More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Strop_4165 on replicon NC_009380
Organism: Salinispora tropica CNB-440



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009380  Strop_4165  major facilitator transporter  100 
 
 		 416 aa  796    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0148559  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0656  major facilitator transporter  39.85 
 
 		 435 aa  201  9.999999999999999e-51  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4222  major facilitator transporter  34.93 
 
 		 432 aa  196  9e-49  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.399211  hitchhiker  0.00102981 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_01200  Major Facilitator Superfamily transporter  37.53 
 
 		 411 aa  186  9e-46  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.780735  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2064  major facilitator transporter  37.02 
 
 		 426 aa  185  1.0000000000000001e-45  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.230072 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2261  major facilitator superfamily MFS_1  37.27 
 
 		 411 aa  182  1e-44  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.484467 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0258  major facilitator superfamily MFS_1  33.41 
 
 		 451 aa  175  1.9999999999999998e-42  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.305305 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8782  major facilitator superfamily MFS_1  34.22 
 
 		 429 aa  174  1.9999999999999998e-42  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.753165 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2409  major facilitator transporter  35.98 
 
 		 402 aa  166  6.9999999999999995e-40  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0925995  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7391  major facilitator transporter  36.14 
 
 		 434 aa  163  5.0000000000000005e-39  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.671193  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7428  antibiotic efflux protein  36.68 
 
 		 406 aa  162  1e-38  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0620213 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2910  major facilitator superfamily MFS_1  35.75 
 
 		 439 aa  158  2e-37  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.346093  normal  0.416861 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3278  major facilitator transporter  34.4 
 
 		 415 aa  148  2.0000000000000003e-34  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.471566  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0236  major facilitator transporter  35.71 
 
 		 402 aa  143  6e-33  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00072705 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2820  major facilitator superfamily MFS_1  33 
 
 		 421 aa  142  8e-33  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.549151  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0419  major facilitator transporter  31.62 
 
 		 416 aa  140  3.9999999999999997e-32  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3773  major facilitator superfamily MFS_1  35.86 
 
 		 420 aa  133  6.999999999999999e-30  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.159588  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_05030  Major Facilitator Superfamily transporter  30.97 
 
 		 414 aa  129  7.000000000000001e-29  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2962  major facilitator superfamily MFS_1  31.47 
 
 		 461 aa  129  1.0000000000000001e-28  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.470581  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2429  major facilitator superfamily MFS_1  32.76 
 
 		 418 aa  126  9e-28  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.945021  normal  0.699098 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0417  major facilitator transporter  30.77 
 
 		 420 aa  125  1e-27  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00934872 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0234  major facilitator superfamily MFS_1  31.09 
 
 		 442 aa  125  2e-27  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0208  hypothetical protein  38.43 
 
 		 289 aa  124  3e-27  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0074  major facilitator superfamily MFS_1  26.03 
 
 		 410 aa  123  6e-27  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.147937  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1568  major facilitator transporter  23.16 
 
 		 405 aa  121  1.9999999999999998e-26  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1600  major facilitator transporter  23.16 
 
 		 405 aa  121  1.9999999999999998e-26  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1603  major facilitator superfamily MFS_1  32.11 
 
 		 432 aa  119  7.999999999999999e-26  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0347546  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_27630  arabinose efflux permease family protein  29.38 
 
 		 417 aa  118  1.9999999999999998e-25  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1093  major facilitator superfamily MFS_1  33.87 
 
 		 408 aa  115  2.0000000000000002e-24  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.400006 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2540  major facilitator superfamily MFS_1  29.9 
 
 		 430 aa  114  2.0000000000000002e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0671  major facilitator transporter  27.6 
 
 		 456 aa  115  2.0000000000000002e-24  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0516  major facilitator superfamily MFS_1  27.45 
 
 		 420 aa  114  3e-24  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2244  major facilitator transporter  29.92 
 
 		 397 aa  113  6e-24  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0347  major facilitator transporter  31.47 
 
 		 425 aa  113  6e-24  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7785  major facilitator superfamily MFS_1  29.95 
 
 		 420 aa  113  7.000000000000001e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.157303 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0719  hypothetical protein  29.85 
 
 		 418 aa  113  8.000000000000001e-24  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.384757  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1671  putative transporter  29.6 
 
 		 418 aa  112  2.0000000000000002e-23  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1705  putative transporter  29.6 
 
 		 418 aa  112  2.0000000000000002e-23  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.167293  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1912  putative transporter  29.6 
 
 		 417 aa  112  2.0000000000000002e-23  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0586  putative transporter  29.6 
 
 		 417 aa  112  2.0000000000000002e-23  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2101  major facilitator superfamily MFS_1  29.59 
 
 		 447 aa  110  4.0000000000000004e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2325  major facilitator superfamily permease  29.41 
 
 		 397 aa  109  7.000000000000001e-23  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0197346  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4491  major facilitator superfamily MFS_1  28.54 
 
 		 423 aa  109  8.000000000000001e-23  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.783622  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6746  hypothetical protein  33.42 
 
 		 427 aa  109  9.000000000000001e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.869375  normal  0.283343 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0365  major facilitator transporter  29.48 
 
 		 427 aa  107  5e-22  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0592694 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0189  major facilitator superfamily MFS_1  26.54 
 
 		 426 aa  105  2e-21  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0572831  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1968  major facilitator superfamily MFS_1  33.24 
 
 		 405 aa  104  4e-21  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00000336752  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3284  major facilitator transporter  26.97 
 
 		 403 aa  103  4e-21  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4370  transporter, major facilitator family  25.7 
 
