More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ksed_02090 on replicon NC_013169
Organism: Kytococcus sedentarius DSM 20547



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013169  Ksed_02090  Major Facilitator Superfamily transporter  100 
 
 		 424 aa  804    Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2680  major facilitator superfamily MFS_1  48.64 
 
 		 414 aa  296  3e-79  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1323  major facilitator superfamily MFS_1  42.43 
 
 		 429 aa  295  1e-78  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.107888  normal  0.120407 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2357  major facilitator superfamily MFS_1  46.83 
 
 		 418 aa  285  1.0000000000000001e-75  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.561235  normal  0.233215 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5018  major facilitator superfamily MFS_1  42.33 
 
 		 422 aa  197  3e-49  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_36730  Major Facilitator Superfamily transporter  34.77 
 
 		 446 aa  186  9e-46  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.298448 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2039  major facilitator superfamily MFS_1  40.14 
 
 		 428 aa  184  2.0000000000000003e-45  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2666  major facilitator transporter  36.75 
 
 		 412 aa  171  3e-41  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.178731  hitchhiker  0.000246371 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2483  major facilitator transporter  36.13 
 
 		 412 aa  159  9e-38  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3958  drug antiporter protein  30.56 
 
 		 418 aa  111  2.0000000000000002e-23  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4032  H+ antiporter protein  30.56 
 
 		 418 aa  111  2.0000000000000002e-23  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3972  H+ antiporter protein  30.56 
 
 		 418 aa  111  3e-23  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.14454  normal  0.0420605 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4461  H+ antiporter protein  29.31 
 
 		 414 aa  107  6e-22  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2234  H+ antiporter protein  29.2 
 
 		 412 aa  100  7e-20  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2769  major facilitator superfamily MFS_1  31.77 
 
 		 417 aa  99.4  1e-19  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.172375  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1564  major facilitator superfamily MFS_1  32.31 
 
 		 401 aa  99.4  1e-19  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.194805  normal  0.215005 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0135  major facilitator transporter  31.41 
 
 		 445 aa  85.1  0.000000000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11284  integral membrane transport protein  30 
 
 		 419 aa  84.7  0.000000000000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0516  major facilitator superfamily MFS_1  25.94 
 
 		 420 aa  84  0.000000000000005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0476  major facilitator transporter  27.55 
 
 		 474 aa  82  0.00000000000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2582  permease, putative  23.16 
 
 		 408 aa  82  0.00000000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2355  macrolide-efflux protein  23.73 
 
 		 408 aa  81.6  0.00000000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000199839  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2420  major facilitator transporter  27.05 
 
 		 417 aa  80.1  0.00000000000006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.13347  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2589  putative permease  23.45 
 
 		 408 aa  79.7  0.00000000000008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.59543e-18 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2318  macrolide-efflux protein  23.16 
 
 		 408 aa  79  0.0000000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.31097  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1600  major facilitator transporter  20.74 
 
 		 405 aa  79  0.0000000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1568  major facilitator transporter  20.74 
 
 		 405 aa  79  0.0000000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5406  major facilitator superfamily MFS_1  25.93 
 
 		 444 aa  79.3  0.0000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.283217 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2402  permease  23.16 
 
 		 408 aa  76.6  0.0000000000007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0859078  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2577  permease  23.16 
 
 		 408 aa  76.6  0.0000000000007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.659755  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0056  major facilitator superfamily MFS_1  26.19 
 
 		 433 aa  76.3  0.0000000000009  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0062  putative membrane transport protein  29.25 
 
 		 418 aa  76.3  0.000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.640827  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3460  major facilitator transporter  26.16 
 
 		 421 aa  76.3  0.000000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0454626  hitchhiker  0.00919031 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2631  putative permease  23.16 
 
 		 408 aa  75.5  0.000000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0615976  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_09700  Major Facilitator Superfamily transporter  28.68 
 
 		 469 aa  74.7  0.000000000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.854337  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0667  major facilitator superfamily MFS_1  26.62 
 
 		 430 aa  72.8  0.00000000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.00302666  hitchhiker  0.0000374441 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2989  putative permease  23.76 
 
 		 362 aa  71.6  0.00000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3024  putative permease  23.75 
 
 		 406 aa  71.2  0.00000000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4481  major facilitator transporter  28.37 
 
 		 416 aa  70.9  0.00000000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.646656  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3486  major facilitator transporter  28.72 
 
 		 450 aa  70.5  0.00000000006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.719238  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0062  major facilitator superfamily MFS_1  24.24 
 
 		 440 aa  69.7  0.00000000009  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.175422  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3573  major facilitator transporter  30.42 
 
 		 416 aa  69.7  0.00000000009  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7785  major facilitator superfamily MFS_1  28.45 
 
 		 420 aa  69.7  0.00000000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.157303 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0684  major facilitator transporter  24.9 
 
 		 412 aa  69.7  0.0000000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00476606  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4174  major facilitator superfamily MFS_1  28.27 
 
 		 414 aa  68.9  0.0000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.176115  normal  0.788258 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5006  major facilitator transporter  28.37 
 
 		 416 aa  69.7  0.0000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.641572  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1000  hypothetical protein  25.13 
 
 		 418 aa  69.7  0.0000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00447157 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3061  major facilitator superfamily MFS_1  25.68 
 
 		 429 aa  68.6  0.0000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  decreased coverage  0.00310805  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0141  major facilitator transporter  31.25 
 
