More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg_2680 on replicon NC_012850
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012850  Rleg_2680  major facilitator superfamily MFS_1  100 
 
 
414 aa  793    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2357  major facilitator superfamily MFS_1  85.23 
 
 
418 aa  558  1e-158  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.561235  normal  0.233215 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_02090  Major Facilitator Superfamily transporter  48.64 
 
 
424 aa  291  2e-77  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1323  major facilitator superfamily MFS_1  43.95 
 
 
429 aa  287  2e-76  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.107888  normal  0.120407 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5018  major facilitator superfamily MFS_1  42.86 
 
 
422 aa  218  1e-55  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_36730  Major Facilitator Superfamily transporter  36.21 
 
 
446 aa  189  1e-46  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.298448 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2666  major facilitator transporter  34.52 
 
 
412 aa  178  2e-43  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.178731  hitchhiker  0.000246371 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2039  major facilitator superfamily MFS_1  37.8 
 
 
428 aa  176  6e-43  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2483  major facilitator transporter  35.1 
 
 
412 aa  174  2.9999999999999996e-42  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2769  major facilitator superfamily MFS_1  30.12 
 
 
417 aa  113  6e-24  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.172375  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4461  H+ antiporter protein  28.81 
 
 
414 aa  112  1.0000000000000001e-23  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0141  major facilitator transporter  31.51 
 
 
478 aa  111  3e-23  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000428453 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0135  major facilitator transporter  30.07 
 
 
445 aa  109  8.000000000000001e-23  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2234  H+ antiporter protein  28.3 
 
 
412 aa  104  3e-21  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2582  permease, putative  27.3 
 
 
408 aa  103  7e-21  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3958  drug antiporter protein  29.6 
 
 
418 aa  101  2e-20  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4032  H+ antiporter protein  29.6 
 
 
418 aa  101  2e-20  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3972  H+ antiporter protein  29.6 
 
 
418 aa  100  3e-20  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.14454  normal  0.0420605 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1564  major facilitator superfamily MFS_1  31.97 
 
 
401 aa  99  1e-19  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.194805  normal  0.215005 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0087  major facilitator transporter  24.62 
 
 
436 aa  98.6  2e-19  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11284  integral membrane transport protein  30.28 
 
 
419 aa  98.6  2e-19  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0062  major facilitator superfamily MFS_1  25.25 
 
 
440 aa  98.2  3e-19  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.175422  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0091  major facilitator superfamily MFS_1  24.74 
 
 
442 aa  96.7  8e-19  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2631  putative permease  27.3 
 
 
408 aa  96.3  8e-19  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0615976  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2355  macrolide-efflux protein  25.27 
 
 
408 aa  95.5  2e-18  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000199839  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0667  major facilitator superfamily MFS_1  27.38 
 
 
430 aa  94.7  3e-18  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.00302666  hitchhiker  0.0000374441 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2318  macrolide-efflux protein  26.18 
 
 
408 aa  94  5e-18  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.31097  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2589  putative permease  26.58 
 
 
408 aa  93.2  8e-18  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.59543e-18 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2402  permease  25 
 
 
408 aa  92  2e-17  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0859078  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2577  permease  25 
 
 
408 aa  92  2e-17  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.659755  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1491  major facilitator transporter  22.58 
 
 
390 aa  90.5  4e-17  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.326017  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1445  major facilitator transporter  22.58 
 
 
390 aa  90.5  4e-17  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00616907  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1284  major facilitator superfamily MFS_1  25.71 
 
 
431 aa  87.8  3e-16  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2627  major facilitator transporter  26.33 
 
 
410 aa  86.3  9e-16  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1281  major facilitator transporter  20.24 
 
 
413 aa  85.9  0.000000000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.835892  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0684  major facilitator transporter  24.63 
 
 
412 aa  85.1  0.000000000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00476606  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0543  major facilitator superfamily MFS_1  33.47 
 
 
448 aa  84.7  0.000000000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6250  major facilitator superfamily MFS_1  27.87 
 
 
433 aa  83.2  0.000000000000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.220883  normal  0.159364 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_09700  Major Facilitator Superfamily transporter  29.97 
 
 
469 aa  81.3  0.00000000000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.854337  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4269  major facilitator transporter  26.67 
 
 
436 aa  80.9  0.00000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.935574 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7785  major facilitator superfamily MFS_1  27.96 
 
 
420 aa  80.9  0.00000000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.157303 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2420  major facilitator transporter  28.19 
 
 
417 aa  80.9  0.00000000000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.13347  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0029  major facilitator superfamily MFS_1  26.97 
 
 
407 aa  79.7  0.00000000000008  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0427  transporter, putative  21.59 
 
 
412 aa  79.7  0.00000000000009  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3756  major facilitator superfamily MFS_1  22.6 
 
 
409 aa  79  0.0000000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4491  major facilitator superfamily MFS_1  26.54 
 
 
423 aa  78.2  0.0000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.783622  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0593  major facilitator transporter  25.38 
 
 
413 aa  79  0.0000000000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.00370301  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1272  major facilitator transporter  23.33 
 
 
418 aa  78.6  0.0000000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0578  major facilitator transporter  25.38 
 
