More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_2910 on replicon NC_014210
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014210  Ndas_2910  major facilitator superfamily MFS_1  100 
 
 		 439 aa  837    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.346093  normal  0.416861 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0258  major facilitator superfamily MFS_1  30.77 
 
 		 451 aa  165  2.0000000000000002e-39  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.305305 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_01200  Major Facilitator Superfamily transporter  33.67 
 
 		 411 aa  164  2.0000000000000002e-39  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.780735  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4165  major facilitator transporter  35.13 
 
 		 416 aa  152  8.999999999999999e-36  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0148559  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4222  major facilitator transporter  29.56 
 
 		 432 aa  141  3e-32  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.399211  hitchhiker  0.00102981 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0074  major facilitator superfamily MFS_1  27.51 
 
 		 410 aa  135  1.9999999999999998e-30  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.147937  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0656  major facilitator transporter  33.42 
 
 		 435 aa  134  3.9999999999999996e-30  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2409  major facilitator transporter  32.09 
 
 		 402 aa  127  5e-28  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0925995  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8782  major facilitator superfamily MFS_1  29.49 
 
 		 429 aa  127  6e-28  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.753165 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7428  antibiotic efflux protein  30.02 
 
 		 406 aa  123  8e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0620213 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4215  major facilitator superfamily MFS_1  29.78 
 
 		 467 aa  120  7e-26  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.251159  normal  0.128113 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2064  major facilitator transporter  31.59 
 
 		 426 aa  118  1.9999999999999998e-25  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.230072 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2820  major facilitator superfamily MFS_1  28.36 
 
 		 421 aa  117  6e-25  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.549151  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2429  major facilitator superfamily MFS_1  31.59 
 
 		 418 aa  114  3e-24  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.945021  normal  0.699098 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0671  major facilitator transporter  28.99 
 
 		 456 aa  112  2.0000000000000002e-23  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2261  major facilitator superfamily MFS_1  29.46 
 
 		 411 aa  107  6e-22  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.484467 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0719  hypothetical protein  28.92 
 
 		 418 aa  105  2e-21  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.384757  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0236  major facilitator transporter  33.7 
 
 		 402 aa  103  4e-21  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00072705 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2325  major facilitator superfamily permease  30.03 
 
 		 397 aa  103  4e-21  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0197346  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2244  major facilitator transporter  28.92 
 
 		 397 aa  104  4e-21  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0208  hypothetical protein  37 
 
 		 289 aa  103  4e-21  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1671  putative transporter  28.65 
 
 		 418 aa  103  5e-21  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1705  putative transporter  28.65 
 
 		 418 aa  103  5e-21  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.167293  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1912  putative transporter  28.65 
 
 		 417 aa  103  5e-21  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0586  putative transporter  28.65 
 
 		 417 aa  103  5e-21  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0417  major facilitator transporter  29.12 
 
 		 420 aa  103  6e-21  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00934872 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3773  major facilitator superfamily MFS_1  32.73 
 
 		 420 aa  100  4e-20  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.159588  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_05030  Major Facilitator Superfamily transporter  28.31 
 
 		 414 aa  99  2e-19  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0419  major facilitator transporter  29.37 
 
 		 416 aa  96.3  9e-19  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0234  major facilitator superfamily MFS_1  28.54 
 
 		 442 aa  96.3  1e-18  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2962  major facilitator superfamily MFS_1  28.78 
 
 		 461 aa  93.6  6e-18  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.470581  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7391  major facilitator transporter  30.87 
 
 		 434 aa  93.2  9e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.671193  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6539  major facilitator superfamily MFS_1  30.47 
 
 		 415 aa  91.7  3e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.6945  normal  0.0125799 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3278  major facilitator transporter  29.21 
 
 		 415 aa  91.3  3e-17  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.471566  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1603  major facilitator superfamily MFS_1  27.1 
 
 		 432 aa  90.1  8e-17  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0347546  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0347  major facilitator transporter  28.08 
 
 		 425 aa  89.4  1e-16  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2355  macrolide-efflux protein  27.49 
 
 		 408 aa  86.7  8e-16  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000199839  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2402  permease  26.29 
 
 		 408 aa  85.9  0.000000000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0859078  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2577  permease  26.29 
 
 		 408 aa  85.9  0.000000000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.659755  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0875  major facilitator superfamily MFS_1  28.07 
 
 		 441 aa  85.9  0.000000000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  hitchhiker  0.00780765  normal  0.0882707 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2318  macrolide-efflux protein  25.99 
 
 		 408 aa  84.7  0.000000000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.31097  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0293  major facilitator superfamily MFS_1  27.93 
 
 		 710 aa  84  0.000000000000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.189593  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6746  hypothetical protein  29.27 
 
 		 427 aa  84  0.000000000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.869375  normal  0.283343 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1968  major facilitator superfamily MFS_1  32.3 
 
 		 405 aa  84  0.000000000000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00000336752  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5406  major facilitator superfamily MFS_1  27.89 
 
 		 444 aa  83.2  0.000000000000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.283217 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1093  major facilitator superfamily MFS_1  29.82 
 
 		 408 aa  83.2  0.000000000000009  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.400006 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0593  major facilitator transporter  24.21 
 
 		 413 aa  82.8  0.00000000000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.00370301  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0844  major facilitator superfamily MFS_1  29.1 
 
 		 403 aa  82.4  0.00000000000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1250  major facilitator transporter  27.3 
 
