More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sked_09700 on replicon NC_013521
Organism: Sanguibacter keddieii DSM 10542



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013521  Sked_09700  Major Facilitator Superfamily transporter  100 
 
 
469 aa  849    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.854337  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0667  major facilitator superfamily MFS_1  42.44 
 
 
430 aa  286  4e-76  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.00302666  hitchhiker  0.0000374441 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2420  major facilitator transporter  43.02 
 
 
417 aa  253  6e-66  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.13347  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0135  major facilitator transporter  40.34 
 
 
445 aa  189  8e-47  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4461  H+ antiporter protein  34.36 
 
 
414 aa  188  2e-46  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0141  major facilitator transporter  41.5 
 
 
478 aa  183  6e-45  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000428453 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2769  major facilitator superfamily MFS_1  35.45 
 
 
417 aa  176  9.999999999999999e-43  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.172375  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2172  major facilitator superfamily MFS_1  38.12 
 
 
478 aa  175  1.9999999999999998e-42  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.647615  hitchhiker  0.0000450319 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2234  H+ antiporter protein  33.5 
 
 
412 aa  171  2e-41  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2858  major facilitator superfamily MFS_1  39.61 
 
 
465 aa  170  5e-41  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.192123  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3958  drug antiporter protein  33.25 
 
 
418 aa  166  6.9999999999999995e-40  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4032  H+ antiporter protein  33.25 
 
 
418 aa  166  6.9999999999999995e-40  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3972  H+ antiporter protein  33 
 
 
418 aa  165  2.0000000000000002e-39  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.14454  normal  0.0420605 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_36730  Major Facilitator Superfamily transporter  36.17 
 
 
446 aa  147  4.0000000000000006e-34  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.298448 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1323  major facilitator superfamily MFS_1  30.34 
 
 
429 aa  146  9e-34  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.107888  normal  0.120407 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11284  integral membrane transport protein  32.79 
 
 
419 aa  137  3.0000000000000003e-31  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2039  major facilitator superfamily MFS_1  37.82 
 
 
428 aa  129  1.0000000000000001e-28  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1564  major facilitator superfamily MFS_1  36.75 
 
 
401 aa  129  1.0000000000000001e-28  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.194805  normal  0.215005 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2666  major facilitator transporter  30.55 
 
 
412 aa  93.2  9e-18  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.178731  hitchhiker  0.000246371 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2483  major facilitator transporter  30.47 
 
 
412 aa  91.3  4e-17  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2680  major facilitator superfamily MFS_1  28.67 
 
 
414 aa  86.3  0.000000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_02090  Major Facilitator Superfamily transporter  28.51 
 
 
424 aa  85.9  0.000000000000001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1491  major facilitator transporter  22.6 
 
 
390 aa  82.8  0.00000000000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.326017  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1445  major facilitator transporter  22.6 
 
 
390 aa  82.8  0.00000000000001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00616907  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21930  major facilitator superfamily MFS_1  22.85 
 
 
432 aa  82  0.00000000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1114  major facilitator superfamily MFS_1  22.79 
 
 
415 aa  81.6  0.00000000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2357  major facilitator superfamily MFS_1  41.48 
 
 
418 aa  81.3  0.00000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.561235  normal  0.233215 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1932  major facilitator superfamily MFS_1  25.83 
 
 
406 aa  78.2  0.0000000000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0968  major facilitator superfamily MFS_1  25.13 
 
 
432 aa  75.9  0.000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.896564  normal  0.510346 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0786  major facilitator transporter  19.77 
 
 
403 aa  74.3  0.000000000005  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.104451  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1118  major facilitator superfamily MFS_1  22.49 
 
 
406 aa  73.9  0.000000000005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2682  permease, putative  25.94 
 
 
440 aa  73.6  0.000000000008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00193571  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2667  putative permease  25.62 
 
 
412 aa  72.8  0.00000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000524828 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2720  putative permease  25 
 
 
412 aa  72  0.00000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.093304  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19250  major facilitator superfamily MFS_1  22.91 
 
 
444 aa  71.2  0.00000000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00108172  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2432  permease  25.62 
 
 
412 aa  71.6  0.00000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0771594  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2380  major facilitator transporter  25.64 
 
 
474 aa  71.6  0.00000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0389897  normal  0.03889 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2468  permease  25.62 
 
 
412 aa  70.1  0.00000000007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.000564968  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2649  permease  25.62 
 
 
412 aa  70.1  0.00000000007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.765576  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1224  major facilitator superfamily MFS_1  26.23 
 
 
440 aa  70.1  0.00000000008  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0752  transporter, putative  26.21 
 
 
446 aa  68.6  0.0000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3179  major facilitator transporter  24.42 
 
 
445 aa  68.9  0.0000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.110331 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2402  permease  23.28 
 
 
408 aa  68.2  0.0000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0859078  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2577  permease  23.28 
 
 
408 aa  68.2  0.0000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.659755  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3442  major facilitator superfamily MFS_1  24.26 
 
 
440 aa  67.8  0.0000000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0102132  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2318  macrolide-efflux protein  23.81 
 
 
408 aa  67.8  0.0000000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.31097  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3486  major facilitator transporter  28.61 
 
 
450 aa  67.8  0.0000000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.719238  normal 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5018  major facilitator superfamily MFS_1  28.69 
 
