More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Snas_1323 on replicon NC_013947
Organism: Stackebrandtia nassauensis DSM 44728



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013947  Snas_1323  major facilitator superfamily MFS_1  100 
 
 
429 aa  827    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.107888  normal  0.120407 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_02090  Major Facilitator Superfamily transporter  42.43 
 
 
424 aa  274  3e-72  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2680  major facilitator superfamily MFS_1  44.1 
 
 
414 aa  246  4e-64  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2357  major facilitator superfamily MFS_1  43.2 
 
 
418 aa  242  7.999999999999999e-63  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.561235  normal  0.233215 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5018  major facilitator superfamily MFS_1  44.22 
 
 
422 aa  234  2.0000000000000002e-60  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_36730  Major Facilitator Superfamily transporter  33.17 
 
 
446 aa  167  4e-40  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.298448 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2039  major facilitator superfamily MFS_1  34.87 
 
 
428 aa  159  7e-38  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2666  major facilitator transporter  30.68 
 
 
412 aa  151  2e-35  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.178731  hitchhiker  0.000246371 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2483  major facilitator transporter  31.25 
 
 
412 aa  142  9.999999999999999e-33  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4461  H+ antiporter protein  31.46 
 
 
414 aa  127  5e-28  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2420  major facilitator transporter  32.14 
 
 
417 aa  119  9.999999999999999e-26  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.13347  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0135  major facilitator transporter  33.67 
 
 
445 aa  117  3.9999999999999997e-25  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3958  drug antiporter protein  29.93 
 
 
418 aa  113  6e-24  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4032  H+ antiporter protein  29.93 
 
 
418 aa  113  6e-24  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3972  H+ antiporter protein  29.93 
 
 
418 aa  112  9e-24  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.14454  normal  0.0420605 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0141  major facilitator transporter  34.62 
 
 
478 aa  110  4.0000000000000004e-23  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000428453 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2234  H+ antiporter protein  28.86 
 
 
412 aa  107  3e-22  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0667  major facilitator superfamily MFS_1  27.54 
 
 
430 aa  102  2e-20  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.00302666  hitchhiker  0.0000374441 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_09700  Major Facilitator Superfamily transporter  31.55 
 
 
469 aa  101  2e-20  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.854337  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2769  major facilitator superfamily MFS_1  29.72 
 
 
417 aa  102  2e-20  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.172375  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2318  macrolide-efflux protein  23.92 
 
 
408 aa  93.2  7e-18  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.31097  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2582  permease, putative  24.21 
 
 
408 aa  93.2  8e-18  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2355  macrolide-efflux protein  23.63 
 
 
408 aa  91.3  3e-17  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000199839  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2402  permease  23.63 
 
 
408 aa  90.5  5e-17  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0859078  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2577  permease  23.63 
 
 
408 aa  90.5  5e-17  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.659755  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2631  putative permease  24.71 
 
 
408 aa  90.1  6e-17  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0615976  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2589  putative permease  23.63 
 
 
408 aa  90.1  8e-17  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.59543e-18 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1564  major facilitator superfamily MFS_1  30.79 
 
 
401 aa  89.7  8e-17  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.194805  normal  0.215005 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0516  major facilitator superfamily MFS_1  27.38 
 
 
420 aa  89.7  9e-17  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11284  integral membrane transport protein  29.59 
 
 
419 aa  88.6  2e-16  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4370  transporter, major facilitator family  25.13 
 
 
410 aa  87.8  3e-16  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  5.0052999999999995e-22 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0427  transporter, putative  23.82 
 
 
412 aa  85.5  0.000000000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0365  major facilitator transporter  28.05 
 
 
427 aa  81.3  0.00000000000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0592694 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0786  major facilitator transporter  22.86 
 
 
403 aa  80.9  0.00000000000004  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.104451  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4269  major facilitator transporter  27.71 
 
 
436 aa  80.9  0.00000000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.935574 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0062  major facilitator superfamily MFS_1  24.38 
 
 
440 aa  79.3  0.0000000000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.175422  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3270  permease, putative  23.02 
 
 
419 aa  78.2  0.0000000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.719917  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2947  macrolide-efflux protein  23.02 
 
 
419 aa  75.9  0.000000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0495728  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3010  macrolide-efflux protein  22.74 
 
 
419 aa  74.7  0.000000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3276  putative permease  22.74 
 
 
419 aa  74.7  0.000000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.550677  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3025  permease  22.52 
 
 
419 aa  73.9  0.000000000006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3258  permease  22.52 
 
 
419 aa  73.9  0.000000000006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7785  major facilitator superfamily MFS_1  25.9 
 
 
420 aa  72.4  0.00000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.157303 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1600  major facilitator transporter  18.58 
 
 
405 aa  71.6  0.00000000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1568  major facilitator transporter  18.58 
 
 
405 aa  71.6  0.00000000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0091  major facilitator superfamily MFS_1  26.82 
 
 
442 aa  70.5  0.00000000006  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1284  major facilitator superfamily MFS_1  26.01 
 
 
431 aa  70.5  0.00000000006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3246  putative permease  22.55 
 
 
419 aa  70.1  0.00000000008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0087  major facilitator transporter  23.43 
 
