More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BURPS1106A_A2244 on replicon NC_009078
Organism: Burkholderia pseudomallei 1106a



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_006349  BMAA1671  putative transporter  99.24 
 
 		 418 aa  754    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0719  hypothetical protein  99.5 
 
 		 418 aa  756    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.384757  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0586  putative transporter  99.24 
 
 		 417 aa  754    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1705  putative transporter  99.24 
 
 		 418 aa  754    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.167293  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1912  putative transporter  99.24 
 
 		 417 aa  754    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2325  major facilitator superfamily permease  98.99 
 
 		 397 aa  752    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0197346  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2244  major facilitator transporter  100 
 
 		 397 aa  757    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6746  hypothetical protein  50.5 
 
 		 427 aa  310  2e-83  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.869375  normal  0.283343 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2429  major facilitator superfamily MFS_1  52.9 
 
 		 418 aa  309  6.999999999999999e-83  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.945021  normal  0.699098 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0671  major facilitator transporter  44.53 
 
 		 456 aa  284  2.0000000000000002e-75  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0656  major facilitator transporter  38.79 
 
 		 435 aa  191  2e-47  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2261  major facilitator superfamily MFS_1  39.51 
 
 		 411 aa  186  8e-46  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.484467 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2064  major facilitator transporter  38.79 
 
 		 426 aa  185  2.0000000000000003e-45  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.230072 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7428  antibiotic efflux protein  34.04 
 
 		 406 aa  149  1.0000000000000001e-34  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0620213 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7391  major facilitator transporter  35.58 
 
 		 434 aa  145  1e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.671193  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_01200  Major Facilitator Superfamily transporter  34.74 
 
 		 411 aa  140  3e-32  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.780735  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4222  major facilitator transporter  28.69 
 
 		 432 aa  140  4.999999999999999e-32  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.399211  hitchhiker  0.00102981 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4215  major facilitator superfamily MFS_1  34.2 
 
 		 467 aa  137  4e-31  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.251159  normal  0.128113 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2820  major facilitator superfamily MFS_1  30.08 
 
 		 421 aa  135  9.999999999999999e-31  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.549151  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3773  major facilitator superfamily MFS_1  36.04 
 
 		 420 aa  129  7.000000000000001e-29  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.159588  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3278  major facilitator transporter  30.33 
 
 		 415 aa  128  2.0000000000000002e-28  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.471566  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2409  major facilitator transporter  32.07 
 
 		 402 aa  127  3e-28  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0925995  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0417  major facilitator transporter  30.05 
 
 		 420 aa  124  4e-27  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00934872 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0347  major facilitator transporter  30.45 
 
 		 425 aa  120  3.9999999999999996e-26  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_05030  Major Facilitator Superfamily transporter  28.33 
 
 		 414 aa  120  4.9999999999999996e-26  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8782  major facilitator superfamily MFS_1  32.89 
 
 		 429 aa  117  3.9999999999999997e-25  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.753165 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2962  major facilitator superfamily MFS_1  32.29 
 
 		 461 aa  114  2.0000000000000002e-24  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.470581  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0419  major facilitator transporter  31.34 
 
 		 416 aa  114  4.0000000000000004e-24  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4165  major facilitator transporter  29.65 
 
 		 416 aa  114  4.0000000000000004e-24  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0148559  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1093  major facilitator superfamily MFS_1  29.25 
 
 		 408 aa  110  3e-23  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.400006 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0236  major facilitator transporter  32.85 
 
 		 402 aa  111  3e-23  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00072705 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1603  major facilitator superfamily MFS_1  29.32 
 
 		 432 aa  109  1e-22  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0347546  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2910  major facilitator superfamily MFS_1  28.69 
 
 		 439 aa  106  7e-22  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.346093  normal  0.416861 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0234  major facilitator superfamily MFS_1  28.61 
 
 		 442 aa  105  1e-21  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0516  major facilitator superfamily MFS_1  28.3 
 
 		 420 aa  102  8e-21  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0258  major facilitator superfamily MFS_1  27.27 
 
 		 451 aa  102  2e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.305305 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6539  major facilitator superfamily MFS_1  29.26 
 
 		 415 aa  98.2  2e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.6945  normal  0.0125799 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3134  major facilitator superfamily MFS_1  30.33 
 
 		 417 aa  97.1  5e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4659  MFS family multidrug resistance protein  34.16 
 
 		 408 aa  96.7  7e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4989  hypothetical protein  28.39 
 
 		 342 aa  96.3  8e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0208  hypothetical protein  31.8 
 
 		 289 aa  92.8  8e-18  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_27630  arabinose efflux permease family protein  30.25 
 
 		 417 aa  92.8  9e-18  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4282  major facilitator superfamily MFS_1  32.11 
 
 		 420 aa  92  1e-17  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.522642 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4170  major facilitator superfamily MFS_1  32.11 
 
 		 420 aa  92  1e-17  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1600  major facilitator transporter  22.67 
 
 		 405 aa  90.1  6e-17  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1568  major facilitator transporter  22.67 
 
 		 405 aa  90.1  6e-17  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7785  major facilitator superfamily MFS_1  30.6 
 
 		 420 aa  88.2  2e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.157303 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8013  major facilitator transporter  29.91 
 
 		 408 aa  88.6  2e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3952  major facilitator transporter  31.18 
 
 		 413 aa  89  2e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6664  major facilitator transporter  29.84 
 