 
422 aa  67.8  0.0000000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4102  major facilitator transporter  26.1 
 
 
438 aa  67.4  0.0000000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.277859  normal  0.56542 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1607  permease  23.65 
 
 
422 aa  67  0.0000000006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.137367  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2487  major facilitator transporter  22.43 
 
 
412 aa  67  0.0000000006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000357828  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1731  permease  23.65 
 
 
422 aa  67  0.0000000006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0365  major facilitator transporter  27.25 
 
 
427 aa  66.6  0.0000000009  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0592694 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1568  multidrug resistance protein; tetracycline resistance determinant  23.89 
 
 
422 aa  65.9  0.000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.766892  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1748  multidrug resistance protein; tetracycline resistance determinant  22.76 
 
 
406 aa  66.2  0.000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000069396  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2355  macrolide-efflux protein  23.82 
 
 
408 aa  65.9  0.000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000199839  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2393  permease; macrolide-efflux protein  25 
 
 
412 aa  66.2  0.000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.366369  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1600  major facilitator transporter  22.53 
 
 
405 aa  66.2  0.000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1607  major facilitator transporter  22.28 
 
 
422 aa  65.9  0.000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0422221  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1568  major facilitator transporter  22.53 
 
 
405 aa  66.2  0.000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2582  permease, putative  21.6 
 
 
408 aa  65.9  0.000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2647  major facilitator transporter  30.07 
 
 
524 aa  65.5  0.000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2631  putative permease  23.33 
 
 
408 aa  65.9  0.000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0615976  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1942  multidrug resistance protein; putative tetracycline resistance determinant  22.51 
 
 
406 aa  65.9  0.000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.0213e-35 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_25090  Major facilitator superfamily transporter  27.25 
 
 
411 aa  65.1  0.000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2589  putative permease  23.33 
 
 
408 aa  64.7  0.000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.59543e-18 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3365  major facilitator superfamily protein  30.33 
 
 
424 aa  65.1  0.000000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1795  hypothetical protein  22.16 
 
 
406 aa  64.3  0.000000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1904  amino acid adenylation domain-containing protein  20.95 
 
 
1833 aa  63.9  0.000000005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.844763  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1738  hypothetical protein  21.62 
 
 
406 aa  63.9  0.000000006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.342222  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1782  putative permease  23.15 
 
 
422 aa  63.9  0.000000006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1559  multidrug resistance protein; tetracycline resistance determinant  23.15 
 
 
422 aa  63.9  0.000000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.285528  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2302  major facilitator superfamily MFS_1  28.13 
 
 
390 aa  63.5  0.000000008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.0000026904  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1250  major facilitator transporter  25.35 
 
 
425 aa  62.8  0.00000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2729  putative permease  22.79 
 
 
434 aa  63.2  0.00000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0743225  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1536  major facilitator transporter  21.11 
 
 
406 aa  62.4  0.00000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.29974  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1572  major facilitator transporter  28.69 
 
 
415 aa  63.2  0.00000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.58248  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0532  major facilitator superfamily MFS_1  26.91 
 
 
428 aa  63.2  0.00000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1808  permease, putative  22.3 
 
 
422 aa  62  0.00000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1531  hypothetical protein  22.63 
 
 
406 aa  62  0.00000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1496  permease  21.62 
 
 
408 aa  62  0.00000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2024  major facilitator superfamily MFS_1  22.95 
 
 
419 aa  62  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1650  hypothetical protein  22.63 
 
 
406 aa  62  0.00000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1398  major facilitator transporter  22.56 
 
 
422 aa  61.6  0.00000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.902897  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1517  major facilitator superfamily MFS_1  22.11 
 
 
412 aa  61.6  0.00000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.5366 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0658  permease of the major facilitator superfamily  27.02 
 
 
485 aa  60.8  0.00000005  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.590518  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1381  major facilitator superfamily MFS_1  22.76 
 
 
407 aa  60.8  0.00000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000258845  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1505  permease; multidrug resistance protein  21.65 
 
 
406 aa  60.8  0.00000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0948022  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1515  major facilitator superfamily MFS_1  25.87 
 
 
416 aa  60.8  0.00000005  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000845442 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11210  major facilitator superfamily MFS_1  23.16 
 
 
433 aa  60.5  0.00000006  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6539  major facilitator superfamily MFS_1  31.58 
 
 
415 aa  60.5  0.00000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.6945  normal  0.0125799 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2534  major facilitator superfamily MFS_1  25.79 
 
 
410 aa  60.5  0.00000007  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1532  major facilitator transporter  21.84 
 
 
423 aa  60.1  0.00000008  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.68199  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3756  major facilitator superfamily MFS_1  25.93 
 
 
409 aa  60.1  0.00000008  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4378  major facilitator transporter  30.74 
 
 
431 aa  60.1  0.00000009  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3270  permease, putative  23.42 
 
 
419 aa  59.7  0.0000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.719917  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3025  permease  23.71 
 
 
419 aa  59.7  0.0000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2947  macrolide-efflux protein  24.01 
 
 
419 aa  59.7  0.0000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0495728  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3258  permease  23.71 
 
 
419 aa  59.7  0.0000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1862  putative permease  22.72 
 
 
422 aa  59.7  0.0000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>