More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Krad_2039 on replicon NC_009664
Organism: Kineococcus radiotolerans SRS30216



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009664  Krad_2039  major facilitator superfamily MFS_1  100 
 
 		 428 aa  787    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_36730  Major Facilitator Superfamily transporter  52.02 
 
 		 446 aa  332  9e-90  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.298448 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_02090  Major Facilitator Superfamily transporter  40.14 
 
 		 424 aa  210  3e-53  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1323  major facilitator superfamily MFS_1  35.19 
 
 		 429 aa  201  1.9999999999999998e-50  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.107888  normal  0.120407 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2680  major facilitator superfamily MFS_1  37.8 
 
 		 414 aa  190  4e-47  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2357  major facilitator superfamily MFS_1  39.8 
 
 		 418 aa  173  5e-42  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.561235  normal  0.233215 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2666  major facilitator transporter  34.5 
 
 		 412 aa  150  4e-35  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.178731  hitchhiker  0.000246371 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5018  major facilitator superfamily MFS_1  40.52 
 
 		 422 aa  144  4e-33  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_09700  Major Facilitator Superfamily transporter  37.53 
 
 		 469 aa  142  9e-33  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.854337  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2483  major facilitator transporter  34.14 
 
 		 412 aa  141  3e-32  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2234  H+ antiporter protein  30.33 
 
 		 412 aa  135  9.999999999999999e-31  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4461  H+ antiporter protein  31.29 
 
 		 414 aa  132  9e-30  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3958  drug antiporter protein  32.26 
 
 		 418 aa  126  8.000000000000001e-28  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4032  H+ antiporter protein  32.26 
 
 		 418 aa  126  8.000000000000001e-28  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3972  H+ antiporter protein  32.26 
 
 		 418 aa  126  9e-28  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.14454  normal  0.0420605 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2769  major facilitator superfamily MFS_1  34.33 
 
 		 417 aa  125  2e-27  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.172375  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0135  major facilitator transporter  36.28 
 
 		 445 aa  118  1.9999999999999998e-25  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1564  major facilitator superfamily MFS_1  36.29 
 
 		 401 aa  113  8.000000000000001e-24  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.194805  normal  0.215005 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0141  major facilitator transporter  35.03 
 
 		 478 aa  111  2.0000000000000002e-23  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000428453 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0667  major facilitator superfamily MFS_1  30.91 
 
 		 430 aa  108  2e-22  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.00302666  hitchhiker  0.0000374441 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0684  major facilitator transporter  28.15 
 
 		 412 aa  99  2e-19  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00476606  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2420  major facilitator transporter  29.78 
 
 		 417 aa  95.9  1e-18  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.13347  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11284  integral membrane transport protein  29.38 
 
 		 419 aa  95.5  2e-18  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3365  major facilitator superfamily protein  30.62 
 
 		 424 aa  86.7  8e-16  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0476  major facilitator transporter  30.45 
 
 		 474 aa  85.1  0.000000000000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1932  major facilitator superfamily MFS_1  27.13 
 
 		 406 aa  83.6  0.000000000000007  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2402  permease  25.2 
 
 		 408 aa  81.6  0.00000000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0859078  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2577  permease  25.2 
 
 		 408 aa  81.6  0.00000000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.659755  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9059  hypothetical protein  29.29 
 
 		 431 aa  82  0.00000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1568  major facilitator transporter  19.57 
 
 		 405 aa  81.3  0.00000000000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1600  major facilitator transporter  19.57 
 
 		 405 aa  81.3  0.00000000000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2355  macrolide-efflux protein  24.87 
 
 		 408 aa  80.9  0.00000000000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000199839  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8887  hypothetical protein  29.63 
 
 		 413 aa  80.1  0.00000000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.889317 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2318  macrolide-efflux protein  24.73 
 
 		 408 aa  80.1  0.00000000000008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.31097  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2582  permease, putative  24.47 
 
 		 408 aa  79  0.0000000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2589  putative permease  24.93 
 
 		 408 aa  78.6  0.0000000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.59543e-18 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0543  major facilitator superfamily MFS_1  31.19 
 
 		 448 aa  77.8  0.0000000000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2631  putative permease  24.18 
 
 		 408 aa  75.9  0.000000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0615976  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0208  major facilitator superfamily MFS_1  22.11 
 
 		 433 aa  76.3  0.000000000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6215  major facilitator superfamily MFS_1  32.01 
 
 		 404 aa  75.5  0.000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0532982  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1974  hypothetical protein  24.76 
 
 		 424 aa  74.7  0.000000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.00936884  normal  0.989231 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1662  major facilitator superfamily MFS_1  21.01 
 
 		 405 aa  74.7  0.000000000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2326  major facilitator superfamily MFS_1  23.43 
 
 		 410 aa  74.3  0.000000000004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4378  major facilitator transporter  28.44 
 
 		 431 aa  73.6  0.000000000007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1613  major facilitator superfamily MFS_1  25.1 
 
 		 418 aa  72  0.00000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000260989  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5212  major facilitator superfamily MFS_1  27.39 
 
 		 408 aa  71.2  0.00000000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0948922  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2953  major facilitator superfamily MFS_1  30.14 
 
 		 413 aa  70.9  0.00000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0279289  hitchhiker  0.000525778 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2384  major facilitator transporter  27.86 
 
 		 441 aa  70.9  0.00000000005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.930234  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0369  major facilitator transporter  23.08 
 
