180 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_5018 on replicon NC_014211
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014211  Ndas_5018  major facilitator superfamily MFS_1  100 
 
 		 422 aa  781    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1323  major facilitator superfamily MFS_1  42.71 
 
 		 429 aa  280  4e-74  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.107888  normal  0.120407 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2680  major facilitator superfamily MFS_1  42.08 
 
 		 414 aa  229  8e-59  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2357  major facilitator superfamily MFS_1  41.77 
 
 		 418 aa  226  8e-58  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.561235  normal  0.233215 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_02090  Major Facilitator Superfamily transporter  41.88 
 
 		 424 aa  212  1e-53  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_36730  Major Facilitator Superfamily transporter  35.44 
 
 		 446 aa  160  5e-38  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.298448 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2666  major facilitator transporter  35.73 
 
 		 412 aa  159  9e-38  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.178731  hitchhiker  0.000246371 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2483  major facilitator transporter  36.53 
 
 		 412 aa  153  7e-36  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2039  major facilitator superfamily MFS_1  39.66 
 
 		 428 aa  130  4.0000000000000003e-29  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3958  drug antiporter protein  31.34 
 
 		 418 aa  104  4e-21  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4032  H+ antiporter protein  31.34 
 
 		 418 aa  104  4e-21  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3972  H+ antiporter protein  31.05 
 
 		 418 aa  102  1e-20  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.14454  normal  0.0420605 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4461  H+ antiporter protein  28.28 
 
 		 414 aa  100  4e-20  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0135  major facilitator transporter  31.54 
 
 		 445 aa  100  6e-20  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2234  H+ antiporter protein  29.04 
 
 		 412 aa  95.5  2e-18  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0141  major facilitator transporter  32.54 
 
 		 478 aa  95.1  2e-18  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000428453 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0667  major facilitator superfamily MFS_1  28.1 
 
 		 430 aa  92.8  1e-17  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.00302666  hitchhiker  0.0000374441 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2769  major facilitator superfamily MFS_1  30.79 
 
 		 417 aa  90.5  6e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.172375  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9059  hypothetical protein  29.56 
 
 		 431 aa  80.9  0.00000000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1564  major facilitator superfamily MFS_1  30.81 
 
 		 401 aa  80.5  0.00000000000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.194805  normal  0.215005 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11284  integral membrane transport protein  28.2 
 
 		 419 aa  78.6  0.0000000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0516  major facilitator superfamily MFS_1  27.51 
 
 		 420 aa  76.6  0.0000000000008  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0543  major facilitator superfamily MFS_1  30.94 
 
 		 448 aa  76.3  0.000000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2318  macrolide-efflux protein  24.72 
 
 		 408 aa  75.5  0.000000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.31097  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2355  macrolide-efflux protein  24.44 
 
 		 408 aa  74.3  0.000000000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000199839  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4370  transporter, major facilitator family  23.84 
 
 		 410 aa  74.3  0.000000000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  5.0052999999999995e-22 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8802  major facilitator superfamily MFS_1  27.36 
 
 		 405 aa  73.9  0.000000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.953446 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2582  permease, putative  23.88 
 
 		 408 aa  73.6  0.000000000007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1568  major facilitator transporter  19.35 
 
 		 405 aa  73.2  0.000000000008  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1600  major facilitator transporter  19.35 
 
 		 405 aa  73.2  0.000000000008  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2402  permease  24.65 
 
 		 408 aa  72.8  0.00000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0859078  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2577  permease  24.65 
 
 		 408 aa  72.8  0.00000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.659755  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2631  putative permease  24.8 
 
 		 408 aa  69.7  0.00000000008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0615976  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2589  putative permease  23.5 
 
 		 408 aa  69.3  0.0000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.59543e-18 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2420  major facilitator transporter  28.73 
 
 		 417 aa  68.6  0.0000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.13347  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_27630  arabinose efflux permease family protein  27.81 
 
 		 417 aa  68.2  0.0000000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3025  permease  23.42 
 
 		 419 aa  67.4  0.0000000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3258  permease  23.42 
 
 		 419 aa  67.4  0.0000000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3061  major facilitator superfamily MFS_1  26.63 
 
 		 429 aa  66.6  0.0000000008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  decreased coverage  0.00310805  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3010  macrolide-efflux protein  23.14 
 
 		 419 aa  66.2  0.000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3276  putative permease  23.14 
 
 		 419 aa  66.2  0.000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.550677  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_09700  Major Facilitator Superfamily transporter  28.01 
 
 		 469 aa  65.5  0.000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.854337  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3270  permease, putative  22.87 
 
 		 419 aa  65.1  0.000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.719917  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2947  macrolide-efflux protein  22.65 
 
 		 419 aa  64.3  0.000000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0495728  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6327  major facilitator transporter  28.62 
 
 		 461 aa  64.3  0.000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.400788 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4491  major facilitator superfamily MFS_1  27.8 
 
 		 423 aa  63.5  0.000000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.783622  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1747  major facilitator superfamily MFS_1  29.07 
 
 		 463 aa  63.2  0.000000009  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.192343  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4269  major facilitator transporter  28.52 
 
 		 436 aa  62.8  0.00000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.935574 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2974  major facilitator transporter  22.04 
 
 		 419 aa  62  0.00000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.109464  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3246  putative permease  22.07 
 