 		 425 aa  82.8  0.00000000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0578  major facilitator transporter  24.21 
 
 		 413 aa  82.8  0.00000000000001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0133344  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4101  major facilitator superfamily MFS_1  30.71 
 
 		 432 aa  81.6  0.00000000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.438153 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2589  putative permease  26.49 
 
 		 408 aa  82  0.00000000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.59543e-18 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_27630  arabinose efflux permease family protein  29.2 
 
 		 417 aa  81.6  0.00000000000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1041  major facilitator transporter  27.09 
 
 		 428 aa  81.6  0.00000000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2582  permease, putative  27.01 
 
 		 408 aa  80.5  0.00000000000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1193  major facilitator superfamily MFS_1  28.53 
 
 		 412 aa  80.9  0.00000000000005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2783  thymidylate kinase  28.23 
 
 		 686 aa  80.5  0.00000000000006  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.855806  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1974  hypothetical protein  24 
 
 		 424 aa  80.1  0.00000000000008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.00936884  normal  0.989231 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3024  putative permease  23.51 
 
 		 406 aa  79.3  0.0000000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0752  transporter, putative  26.55 
 
 		 446 aa  78.6  0.0000000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2968  major facilitator superfamily MFS_1  27.76 
 
 		 441 aa  77.4  0.0000000000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0982222 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4306  thymidylate kinase  27.72 
 
 		 730 aa  77.4  0.0000000000005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4491  major facilitator superfamily MFS_1  29.16 
 
 		 423 aa  77.4  0.0000000000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.783622  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2707  macrolide efflux protein  22.83 
 
 		 406 aa  77  0.0000000000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0968867  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0308  dTMP kinase  26.55 
 
 		 709 aa  75.9  0.000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.233817 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1904  amino acid adenylation domain-containing protein  23.16 
 
 		 1833 aa  76.3  0.000000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.844763  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2255  putative permease  22.92 
 
 		 404 aa  75.5  0.000000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.134353 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4005  major facilitator superfamily MFS_1  26.28 
 
 		 442 aa  74.7  0.000000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.0701044 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2631  putative permease  25.4 
 
 		 408 aa  74.3  0.000000000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0615976  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2286  major facilitator transporter  21 
 
 		 414 aa  74.3  0.000000000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0407537  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1991  major facilitator superfamily MFS_1  27.13 
 
 		 450 aa  73.9  0.000000000005  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.762129  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3025  permease, putative  23.59 
 
 		 406 aa  73.6  0.000000000006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.076608  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4296  major facilitator transporter  28.61 
 
 		 416 aa  73.6  0.000000000006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.970953 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0689  major facilitator superfamily MFS_1  26.37 
 
 		 439 aa  73.6  0.000000000007  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5351  major facilitator superfamily MFS_1  30.53 
 
 		 401 aa  72.8  0.00000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.804378  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0871  macrolide efflux protein, putative  27.17 
 
 		 394 aa  72.8  0.00000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2726  macrolide efflux protein  23.23 
 
 		 406 aa  72.4  0.00000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.277105  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5006  major facilitator transporter  26.75 
 
 		 416 aa  72  0.00000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.641572  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2777  permease  23.23 
 
 		 406 aa  72  0.00000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.145309  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2988  permease  23.23 
 
 		 406 aa  72  0.00000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1747  major facilitator superfamily MFS_1  26.48 
 
 		 463 aa  72  0.00000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.192343  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1118  major facilitator superfamily MFS_1  22.34 
 
 		 406 aa  72  0.00000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2754  major facilitator superfamily MFS_1  28 
 
 		 453 aa  71.2  0.00000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.192829  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3727  major facilitator transporter  27.92 
 
 		 416 aa  71.6  0.00000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.274242  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9221  dTMP kinase  29.56 
 
 		 688 aa  71.2  0.00000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.625222  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2511  ABC transporter, permease protein, putative  20.28 
 
 		 414 aa  71.2  0.00000000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00150223  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8399  thymidylate kinase  26.18 
 
 		 901 aa  71.2  0.00000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30800  arabinose efflux permease family protein  25.39 
 
 		 452 aa  70.9  0.00000000004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0490  major facilitator superfamily MFS_1  28.87 
 
 		 461 aa  71.2  0.00000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0768  major facilitator superfamily MFS_1  26.94 
 
 		 456 aa  70.5  0.00000000006  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3467  thymidylate kinase  28.32 
 
 		 686 aa  70.1  0.00000000007  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2989  putative permease  23.22 
 
 		 362 aa  70.1  0.00000000008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4597  major facilitator superfamily MFS_1  28.71 
 
 		 727 aa  69.7  0.00000000009  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3206  major facilitator transporter  28.24 
 
 		 413 aa  69.3  0.0000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.130501  normal  0.812744 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4055  major facilitator transporter  28.5 
 
 		 413 aa  69.3  0.0000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4311  major facilitator transporter  28.5 
 
 		 413 aa  69.3  0.0000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.481156  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2206  major facilitator transporter  25.6 
 
 		 447 aa  69.3  0.0000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4378  major facilitator transporter  23.82 
 
 		 431 aa  68.9  0.0000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4326  major facilitator superfamily MFS_1  29.02 
 
 		 404 aa  68.9  0.0000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6250  major facilitator superfamily MFS_1  28.01 
 
 		 433 aa  68.6  0.0000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.220883  normal  0.159364 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>