 
436 aa  68.6  0.0000000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1904  amino acid adenylation domain-containing protein  22.68 
 
 
1833 aa  68.9  0.0000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.844763  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0598  major facilitator transporter  24.61 
 
 
427 aa  67.8  0.0000000004  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  unclonable  0.00000000170409  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2647  major facilitator transporter  28.19 
 
 
524 aa  67.4  0.0000000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11210  major facilitator superfamily MFS_1  25.1 
 
 
433 aa  67.4  0.0000000004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3926  major facilitator transporter  26.65 
 
 
457 aa  67.8  0.0000000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1536  major facilitator transporter  23.53 
 
 
406 aa  67.4  0.0000000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.29974  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1445  major facilitator transporter  20.66 
 
 
390 aa  67  0.0000000006  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00616907  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1491  major facilitator transporter  20.66 
 
 
390 aa  67  0.0000000006  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.326017  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2974  major facilitator transporter  23.15 
 
 
419 aa  65.9  0.000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.109464  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1684  transporter  23.68 
 
 
420 aa  65.9  0.000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1819  transporter  23.68 
 
 
420 aa  65.9  0.000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000952932  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1864  putative transporter  23.68 
 
 
420 aa  65.5  0.000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.42079e-47 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0684  major facilitator transporter  23.31 
 
 
412 aa  64.3  0.000000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00476606  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1630  transporter  23.16 
 
 
420 aa  64.7  0.000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8013  major facilitator transporter  27.82 
 
 
408 aa  64.7  0.000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1572  major facilitator transporter  25 
 
 
415 aa  64.3  0.000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.58248  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5006  major facilitator transporter  28.76 
 
 
416 aa  64.3  0.000000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.641572  normal 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1813  major facilitator superfamily permease  23.61 
 
 
410 aa  64.3  0.000000004  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0476  major facilitator transporter  25.69 
 
 
474 aa  63.9  0.000000005  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3246  permease, putative  19.95 
 
 
417 aa  63.9  0.000000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0277963  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3573  major facilitator transporter  28.07 
 
 
416 aa  63.9  0.000000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1380  major facilitator superfamily MFS_1  26 
 
 
401 aa  63.5  0.000000006  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.185265  hitchhiker  0.00924404 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2540  major facilitator superfamily MFS_1  23.21 
 
 
430 aa  63.5  0.000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1272  major facilitator transporter  25.9 
 
 
418 aa  63.5  0.000000006  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1364  major facilitator superfamily MFS_1  27.17 
 
 
441 aa  63.5  0.000000007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.0393169 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3679  major facilitator superfamily MFS_1  27.62 
 
 
410 aa  63.2  0.000000008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.709991  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4481  major facilitator transporter  28.33 
 
 
416 aa  62.8  0.00000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.646656  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3871  major facilitator superfamily MFS_1  23.79 
 
 
433 aa  63.2  0.00000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0205552  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0369  major facilitator transporter  24.53 
 
 
418 aa  62.4  0.00000002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.616869  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2987  permease; tetracycline resistance determinant  20.21 
 
 
414 aa  62  0.00000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.105308  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1000  hypothetical protein  24.18 
 
 
418 aa  62  0.00000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00447157 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3257  tetracycline resistance determinant TetV  18.45 
 
 
414 aa  62  0.00000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.160876  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19250  major facilitator superfamily MFS_1  28.51 
 
 
444 aa  61.6  0.00000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00108172  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2102  major facilitator transporter  30.13 
 
 
427 aa  61.6  0.00000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0117925  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2733  major facilitator superfamily MFS_1  28.25 
 
 
424 aa  61.6  0.00000003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1795  hypothetical protein  23.51 
 
 
406 aa  61.2  0.00000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1738  hypothetical protein  23.23 
 
 
406 aa  61.2  0.00000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.342222  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0885  major facilitator transporter  27.43 
 
 
415 aa  61.2  0.00000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1505  permease; multidrug resistance protein  23.24 
 
 
406 aa  60.8  0.00000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0948022  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3515  putative transporter  22.73 
 
 
420 aa  60.5  0.00000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6327  major facilitator transporter  25.19 
 
 
461 aa  60.1  0.00000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.400788 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0189  major facilitator superfamily MFS_1  24.56 
 
 
426 aa  59.3  0.0000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0572831  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8802  major facilitator superfamily MFS_1  22.41 
 
 
405 aa  58.9  0.0000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.953446 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1531  hypothetical protein  23.34 
 
 
406 aa  59.3  0.0000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1496  permease  23.63 
 
 
408 aa  59.7  0.0000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1717  hypothetical protein  23.34 
 
 
387 aa  59.3  0.0000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1650  hypothetical protein  23.34 
 
 
406 aa  59.3  0.0000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1367  major facilitator family transporter  26.58 
 
 
415 aa  59.3  0.0000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1827  putative transporter  23.31 
 
 
420 aa  58.9  0.0000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2303  major facilitator transporter  23.5 
 
 
435 aa  58.9  0.0000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.533597  normal  0.893433 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4101  major facilitator superfamily MFS_1  32.11 
 
 
432 aa  57.8  0.0000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.438153 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>