More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_4665 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013595  Sros_4665  hypothetical protein  100 
 
 		 445 aa  851    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0402536 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1744  major facilitator superfamily MFS_1  35.77 
 
 		 436 aa  176  9e-43  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.795428 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0365  major facilitator transporter  31.02 
 
 		 427 aa  165  1.0000000000000001e-39  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0592694 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0516  major facilitator superfamily MFS_1  29.6 
 
 		 420 aa  165  2.0000000000000002e-39  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3871  major facilitator superfamily MFS_1  29.53 
 
 		 433 aa  139  1e-31  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0205552  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8128  major facilitator superfamily MFS_1  30.94 
 
 		 512 aa  133  7.999999999999999e-30  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1568  major facilitator transporter  26.02 
 
 		 405 aa  130  6e-29  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1600  major facilitator transporter  26.02 
 
 		 405 aa  130  6e-29  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2072  major facilitator transporter  28.89 
 
 		 417 aa  123  8e-27  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.205391  normal  0.200266 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1974  hypothetical protein  26.97 
 
 		 424 aa  122  9.999999999999999e-27  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.00936884  normal  0.989231 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7174  major facilitator superfamily MFS_1  31.67 
 
 		 428 aa  121  3e-26  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.295435  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3952  major facilitator transporter  29.34 
 
 		 413 aa  117  3e-25  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0752  transporter, putative  26.55 
 
 		 446 aa  112  1.0000000000000001e-23  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0258  major facilitator superfamily MFS_1  30.27 
 
 		 451 aa  112  1.0000000000000001e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.305305 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1224  major facilitator superfamily MFS_1  28.18 
 
 		 440 aa  109  9.000000000000001e-23  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2206  major facilitator transporter  26.35 
 
 		 447 aa  109  1e-22  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1991  major facilitator superfamily MFS_1  28.83 
 
 		 450 aa  108  2e-22  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.762129  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3061  major facilitator superfamily MFS_1  28.6 
 
 		 429 aa  108  2e-22  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  decreased coverage  0.00310805  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0062  major facilitator superfamily MFS_1  26.2 
 
 		 440 aa  107  4e-22  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.175422  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0087  major facilitator transporter  26.97 
 
 		 436 aa  107  5e-22  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0875  major facilitator superfamily MFS_1  31.94 
 
 		 441 aa  106  9e-22  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  hitchhiker  0.00780765  normal  0.0882707 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2384  major facilitator transporter  26.81 
 
 		 441 aa  105  1e-21  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.930234  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1000  hypothetical protein  28.65 
 
 		 418 aa  105  2e-21  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00447157 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1827  putative transporter  26.54 
 
 		 420 aa  104  3e-21  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5814  major facilitator superfamily MFS_1  23.69 
 
 		 423 aa  103  6e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.915234  hitchhiker  0.00491963 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1940  putative transporter  26.27 
 
 		 420 aa  103  7e-21  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000531086  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2409  major facilitator transporter  30.41 
 
 		 402 aa  102  1e-20  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0925995  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0885  major facilitator transporter  29.78 
 
 		 415 aa  102  1e-20  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2024  major facilitator superfamily MFS_1  24.67 
 
 		 419 aa  102  2e-20  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3515  putative transporter  26.13 
 
 		 420 aa  102  2e-20  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1420  major facilitator superfamily MFS_1  29.29 
 
 		 420 aa  101  3e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4378  major facilitator transporter  25.75 
 
 		 431 aa  101  3e-20  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5360  major facilitator superfamily MFS_1  28.57 
 
 		 430 aa  101  3e-20  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.261806  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1864  putative transporter  25.54 
 
 		 420 aa  101  3e-20  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.42079e-47 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3024  putative permease  24.19 
 
 		 406 aa  100  4e-20  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_27630  arabinose efflux permease family protein  26.87 
 
 		 417 aa  100  6e-20  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1684  transporter  25.54 
 
 		 420 aa  100  7e-20  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1819  transporter  25.54 
 
 		 420 aa  100  7e-20  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000952932  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3626  major facilitator transporter  30.79 
 
 		 413 aa  99.8  8e-20  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.348332  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_24170  arabinose efflux permease family protein  28.79 
 
 		 405 aa  99.8  8e-20  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.917707  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2540  major facilitator superfamily MFS_1  29.13 
 
 		 430 aa  99.8  9e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1630  transporter  25.3 
 
 		 420 aa  99.4  1e-19  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4222  major facilitator transporter  27.52 
 
 		 432 aa  99  1e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.399211  hitchhiker  0.00102981 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0476  major facilitator transporter  29.44 
 
 		 474 aa  98.6  2e-19  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1892  transporter, putative  25.3 
 
 		 420 aa  99  2e-19  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0166254  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2968  major facilitator superfamily MFS_1  30.19 
 
 		 441 aa  98.6  2e-19  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0982222 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4322  major facilitator transporter  29.74 
 
 		 418 aa  98.6  2e-19  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.369395  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8782  major facilitator superfamily MFS_1  29.62 
 
 		 429 aa  97.8  3e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.753165 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1677  hypothetical protein  28.03 
 
 		 435 aa  97.8  4e-19  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2707  macrolide efflux protein  25.48 
 
 		 406 aa  97.1  6e-19  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0968867  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2255  putative permease  24.01 
 
