 
 
 		 442 aa  107  4e-22  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5351  major facilitator superfamily MFS_1  30 
 
 		 401 aa  106  9e-22  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.804378  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0208  hypothetical protein  37 
 
 		 289 aa  105  1e-21  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0419  major facilitator transporter  26.61 
 
 		 416 aa  105  2e-21  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0347  major facilitator transporter  29.65 
 
 		 425 aa  103  9e-21  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1603  major facilitator superfamily MFS_1  28.91 
 
 		 432 aa  102  1e-20  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0347546  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0365  major facilitator transporter  27.84 
 
 		 427 aa  101  3e-20  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0592694 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7428  antibiotic efflux protein  26.48 
 
 		 406 aa  97.8  3e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0620213 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4989  hypothetical protein  27.24 
 
 		 342 aa  97.4  4e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0516  major facilitator superfamily MFS_1  24.11 
 
 		 420 aa  94.7  3e-18  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1093  major facilitator superfamily MFS_1  27.79 
 
 		 408 aa  92  2e-17  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.400006 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6539  major facilitator superfamily MFS_1  31.02 
 
 		 415 aa  90.9  4e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.6945  normal  0.0125799 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0074  major facilitator superfamily MFS_1  25.54 
 
 		 410 aa  90.1  6e-17  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.147937  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4461  H+ antiporter protein  27.18 
 
 		 414 aa  90.1  8e-17  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6664  major facilitator transporter  28.35 
 
 		 414 aa  89  2e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.740991 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2355  macrolide-efflux protein  25.61 
 
 		 408 aa  87.4  4e-16  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000199839  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7785  major facilitator superfamily MFS_1  26.81 
 
 		 420 aa  87.8  4e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.157303 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0091  major facilitator superfamily MFS_1  29.64 
 
 		 442 aa  87  6e-16  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2582  permease, putative  25.61 
 
 		 408 aa  86.7  7e-16  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8013  major facilitator transporter  28.41 
 
 		 408 aa  87  7e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0578  major facilitator transporter  21.07 
 
 		 413 aa  85.9  0.000000000000001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0133344  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2318  macrolide-efflux protein  26.12 
 
 		 408 aa  86.3  0.000000000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.31097  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0593  major facilitator transporter  21.07 
 
 		 413 aa  85.9  0.000000000000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.00370301  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_27630  arabinose efflux permease family protein  28.69 
 
 		 417 aa  85.5  0.000000000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0062  major facilitator superfamily MFS_1  26.52 
 
 		 440 aa  84.7  0.000000000000003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.175422  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2631  putative permease  25.61 
 
 		 408 aa  84.7  0.000000000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0615976  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5406  major facilitator superfamily MFS_1  26.83 
 
 		 444 aa  84.3  0.000000000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.283217 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2540  major facilitator superfamily MFS_1  27.23 
 
 		 430 aa  84.3  0.000000000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4491  major facilitator superfamily MFS_1  26.33 
 
 		 423 aa  84  0.000000000000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.783622  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2402  permease  25.56 
 
 		 408 aa  84  0.000000000000006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0859078  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2577  permease  25.56 
 
 		 408 aa  84  0.000000000000006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.659755  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0056  major facilitator superfamily MFS_1  29.8 
 
 		 433 aa  82.8  0.00000000000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2589  putative permease  25.56 
 
 		 408 aa  83.2  0.00000000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.59543e-18 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1600  major facilitator transporter  21.84 
 
 		 405 aa  82.4  0.00000000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1568  major facilitator transporter  21.84 
 
 		 405 aa  82.4  0.00000000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2902  major facilitator superfamily MFS_1  29.11 
 
 		 406 aa  81.3  0.00000000000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.21173  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6250  major facilitator superfamily MFS_1  28.65 
 
 		 433 aa  80.5  0.00000000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.220883  normal  0.159364 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5208  major facilitator superfamily MFS_1  27.25 
 
 		 432 aa  80.5  0.00000000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.377398  normal  0.900425 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2968  major facilitator superfamily MFS_1  28.86 
 
 		 441 aa  80.5  0.00000000000006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0982222 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1193  major facilitator superfamily MFS_1  27.01 
 
 		 412 aa  80.1  0.00000000000007  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2234  H+ antiporter protein  26.2 
 
 		 412 aa  79  0.0000000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0087  major facilitator transporter  26.27 
 
 		 436 aa  79.3  0.0000000000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4238  major facilitator transporter  27.35 
 
 		 420 aa  78.6  0.0000000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.375023 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1364  major facilitator superfamily MFS_1  25.54 
 
 		 441 aa  79  0.0000000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0393169 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0532  major facilitator superfamily MFS_1  25.21 
 
 		 428 aa  78.2  0.0000000000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0689  major facilitator superfamily MFS_1  25 
 
 		 439 aa  77.4  0.0000000000005  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4138  major facilitator superfamily MFS_1  27.83 
 
 		 435 aa  76.6  0.0000000000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.496821  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1041  major facilitator transporter  26.32 
 
 		 428 aa  75.9  0.000000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1532  major facilitator transporter  22.79 
 
 		 423 aa  76.3  0.000000000001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.68199  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3972  H+ antiporter protein  27.85 
 
 		 418 aa  75.9  0.000000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.14454  normal  0.0420605 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3958  drug antiporter protein  27.85 
 
 		 418 aa  76.3  0.000000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4032  H+ antiporter protein  27.85 
 
 		 418 aa  76.3  0.000000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0189  major facilitator superfamily MFS_1  23.04 
 
 		 426 aa  75.1  0.000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0572831  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3134  major facilitator superfamily MFS_1  30.46 
 
 		 417 aa  74.7  0.000000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1744  major facilitator superfamily MFS_1  28.92 
 
 		 436 aa  73.9  0.000000000006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.795428 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0684  major facilitator transporter  25.84 
 
 		 412 aa  73.6  0.000000000007  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00476606  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2392  major facilitator superfamily MFS_1  24.87 
 
 		 415 aa  73.2  0.000000000008  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.000384037  normal  0.689164 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4659  MFS family multidrug resistance protein  29.71 
 
 		 408 aa  72.8  0.00000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2384  major facilitator transporter  27.29 
 
 		 441 aa  73.2  0.00000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.930234  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3246  permease, putative  24.2 
 
 		 417 aa  72.4  0.00000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0277963  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19250  major facilitator superfamily MFS_1  23.89 
 
 		 444 aa  72  0.00000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00108172  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1508  major facilitator superfamily permease  25.36 
 
 		 403 aa  72  0.00000000002  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1438  major facilitator superfamily MFS_1  30.3 
 
 		 416 aa  71.6  0.00000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3871  major facilitator superfamily MFS_1  25.96 
 
 		 433 aa  71.6  0.00000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0205552  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1155  major facilitator superfamily MFS_1  28.18 
 
 		 399 aa  71.2  0.00000000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.128986 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2987  permease; tetracycline resistance determinant  22.93 
 
 		 414 aa  71.6  0.00000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.105308  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4269  major facilitator transporter  30.67 
 
 		 436 aa  71.6  0.00000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.935574 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4378  major facilitator transporter  26.68 
 
 		 431 aa  70.9  0.00000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0053  transporter, putative  29.57 
 
 		 431 aa  70.9  0.00000000004  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1864  putative transporter  23.46 
 
 		 420 aa  70.5  0.00000000006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.42079e-47 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21930  major facilitator superfamily MFS_1  21.23 
 
 		 432 aa  70.5  0.00000000006  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>