 		 414 aa  85.5  0.000000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.740991 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2968  major facilitator superfamily MFS_1  28.17 
 
 		 441 aa  85.9  0.000000000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0982222 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5398  major facilitator superfamily MFS_1  32.21 
 
 		 401 aa  84.3  0.000000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.154835  normal  0.293524 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0087  major facilitator transporter  29.27 
 
 		 436 aa  84.7  0.000000000000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0365  major facilitator transporter  29.34 
 
 		 427 aa  84  0.000000000000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0592694 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4370  transporter, major facilitator family  24.72 
 
 		 410 aa  84  0.000000000000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  5.0052999999999995e-22 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0074  major facilitator superfamily MFS_1  25 
 
 		 410 aa  83.2  0.000000000000007  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.147937  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6327  major facilitator transporter  28.53 
 
 		 461 aa  83.2  0.000000000000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.400788 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1684  transporter  25.73 
 
 		 420 aa  82.4  0.00000000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1819  transporter  25.73 
 
 		 420 aa  82.4  0.00000000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000952932  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2101  major facilitator superfamily MFS_1  26.22 
 
 		 447 aa  81.6  0.00000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1864  putative transporter  25.73 
 
 		 420 aa  80.9  0.00000000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.42079e-47 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1630  transporter  25.73 
 
 		 420 aa  80.9  0.00000000000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1193  major facilitator superfamily MFS_1  28.22 
 
 		 412 aa  80.5  0.00000000000005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0062  major facilitator superfamily MFS_1  26.46 
 
 		 440 aa  79.3  0.00000000000009  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.175422  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0091  major facilitator superfamily MFS_1  29.13 
 
 		 442 aa  79.3  0.0000000000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2707  macrolide efflux protein  21.91 
 
 		 406 aa  77.8  0.0000000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0968867  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2255  putative permease  21.65 
 
 		 404 aa  77.8  0.0000000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.134353 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5351  major facilitator superfamily MFS_1  28.83 
 
 		 401 aa  77.4  0.0000000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.804378  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5406  major facilitator superfamily MFS_1  27.63 
 
 		 444 aa  77.4  0.0000000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.283217 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1940  putative transporter  25.73 
 
 		 420 aa  77.4  0.0000000000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000531086  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0189  major facilitator superfamily MFS_1  24.04 
 
 		 426 aa  77.4  0.0000000000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0572831  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0053  transporter, putative  27 
 
 		 431 aa  77.4  0.0000000000005  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0056  major facilitator superfamily MFS_1  27.27 
 
 		 433 aa  77  0.0000000000005  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0176  major facilitator transporter  30.09 
 
 		 426 aa  77.4  0.0000000000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.379469  normal  0.234316 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4481  major facilitator transporter  26.72 
 
 		 416 aa  77.4  0.0000000000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.646656  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6250  major facilitator superfamily MFS_1  29.79 
 
 		 433 aa  76.6  0.0000000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.220883  normal  0.159364 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0593  major facilitator transporter  22.22 
 
 		 413 aa  76.6  0.0000000000008  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.00370301  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0578  major facilitator transporter  22.22 
 
 		 413 aa  76.6  0.0000000000008  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0133344  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0689  major facilitator superfamily MFS_1  25.47 
 
 		 439 aa  76.3  0.0000000000008  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3508  protein of unknown function DUF894, DitE  28.65 
 
 		 526 aa  76.3  0.0000000000009  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1892  transporter, putative  25.79 
 
 		 420 aa  75.5  0.000000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0166254  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7117  major facilitator superfamily MFS_1  29.02 
 
 		 432 aa  76.3  0.000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5006  major facilitator transporter  27.61 
 
 		 416 aa  74.7  0.000000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.641572  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3024  putative permease  21.65 
 
 		 406 aa  75.5  0.000000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_2010  transporter, putative  27.9 
 
 		 429 aa  73.9  0.000000000004  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3031  major facilitator transporter  24.86 
 
 		 420 aa  73.6  0.000000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0036629 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3257  tetracycline resistance determinant TetV  23 
 
 		 414 aa  73.9  0.000000000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.160876  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4055  major facilitator transporter  28.97 
 
 		 413 aa  73.9  0.000000000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4311  major facilitator transporter  28.97 
 
 		 413 aa  73.9  0.000000000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.481156  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3246  permease, putative  22.74 
 
 		 417 aa  73.2  0.000000000007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0277963  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2726  macrolide efflux protein  21.65 
 
 		 406 aa  73.2  0.000000000008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.277105  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3573  major facilitator transporter  27.94 
 
 		 416 aa  73.2  0.000000000008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2777  permease  21.65 
 
 		 406 aa  72.8  0.000000000009  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.145309  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2987  permease; tetracycline resistance determinant  22.4 
 
 		 414 aa  73.2  0.000000000009  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.105308  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2988  permease  21.65 
 
 		 406 aa  72.8  0.000000000009  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3206  major facilitator transporter  29.37 
 
 		 413 aa  72.8  0.00000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.130501  normal  0.812744 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4151  MFS permease  26.3 
 
 		 410 aa  72.8  0.00000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3596  major facilitator superfamily MFS_1  27.65 
 
 		 417 aa  71.6  0.00000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0532  major facilitator superfamily MFS_1  27.35 
 
 		 428 aa  72  0.00000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4461  H+ antiporter protein  28.86 
 
 		 414 aa  72  0.00000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>