 		 478 aa  68.6  0.0000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000428453 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1380  major facilitator superfamily MFS_1  26.41 
 
 		 401 aa  68.9  0.0000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.185265  hitchhiker  0.00924404 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5268  MFS family transporter  28.84 
 
 		 403 aa  68.9  0.0000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2707  macrolide efflux protein  23.84 
 
 		 406 aa  67  0.0000000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0968867  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_61170  putative transmembrane protein  28.57 
 
 		 403 aa  66.6  0.0000000007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1932  major facilitator superfamily MFS_1  26.22 
 
 		 406 aa  67  0.0000000007  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5216  major facilitator transporter  30.42 
 
 		 416 aa  66.6  0.0000000009  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5208  major facilitator superfamily MFS_1  28.95 
 
 		 432 aa  66.6  0.0000000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.377398  normal  0.900425 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5551  major facilitator superfamily MFS_1  28.19 
 
 		 420 aa  65.9  0.000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.138486  normal  0.597938 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3299  major facilitator transporter  31.58 
 
 		 416 aa  65.5  0.000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.174226  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5069  major facilitator transporter  31.58 
 
 		 416 aa  65.5  0.000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2255  putative permease  23.01 
 
 		 404 aa  64.7  0.000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.134353 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3442  major facilitator superfamily MFS_1  28.76 
 
 		 440 aa  65.1  0.000000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0102132  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0376  major facilitator family transporter  22.59 
 
 		 410 aa  64.3  0.000000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.118082  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1221  major facilitator transporter  26.77 
 
 		 451 aa  64.3  0.000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0719879 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2679  major facilitator superfamily MFS_1  25.28 
 
 		 453 aa  64.3  0.000000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.000000322743  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1114  major facilitator superfamily MFS_1  22.95 
 
 		 415 aa  64.3  0.000000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0434  major facilitator family transporter  22.59 
 
 		 410 aa  64.3  0.000000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0390  major facilitator family transporter  22.59 
 
 		 410 aa  64.3  0.000000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2540  major facilitator superfamily MFS_1  26.19 
 
 		 430 aa  64.3  0.000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1259  major facilitator transporter  28.74 
 
 		 491 aa  64.3  0.000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0884652  normal  0.0333983 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1250  major facilitator transporter  23.8 
 
 		 425 aa  63.9  0.000000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0367  sugar transporter  22.59 
 
 		 410 aa  63.5  0.000000006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000621781  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0786  major facilitator transporter  20.75 
 
 		 403 aa  63.9  0.000000006  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.104451  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0591  hypothetical protein  31.58 
 
 		 416 aa  63.9  0.000000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4356  major facilitator superfamily MFS_1  29.53 
 
 		 388 aa  63.2  0.000000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.510834  normal  0.27139 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2777  permease  23.56 
 
 		 406 aa  63.2  0.00000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.145309  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2726  macrolide efflux protein  23.56 
 
 		 406 aa  62.4  0.00000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.277105  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0504  major facilitator family transporter  21.3 
 
 		 410 aa  62.8  0.00000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2988  permease  23.56 
 
 		 406 aa  63.2  0.00000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2101  major facilitator superfamily MFS_1  27.78 
 
 		 479 aa  63.2  0.00000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0210  major facilitator superfamily MFS_1  27.86 
 
 		 476 aa  62.4  0.00000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4868  major facilitator family transporter  22.59 
 
 		 410 aa  62.4  0.00000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0087  major facilitator transporter  23.74 
 
 		 436 aa  62.4  0.00000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3679  major facilitator superfamily MFS_1  29.7 
 
 		 410 aa  62.4  0.00000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.709991  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2418  major facilitator superfamily MFS_1  30.83 
 
 		 412 aa  61.6  0.00000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.269173 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0504  major facilitator family transporter  22.52 
 
 		 410 aa  62  0.00000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.280977  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0456  major facilitator family transporter  21.76 
 
 		 410 aa  61.6  0.00000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0890515  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4706  major facilitator superfamily MFS_1  25.87 
 
 		 445 aa  62  0.00000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.93667 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3450  major facilitator superfamily MFS_1  24.33 
 
 		 499 aa  62  0.00000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00033474 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0371  major facilitator transporter  22.81 
 
 		 405 aa  62.4  0.00000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0482  major facilitator superfamily MFS_1  36.47 
 
 		 458 aa  62  0.00000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.787835  normal  0.855857 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1904  amino acid adenylation domain-containing protein  21.37 
 
 		 1833 aa  61.6  0.00000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.844763  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1264  major facilitator superfamily MFS_1  26.33 
 
 		 422 aa  61.6  0.00000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.62642  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1118  major facilitator superfamily MFS_1  22.46 
 
 		 406 aa  60.8  0.00000004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3575  major facilitator superfamily MFS_1  29.06 
 
 		 416 aa  61.2  0.00000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0832  major facilitator superfamily MFS_1  29.49 
 
 		 443 aa  60.8  0.00000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.533006  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1813  major facilitator superfamily permease  24.4 
 
 		 410 aa  60.8  0.00000004  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3025  permease, putative  22.69 
 
 		 406 aa  60.5  0.00000006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.076608  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0805  major facilitator superfamily MFS_1  24.88 
 
 		 459 aa  60.5  0.00000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3776  major facilitator superfamily MFS_1  28.39 
 
 		 412 aa  60.5  0.00000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5805  putative major facilitator superfamily (MFS) transporter  25.14 
 
 		 419 aa  59.7  0.00000009  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.774942 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>