More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_1968 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_1968  major facilitator superfamily MFS_1  100 
 
 		 405 aa  743    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00000336752  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4222  major facilitator transporter  46.31 
 
 		 432 aa  308  1.0000000000000001e-82  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.399211  hitchhiker  0.00102981 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2409  major facilitator transporter  45.32 
 
 		 402 aa  246  4e-64  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0925995  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3278  major facilitator transporter  39.7 
 
 		 415 aa  224  2e-57  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.471566  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2820  major facilitator superfamily MFS_1  36.21 
 
 		 421 aa  219  7e-56  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.549151  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0234  major facilitator superfamily MFS_1  40.7 
 
 		 442 aa  202  7e-51  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1603  major facilitator superfamily MFS_1  38.35 
 
 		 432 aa  201  9.999999999999999e-51  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0347546  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0417  major facilitator transporter  39.45 
 
 		 420 aa  200  3e-50  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00934872 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_05030  Major Facilitator Superfamily transporter  36.34 
 
 		 414 aa  200  3.9999999999999996e-50  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1093  major facilitator superfamily MFS_1  40.15 
 
 		 408 aa  196  5.000000000000001e-49  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.400006 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0347  major facilitator transporter  39.1 
 
 		 425 aa  189  5.999999999999999e-47  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_01200  Major Facilitator Superfamily transporter  39.02 
 
 		 411 aa  159  1e-37  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.780735  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8782  major facilitator superfamily MFS_1  33.42 
 
 		 429 aa  129  7.000000000000001e-29  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.753165 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0656  major facilitator transporter  34.22 
 
 		 435 aa  125  2e-27  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7428  antibiotic efflux protein  36.36 
 
 		 406 aa  121  1.9999999999999998e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0620213 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0236  major facilitator transporter  36.6 
 
 		 402 aa  121  1.9999999999999998e-26  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00072705 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2261  major facilitator superfamily MFS_1  34.9 
 
 		 411 aa  119  7.999999999999999e-26  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.484467 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0258  major facilitator superfamily MFS_1  30.42 
 
 		 451 aa  119  9.999999999999999e-26  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.305305 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4165  major facilitator transporter  33.53 
 
 		 416 aa  118  1.9999999999999998e-25  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0148559  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0208  hypothetical protein  37.64 
 
 		 289 aa  112  1.0000000000000001e-23  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2064  major facilitator transporter  33.15 
 
 		 426 aa  108  2e-22  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.230072 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2910  major facilitator superfamily MFS_1  32.05 
 
 		 439 aa  105  2e-21  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.346093  normal  0.416861 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4215  major facilitator superfamily MFS_1  33.7 
 
 		 467 aa  104  3e-21  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.251159  normal  0.128113 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0419  major facilitator transporter  31.84 
 
 		 416 aa  104  4e-21  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0074  major facilitator superfamily MFS_1  27.84 
 
 		 410 aa  98.2  2e-19  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.147937  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5351  major facilitator superfamily MFS_1  30.72 
 
 		 401 aa  97.4  4e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.804378  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6746  hypothetical protein  34.15 
 
 		 427 aa  96.7  6e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.869375  normal  0.283343 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0719  hypothetical protein  31.77 
 
 		 418 aa  95.1  2e-18  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.384757  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1912  putative transporter  31.77 
 
 		 417 aa  94.7  2e-18  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2244  major facilitator transporter  31.77 
 
 		 397 aa  94.7  2e-18  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0586  putative transporter  31.77 
 
 		 417 aa  94.7  2e-18  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7391  major facilitator transporter  31.93 
 
 		 434 aa  94.7  3e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.671193  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1671  putative transporter  31.77 
 
 		 418 aa  94.7  3e-18  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2962  major facilitator superfamily MFS_1  30.79 
 
 		 461 aa  94.7  3e-18  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.470581  normal  1 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1705  putative transporter  31.77 
 
 		 418 aa  94.7  3e-18  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.167293  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2325  major facilitator superfamily permease  31.77 
 
 		 397 aa  94  5e-18  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0197346  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0365  major facilitator transporter  32.26 
 
 		 427 aa  93.2  8e-18  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0592694 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3773  major facilitator superfamily MFS_1  35.68 
 
 		 420 aa  89  1e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.159588  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2389  protein of unknown function DUF894 DitE  30.89 
 
 		 549 aa  88.6  2e-16  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2429  major facilitator superfamily MFS_1  33.63 
 
 		 418 aa  83.2  0.000000000000008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.945021  normal  0.699098 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0578  major facilitator transporter  27.31 
 
 		 413 aa  82.4  0.00000000000001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0133344  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2072  major facilitator transporter  29.68 
 
 		 417 aa  82.4  0.00000000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.205391  normal  0.200266 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0593  major facilitator transporter  27.31 
 
 		 413 aa  82.4  0.00000000000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.00370301  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0516  major facilitator superfamily MFS_1  25.78 
 
 		 420 aa  81.6  0.00000000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0189  hypothetical protein  32.17 
 
 		 539 aa  82  0.00000000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2884  hypothetical protein  28.9 
 
 		 543 aa  80.9  0.00000000000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1399  major facilitator transporter  30.17 
 
 		 360 aa  80.9  0.00000000000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.41856  normal  0.33149 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0671  major facilitator transporter  30.08 
 
 		 456 aa  80.9  0.00000000000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5006  major facilitator transporter  29.57 
 
 		 416 aa  80.1  0.00000000000007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.641572  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0743  major facilitator transporter  31.11 
 