 
413 aa  79  0.0000000000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0133344  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2206  major facilitator transporter  26.68 
 
 
447 aa  77.4  0.0000000000005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0056  major facilitator superfamily MFS_1  24.07 
 
 
433 aa  77  0.0000000000006  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3952  major facilitator transporter  26.63 
 
 
413 aa  77  0.0000000000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1193  major facilitator superfamily MFS_1  26.04 
 
 
412 aa  76.3  0.0000000000009  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5208  major facilitator superfamily MFS_1  27.07 
 
 
432 aa  76.3  0.000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.377398  normal  0.900425 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21930  major facilitator superfamily MFS_1  24.68 
 
 
432 aa  75.5  0.000000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0732  major facilitator superfamily MFS_1  23.98 
 
 
412 aa  75.5  0.000000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.000169813  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1000  hypothetical protein  24.82 
 
 
418 aa  75.1  0.000000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00447157 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3270  permease, putative  24.35 
 
 
419 aa  74.3  0.000000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.719917  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0395  permease  22.2 
 
 
430 aa  74.7  0.000000000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0177527  normal  0.113221 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1684  transporter  25.24 
 
 
420 aa  74.3  0.000000000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1819  transporter  25.24 
 
 
420 aa  74.3  0.000000000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000952932  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2947  macrolide-efflux protein  24.08 
 
 
419 aa  73.6  0.000000000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0495728  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1532  major facilitator transporter  24.29 
 
 
423 aa  73.6  0.000000000006  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.68199  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1864  putative transporter  25.24 
 
 
420 aa  73.2  0.000000000007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.42079e-47 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3276  putative permease  23.36 
 
 
419 aa  72.4  0.00000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.550677  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3010  macrolide-efflux protein  23.36 
 
 
419 aa  72.4  0.00000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3626  major facilitator transporter  24.46 
 
 
413 aa  71.6  0.00000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.348332  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0476  major facilitator transporter  24.87 
 
 
474 aa  72  0.00000000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0701  major facilitator superfamily MFS_1  23.53 
 
 
423 aa  72.4  0.00000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0516  major facilitator superfamily MFS_1  25.85 
 
 
420 aa  71.6  0.00000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1827  putative transporter  25.12 
 
 
420 aa  71.2  0.00000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6664  major facilitator transporter  27.42 
 
 
414 aa  71.6  0.00000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.740991 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3025  permease  24.08 
 
 
419 aa  70.9  0.00000000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3258  permease  24.08 
 
 
419 aa  70.9  0.00000000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1508  major facilitator superfamily permease  21.43 
 
 
403 aa  70.9  0.00000000004  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3871  major facilitator superfamily MFS_1  25.38 
 
 
433 aa  70.5  0.00000000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0205552  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3515  putative transporter  25.07 
 
 
420 aa  70.5  0.00000000006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1630  transporter  24.76 
 
 
420 aa  70.1  0.00000000007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1600  major facilitator transporter  19.59 
 
 
405 aa  70.1  0.00000000007  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1568  major facilitator transporter  19.59 
 
 
405 aa  70.1  0.00000000007  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2303  major facilitator transporter  25.58 
 
 
435 aa  69.7  0.00000000008  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.533597  normal  0.893433 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1892  transporter, putative  24.28 
 
 
420 aa  69.7  0.0000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0166254  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9059  hypothetical protein  31.3 
 
 
431 aa  69.3  0.0000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0968  major facilitator superfamily MFS_1  24.69 
 
 
432 aa  69.3  0.0000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.896564  normal  0.510346 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3596  major facilitator superfamily MFS_1  27.2 
 
 
417 aa  68.6  0.0000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1250  major facilitator transporter  26.21 
 
 
425 aa  68.6  0.0000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1940  putative transporter  24.76 
 
 
420 aa  68.9  0.0000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000531086  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3246  putative permease  23.88 
 
 
419 aa  68.6  0.0000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3679  major facilitator superfamily MFS_1  26.7 
 
 
410 aa  68.2  0.0000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.709991  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_2010  transporter, putative  23.33 
 
 
429 aa  67.8  0.0000000003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2974  major facilitator transporter  22.81 
 
 
419 aa  67.8  0.0000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.109464  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1224  major facilitator superfamily MFS_1  23.95 
 
 
440 aa  68.2  0.0000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_05410  arabinose efflux permease family protein  25.66 
 
 
429 aa  68.2  0.0000000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0915887  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5814  major facilitator superfamily MFS_1  22.57 
 
 
423 aa  67.8  0.0000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.915234  hitchhiker  0.00491963 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4378  major facilitator transporter  26.87 
 
 
431 aa  67.4  0.0000000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4101  major facilitator superfamily MFS_1  25.49 
 
 
432 aa  67.4  0.0000000005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.438153 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2384  major facilitator transporter  24.57 
 
 
441 aa  67  0.0000000006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.930234  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1114  major facilitator superfamily MFS_1  23.48 
 
 
415 aa  66.6  0.0000000007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3035  MFS family transporter  26.04 
 
 
425 aa  66.6  0.0000000008  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3037  major facilitator superfamily MFS_1  24.73 
 
 
421 aa  66.6  0.0000000008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>