 		 410 aa  102  9e-21  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  5.0052999999999995e-22 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0691  major facilitator transporter  32.28 
 
 		 428 aa  102  1e-20  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.877498 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1728  major facilitator superfamily MFS_1  28.72 
 
 		 417 aa  101  2e-20  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3246  permease, putative  23.02 
 
 		 417 aa  100  5e-20  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0277963  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1193  major facilitator superfamily MFS_1  27.58 
 
 		 412 aa  100  6e-20  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2679  major facilitator superfamily MFS_1  28.53 
 
 		 453 aa  99  1e-19  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.000000322743  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2303  major facilitator transporter  30.83 
 
 		 435 aa  99.4  1e-19  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.533597  normal  0.893433 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0689  major facilitator superfamily MFS_1  26.4 
 
 		 439 aa  97.4  4e-19  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5406  major facilitator superfamily MFS_1  30.39 
 
 		 444 aa  97.1  5e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.283217 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6327  major facilitator transporter  30.59 
 
 		 461 aa  96.3  9e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.400788 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2987  permease; tetracycline resistance determinant  23.62 
 
 		 414 aa  95.9  1e-18  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.105308  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3257  tetracycline resistance determinant TetV  23.54 
 
 		 414 aa  95.9  1e-18  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.160876  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1041  major facilitator transporter  27.49 
 
 		 428 aa  95.5  1e-18  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0652  major facilitator transporter  28.57 
 
 		 423 aa  93.6  6e-18  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0291479  normal  0.182714 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6664  major facilitator transporter  28.45 
 
 		 414 aa  93.2  7e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.740991 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3460  major facilitator transporter  27.02 
 
 		 421 aa  92.4  1e-17  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0454626  hitchhiker  0.00919031 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4378  major facilitator transporter  26.51 
 
 		 431 aa  92  2e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2968  major facilitator superfamily MFS_1  28.85 
 
 		 441 aa  91.7  2e-17  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0982222 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5398  major facilitator superfamily MFS_1  29.34 
 
 		 401 aa  91.7  2e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.154835  normal  0.293524 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8802  major facilitator superfamily MFS_1  26.94 
 
 		 405 aa  92  2e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.953446 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0371  major facilitator transporter  25.26 
 
 		 405 aa  90.1  7e-17  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0456  major facilitator family transporter  25.83 
 
 		 410 aa  89.4  1e-16  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0890515  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4174  major facilitator superfamily MFS_1  26.11 
 
 		 414 aa  89.4  1e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.176115  normal  0.788258 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6539  major facilitator superfamily MFS_1  28.31 
 
 		 415 aa  89.4  1e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.6945  normal  0.0125799 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0504  major facilitator family transporter  24.81 
 
 		 410 aa  88.6  2e-16  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2355  macrolide-efflux protein  25.49 
 
 		 408 aa  89  2e-16  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000199839  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2902  major facilitator superfamily MFS_1  30.75 
 
 		 406 aa  88.2  2e-16  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.21173  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2589  putative permease  24.54 
 
 		 408 aa  88.6  2e-16  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.59543e-18 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4868  major facilitator family transporter  26.07 
 
 		 410 aa  88.6  2e-16  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2318  macrolide-efflux protein  24.93 
 
 		 408 aa  88.2  3e-16  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.31097  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2582  permease, putative  24.66 
 
 		 408 aa  87  5e-16  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0376  major facilitator family transporter  24.56 
 
 		 410 aa  87  5e-16  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.118082  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2631  putative permease  25.57 
 
 		 408 aa  87  5e-16  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0615976  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0390  major facilitator family transporter  24.56 
 
 		 410 aa  87  5e-16  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1399  major facilitator transporter  28.81 
 
 		 360 aa  87  5e-16  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.41856  normal  0.33149 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0434  major facilitator family transporter  24.56 
 
 		 410 aa  87  6e-16  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1438  major facilitator superfamily MFS_1  26.82 
 
 		 416 aa  86.7  7e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0367  sugar transporter  23.98 
 
 		 410 aa  86.7  8e-16  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000621781  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2940  major facilitator superfamily MFS_1  25.65 
 
 		 422 aa  86.3  9e-16  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4215  major facilitator superfamily MFS_1  32.95 
 
 		 467 aa  86.3  9e-16  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.251159  normal  0.128113 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0504  major facilitator family transporter  25.81 
 
 		 410 aa  86.3  0.000000000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.280977  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2402  permease  24.27 
 
 		 408 aa  85.5  0.000000000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0859078  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0364  sugar transporter  25.19 
 
 		 410 aa  85.1  0.000000000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2972  major facilitator transporter  26.68 
 
 		 415 aa  85.1  0.000000000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2577  permease  24.27 
 
 		 408 aa  85.5  0.000000000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.659755  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4101  major facilitator superfamily MFS_1  28.84 
 
 		 432 aa  85.1  0.000000000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.438153 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1613  major facilitator superfamily MFS_1  26.03 
 
 		 418 aa  84.7  0.000000000000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000260989  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0593  major facilitator transporter  24.61 
 
 		 413 aa  84.3  0.000000000000004  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.00370301  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0578  major facilitator transporter  24.61 
 
 		 413 aa  84.3  0.000000000000004  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0133344  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1000  hypothetical protein  29.33 
 
 		 418 aa  84  0.000000000000005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00447157 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5006  major facilitator transporter  26.28 
 
 		 416 aa  82.4  0.00000000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.641572  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2707  macrolide efflux protein  20.58 
 
 		 406 aa  81.6  0.00000000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0968867  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>