 		 418 aa  70.5  0.00000000005  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.616869  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1864  putative transporter  24.01 
 
 		 420 aa  69.7  0.0000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.42079e-47 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1532  major facilitator transporter  23.1 
 
 		 423 aa  69.7  0.0000000001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.68199  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0356  major facilitator superfamily MFS_1  33.16 
 
 		 407 aa  68.6  0.0000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0427  transporter, putative  24.13 
 
 		 412 aa  68.9  0.0000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1940  putative transporter  23.69 
 
 		 420 aa  68.6  0.0000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000531086  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3679  major facilitator superfamily MFS_1  30.61 
 
 		 410 aa  68.6  0.0000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.709991  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0968  major facilitator superfamily MFS_1  26.14 
 
 		 432 aa  68.9  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.896564  normal  0.510346 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1702  major facilitator superfamily MFS_1  27.74 
 
 		 438 aa  68.6  0.0000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.101015  normal  0.0466104 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1486  major facilitator transporter  25.23 
 
 		 420 aa  68.2  0.0000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.467645  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1684  transporter  23.76 
 
 		 420 aa  68.2  0.0000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1819  transporter  23.76 
 
 		 420 aa  68.2  0.0000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000952932  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5814  major facilitator superfamily MFS_1  23.98 
 
 		 423 aa  67.8  0.0000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.915234  hitchhiker  0.00491963 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2947  macrolide-efflux protein  22.74 
 
 		 419 aa  67.4  0.0000000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0495728  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6539  major facilitator superfamily MFS_1  30.14 
 
 		 415 aa  67.4  0.0000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.6945  normal  0.0125799 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3061  major facilitator superfamily MFS_1  25.91 
 
 		 429 aa  67.8  0.0000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  decreased coverage  0.00310805  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0258  major facilitator superfamily MFS_1  27.87 
 
 		 451 aa  67.4  0.0000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.305305 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0297  major facilitator superfamily MFS_1  32.79 
 
 		 423 aa  67.4  0.0000000005  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.0210722  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3575  major facilitator superfamily MFS_1  29.09 
 
 		 416 aa  67.4  0.0000000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1892  transporter, putative  24.26 
 
 		 420 aa  67  0.0000000006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0166254  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1381  major facilitator superfamily MFS_1  22.41 
 
 		 407 aa  67  0.0000000006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000258845  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1224  major facilitator superfamily MFS_1  26.42 
 
 		 440 aa  67  0.0000000006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0365  major facilitator transporter  29.47 
 
 		 427 aa  67  0.0000000006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0592694 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0990  major facilitator transporter  28.62 
 
 		 414 aa  66.6  0.0000000008  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  hitchhiker  0.00457828  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3270  permease, putative  23.04 
 
 		 419 aa  66.2  0.000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.719917  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3010  macrolide-efflux protein  23.4 
 
 		 419 aa  66.2  0.000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2956  major facilitator superfamily MFS_1  31.14 
 
 		 412 aa  66.2  0.000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000194659 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3276  putative permease  23.4 
 
 		 419 aa  66.2  0.000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.550677  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1620  major facilitator superfamily MFS_1  22.61 
 
 		 417 aa  66.2  0.000000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2754  major facilitator superfamily MFS_1  28.68 
 
 		 453 aa  65.9  0.000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.192829  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1491  major facilitator transporter  21.25 
 
 		 390 aa  65.1  0.000000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.326017  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3246  putative permease  22.7 
 
 		 419 aa  65.5  0.000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1445  major facilitator transporter  21.25 
 
 		 390 aa  65.1  0.000000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00616907  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0786  major facilitator transporter  19.58 
 
 		 403 aa  65.1  0.000000003  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.104451  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3776  major facilitator superfamily MFS_1  28.12 
 
 		 412 aa  64.7  0.000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1630  transporter  23.51 
 
 		 420 aa  64.7  0.000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_25090  Major facilitator superfamily transporter  28.76 
 
 		 411 aa  64.7  0.000000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3515  putative transporter  22.94 
 
 		 420 aa  65.1  0.000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3952  major facilitator transporter  25.97 
 
 		 413 aa  64.7  0.000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5433  major facilitator superfamily MFS_1  26.9 
 
 		 417 aa  63.9  0.000000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.317246  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2206  major facilitator transporter  27.11 
 
 		 447 aa  63.9  0.000000005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4774  major facilitator transporter  27.81 
 
 		 443 aa  63.9  0.000000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0752  transporter, putative  26.22 
 
 		 446 aa  63.9  0.000000006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2925  major facilitator transporter  25.34 
 
 		 425 aa  63.5  0.000000006  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3025  permease  22.49 
 
 		 419 aa  63.5  0.000000007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3258  permease  22.49 
 
 		 419 aa  63.5  0.000000007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0091  major facilitator superfamily MFS_1  25 
 
 		 442 aa  62.8  0.00000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1827  putative transporter  23.3 
 
 		 420 aa  63.2  0.00000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4238  major facilitator transporter  31.98 
 
 		 420 aa  63.2  0.00000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.375023 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0395  permease  24.81 
 
 		 430 aa  63.2  0.00000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0177527  normal  0.113221 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4779  major facilitator transporter  24.59 
 
 		 428 aa  62.4  0.00000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00000206756  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4706  major facilitator superfamily MFS_1  26.43 
 
 		 445 aa  62  0.00000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.93667 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>