 		 404 aa  97.1  6e-19  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.134353 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3555  major facilitator superfamily MFS_1  29.13 
 
 		 449 aa  96.7  7e-19  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.194127  normal  0.458265 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2820  major facilitator superfamily MFS_1  26.74 
 
 		 421 aa  95.1  2e-18  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.549151  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4356  major facilitator superfamily MFS_1  30.4 
 
 		 388 aa  95.1  2e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.510834  normal  0.27139 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6664  major facilitator transporter  28.88 
 
 		 414 aa  95.1  2e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.740991 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30800  arabinose efflux permease family protein  30.05 
 
 		 452 aa  94.7  3e-18  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0768  major facilitator superfamily MFS_1  28.38 
 
 		 456 aa  94.4  3e-18  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0968  major facilitator superfamily MFS_1  26.01 
 
 		 432 aa  93.6  6e-18  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.896564  normal  0.510346 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1861  major facilitator transporter  26.7 
 
 		 413 aa  93.2  7e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0051281 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7785  major facilitator superfamily MFS_1  27.76 
 
 		 420 aa  93.6  7e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.157303 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2380  major facilitator transporter  26.21 
 
 		 474 aa  93.2  9e-18  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0389897  normal  0.03889 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3025  permease, putative  24.16 
 
 		 406 aa  92.4  1e-17  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.076608  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1719  major facilitator superfamily MFS_1  25.89 
 
 		 447 aa  92.8  1e-17  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1747  major facilitator superfamily MFS_1  27.15 
 
 		 463 aa  92.4  1e-17  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.192343  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1093  major facilitator superfamily MFS_1  29.59 
 
 		 408 aa  92.4  2e-17  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.400006 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2777  permease  25.24 
 
 		 406 aa  91.3  3e-17  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.145309  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2988  permease  25.24 
 
 		 406 aa  91.3  3e-17  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0091  major facilitator superfamily MFS_1  25.61 
 
 		 442 aa  91.3  3e-17  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0689  major facilitator superfamily MFS_1  25 
 
 		 439 aa  91.3  3e-17  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2726  macrolide efflux protein  25 
 
 		 406 aa  90.9  4e-17  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.277105  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1613  major facilitator superfamily MFS_1  28.43 
 
 		 418 aa  90.9  4e-17  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000260989  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2984  putative permease  25 
 
 		 404 aa  90.5  5e-17  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000116191 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3573  major facilitator transporter  29.61 
 
 		 416 aa  90.5  6e-17  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0746  hypothetical protein  24.09 
 
 		 431 aa  89.7  1e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0165656  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5208  major facilitator superfamily MFS_1  28.57 
 
 		 432 aa  89  2e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.377398  normal  0.900425 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1942  multidrug resistance protein; putative tetracycline resistance determinant  23.98 
 
 		 406 aa  89  2e-16  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.0213e-35 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8887  hypothetical protein  26.48 
 
 		 413 aa  87.8  3e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.889317 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2972  major facilitator transporter  29.39 
 
 		 415 aa  88.2  3e-16  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4715  major facilitator transporter  27.47 
 
 		 428 aa  87.8  3e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0417  major facilitator transporter  27.7 
 
 		 420 aa  87.8  4e-16  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00934872 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5006  major facilitator transporter  28.36 
 
 		 416 aa  87.4  4e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.641572  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6539  major facilitator superfamily MFS_1  28.88 
 
 		 415 aa  87  5e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.6945  normal  0.0125799 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2101  major facilitator superfamily MFS_1  27.76 
 
 		 447 aa  87  5e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3588  major facilitator superfamily MFS_1  28.39 
 
 		 428 aa  86.7  7e-16  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.273478 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2679  major facilitator superfamily MFS_1  26.21 
 
 		 453 aa  86.7  8e-16  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.000000322743  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4481  major facilitator transporter  28.99 
 
 		 416 aa  86.7  8e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.646656  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1748  multidrug resistance protein; tetracycline resistance determinant  23.21 
 
 		 406 aa  85.9  0.000000000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000069396  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3037  major facilitator superfamily MFS_1  24.05 
 
 		 421 aa  85.9  0.000000000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7428  antibiotic efflux protein  28.54 
 
 		 406 aa  85.9  0.000000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0620213 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0830  major facilitator superfamily MFS_1  28.02 
 
 		 422 aa  85.9  0.000000000000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0559019  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5216  major facilitator transporter  28.99 
 
 		 416 aa  85.5  0.000000000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0532  major facilitator superfamily MFS_1  25.74 
 
 		 428 aa  85.1  0.000000000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0419  major facilitator transporter  26.61 
 
 		 416 aa  85.5  0.000000000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0792  major facilitator transporter  28.38 
 
 		 450 aa  85.5  0.000000000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1272  major facilitator transporter  24.34 
 
 		 418 aa  84.7  0.000000000000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2654  macrolide efflux protein, putative  22.92 
 
 		 414 aa  84.3  0.000000000000004  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3031  major facilitator transporter  27.03 
 
 		 420 aa  84.3  0.000000000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0036629 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0684  major facilitator transporter  29.19 
 
 		 412 aa  84.3  0.000000000000004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00476606  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2392  major facilitator superfamily MFS_1  27.18 
 
 		 415 aa  84  0.000000000000005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.000384037  normal  0.689164 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0107  hypothetical protein  25.36 
 
 		 423 aa  84  0.000000000000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0053883 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>