 		 410 aa  78.2  0.0000000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2303  major facilitator transporter  29.29 
 
 		 435 aa  78.6  0.0000000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.533597  normal  0.893433 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0062  major facilitator superfamily MFS_1  24.15 
 
 		 440 aa  79  0.0000000000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.175422  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0395  permease  23.96 
 
 		 430 aa  77.4  0.0000000000004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0177527  normal  0.113221 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3555  major facilitator superfamily MFS_1  32.58 
 
 		 449 aa  77.4  0.0000000000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.194127  normal  0.458265 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3145  major facilitator superfamily MFS_1  30.15 
 
 		 440 aa  77  0.0000000000005  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.985088  normal  0.131643 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0691  major facilitator transporter  28.13 
 
 		 428 aa  77  0.0000000000006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.877498 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0189  major facilitator superfamily MFS_1  24.39 
 
 		 426 aa  76.6  0.0000000000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0572831  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3228  hypothetical protein  29.06 
 
 		 405 aa  76.3  0.0000000000009  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.65431  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4481  major facilitator transporter  29.32 
 
 		 416 aa  76.3  0.0000000000009  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.646656  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2384  protein of unknown function DUF894 DitE  30.18 
 
 		 549 aa  75.1  0.000000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.123744  normal  0.932575 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0087  major facilitator transporter  23.44 
 
 		 436 aa  75.1  0.000000000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2101  major facilitator superfamily MFS_1  29.25 
 
 		 447 aa  74.3  0.000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1221  major facilitator transporter  25.95 
 
 		 451 aa  73.9  0.000000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0719879 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1630  transporter  22.97 
 
 		 420 aa  73.6  0.000000000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2101  major facilitator superfamily MFS_1  30.99 
 
 		 479 aa  73.6  0.000000000006  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0091  major facilitator superfamily MFS_1  22.45 
 
 		 442 aa  73.2  0.000000000007  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1684  transporter  22.97 
 
 		 420 aa  73.2  0.000000000008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1819  transporter  22.97 
 
 		 420 aa  73.2  0.000000000008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000952932  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4491  major facilitator superfamily MFS_1  27.79 
 
 		 423 aa  72.8  0.000000000009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.783622  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_2010  transporter, putative  24.73 
 
 		 429 aa  72.4  0.00000000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1864  putative transporter  22.97 
 
 		 420 aa  72.4  0.00000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.42079e-47 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5278  hypothetical protein  29.85 
 
 		 408 aa  72.8  0.00000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.306023  normal  0.251543 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2685  major facilitator superfamily MFS_1  28.75 
 
 		 406 aa  71.6  0.00000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.188987  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2355  macrolide-efflux protein  27.13 
 
 		 408 aa  71.2  0.00000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000199839  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2631  putative permease  26.1 
 
 		 408 aa  71.2  0.00000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0615976  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0176  major facilitator transporter  26.32 
 
 		 426 aa  70.9  0.00000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.379469  normal  0.234316 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1572  major facilitator transporter  30.99 
 
 		 415 aa  71.2  0.00000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.58248  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1046  major facilitator transporter  30.65 
 
 		 437 aa  70.5  0.00000000004  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.340511  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0056  major facilitator superfamily MFS_1  26.03 
 
 		 433 aa  70.9  0.00000000004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3460  major facilitator transporter  27.67 
 
 		 421 aa  70.5  0.00000000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0454626  hitchhiker  0.00919031 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1167  protein of unknown function DUF894, DitE  32.08 
 
 		 529 aa  70.5  0.00000000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2318  macrolide-efflux protein  26.65 
 
 		 408 aa  70.1  0.00000000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.31097  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2641  major facilitator transporter  27.41 
 
 		 499 aa  70.1  0.00000000006  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.893021  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3515  putative transporter  22.38 
 
 		 420 aa  70.1  0.00000000007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3776  major facilitator superfamily MFS_1  31.87 
 
 		 412 aa  69.7  0.00000000009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2943  major facilitator superfamily MFS_1  28.75 
 
 		 406 aa  69.7  0.00000000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.747804  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2418  major facilitator superfamily MFS_1  27.49 
 
 		 412 aa  69.7  0.00000000009  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.269173 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2582  permease, putative  26.23 
 
 		 408 aa  69.3  0.0000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2972  major facilitator transporter  28.49 
 
 		 415 aa  68.9  0.0000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19250  major facilitator superfamily MFS_1  23.06 
 
 		 444 aa  68.9  0.0000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00108172  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4652  major facilitator superfamily MFS_1  28.31 
 
 		 406 aa  68.9  0.0000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4659  MFS family multidrug resistance protein  30.53 
 
 		 408 aa  68.6  0.0000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4269  major facilitator transporter  28.12 
 
 		 436 aa  68.6  0.0000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.935574 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2589  putative permease  26.86 
 
 		 408 aa  68.2  0.0000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.59543e-18 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1827  putative transporter  22.25 
 
 		 420 aa  68.2  0.0000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0118  major facilitator superfamily MFS_1  22.32 
 
 		 425 aa  68.2  0.0000000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4514  major facilitator transporter  28.01 
 
 		 406 aa  67.8  0.0000000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0261  major facilitator superfamily MFS_1  28.06 
 
 		 438 aa  67.4  0.0000000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0905059 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4370  transporter, major facilitator family  21.65 
 
 		 410 aa  67.4  0.0000000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  5.0052999999999995e-22 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3970  protein of unknown function DUF894 DitE  27.47 
 
 		 535 aa  67.4  0.0000000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>