 		 419 aa  60.8  0.00000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3365  major facilitator superfamily protein  30.3 
 
 		 424 aa  60.1  0.00000007  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0369  major facilitator transporter  19.31 
 
 		 418 aa  59.3  0.0000001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.616869  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2072  major facilitator transporter  27.81 
 
 		 417 aa  58.5  0.0000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.205391  normal  0.200266 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1539  major facilitator transporter  20.59 
 
 		 412 aa  58.5  0.0000002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  unclonable  0.000000151531  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1327  major facilitator superfamily MFS_1  26.22 
 
 		 433 aa  58.5  0.0000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3679  major facilitator superfamily MFS_1  27.86 
 
 		 410 aa  58.2  0.0000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.709991  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1536  major facilitator transporter  20.75 
 
 		 406 aa  57.8  0.0000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.29974  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0062  putative membrane transport protein  29.78 
 
 		 418 aa  57.8  0.0000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.640827  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2514  major facilitator superfamily MFS_1  24.07 
 
 		 439 aa  57.8  0.0000004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0504  major facilitator family transporter  19.86 
 
 		 410 aa  57  0.0000006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.280977  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0189  major facilitator superfamily MFS_1  23.59 
 
 		 426 aa  57  0.0000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0572831  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0056  major facilitator superfamily MFS_1  24.73 
 
 		 433 aa  56.6  0.0000007  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4868  major facilitator family transporter  20.5 
 
 		 410 aa  56.6  0.0000008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0367  sugar transporter  20.4 
 
 		 410 aa  56.2  0.0000009  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000621781  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2679  major facilitator superfamily MFS_1  28.07 
 
 		 453 aa  56.2  0.000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.000000322743  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0376  major facilitator family transporter  20.25 
 
 		 410 aa  55.1  0.000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.118082  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0053  transporter, putative  26.07 
 
 		 431 aa  55.5  0.000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0390  major facilitator family transporter  20.25 
 
 		 410 aa  55.1  0.000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2303  major facilitator transporter  27.49 
 
 		 435 aa  55.5  0.000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.533597  normal  0.893433 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0434  major facilitator family transporter  20.25 
 
 		 410 aa  55.5  0.000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2972  major facilitator transporter  26.13 
 
 		 415 aa  55.1  0.000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0062  major facilitator superfamily MFS_1  24.81 
 
 		 440 aa  55.1  0.000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.175422  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3596  major facilitator superfamily MFS_1  26.3 
 
 		 417 aa  55.8  0.000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3575  major facilitator superfamily MFS_1  31.6 
 
 		 416 aa  54.7  0.000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0456  major facilitator family transporter  21.21 
 
 		 410 aa  54.7  0.000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0890515  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0476  major facilitator transporter  26.63 
 
 		 474 aa  54.3  0.000004  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3442  major facilitator superfamily MFS_1  25.75 
 
 		 440 aa  54.3  0.000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0102132  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1505  permease; multidrug resistance protein  19.85 
 
 		 406 aa  53.9  0.000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0948022  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2854  hypothetical protein  28.17 
 
 		 452 aa  53.9  0.000005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1861  major facilitator transporter  26.55 
 
 		 413 aa  53.9  0.000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0051281 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0365  major facilitator transporter  30.22 
 
 		 427 aa  53.9  0.000005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0592694 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0371  major facilitator transporter  19.75 
 
 		 405 aa  53.9  0.000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0786  major facilitator transporter  20.26 
 
 		 403 aa  53.9  0.000005  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.104451  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1531  hypothetical protein  19.85 
 
 		 406 aa  53.5  0.000006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1650  hypothetical protein  19.85 
 
 		 406 aa  53.5  0.000006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3471  major facilitator transporter  24.81 
 
 		 419 aa  53.5  0.000007  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_25090  Major facilitator superfamily transporter  26.32 
 
 		 411 aa  53.5  0.000007  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1496  permease  20.38 
 
 		 408 aa  53.1  0.000009  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1559  major facilitator transporter  20.17 
 
 		 412 aa  53.1  0.000009  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.00000341731  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6664  major facilitator transporter  28.07 
 
 		 414 aa  53.1  0.000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.740991 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0504  major facilitator family transporter  21.16 
 
 		 410 aa  53.1  0.000009  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5406  major facilitator superfamily MFS_1  28.95 
 
 		 444 aa  52.8  0.00001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.283217 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1717  hypothetical protein  20.97 
 
 		 387 aa  52.8  0.00001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0427  transporter, putative  18.66 
 
 		 412 aa  52.8  0.00001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2475  major facilitator superfamily MFS_1  27.62 
 
 		 494 aa  52.4  0.00002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.495662  normal  0.811847 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6250  major facilitator superfamily MFS_1  26.76 
 
 		 433 aa  51.6  0.00002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.220883  normal  0.159364 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0732  major facilitator superfamily MFS_1  24 
 
 		 412 aa  52.4  0.00002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.000169813  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1380  major facilitator superfamily MFS_1  28 
 
 		 401 aa  52.4  0.00002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.185265  hitchhiker  0.00924404 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8013  major facilitator transporter  27.04 
 
 		 408 aa  52.4  0.00002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0684  major facilitator transporter  24.19 
 
 		 412 aa  52.4  0.00002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00476606  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>